| Definition | Chlamydophila pneumoniae CWL029, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_000922 |
| Length | 1,230,230 |
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Identifier: 15618636
GI number: 15618636
Start: 810877
End: 813372
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: CPn0726
Alternate gene names: NA
Gene position: 813372-810877 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15618638
Following gene: 15618635
Centisome position: 66.12
GC content: 40.99
Gene sequence:
>2496_bases ATGATTTATAGCACTTCTATTTCAACATTTTATAAAAAACTCTCTCTAGTGTCTTCAATGCATTCTTTTGCACAAAGACA CAGGGAATCTTTAGAACATATCGCTAATTATGAGAAGACTACAGCGGAACGTGACATACTAAAACGGTTGATCGAAGTTT TGGATCAGAGGGCGAGCGAGCGCTACCGCTCTGCCGTCGAGAAGCTACACAAATATGAAGTGGAGCGTGCGACAGTAGCG AAGTCTATTCCTGTGGCAGCCATTCATGAGAAACCTCTTTCCTCTACACATGCATCTGTTCAGGTTACAGCAAGTACGCC AGCAGCTACAGGATCTGGAGTCGGGGCCTATTATAACGCAGTAAAACAGAAGTGGGCGCAAGATCTTATCGTTGAGCTTA ATACGGTTATGACCACTATCATGGCCTCAGTTAATAGTAAGAATCCTGCAAATAAAGATGTCTTTGATAAATTAAATACT GAACTTCAGGCTTTAGTCGCTGCGGGGAATAATTTAACAGAAGAGAATTTTCAGACTCTCTACAATTTCCCAGAGGAGAT CTTCACTGCAATCCAACGAGCAGATACGTTTACTGGGGGAATGAAAACAGACTTTACGAACCAGTTGGCAGGCAAATATG GAAATCAAGCTACTTTAACTCAAACGTTTGCAGACGGTAGAGTCGAAGGGTTCAAAGACATCCTTACAGCGGTACAAGGA GTCCTTACACCAGAGCAGTTTACTATCTTTGCTGAGATTGCGACAGAGCTGCAGGCTTTAGCAGATCATGTAGGTAATTT TGATGAAGCAGGATTACAACGGATTGAGGATGCTGGAGAAAAACTCGCCGCAGTCATTAATTCTTCTGACCTGACTAGAA ATGATAAAATTATGTTCTGTCAACATATAACAGACTTATACTCAGATCAAGTTGCGGCTTTAGGATCCTTTGATACGGTA CTTGATGCAAGTATCTATGTTAACCAGCATCAAGGAACGATGTTTTCCAATTTGTCTAGCTTTGTTGGCTCTTTAATTGG AACTTTTGCTCCAATTGATCTGAGTTCCTCTCAAGGTGATATTAGTAGTGCGGCTTTAGCTGGAGCTCTACAAACAGCCC GAGGGTTAAATTCTCGTTTCAATGAGTTAACTGCTGAGCAACAGAAACTGATTAATGAGTGTATAAAATCTTTGGTTACC TTTAAGTGTGGTGAGCACCTTGGTGCTATCTGGGCTTATTTTACAGCATCTACTGTAGTTGCTTTAAACCCTACTGCAAC CATGGACCACGTTAAAGCTGCTATCCTTGAAGAAGCTAAAGAATTAGATAACTCTAGTTTTCAGTTAGCATCATCTATAA AATCCGCGATGACTTCAATTGTAAATTCAAGCGGTTCCTTTTCCGTAACGGTGAACTCAAGTACCTTACAATATACTATA TATTCTGAGAAAAACGGCAAAGTTGAGATTAATCAAATCCTGTTAAATTATGGATCTACAGGATTTTTGCCAGAAATTAC GAAACTAGCAAAAACAAACGCCGAATCTACGGCACGAAGTTATTTTCGGTTTAAGGCTCTTGCTGCTGTAGAATCAGAAA ATGTACAGAACAAAATCGAAGATCTTCAGAGTCAATTGCAACAATTCACCAATATGAAAACAGAACTGTTTGATGGGCAA TTGTTATCACAGGCTAGTGAATTACGGGCTCTCCCCCTACCTTCGGCAGTCGCCTCTGTGTTGATCGATCGTTATATGCC TAAAGAGGTCGATTATCTAAATGAAATCTATAAGAAGCTATATTATAGCAACTTAGGATCTTCTATCGGAAATTCCATTA TTGATGCGATTTCTCAATATGTCAATGGAGCTACGTATTTCAATTTTGCTAGTTATGTGGGACAACAGCCGGCAGTAGGT GCTGGGGGAGCGAATGCCTTCCCAGGATCTCAAGAAAGCGCTCAGGCAAAGTTGGATCAGGAGCGAAAGCAAGCTGCTTT GTATCTCCAAGAAACACGGGGAGCTCTTACAGTTATTGAAGAACAAAGAGCTAGAGTGCTTAAAGATGATAAAATCACGA ATGAGCAGCGCTCCACGATTTTAGATTCCTTAAGGAACTACGAGGACAACATCAATTCTATCTCAGGTTCTTTAGTGTTA TTGCAAAATTACTTACAGCCTTTGTCTATAGCTGGAGGTTCTGTAGCAGGAACTTTTGAAGTTAAAGAGGGGCAAGAGCA ATGGCAAGCGCGATTGCAGATTCTTGAAGAAGCTTTAGTGTCCGGGTTAGTAGGAAATATGATTAATGGGGGTATGTTCC CACTGCAATCTACAATACAGTCAGACCAGCAATCTTTTGCGGATATGGGACAGAACTTCCAGTTAGATTTGCAGATGCAC CTGACTTCTATGCAGCAGGAGTGGACTGTAGTCGCGACTTCTCTACAGCTTTTAAATCAAATGTACTTAAGTTTAGCACG AAGCCTGACAGGATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TCTTTTTAAACATTTGACGAATTTTTTGAATTAAAAAAATAATTTATTAATGTTAATGTTAATTAAAAATAACACTGTTC TTATCTAAGCAGACATTGAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTCTTCAATTTCTAAACTTGGATTTCTAAATCTTAAAAAAATTTTAATCTTGCGGAGATGTTGGCATGTTTTTCGCTCCT CTTCTTTATGAATCGTTACG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 831; Mature: 831
Protein sequence:
>831_residues MIYSTSISTFYKKLSLVSSMHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVA KSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNT ELQALVAAGNNLTEENFQTLYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQG VLTPEQFTIFAEIATELQALADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTV LDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVT FKCGEHLGAIWAYFTASTVVALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTI YSEKNGKVEINQILLNYGSTGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQ LLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSIGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVG AGGANAFPGSQESAQAKLDQERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVL LQNYLQPLSIAGGSVAGTFEVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMH LTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG
Sequences:
>Translated_831_residues MIYSTSISTFYKKLSLVSSMHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVA KSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNT ELQALVAAGNNLTEENFQTLYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQG VLTPEQFTIFAEIATELQALADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTV LDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVT FKCGEHLGAIWAYFTASTVVALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTI YSEKNGKVEINQILLNYGSTGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQ LLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSIGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVG AGGANAFPGSQESAQAKLDQERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVL LQNYLQPLSIAGGSVAGTFEVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMH LTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG >Mature_831_residues MIYSTSISTFYKKLSLVSSMHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVA KSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNT ELQALVAAGNNLTEENFQTLYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQG VLTPEQFTIFAEIATELQALADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTV LDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVT FKCGEHLGAIWAYFTASTVVALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTI YSEKNGKVEINQILLNYGSTGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQ LLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSIGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVG AGGANAFPGSQESAQAKLDQERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVL LQNYLQPLSIAGGSVAGTFEVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMH LTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 91054; Mature: 91054
Theoretical pI: Translated: 4.83; Mature: 4.83
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIYSTSISTFYKKLSLVSSMHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASE CEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RYRSAVEKLHKYEVERATVAKSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHH VKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH YNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQG HCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH VLTPEQFTIFAEIATELQALADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFC CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH QHITDLYSDQVAALGSFDTVLDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGD HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC ISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTVV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE ALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTI EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCEEEEEE YSEKNGKVEINQILLNYGSTGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIE EECCCCCEEHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLQSQLQQFTNMKTELFDGQLLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKL HHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH YYSNLGSSIGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLDQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH ERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVL HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQNYLQPLSIAGGSVAGTFEVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQ HHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH SDQQSFADMGQNFQLDLQMHLTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG HHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MIYSTSISTFYKKLSLVSSMHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASE CEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RYRSAVEKLHKYEVERATVAKSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHH VKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH YNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQG HCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH VLTPEQFTIFAEIATELQALADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFC CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH QHITDLYSDQVAALGSFDTVLDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGD HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC ISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTVV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE ALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTI EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCEEEEEE YSEKNGKVEINQILLNYGSTGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIE EECCCCCEEHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLQSQLQQFTNMKTELFDGQLLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKL HHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH YYSNLGSSIGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLDQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH ERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVL HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQNYLQPLSIAGGSVAGTFEVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQ HHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH SDQQSFADMGQNFQLDLQMHLTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG HHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA