Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is Not Available

Identifier: 15645155

GI number: 15645155

Start: 561625

End: 563232

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: HP0529

Alternate gene names: NA

Gene position: 563232-561625 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15645156

Following gene: 15645154

Centisome position: 33.77

GC content: 36.13

Gene sequence:

>1608_bases
ATGTTTAATATTAAAAGGAATTTTTTAATAACGATCATAAGTTTTTTTCTCATTGTTCCTAATTGGTTGAAAGCTATTGA
TTTGCCCATTGTTTCAAATCTCAAAATTTACCAAACAGTTTATTGCATGCTGATACCGAGTTATGTTTTAACCAACAAAA
GTTTTGCAGATATTTTAACAGGCTATACATCTATTGGTGCATCAGGGAGTGGAAAGAGTTCAGGGCAGGGTGTGATTGAA
GCGCTTAGCACACCATTAGCCACAAGTTTAGCCGCTAGCAATCTGGTGAAATATTTGAATACTTTAGGTCCTTTATGGGG
ATCGGCGTGGGCAAGTGTTGCTACAGCTATACAAGGTTTTGCTCTAACGCCATCAAGTGGCTGTAATTTTGGTTGGAACG
CATTGATAAATAAAAACATAGATGTATCCATGGATAGCGTGCTAGACAATTTGAGCAACAAAATTCAGAATTTTACCAAA
GGCGGTGTTGAGGACAATGTGAAAGGCAATATTCTTTTACAAATAATTGGCTCAATAACCGCTCAAGCTTCTACGAATAT
TACAGCTGATGGTTTAATTTGGCTGATTGGTAAAGAATTCACTGCAAATAAACTGCAAAACAACACTACAGCCATGCTTG
CTTTTGCCGCATTAGAATCTGTTGTCAAAGGAGCGGACGCTGCTGTTCTTCCTGCATATGGTGTAGTCAATCTGCCTGAT
ATTATCATAGGGCAAGGGTCATATCTTGATTTTGTTTCTTACCTAATTTATATCGTTTTTGGGATTTTTGTTTTTATTTC
TTTTATGAAATTGAGGGATATTTCAAGTAACATTCAGATTAACATAGGTTTTGAATACATGCGATTTGTTGGGGGGACAT
TATTCAAAATGGCGATGGTCTCTTTTATCGCCTATGCAGGTTTTGGTTATCTTTATAAAATCTCTTATTCTATTTATTTT
GGTTTAGCAGGCGCTTTTGGGCTGAATCAAGTTCTTTTTTGGGCTTTAGATTTAGTGCTGAATTACACTGTTAATTCAAT
TTTACCTGCGGTAAGAGCTGTTTTTTCTAATGTTGGCAACAACGCTCCTAGTTTGTTACAAGGCTTGCAAGTGGCAGGTA
TTTCTTTATTCGCCATTTTTATGCAAGTAACTATCATTATGAGAATAAGCACTGTTGTTGTGAAACCTTTGATAGCTGGG
GCTTTTAGCGGTATTGTGTTCCCTATTGCAGTAAGTTTGATCGTGCTAGATTGGTTCAAAGATTCTATGAAAAACATATT
GATATGGTTTATTAATAATTTGTTTATCTTGGTTCTAGCTATTCCTATTTTGCTCTTTGGTGTTTTGGCATTATTGGCAT
TCAATTTGACCATAACGCCCTCTGTTGCTATACAAAACATCAATCAAGGGGGACTAGGTATCGATTCAACTATTGCGAGT
TTGATCACCCTATTTATTTTAAAAGGTTTCATAGAGACGATTATTGAGAGCGTCAATGCGATCGTTAATACCATTTTTAG
CTCTGTTTCTATGGATGGTAGCAGAATGGATAGAGAAAGAGATGCCTTAATGGTTGGAAGAGTTGGTGGATCTATGTTTA
AAGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTCAAATCACAGATTTACAAAACGAACAGACGGTAAGCGAAATTTTGAGAAAGATCAGAGAAGTGGAATCAAAAAATAA
GGCATTAAATAAATAAGAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCCACTTTATTCTTGTGTTACAATTACAAATATTTTTTAAGAGGAATTGTTGATGGGGCAGGCATTTTTTAAAAAAATTG
TTGGCTGTTTCTGTCTTGGT

Product: cag pathogenicity island protein (cag9)

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 535; Mature: 535

Protein sequence:

>535_residues
MFNIKRNFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILTGYTSIGASGSGKSSGQGVIE
ALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGFALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSVLDNLSNKIQNFTK
GGVEDNVKGNILLQIIGSITAQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPD
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISSNIQINIGFEYMRFVGGTLFKMAMVSFIAYAGFGYLYKISYSIYF
GLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGNNAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAG
AFSGIVFPIAVSLIVLDWFKDSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGRVGGSMFKG

Sequences:

>Translated_535_residues
MFNIKRNFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILTGYTSIGASGSGKSSGQGVIE
ALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGFALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSVLDNLSNKIQNFTK
GGVEDNVKGNILLQIIGSITAQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPD
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISSNIQINIGFEYMRFVGGTLFKMAMVSFIAYAGFGYLYKISYSIYF
GLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGNNAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAG
AFSGIVFPIAVSLIVLDWFKDSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGRVGGSMFKG
>Mature_535_residues
MFNIKRNFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILTGYTSIGASGSGKSSGQGVIE
ALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGFALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSVLDNLSNKIQNFTK
GGVEDNVKGNILLQIIGSITAQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPD
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISSNIQINIGFEYMRFVGGTLFKMAMVSFIAYAGFGYLYKISYSIYF
GLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGNNAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAG
AFSGIVFPIAVSLIVLDWFKDSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGRVGGSMFKG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57738; Mature: 57738

Theoretical pI: Translated: 9.05; Mature: 9.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFNIKRNFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
GYTSIGASGSGKSSGQGVIEALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGF
HHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
ALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSVLDNLSNKIQNFTKGGVEDNVKGNILLQIIGSIT
EECCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
AQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPD
HHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCH
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISSNIQINIGFEYMRFVGGTLFKMAMV
HEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFIAYAGFGYLYKISYSIYFGLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGN
HHHHHHCCHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAGAFSGIVFPIAVSLIVLDWFK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGRVGGSMFKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHEEEECCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFNIKRNFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
GYTSIGASGSGKSSGQGVIEALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGF
HHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
ALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSVLDNLSNKIQNFTKGGVEDNVKGNILLQIIGSIT
EECCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
AQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPD
HHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCH
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISSNIQINIGFEYMRFVGGTLFKMAMV
HEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFIAYAGFGYLYKISYSIYFGLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGN
HHHHHHCCHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAGAFSGIVFPIAVSLIVLDWFK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGRVGGSMFKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHEEEECCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA