Definition Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome.
Accession NC_001318
Length 910,724

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15594418

Identifier: 15594418

GI number: 15594418

Start: 67248

End: 69569

Strand: Direct

Name: 15594418

Synonym: BB0072

Alternate gene names: NA

Gene position: 67248-69569 (Clockwise)

Preceding gene: 15594417

Following gene: 15594419

Centisome position: 7.38

GC content: 24.98

Gene sequence:

>2322_bases
ATGCTAGACTTAGAAAAAGTAAAAACAATTTTTAAAAAATACAATAAATACGAAATAAATATTAACGAGATTCAAATACC
TGAATATGCCCTAATACCCCTTGAAACAGAAAATTCAAAATCCATAATATACATAATTGAAAAACAAAAAATAGAAGAAA
ATCAAATTTTATCCAAAAACTCAAACATAGAGCTATACACATATTCTCCAATATCTGGAATAGTAGAAAAAATATACACA
GCCAATTTTCCAGATGGAAAAAATTTAAAATCAGCATTAATCAAATTTCAAGGAAAAATAAAAACTGAAAAAACACCAAT
TGAAGAAGGAGCCTCAAGAGAAAAAACCTTGGAAAAATTAATTCAACTGGGAATTCCTTGGTTTAACGAAAATTCTTTAT
TTCAATTCATAAACAAATGTAAAAAAATAGACAAAATGATTTTATTAACAAACGGAAAAGATGCATTTACAAATATTTCA
GAAGCACTGATGGCAGAAAAATTAGAAGAAATTTTTTCAGGATTCCAAATAATCGACAAAATATTCAAATTCAAAGAAAT
AATAATAATAATATCAAATAAAGACAAACTAAAAAAAGAATTCGAAAAATTGAGTATTTTTAAAAACAGAAAAATAAAAA
TTAAATCTTTAGAAAATGCATATCCTTATACAAATCACGAAATGATAATGCACTTTTTATACAATAATAAAAATACAAAA
GATGATATAAATCCCCACAACAATATTTTATTAGCAAATATTGAAGATCTATACAATGCAAATCTTGTCATAAAAAATAA
CAACCCTTATAAAGAAAAATTTGTAGCTATAAATGGAAATAAAAAAATAAAAAGTAGAATACTGAAGGTAAAAATTGGAA
CCTCTTTCAGCCAGCTAATAAATGAGAAAATTGACACAAAAAAATATGAAATTTTTTTAAACAACCCAGCCAATAAAATA
AAAATCGATACATTAAACATACCGATAACAAGAGATATTTATAGTCTCACCATATTAAAGAAAAAGTCAATATACGACAA
AATTAAAGCATTGTTTATATCAAGCTTTGCACCATTGCAAATGGAAAATATTATTTTTTCATTCTTAAAGAAAGAAAAAA
TAAATAATAGCGGCAAATTAAAAATATTTAATTATACAGACAAAGAAGTAGAAGAAGAAATACATAAGGTTCAAAAAGAA
ATTAAAAGCAAAATTCTAAATGAAAGTCTAACAAATGAAGCAATATACACTGAAAACAATTTAAAAGACATATACTTTGC
TATCATACTATCACTATCACCTAGCCTGATATTTTCTTTCCTAAATAACACAAAATTCATGACAGACACCTTGCTGTTAA
TATTTATTAGTGTGGCAATCTATATACCTATAATGCTAAAAATTAATTACAAATGTTTGTCTTTTTTTGTTTACGCCGCC
TTAATGATAAGCATTATATTGCCCTTGGATTTAGAAATTACACTAAAAATAATTTCCTTATTATTTACTTTTTTGGTATT
CTTTTACTTTTTCAGACTATCAGCATTTTTGGCAAACCCTATATTAATTTCTTTTATGTTTTTGGTATTAAATTTTCCGG
TAAGTTTTAAGCAAGCCTATCAAGAGGAACTTAAAAATTCAAATTCAATAATTCCAACCTGGAATGAAATAATTGAAACA
AATCCAAACATAAAAAATTTAAAAAGTTTAAATACCTTTACAAGATATGAAAGTAAAAAAATAGATGCAATTGAAAACTT
TGTAAATCAAAACATTTTTTCCGCTTTTAATATAATTGTCACAAGATTTCATATTGAAAGTCTTTTGGGAGTTAATAATG
AAAAAAAAATATCTCCTATCTTGCTTTATTTTGGCCTCTTATTAATAGTTGGCAAATATATAATCAACAAATTAATACCA
CTCTCATTTTATATAAGCTTAATGGCAATCTCGTACATAGCACATAATATAGGAATGCTAAACCACATCAGCTCCGACAT
GTTAACACTACTTATTTCTCCAATCCCAATGCTGTTAATATTTACAATGGCAACAGAATTGCAAATAACACCTCACTTTA
AATTTGAGCAAATACTCTACGGATCAATATTGGCATTTATATACTTTTTGACATTAAGCTACATTCCTTTTGAAACTTTA
TCAGTCATAATATCTATTTTCATCTTACAAACAAGCTCAAACTTAATAAAAAAATATAGCTTAACCTTCAAAATTAAAAA
AATAATGCATGTTTTGAAAACAAATAAAGAAAAAGCACTCAAAACACCTCTTGAGAATGAAAAGGATATAATAAAATTAT
GA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCTTTGTATTACTATTCCTATTTAAAGCAATAAGATTTACAATTCTTTTAAACATAAATGAAAAAACCTATAAAAAATA
TATTCAAGGATAAATAGCTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCAATAATTTAATTGCATGCCTAATTATTAACAACTTAACCTTAATACACTTTGTTGGATTTGAGGACATAAAAATAAAA
AACAATATAATGCTAATAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 773; Mature: 773

Protein sequence:

>773_residues
MLDLEKVKTIFKKYNKYEININEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKNSNIELYTYSPISGIVEKIYT
ANFPDGKNLKSALIKFQGKIKTEKTPIEEGASREKTLEKLIQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDAFTNIS
EALMAEKLEEIFSGFQIIDKIFKFKEIIIIISNKDKLKKEFEKLSIFKNRKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNTK
DDINPHNNILLANIEDLYNANLVIKNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQLINEKIDTKKYEIFLNNPANKI
KIDTLNIPITRDIYSLTILKKKSIYDKIKALFISSFAPLQMENIIFSFLKKEKINNSGKLKIFNYTDKEVEEEIHKVQKE
IKSKILNESLTNEAIYTENNLKDIYFAIILSLSPSLIFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYIPIMLKINYKCLSFFVYAA
LMISIILPLDLEITLKIISLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFLVLNFPVSFKQAYQEELKNSNSIIPTWNEIIET
NPNIKNLKSLNTFTRYESKKIDAIENFVNQNIFSAFNIIVTRFHIESLLGVNNEKKISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIP
LSFYISLMAISYIAHNIGMLNHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATELQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLTLSYIPFETL
SVIISIFILQTSSNLIKKYSLTFKIKKIMHVLKTNKEKALKTPLENEKDIIKL

Sequences:

>Translated_773_residues
MLDLEKVKTIFKKYNKYEININEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKNSNIELYTYSPISGIVEKIYT
ANFPDGKNLKSALIKFQGKIKTEKTPIEEGASREKTLEKLIQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDAFTNIS
EALMAEKLEEIFSGFQIIDKIFKFKEIIIIISNKDKLKKEFEKLSIFKNRKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNTK
DDINPHNNILLANIEDLYNANLVIKNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQLINEKIDTKKYEIFLNNPANKI
KIDTLNIPITRDIYSLTILKKKSIYDKIKALFISSFAPLQMENIIFSFLKKEKINNSGKLKIFNYTDKEVEEEIHKVQKE
IKSKILNESLTNEAIYTENNLKDIYFAIILSLSPSLIFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYIPIMLKINYKCLSFFVYAA
LMISIILPLDLEITLKIISLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFLVLNFPVSFKQAYQEELKNSNSIIPTWNEIIET
NPNIKNLKSLNTFTRYESKKIDAIENFVNQNIFSAFNIIVTRFHIESLLGVNNEKKISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIP
LSFYISLMAISYIAHNIGMLNHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATELQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLTLSYIPFETL
SVIISIFILQTSSNLIKKYSLTFKIKKIMHVLKTNKEKALKTPLENEKDIIKL
>Mature_773_residues
MLDLEKVKTIFKKYNKYEININEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKNSNIELYTYSPISGIVEKIYT
ANFPDGKNLKSALIKFQGKIKTEKTPIEEGASREKTLEKLIQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDAFTNIS
EALMAEKLEEIFSGFQIIDKIFKFKEIIIIISNKDKLKKEFEKLSIFKNRKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNTK
DDINPHNNILLANIEDLYNANLVIKNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQLINEKIDTKKYEIFLNNPANKI
KIDTLNIPITRDIYSLTILKKKSIYDKIKALFISSFAPLQMENIIFSFLKKEKINNSGKLKIFNYTDKEVEEEIHKVQKE
IKSKILNESLTNEAIYTENNLKDIYFAIILSLSPSLIFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYIPIMLKINYKCLSFFVYAA
LMISIILPLDLEITLKIISLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFLVLNFPVSFKQAYQEELKNSNSIIPTWNEIIET
NPNIKNLKSLNTFTRYESKKIDAIENFVNQNIFSAFNIIVTRFHIESLLGVNNEKKISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIP
LSFYISLMAISYIAHNIGMLNHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATELQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLTLSYIPFETL
SVIISIFILQTSSNLIKKYSLTFKIKKIMHVLKTNKEKALKTPLENEKDIIKL

Specific function: Unknown

COG id: COG4656

COG function: function code C; Predicted NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89850; Mature: 89850

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLDLEKVKTIFKKYNKYEININEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKN
CCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHCCC
SNIELYTYSPISGIVEKIYTANFPDGKNLKSALIKFQGKIKTEKTPIEEGASREKTLEKL
CCEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
IQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDAFTNISEALMAEKLEEIFSGFQIIDK
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFKFKEIIIIISNKDKLKKEFEKLSIFKNRKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNTK
HHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
DDINPHNNILLANIEDLYNANLVIKNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQLI
CCCCCCCCEEEEEHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEEECCCHHHHHCEEEEEECCCHHHHH
NEKIDTKKYEIFLNNPANKIKIDTLNIPITRDIYSLTILKKKSIYDKIKALFISSFAPLQ
HHHCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
MENIIFSFLKKEKINNSGKLKIFNYTDKEVEEEIHKVQKEIKSKILNESLTNEAIYTENN
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCC
LKDIYFAIILSLSPSLIFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYIPIMLKINYKCLSFFVYAA
CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHH
LMISIILPLDLEITLKIISLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFLVLNFPVSFKQAY
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
QEELKNSNSIIPTWNEIIETNPNIKNLKSLNTFTRYESKKIDAIENFVNQNIFSAFNIIV
HHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TRFHIESLLGVNNEKKISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIPLSFYISLMAISYIAHNIGML
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATELQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLTLSYIPFETL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
SVIISIFILQTSSNLIKKYSLTFKIKKIMHVLKTNKEKALKTPLENEKDIIKL
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCHHCC
>Mature Secondary Structure
MLDLEKVKTIFKKYNKYEININEIQIPEYALIPLETENSKSIIYIIEKQKIEENQILSKN
CCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHCCC
SNIELYTYSPISGIVEKIYTANFPDGKNLKSALIKFQGKIKTEKTPIEEGASREKTLEKL
CCEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
IQLGIPWFNENSLFQFINKCKKIDKMILLTNGKDAFTNISEALMAEKLEEIFSGFQIIDK
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFKFKEIIIIISNKDKLKKEFEKLSIFKNRKIKIKSLENAYPYTNHEMIMHFLYNNKNTK
HHHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
DDINPHNNILLANIEDLYNANLVIKNNNPYKEKFVAINGNKKIKSRILKVKIGTSFSQLI
CCCCCCCCEEEEEHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEEECCCHHHHHCEEEEEECCCHHHHH
NEKIDTKKYEIFLNNPANKIKIDTLNIPITRDIYSLTILKKKSIYDKIKALFISSFAPLQ
HHHCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
MENIIFSFLKKEKINNSGKLKIFNYTDKEVEEEIHKVQKEIKSKILNESLTNEAIYTENN
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCC
LKDIYFAIILSLSPSLIFSFLNNTKFMTDTLLLIFISVAIYIPIMLKINYKCLSFFVYAA
CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHH
LMISIILPLDLEITLKIISLLFTFLVFFYFFRLSAFLANPILISFMFLVLNFPVSFKQAY
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
QEELKNSNSIIPTWNEIIETNPNIKNLKSLNTFTRYESKKIDAIENFVNQNIFSAFNIIV
HHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TRFHIESLLGVNNEKKISPILLYFGLLLIVGKYIINKLIPLSFYISLMAISYIAHNIGML
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NHISSDMLTLLISPIPMLLIFTMATELQITPHFKFEQILYGSILAFIYFLTLSYIPFETL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
SVIISIFILQTSSNLIKKYSLTFKIKKIMHVLKTNKEKALKTPLENEKDIIKL
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA