Definition Chlamydophila pneumoniae CWL029, complete genome.
Accession NC_000922
Length 1,230,230

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Identifier: 15618636

GI number: 15618636

Start: 810877

End: 813372

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: CPn0726

Alternate gene names: NA

Gene position: 813372-810877 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15618638

Following gene: 15618635

Centisome position: 66.12

GC content: 40.99

Gene sequence:

>2496_bases
ATGATTTATAGCACTTCTATTTCAACATTTTATAAAAAACTCTCTCTAGTGTCTTCAATGCATTCTTTTGCACAAAGACA
CAGGGAATCTTTAGAACATATCGCTAATTATGAGAAGACTACAGCGGAACGTGACATACTAAAACGGTTGATCGAAGTTT
TGGATCAGAGGGCGAGCGAGCGCTACCGCTCTGCCGTCGAGAAGCTACACAAATATGAAGTGGAGCGTGCGACAGTAGCG
AAGTCTATTCCTGTGGCAGCCATTCATGAGAAACCTCTTTCCTCTACACATGCATCTGTTCAGGTTACAGCAAGTACGCC
AGCAGCTACAGGATCTGGAGTCGGGGCCTATTATAACGCAGTAAAACAGAAGTGGGCGCAAGATCTTATCGTTGAGCTTA
ATACGGTTATGACCACTATCATGGCCTCAGTTAATAGTAAGAATCCTGCAAATAAAGATGTCTTTGATAAATTAAATACT
GAACTTCAGGCTTTAGTCGCTGCGGGGAATAATTTAACAGAAGAGAATTTTCAGACTCTCTACAATTTCCCAGAGGAGAT
CTTCACTGCAATCCAACGAGCAGATACGTTTACTGGGGGAATGAAAACAGACTTTACGAACCAGTTGGCAGGCAAATATG
GAAATCAAGCTACTTTAACTCAAACGTTTGCAGACGGTAGAGTCGAAGGGTTCAAAGACATCCTTACAGCGGTACAAGGA
GTCCTTACACCAGAGCAGTTTACTATCTTTGCTGAGATTGCGACAGAGCTGCAGGCTTTAGCAGATCATGTAGGTAATTT
TGATGAAGCAGGATTACAACGGATTGAGGATGCTGGAGAAAAACTCGCCGCAGTCATTAATTCTTCTGACCTGACTAGAA
ATGATAAAATTATGTTCTGTCAACATATAACAGACTTATACTCAGATCAAGTTGCGGCTTTAGGATCCTTTGATACGGTA
CTTGATGCAAGTATCTATGTTAACCAGCATCAAGGAACGATGTTTTCCAATTTGTCTAGCTTTGTTGGCTCTTTAATTGG
AACTTTTGCTCCAATTGATCTGAGTTCCTCTCAAGGTGATATTAGTAGTGCGGCTTTAGCTGGAGCTCTACAAACAGCCC
GAGGGTTAAATTCTCGTTTCAATGAGTTAACTGCTGAGCAACAGAAACTGATTAATGAGTGTATAAAATCTTTGGTTACC
TTTAAGTGTGGTGAGCACCTTGGTGCTATCTGGGCTTATTTTACAGCATCTACTGTAGTTGCTTTAAACCCTACTGCAAC
CATGGACCACGTTAAAGCTGCTATCCTTGAAGAAGCTAAAGAATTAGATAACTCTAGTTTTCAGTTAGCATCATCTATAA
AATCCGCGATGACTTCAATTGTAAATTCAAGCGGTTCCTTTTCCGTAACGGTGAACTCAAGTACCTTACAATATACTATA
TATTCTGAGAAAAACGGCAAAGTTGAGATTAATCAAATCCTGTTAAATTATGGATCTACAGGATTTTTGCCAGAAATTAC
GAAACTAGCAAAAACAAACGCCGAATCTACGGCACGAAGTTATTTTCGGTTTAAGGCTCTTGCTGCTGTAGAATCAGAAA
ATGTACAGAACAAAATCGAAGATCTTCAGAGTCAATTGCAACAATTCACCAATATGAAAACAGAACTGTTTGATGGGCAA
TTGTTATCACAGGCTAGTGAATTACGGGCTCTCCCCCTACCTTCGGCAGTCGCCTCTGTGTTGATCGATCGTTATATGCC
TAAAGAGGTCGATTATCTAAATGAAATCTATAAGAAGCTATATTATAGCAACTTAGGATCTTCTATCGGAAATTCCATTA
TTGATGCGATTTCTCAATATGTCAATGGAGCTACGTATTTCAATTTTGCTAGTTATGTGGGACAACAGCCGGCAGTAGGT
GCTGGGGGAGCGAATGCCTTCCCAGGATCTCAAGAAAGCGCTCAGGCAAAGTTGGATCAGGAGCGAAAGCAAGCTGCTTT
GTATCTCCAAGAAACACGGGGAGCTCTTACAGTTATTGAAGAACAAAGAGCTAGAGTGCTTAAAGATGATAAAATCACGA
ATGAGCAGCGCTCCACGATTTTAGATTCCTTAAGGAACTACGAGGACAACATCAATTCTATCTCAGGTTCTTTAGTGTTA
TTGCAAAATTACTTACAGCCTTTGTCTATAGCTGGAGGTTCTGTAGCAGGAACTTTTGAAGTTAAAGAGGGGCAAGAGCA
ATGGCAAGCGCGATTGCAGATTCTTGAAGAAGCTTTAGTGTCCGGGTTAGTAGGAAATATGATTAATGGGGGTATGTTCC
CACTGCAATCTACAATACAGTCAGACCAGCAATCTTTTGCGGATATGGGACAGAACTTCCAGTTAGATTTGCAGATGCAC
CTGACTTCTATGCAGCAGGAGTGGACTGTAGTCGCGACTTCTCTACAGCTTTTAAATCAAATGTACTTAAGTTTAGCACG
AAGCCTGACAGGATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTTTTTAAACATTTGACGAATTTTTTGAATTAAAAAAATAATTTATTAATGTTAATGTTAATTAAAAATAACACTGTTC
TTATCTAAGCAGACATTGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCTTCAATTTCTAAACTTGGATTTCTAAATCTTAAAAAAATTTTAATCTTGCGGAGATGTTGGCATGTTTTTCGCTCCT
CTTCTTTATGAATCGTTACG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 831; Mature: 831

Protein sequence:

>831_residues
MIYSTSISTFYKKLSLVSSMHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVA
KSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNT
ELQALVAAGNNLTEENFQTLYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQG
VLTPEQFTIFAEIATELQALADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTV
LDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVT
FKCGEHLGAIWAYFTASTVVALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTI
YSEKNGKVEINQILLNYGSTGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQ
LLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSIGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVG
AGGANAFPGSQESAQAKLDQERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVL
LQNYLQPLSIAGGSVAGTFEVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMH
LTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG

Sequences:

>Translated_831_residues
MIYSTSISTFYKKLSLVSSMHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVA
KSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNT
ELQALVAAGNNLTEENFQTLYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQG
VLTPEQFTIFAEIATELQALADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTV
LDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVT
FKCGEHLGAIWAYFTASTVVALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTI
YSEKNGKVEINQILLNYGSTGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQ
LLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSIGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVG
AGGANAFPGSQESAQAKLDQERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVL
LQNYLQPLSIAGGSVAGTFEVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMH
LTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG
>Mature_831_residues
MIYSTSISTFYKKLSLVSSMHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVA
KSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNT
ELQALVAAGNNLTEENFQTLYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQG
VLTPEQFTIFAEIATELQALADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTV
LDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVT
FKCGEHLGAIWAYFTASTVVALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTI
YSEKNGKVEINQILLNYGSTGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQ
LLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSIGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVG
AGGANAFPGSQESAQAKLDQERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVL
LQNYLQPLSIAGGSVAGTFEVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMH
LTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91054; Mature: 91054

Theoretical pI: Translated: 4.83; Mature: 4.83

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIYSTSISTFYKKLSLVSSMHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASE
CEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RYRSAVEKLHKYEVERATVAKSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHH
VKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
YNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQG
HCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
VLTPEQFTIFAEIATELQALADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFC
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH
QHITDLYSDQVAALGSFDTVLDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGD
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
ISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEE
ALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTI
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCEEEEEE
YSEKNGKVEINQILLNYGSTGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIE
EECCCCCEEHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DLQSQLQQFTNMKTELFDGQLLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKL
HHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
YYSNLGSSIGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLDQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
ERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQNYLQPLSIAGGSVAGTFEVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQ
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
SDQQSFADMGQNFQLDLQMHLTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG
HHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MIYSTSISTFYKKLSLVSSMHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASE
CEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RYRSAVEKLHKYEVERATVAKSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHH
VKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
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SDQQSFADMGQNFQLDLQMHLTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG
HHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA