| Definition | Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_001318 |
| Length | 910,724 |
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The map label for this gene is secA [H]
Identifier: 15594499
GI number: 15594499
Start: 153701
End: 156400
Strand: Reverse
Name: secA [H]
Synonym: BB0154
Alternate gene names: 15594499
Gene position: 156400-153701 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15594506
Following gene: 15594498
Centisome position: 17.17
GC content: 33.15
Gene sequence:
>2700_bases ATGTTAAAAGCAGTACTTGAGACAACTATTGGCTCAAAAAGTAAAAGAGATTTAAAAGATTATCTTCCGACTTTAAGAAA TATTAATAAGCTTGAGCGTTGGGCATTATTGTTGGCAGATGAAGATTTTTCAAAGGAGACAGAAAAGCTTAAAGATGAAT TAAAATCGGGTAATTCTTTAGAGAATATTTTAGAGCGAGCTTTTACTCTGTCTAGAGAAGCTGCTAGAAGGCGTCTTAAA GAAAGGCCTTATGATGTGCAAATCATTGCGGGGCTTGCTCTTCACAAAGGCAAAATAATAGAAATGAAAACGGGAGAAGG AAAAACTCTCTCCTCAGTTCAAGCGGCGTATTTAAATAGTTTAACAGGAGATGGGGTTATTATTGTTACTGTTAATGACT ATCTTGCAGAACGTGATTCCAATTGGATGAAGCCGGTTTTTGATCTTTTGGGTGTTAGCGTGGGGGTTGTTCTATCTAAT ATGGATTATGAGCTAAGAAAGGCTCAATATGCTAAAGATATTACTTATGTTACAAATAATGAACTTGGATTTGATTATCT AAGAGATAATATGCGTTATGACTTGAATGAAAAATCCTTGAGAAAGTTTAATTATTGTATTATTGATGAAATTGATTCTA TTTTGATCGATGAGGCAAGAACTCCATTGATTATTTCAGGGCCTACTGAAGGCAACACCAATGCTTATCTTGAAGTTAAT TCTCTTGTATCTTTTTTAAAAGAATGTTCCAAGGATCCCAAAACAGGTGATTATCCTTTAGAAATAGACGACCTTGATGG TGATTATACTGTTGATGAAAAAGCCAAAAGAATTTCTTTTACTGCCAAAGGGCTTAATAATCTTGAACAGCTTTTAGTTT CTAAAGGCATTATTAGTGGGTCTATGTATACCGATTCAAATTTTAATTATGTTCATTATATGACTCAAGCCTTAAAAGCA CATTTGCTTTTTTTAAAAAATAGAGAGTATATTGTTGGTGATTCTGGGGTTGAGATTGTAGATGAATTTACTGGGAGAGT TTTAACAGGGCGAAGATATTCAGATGGACTTCACCAAGCTATTGAGGCTAAAGAAGGAGTTAGAGTTGCTAATGAAAATA AGACTATGGCAACTATTACTTTTCAAAATTTATTTAGAATGTTTGATAAAATTTCTGGCATGACAGGTACAGCTGATACA GAAGCTAAGGAATTTCATAAAATATATAATCTTGATGTAGTTGTAGTTCCAACAAATAGATTGTTAGCGCGAATAGATGA GGATGATACTATTTATTATACGGAAGAATTTAAATTTAATGCGATTACAGATGAGGTTTACAAAACTTACAAAAAAGGCC AACCGGTTTTAGTGGGAACCGTTTCTATTGAAAAATCTGAGATTTTATCAGCTATGTTTAAAAACAGAGGGATTAAGCAT GAAGTTCTTAATGCAAAAAATCATTCTCGAGAAGCATTTATTATTGCTGAAGCTGGAGCAAAACATGCGGTTACAATAGC AACAAATATGGCTGGTCGTGGTACGGATATTAAGCTTGGGGGAAATATTGAGCACAGAGTTAGAAAAAAAATCGGAACTA ATGTAAGCCTTGAAGAATTTCAAGAGGCTGTTAAAAATGAGAGAGAAAATTACCTGAAAGACTATAATGAGGTTAAAAGT CTTGGTGGGCTTTATGTTATTGGTAGTGAGCGTCACGAATCAAGGCGAATAGACAATCAGCTTCGTGGGCGTAGTGGAAG ACAAGGTGACCCTGGGCGCTCAAGATTTTATGTGTCCCTTGAGGACGATTTAATGCGCCTTTTTGCTGGGGACAACCTAA GATCATTAATGGGTAAGCTTGGAATGGCAACAGGAGAGCCTATTACACATTCTCTTTTAACTAAATCTTTGATTAATGCT CAAAAACGAGTAGAAGACAGAAATTTTGAAATTAGAAAGCATTTGTTAGAGTATGACGATGTTATTACAAAACAAAGAGA TTTTATTTATGCTCAGAGAAACTCCATTCTTGAAGATACAGCTATTAAGGATCGTATTCTTGTTGCTTTAGAAGAATATC TTAGTTTTTTGCTTGAAGGGACAAAAAGTAGCACGGTTTCAAATGTTTTTTTAAATGAAGTAAATTCAATTTTTGCTTAT ATGCTTGAGAGTCTTGGTTCTATTGAAAATATTAGTTCTCTTGATTTAAAGGCTAAGCTAATGCAAATAGCAAAAGCAAA TTTAGATGAAAAGGAAAATTTGATTGGTAGAGATCTTTTTAATGGATTTTTAAGATATGAATATTTGAAAAATATTGATT TTAAATTTCAGGAACATCTTGCAAATTTAGACTCTTTAAGAGAGGCTGTTTATTTAAGGTCTTATGCCAATAAAAATCCA ATCACAGAATACAAAGAAGAGGGATTTTCAATATTTAGCGAGCTTATTAAAGATATTAAAGTTTCTACCATAAGGCGTGT TCTTCAATTAAAATTGGATAGCAATTCTTCCGATTTTAAGTCAACAAAGAAGTCTAGGAATGTTAAACCAATTCATAAAG AACTTTCTGGAATTGTTATTAATGAGAATAAAAGCGCTTCTAATGTTCAAGTGGTTAGAAGTTCTCCTAAAATAGGCAGA AATGAGCCTTGTTATTGTGGAAGTGGGAAGAAATATAAAAATTGTCATGGCAAAAGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAGCAAGCTTAATATAAGAGCTTTATAGTGTTTTTTCATATTTTTATATTATTATTTAAAATGACTTTAAGTCAATTATT TAGGAGAATTAATACCTACC
Downstream 100 bases:
>100_bases AACAGGAGGTTTTTATGTTTAAGCTGCCAGAACTTGGTTATGATTATGATGCTGTTGAGCCTTATATTGATGCTAAAACT ATGGAAATTCATCATAGCAA
Product: preprotein translocase subunit SecA
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 899; Mature: 899
Protein sequence:
>899_residues MLKAVLETTIGSKSKRDLKDYLPTLRNINKLERWALLLADEDFSKETEKLKDELKSGNSLENILERAFTLSREAARRRLK ERPYDVQIIAGLALHKGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNSLTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSN MDYELRKAQYAKDITYVTNNELGFDYLRDNMRYDLNEKSLRKFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGPTEGNTNAYLEVN SLVSFLKECSKDPKTGDYPLEIDDLDGDYTVDEKAKRISFTAKGLNNLEQLLVSKGIISGSMYTDSNFNYVHYMTQALKA HLLFLKNREYIVGDSGVEIVDEFTGRVLTGRRYSDGLHQAIEAKEGVRVANENKTMATITFQNLFRMFDKISGMTGTADT EAKEFHKIYNLDVVVVPTNRLLARIDEDDTIYYTEEFKFNAITDEVYKTYKKGQPVLVGTVSIEKSEILSAMFKNRGIKH EVLNAKNHSREAFIIAEAGAKHAVTIATNMAGRGTDIKLGGNIEHRVRKKIGTNVSLEEFQEAVKNERENYLKDYNEVKS LGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGRSRFYVSLEDDLMRLFAGDNLRSLMGKLGMATGEPITHSLLTKSLINA QKRVEDRNFEIRKHLLEYDDVITKQRDFIYAQRNSILEDTAIKDRILVALEEYLSFLLEGTKSSTVSNVFLNEVNSIFAY MLESLGSIENISSLDLKAKLMQIAKANLDEKENLIGRDLFNGFLRYEYLKNIDFKFQEHLANLDSLREAVYLRSYANKNP ITEYKEEGFSIFSELIKDIKVSTIRRVLQLKLDSNSSDFKSTKKSRNVKPIHKELSGIVINENKSASNVQVVRSSPKIGR NEPCYCGSGKKYKNCHGKS
Sequences:
>Translated_899_residues MLKAVLETTIGSKSKRDLKDYLPTLRNINKLERWALLLADEDFSKETEKLKDELKSGNSLENILERAFTLSREAARRRLK ERPYDVQIIAGLALHKGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNSLTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSN MDYELRKAQYAKDITYVTNNELGFDYLRDNMRYDLNEKSLRKFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGPTEGNTNAYLEVN SLVSFLKECSKDPKTGDYPLEIDDLDGDYTVDEKAKRISFTAKGLNNLEQLLVSKGIISGSMYTDSNFNYVHYMTQALKA HLLFLKNREYIVGDSGVEIVDEFTGRVLTGRRYSDGLHQAIEAKEGVRVANENKTMATITFQNLFRMFDKISGMTGTADT EAKEFHKIYNLDVVVVPTNRLLARIDEDDTIYYTEEFKFNAITDEVYKTYKKGQPVLVGTVSIEKSEILSAMFKNRGIKH EVLNAKNHSREAFIIAEAGAKHAVTIATNMAGRGTDIKLGGNIEHRVRKKIGTNVSLEEFQEAVKNERENYLKDYNEVKS LGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGRSRFYVSLEDDLMRLFAGDNLRSLMGKLGMATGEPITHSLLTKSLINA QKRVEDRNFEIRKHLLEYDDVITKQRDFIYAQRNSILEDTAIKDRILVALEEYLSFLLEGTKSSTVSNVFLNEVNSIFAY MLESLGSIENISSLDLKAKLMQIAKANLDEKENLIGRDLFNGFLRYEYLKNIDFKFQEHLANLDSLREAVYLRSYANKNP ITEYKEEGFSIFSELIKDIKVSTIRRVLQLKLDSNSSDFKSTKKSRNVKPIHKELSGIVINENKSASNVQVVRSSPKIGR NEPCYCGSGKKYKNCHGKS >Mature_899_residues MLKAVLETTIGSKSKRDLKDYLPTLRNINKLERWALLLADEDFSKETEKLKDELKSGNSLENILERAFTLSREAARRRLK ERPYDVQIIAGLALHKGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNSLTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSN MDYELRKAQYAKDITYVTNNELGFDYLRDNMRYDLNEKSLRKFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGPTEGNTNAYLEVN SLVSFLKECSKDPKTGDYPLEIDDLDGDYTVDEKAKRISFTAKGLNNLEQLLVSKGIISGSMYTDSNFNYVHYMTQALKA HLLFLKNREYIVGDSGVEIVDEFTGRVLTGRRYSDGLHQAIEAKEGVRVANENKTMATITFQNLFRMFDKISGMTGTADT EAKEFHKIYNLDVVVVPTNRLLARIDEDDTIYYTEEFKFNAITDEVYKTYKKGQPVLVGTVSIEKSEILSAMFKNRGIKH EVLNAKNHSREAFIIAEAGAKHAVTIATNMAGRGTDIKLGGNIEHRVRKKIGTNVSLEEFQEAVKNERENYLKDYNEVKS LGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGRSRFYVSLEDDLMRLFAGDNLRSLMGKLGMATGEPITHSLLTKSLINA QKRVEDRNFEIRKHLLEYDDVITKQRDFIYAQRNSILEDTAIKDRILVALEEYLSFLLEGTKSSTVSNVFLNEVNSIFAY MLESLGSIENISSLDLKAKLMQIAKANLDEKENLIGRDLFNGFLRYEYLKNIDFKFQEHLANLDSLREAVYLRSYANKNP ITEYKEEGFSIFSELIKDIKVSTIRRVLQLKLDSNSSDFKSTKKSRNVKPIHKELSGIVINENKSASNVQVVRSSPKIGR NEPCYCGSGKKYKNCHGKS
Specific function: Part of the Sec protein translocase complex. Interacts with the secYEG preprotein conducting channel. Has a central role in coupling the hydrolysis of ATP to the transfer of proteins into and across the cell membrane, serving as an ATP-driven molecular mo
COG id: COG0653
COG function: function code U; Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Cytoplasm (By similarity). Note=Distribution is 50-50 (By similarity) [H]
Metaboloic importance: Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the secA family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786287, Length=917, Percent_Identity=44.1657579062159, Blast_Score=762, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004027 - InterPro: IPR000185 - InterPro: IPR020937 - InterPro: IPR011115 - InterPro: IPR014018 - InterPro: IPR011130 - InterPro: IPR011116 [H]
Pfam domain/function: PF02810 SEC-C; PF07517 SecA_DEAD; PF01043 SecA_PP_bind; PF07516 SecA_SW [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 102088; Mature: 102088
Theoretical pI: Translated: 7.92; Mature: 7.92
Prosite motif: PS01312 SECA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLKAVLETTIGSKSKRDLKDYLPTLRNINKLERWALLLADEDFSKETEKLKDELKSGNSL CCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCHH ENILERAFTLSREAARRRLKERPYDVQIIAGLALHKGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHC LTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSNMDYELRKAQYAKDITYVTNN CCCCCEEEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECC ELGFDYLRDNMRYDLNEKSLRKFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGPTEGNTNAYLEVN CCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEHH SLVSFLKECSKDPKTGDYPLEIDDLDGDYTVDEKAKRISFTAKGLNNLEQLLVSKGIISG HHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC SMYTDSNFNYVHYMTQALKAHLLFLKNREYIVGDSGVEIVDEFTGRVLTGRRYSDGLHQA CEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEECCCCHHHHHHHCCCEECCCCHHHHHHHH IEAKEGVRVANENKTMATITFQNLFRMFDKISGMTGTADTEAKEFHKIYNLDVVVVPTNR HHHHCCCEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCHH LLARIDEDDTIYYTEEFKFNAITDEVYKTYKKGQPVLVGTVSIEKSEILSAMFKNRGIKH HHEEECCCCEEEEECCEEECHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCH EVLNAKNHSREAFIIAEAGAKHAVTIATNMAGRGTDIKLGGNIEHRVRKKIGTNVSLEEF HHHCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCHHHH QEAVKNERENYLKDYNEVKSLGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGRSRFYVSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEE EDDLMRLFAGDNLRSLMGKLGMATGEPITHSLLTKSLINAQKRVEDRNFEIRKHLLEYDD HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH VITKQRDFIYAQRNSILEDTAIKDRILVALEEYLSFLLEGTKSSTVSNVFLNEVNSIFAY HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH MLESLGSIENISSLDLKAKLMQIAKANLDEKENLIGRDLFNGFLRYEYLKNIDFKFQEHL HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH ANLDSLREAVYLRSYANKNPITEYKEEGFSIFSELIKDIKVSTIRRVLQLKLDSNSSDFK HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH STKKSRNVKPIHKELSGIVINENKSASNVQVVRSSPKIGRNEPCYCGSGKKYKNCHGKS HHHHCCCCCHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MLKAVLETTIGSKSKRDLKDYLPTLRNINKLERWALLLADEDFSKETEKLKDELKSGNSL CCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCHH ENILERAFTLSREAARRRLKERPYDVQIIAGLALHKGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHC LTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSNMDYELRKAQYAKDITYVTNN CCCCCEEEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECC ELGFDYLRDNMRYDLNEKSLRKFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGPTEGNTNAYLEVN CCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEHH SLVSFLKECSKDPKTGDYPLEIDDLDGDYTVDEKAKRISFTAKGLNNLEQLLVSKGIISG HHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC SMYTDSNFNYVHYMTQALKAHLLFLKNREYIVGDSGVEIVDEFTGRVLTGRRYSDGLHQA CEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEECCCCHHHHHHHCCCEECCCCHHHHHHHH IEAKEGVRVANENKTMATITFQNLFRMFDKISGMTGTADTEAKEFHKIYNLDVVVVPTNR HHHHCCCEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCHH LLARIDEDDTIYYTEEFKFNAITDEVYKTYKKGQPVLVGTVSIEKSEILSAMFKNRGIKH HHEEECCCCEEEEECCEEECHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCH EVLNAKNHSREAFIIAEAGAKHAVTIATNMAGRGTDIKLGGNIEHRVRKKIGTNVSLEEF HHHCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCHHHH QEAVKNERENYLKDYNEVKSLGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGRSRFYVSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEE EDDLMRLFAGDNLRSLMGKLGMATGEPITHSLLTKSLINAQKRVEDRNFEIRKHLLEYDD HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH VITKQRDFIYAQRNSILEDTAIKDRILVALEEYLSFLLEGTKSSTVSNVFLNEVNSIFAY HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH MLESLGSIENISSLDLKAKLMQIAKANLDEKENLIGRDLFNGFLRYEYLKNIDFKFQEHL HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH ANLDSLREAVYLRSYANKNPITEYKEEGFSIFSELIKDIKVSTIRRVLQLKLDSNSSDFK HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH STKKSRNVKPIHKELSGIVINENKSASNVQVVRSSPKIGRNEPCYCGSGKKYKNCHGKS HHHHCCCCCHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA