| Definition | Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_001318 |
| Length | 910,724 |
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The map label for this gene is 15594418
Identifier: 15594418
GI number: 15594418
Start: 67248
End: 69569
Strand: Direct
Name: 15594418
Synonym: BB0072
Alternate gene names: NA
Gene position: 67248-69569 (Clockwise)
Preceding gene: 15594417
Following gene: 15594419
Centisome position: 7.38
GC content: 24.98
Gene sequence:
>2322_bases ATGCTAGACTTAGAAAAAGTAAAAACAATTTTTAAAAAATACAATAAATACGAAATAAATATTAACGAGATTCAAATACC TGAATATGCCCTAATACCCCTTGAAACAGAAAATTCAAAATCCATAATATACATAATTGAAAAACAAAAAATAGAAGAAA ATCAAATTTTATCCAAAAACTCAAACATAGAGCTATACACATATTCTCCAATATCTGGAATAGTAGAAAAAATATACACA GCCAATTTTCCAGATGGAAAAAATTTAAAATCAGCATTAATCAAATTTCAAGGAAAAATAAAAACTGAAAAAACACCAAT TGAAGAAGGAGCCTCAAGAGAAAAAACCTTGGAAAAATTAATTCAACTGGGAATTCCTTGGTTTAACGAAAATTCTTTAT TTCAATTCATAAACAAATGTAAAAAAATAGACAAAATGATTTTATTAACAAACGGAAAAGATGCATTTACAAATATTTCA GAAGCACTGATGGCAGAAAAATTAGAAGAAATTTTTTCAGGATTCCAAATAATCGACAAAATATTCAAATTCAAAGAAAT AATAATAATAATATCAAATAAAGACAAACTAAAAAAAGAATTCGAAAAATTGAGTATTTTTAAAAACAGAAAAATAAAAA TTAAATCTTTAGAAAATGCATATCCTTATACAAATCACGAAATGATAATGCACTTTTTATACAATAATAAAAATACAAAA GATGATATAAATCCCCACAACAATATTTTATTAGCAAATATTGAAGATCTATACAATGCAAATCTTGTCATAAAAAATAA CAACCCTTATAAAGAAAAATTTGTAGCTATAAATGGAAATAAAAAAATAAAAAGTAGAATACTGAAGGTAAAAATTGGAA CCTCTTTCAGCCAGCTAATAAATGAGAAAATTGACACAAAAAAATATGAAATTTTTTTAAACAACCCAGCCAATAAAATA AAAATCGATACATTAAACATACCGATAACAAGAGATATTTATAGTCTCACCATATTAAAGAAAAAGTCAATATACGACAA AATTAAAGCATTGTTTATATCAAGCTTTGCACCATTGCAAATGGAAAATATTATTTTTTCATTCTTAAAGAAAGAAAAAA TAAATAATAGCGGCAAATTAAAAATATTTAATTATACAGACAAAGAAGTAGAAGAAGAAATACATAAGGTTCAAAAAGAA ATTAAAAGCAAAATTCTAAATGAAAGTCTAACAAATGAAGCAATATACACTGAAAACAATTTAAAAGACATATACTTTGC TATCATACTATCACTATCACCTAGCCTGATATTTTCTTTCCTAAATAACACAAAATTCATGACAGACACCTTGCTGTTAA TATTTATTAGTGTGGCAATCTATATACCTATAATGCTAAAAATTAATTACAAATGTTTGTCTTTTTTTGTTTACGCCGCC TTAATGATAAGCATTATATTGCCCTTGGATTTAGAAATTACACTAAAAATAATTTCCTTATTATTTACTTTTTTGGTATT CTTTTACTTTTTCAGACTATCAGCATTTTTGGCAAACCCTATATTAATTTCTTTTATGTTTTTGGTATTAAATTTTCCGG TAAGTTTTAAGCAAGCCTATCAAGAGGAACTTAAAAATTCAAATTCAATAATTCCAACCTGGAATGAAATAATTGAAACA AATCCAAACATAAAAAATTTAAAAAGTTTAAATACCTTTACAAGATATGAAAGTAAAAAAATAGATGCAATTGAAAACTT TGTAAATCAAAACATTTTTTCCGCTTTTAATATAATTGTCACAAGATTTCATATTGAAAGTCTTTTGGGAGTTAATAATG AAAAAAAAATATCTCCTATCTTGCTTTATTTTGGCCTCTTATTAATAGTTGGCAAATATATAATCAACAAATTAATACCA CTCTCATTTTATATAAGCTTAATGGCAATCTCGTACATAGCACATAATATAGGAATGCTAAACCACATCAGCTCCGACAT GTTAACACTACTTATTTCTCCAATCCCAATGCTGTTAATATTTACAATGGCAACAGAATTGCAAATAACACCTCACTTTA AATTTGAGCAAATACTCTACGGATCAATATTGGCATTTATATACTTTTTGACATTAAGCTACATTCCTTTTGAAACTTTA TCAGTCATAATATCTATTTTCATCTTACAAACAAGCTCAAACTTAATAAAAAAATATAGCTTAACCTTCAAAATTAAAAA AATAATGCATGTTTTGAAAACAAATAAAGAAAAAGCACTCAAAACACCTCTTGAGAATGAAAAGGATATAATAAAATTAT GA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCTTTGTATTACTATTCCTATTTAAAGCAATAAGATTTACAATTCTTTTAAACATAAATGAAAAAACCTATAAAAAATA TATTCAAGGATAAATAGCTA
Downstream 100 bases:
>100_bases CCAATAATTTAATTGCATGCCTAATTATTAACAACTTAACCTTAATACACTTTGTTGGATTTGAGGACATAAAAATAAAA AACAATATAATGCTAATAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 773; Mature: 773
Protein sequence:
>773_residues MLDLEKVKTIFKKYNKYEININEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKNSNIELYTYSPISGIVEKIYT ANFPDGKNLKSALIKFQGKIKTEKTPIEEGASREKTLEKLIQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDAFTNIS EALMAEKLEEIFSGFQIIDKIFKFKEIIIIISNKDKLKKEFEKLSIFKNRKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNTK DDINPHNNILLANIEDLYNANLVIKNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQLINEKIDTKKYEIFLNNPANKI KIDTLNIPITRDIYSLTILKKKSIYDKIKALFISSFAPLQMENIIFSFLKKEKINNSGKLKIFNYTDKEVEEEIHKVQKE IKSKILNESLTNEAIYTENNLKDIYFAIILSLSPSLIFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYIPIMLKINYKCLSFFVYAA LMISIILPLDLEITLKIISLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFLVLNFPVSFKQAYQEELKNSNSIIPTWNEIIET NPNIKNLKSLNTFTRYESKKIDAIENFVNQNIFSAFNIIVTRFHIESLLGVNNEKKISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIP LSFYISLMAISYIAHNIGMLNHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATELQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLTLSYIPFETL SVIISIFILQTSSNLIKKYSLTFKIKKIMHVLKTNKEKALKTPLENEKDIIKL
Sequences:
>Translated_773_residues MLDLEKVKTIFKKYNKYEININEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKNSNIELYTYSPISGIVEKIYT ANFPDGKNLKSALIKFQGKIKTEKTPIEEGASREKTLEKLIQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDAFTNIS EALMAEKLEEIFSGFQIIDKIFKFKEIIIIISNKDKLKKEFEKLSIFKNRKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNTK DDINPHNNILLANIEDLYNANLVIKNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQLINEKIDTKKYEIFLNNPANKI KIDTLNIPITRDIYSLTILKKKSIYDKIKALFISSFAPLQMENIIFSFLKKEKINNSGKLKIFNYTDKEVEEEIHKVQKE IKSKILNESLTNEAIYTENNLKDIYFAIILSLSPSLIFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYIPIMLKINYKCLSFFVYAA LMISIILPLDLEITLKIISLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFLVLNFPVSFKQAYQEELKNSNSIIPTWNEIIET NPNIKNLKSLNTFTRYESKKIDAIENFVNQNIFSAFNIIVTRFHIESLLGVNNEKKISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIP LSFYISLMAISYIAHNIGMLNHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATELQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLTLSYIPFETL SVIISIFILQTSSNLIKKYSLTFKIKKIMHVLKTNKEKALKTPLENEKDIIKL >Mature_773_residues MLDLEKVKTIFKKYNKYEININEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKNSNIELYTYSPISGIVEKIYT ANFPDGKNLKSALIKFQGKIKTEKTPIEEGASREKTLEKLIQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDAFTNIS EALMAEKLEEIFSGFQIIDKIFKFKEIIIIISNKDKLKKEFEKLSIFKNRKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNTK DDINPHNNILLANIEDLYNANLVIKNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQLINEKIDTKKYEIFLNNPANKI KIDTLNIPITRDIYSLTILKKKSIYDKIKALFISSFAPLQMENIIFSFLKKEKINNSGKLKIFNYTDKEVEEEIHKVQKE IKSKILNESLTNEAIYTENNLKDIYFAIILSLSPSLIFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYIPIMLKINYKCLSFFVYAA LMISIILPLDLEITLKIISLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFLVLNFPVSFKQAYQEELKNSNSIIPTWNEIIET NPNIKNLKSLNTFTRYESKKIDAIENFVNQNIFSAFNIIVTRFHIESLLGVNNEKKISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIP LSFYISLMAISYIAHNIGMLNHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATELQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLTLSYIPFETL SVIISIFILQTSSNLIKKYSLTFKIKKIMHVLKTNKEKALKTPLENEKDIIKL
Specific function: Unknown
COG id: COG4656
COG function: function code C; Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 89850; Mature: 89850
Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLDLEKVKTIFKKYNKYEININEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKN CCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHCCC SNIELYTYSPISGIVEKIYTANFPDGKNLKSALIKFQGKIKTEKTPIEEGASREKTLEKL CCEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH IQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDAFTNISEALMAEKLEEIFSGFQIIDK HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFKFKEIIIIISNKDKLKKEFEKLSIFKNRKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNTK HHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC DDINPHNNILLANIEDLYNANLVIKNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQLI CCCCCCCCEEEEEHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEEECCCHHHHHCEEEEEECCCHHHHH NEKIDTKKYEIFLNNPANKIKIDTLNIPITRDIYSLTILKKKSIYDKIKALFISSFAPLQ HHHCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH MENIIFSFLKKEKINNSGKLKIFNYTDKEVEEEIHKVQKEIKSKILNESLTNEAIYTENN HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCC LKDIYFAIILSLSPSLIFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYIPIMLKINYKCLSFFVYAA CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHH LMISIILPLDLEITLKIISLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFLVLNFPVSFKQAY HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH QEELKNSNSIIPTWNEIIETNPNIKNLKSLNTFTRYESKKIDAIENFVNQNIFSAFNIIV HHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TRFHIESLLGVNNEKKISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIPLSFYISLMAISYIAHNIGML HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATELQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLTLSYIPFETL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH SVIISIFILQTSSNLIKKYSLTFKIKKIMHVLKTNKEKALKTPLENEKDIIKL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCHHCC >Mature Secondary Structure MLDLEKVKTIFKKYNKYEININEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKN CCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHCCC SNIELYTYSPISGIVEKIYTANFPDGKNLKSALIKFQGKIKTEKTPIEEGASREKTLEKL CCEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH IQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDAFTNISEALMAEKLEEIFSGFQIIDK HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFKFKEIIIIISNKDKLKKEFEKLSIFKNRKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNTK HHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC DDINPHNNILLANIEDLYNANLVIKNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQLI CCCCCCCCEEEEEHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEEECCCHHHHHCEEEEEECCCHHHHH NEKIDTKKYEIFLNNPANKIKIDTLNIPITRDIYSLTILKKKSIYDKIKALFISSFAPLQ HHHCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH MENIIFSFLKKEKINNSGKLKIFNYTDKEVEEEIHKVQKEIKSKILNESLTNEAIYTENN HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCC LKDIYFAIILSLSPSLIFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYIPIMLKINYKCLSFFVYAA CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHH LMISIILPLDLEITLKIISLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFLVLNFPVSFKQAY HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH QEELKNSNSIIPTWNEIIETNPNIKNLKSLNTFTRYESKKIDAIENFVNQNIFSAFNIIV HHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TRFHIESLLGVNNEKKISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIPLSFYISLMAISYIAHNIGML HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATELQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLTLSYIPFETL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH SVIISIFILQTSSNLIKKYSLTFKIKKIMHVLKTNKEKALKTPLENEKDIIKL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA