Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is Not Available

Identifier: 13357823

GI number: 13357823

Start: 295582

End: 297366

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: UU263

Alternate gene names: NA

Gene position: 297366-295582 (Counterclockwise)

Preceding gene: 13357824

Following gene: 13357771

Centisome position: 39.56

GC content: 20.84

Gene sequence:

>1785_bases
ATGAAAATAAATTTTAAAAGAACTTTTTTATTATCATTTATAGGAGTTATAGTTACACCAATTCCTATAATTTTGAGTTG
CTCATTAACAAAAATTAAAAAAGAAGACAATAAAAATTTCTTTAATCTTTATTTGAAAATTAAAGAAGAAGCTAGTTCTA
AAGTTGATTTTGTTCTTAAAAATAATCATAAATACAATTATCTTCTTAATAAAGCAGATATAATCAATAATTATATTAAT
TACTTGGTGAATTTAAATTTAAATGAAAATAGTGAGAATGAATTATTAGCATTTACTTATTATGAATTATATAAATTAAT
AAAAGATTTTAATTATCTTTTAAAAGAAAAAACACAAGAATATGAATCATGATTAATTAAAATTGATAACTTTGTTAAAT
TAATAAAAAAAAGACAAGCCGATTTTTTAAATTTTAAAAATAAAAACAAAATTATTCATGATATCGATCATATCAAAAAT
AATATTGAAGAAATTTTAACTAATTATAATCAAATTCCTGATAATGAAAATATTGATGATATCAAATTAAGATATAAAAA
AATGATTGAATCATACGATGGTCTTTATAAAAAAACAATTAATGATGAAGCTAATAAAATCAAAAATATTAAATCTGATG
TTAAAAATTTAAAACATAATTATTTTGAAAAAATTGATAATGGTGAAGAATATTATAAGTTATACAATAGAGAAATTATG
GAATTATTTCATGAAGCTAATCAACTTCATGAAAATATTTCTTCAGTACTACAGAGTATATTAAACAGAAAATTAATTGA
AAATAAAATCGATAATATTAAAAGAGAAATCCAAGAACATAAAAAAGTTTCACAATATATTAAACAAAATGGCCACAAAA
ATAATCAAGATTTTTGAGATACATGAAAAGAAGATATTTTAGGTAAAAAGTTTATATATCAAACTTTAATGGATAATACT
AATGTTGCTATTTGATATGGATTAGCATTAAAAATTGAAGATTTAGCAAAACAAAAATTTATAAACACTAAATCTCTAGA
ATTAAAACAATTAATAGAAAAATGAAAATTATATGGTCAAGCACTTATTAGAGATAGTTTAGACGCAGCCAATTTTTCGG
GTCTATTTTTTACTATTAAGTCCAAAACTTCAATGTTAGATAATTGACAACCATCAATAGATCCTAATTCTCTTTCAAAA
AAAGGTAAATACTACCTCTTAATTAAAAAATTAAAAGATTTAACAAACGAAATTGAGAAAAAAGCACGTAATGCTAATCA
AAAACTTTCTAGATTTTATGATAGCGTTGTCAAAGATGATGTTGAGCAAATTGTTCCATATATTAAAGCCGTTGGTTATG
GTTTTTATCCCCAAGAAGAATTTGGTGAATTAATGTATTGATCTAATTACTATTTAAATCAATTACCAGATGTTTTTCAA
TATTATAAAGAAAAGATAATTAAACCTATTATTGATCAAATTAAATCAAAAAGTGATTCAGCAAACGATGTTTCAAAATT
AGAAGAACTTTATAATTTTAAATATCATTACACTAATATCTATGAACCTTTTAATCAAAAAAGAGATAATTTTTATTATT
ATTCTGACTATAAAACAGATGATAAAGGTGAAAAAATTAAAAATAGTGATGAAATGTTTATATTAACAAAACAAGTTCCT
AATCATTTAAAAAATGAATATGATACAGCAAGATTGTTTTTTAGAATAGAGAGAACAATTGGTGAAATATGTAAAAAATA
CGCGTTAACTAATCCTTTAGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATATAATATAATTCATATTAGTCAATATCTGTATTTATATAAAGAACTAATATATATATATATATATATGATATTAAA
ACTAATGGATATTTTACATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACATTATTAATAATCATGTTTTATAAAAATAAATTCAATCTTAGACATAAATATATTAATTTTGGTGTTAATTCGGATT
TTTAAAATAACTCTATCATC

Product: membrane lipoprotein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 594; Mature: 594

Protein sequence:

>594_residues
MKINFKRTFLLSFIGVIVTPIPIILSCSLTKIKKEDNKNFFNLYLKIKEEASSKVDFVLKNNHKYNYLLNKADIINNYIN
YLVNLNLNENSENELLAFTYYELYKLIKDFNYLLKEKTQEYESWLIKIDNFVKLIKKRQADFLNFKNKNKIIHDIDHIKN
NIEEILTNYNQIPDNENIDDIKLRYKKMIESYDGLYKKTINDEANKIKNIKSDVKNLKHNYFEKIDNGEEYYKLYNREIM
ELFHEANQLHENISSVLQSILNRKLIENKIDNIKREIQEHKKVSQYIKQNGHKNNQDFWDTWKEDILGKKFIYQTLMDNT
NVAIWYGLALKIEDLAKQKFINTKSLELKQLIEKWKLYGQALIRDSLDAANFSGLFFTIKSKTSMLDNWQPSIDPNSLSK
KGKYYLLIKKLKDLTNEIEKKARNANQKLSRFYDSVVKDDVEQIVPYIKAVGYGFYPQEEFGELMYWSNYYLNQLPDVFQ
YYKEKIIKPIIDQIKSKSDSANDVSKLEELYNFKYHYTNIYEPFNQKRDNFYYYSDYKTDDKGEKIKNSDEMFILTKQVP
NHLKNEYDTARLFFRIERTIGEICKKYALTNPLE

Sequences:

>Translated_594_residues
MKINFKRTFLLSFIGVIVTPIPIILSCSLTKIKKEDNKNFFNLYLKIKEEASSKVDFVLKNNHKYNYLLNKADIINNYIN
YLVNLNLNENSENELLAFTYYELYKLIKDFNYLLKEKTQEYES*LIKIDNFVKLIKKRQADFLNFKNKNKIIHDIDHIKN
NIEEILTNYNQIPDNENIDDIKLRYKKMIESYDGLYKKTINDEANKIKNIKSDVKNLKHNYFEKIDNGEEYYKLYNREIM
ELFHEANQLHENISSVLQSILNRKLIENKIDNIKREIQEHKKVSQYIKQNGHKNNQDF*DT*KEDILGKKFIYQTLMDNT
NVAI*YGLALKIEDLAKQKFINTKSLELKQLIEK*KLYGQALIRDSLDAANFSGLFFTIKSKTSMLDN*QPSIDPNSLSK
KGKYYLLIKKLKDLTNEIEKKARNANQKLSRFYDSVVKDDVEQIVPYIKAVGYGFYPQEEFGELMY*SNYYLNQLPDVFQ
YYKEKIIKPIIDQIKSKSDSANDVSKLEELYNFKYHYTNIYEPFNQKRDNFYYYSDYKTDDKGEKIKNSDEMFILTKQVP
NHLKNEYDTARLFFRIERTIGEICKKYALTNPLE
>Mature_594_residues
MKINFKRTFLLSFIGVIVTPIPIILSCSLTKIKKEDNKNFFNLYLKIKEEASSKVDFVLKNNHKYNYLLNKADIINNYIN
YLVNLNLNENSENELLAFTYYELYKLIKDFNYLLKEKTQEYES*LIKIDNFVKLIKKRQADFLNFKNKNKIIHDIDHIKN
NIEEILTNYNQIPDNENIDDIKLRYKKMIESYDGLYKKTINDEANKIKNIKSDVKNLKHNYFEKIDNGEEYYKLYNREIM
ELFHEANQLHENISSVLQSILNRKLIENKIDNIKREIQEHKKVSQYIKQNGHKNNQDF*DT*KEDILGKKFIYQTLMDNT
NVAI*YGLALKIEDLAKQKFINTKSLELKQLIEK*KLYGQALIRDSLDAANFSGLFFTIKSKTSMLDN*QPSIDPNSLSK
KGKYYLLIKKLKDLTNEIEKKARNANQKLSRFYDSVVKDDVEQIVPYIKAVGYGFYPQEEFGELMY*SNYYLNQLPDVFQ
YYKEKIIKPIIDQIKSKSDSANDVSKLEELYNFKYHYTNIYEPFNQKRDNFYYYSDYKTDDKGEKIKNSDEMFILTKQVP
NHLKNEYDTARLFFRIERTIGEICKKYALTNPLE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69761; Mature: 69761

Theoretical pI: Translated: 9.30; Mature: 9.30

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKINFKRTFLLSFIGVIVTPIPIILSCSLTKIKKEDNKNFFNLYLKIKEEASSKVDFVLK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEHHHCCCCEEEEEE
NNHKYNYLLNKADIINNYINYLVNLNLNENSENELLAFTYYELYKLIKDFNYLLKEKTQE
CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YESLIKIDNFVKLIKKRQADFLNFKNKNKIIHDIDHIKNNIEEILTNYNQIPDNENIDDI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
KLRYKKMIESYDGLYKKTINDEANKIKNIKSDVKNLKHNYFEKIDNGEEYYKLYNREIME
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
LFHEANQLHENISSVLQSILNRKLIENKIDNIKREIQEHKKVSQYIKQNGHKNNQDFDTK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCH
EDILGKKFIYQTLMDNTNVAIYGLALKIEDLAKQKFINTKSLELKQLIEKKLYGQALIRD
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLDAANFSGLFFTIKSKTSMLDNQPSIDPNSLSKKGKYYLLIKKLKDLTNEIEKKARNAN
CCCCCCCCCEEEEEECHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKLSRFYDSVVKDDVEQIVPYIKAVGYGFYPQEEFGELMYSNYYLNQLPDVFQYYKEKII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KPIIDQIKSKSDSANDVSKLEELYNFKYHYTNIYEPFNQKRDNFYYYSDYKTDDKGEKIK
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCC
NSDEMFILTKQVPNHLKNEYDTARLFFRIERTIGEICKKYALTNPLE
CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKINFKRTFLLSFIGVIVTPIPIILSCSLTKIKKEDNKNFFNLYLKIKEEASSKVDFVLK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEHHHCCCCEEEEEE
NNHKYNYLLNKADIINNYINYLVNLNLNENSENELLAFTYYELYKLIKDFNYLLKEKTQE
CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YESLIKIDNFVKLIKKRQADFLNFKNKNKIIHDIDHIKNNIEEILTNYNQIPDNENIDDI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
KLRYKKMIESYDGLYKKTINDEANKIKNIKSDVKNLKHNYFEKIDNGEEYYKLYNREIME
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
LFHEANQLHENISSVLQSILNRKLIENKIDNIKREIQEHKKVSQYIKQNGHKNNQDFDTK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCH
EDILGKKFIYQTLMDNTNVAIYGLALKIEDLAKQKFINTKSLELKQLIEKKLYGQALIRD
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLDAANFSGLFFTIKSKTSMLDNQPSIDPNSLSKKGKYYLLIKKLKDLTNEIEKKARNAN
CCCCCCCCCEEEEEECHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKLSRFYDSVVKDDVEQIVPYIKAVGYGFYPQEEFGELMYSNYYLNQLPDVFQYYKEKII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KPIIDQIKSKSDSANDVSKLEELYNFKYHYTNIYEPFNQKRDNFYYYSDYKTDDKGEKIK
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCC
NSDEMFILTKQVPNHLKNEYDTARLFFRIERTIGEICKKYALTNPLE
CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA