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The map label for this gene is gap1

Identifier: 13508058

GI number: 13508058

Start: 378658

End: 380169

Strand: Direct

Name: gap1

Synonym: MPN319

Alternate gene names: NA

Gene position: 378658-380169 (Clockwise)

Preceding gene: 13508057

Following gene: 161723289

Centisome position: 46.38

GC content: 41.01

Gene sequence:

>1512_bases
ATGTCACACCAAGAGCAGTTACATAAACCTAACCGGCAACAGTTTAGCGAAAAGCAATTTATTGCTTTTGCTTTTAACTA
TGTTGCTGGGTTCGGCTTTATTTCCGTGGTGCTAACCATGTTTAAGCTTGGCCCGTTTTCTTACTTGATCCTAGGGCTAG
CAGCTTTAGGTATTTTGGGGGTAATGTTGTCCTTTTCGCGCCTTTCAATTATTTGTGGTAGCAAGGCTTACGGTGGTAGT
TATTTAATAGCCAAAAAAGCACTTGGTGTGAAAACAATCACGGCGCGTTTCTTTACTTTTTTGAGTGGTTGAAATGTTTC
CTTAACCGGTCCTTTTAATGGGTTAATTGTGCCAGCGGTGCTAGTTCTCTCGTTTGCTGATATTAAAGCAGTGAAGGATA
ACAATGGTGCTTTAATTGGCTTACTGGTCGGGGGCTTTGTTTTATTTGGGGCATTAAACTTCATCTCCCTGTTTGGCCTT
AAAATGAATAAGAACGCCATTCTCTTCTTTGCCATAGTGAAGTGAGTAGTTGTTCTGGGCGGTTTAATTTTGGGAATCTA
CCTCATCGGTACGAACCACGGCCATGGTTTTGTCGAAAACAACACTTTAGGTGAACACATTGAAGATCTCAGTTTCCTTA
AAGTTATTTCTACTACTGTGGGGATGTTGGTGGCCTTTGCTGGTACCGAAGATCTTACTGCGATTACCCCGGATGTGAAG
TCAAAAAACATCCGTAAGTGTTTCTTATTGATGTTTGGTGCAGTTACCCTGCTTTATCTAATCGGTTTTGTCATTATTAG
TGGGATTTCTGGTTTAAATGGTTATGGCCTTGATGGTAAAGAAAAGAATGAAAAAGCGATTAACACCTTTGGTTCGATTT
ACTTTCAAGCAGGCGGTAAGTATTTAGGCATCCCACTGTTGGTCATCTTTGGTCTGGGTTTTTTACTCAATTCCTTGGCA
TCACGATTAGGCATGACCATTACGACAGCGCGCAAATACGTTGCGTTAGCCCAAGATGGTTTCTTGCCGTCCTTTATTAA
CGAACAAAACAAGCACCACGAGTACCATAAGGCAGTGTGAGCTAGCAACATTATGACCTTAGCAGTGATGGTGCTGATGA
TCATTGTCCCCTTTTTACCTAATGATGAAAACCCCGGTAAACAGCTCGTTATGTTCGATGCCATTAGTGTTTTAGTTGAA
GTGGCGATTGAACTAGCAGTGTTAATTTCCTTAATCCAGTACTTTATTACCTACATCTTCTTCTTTATGATTCTGGCCAA
AAAAGAGGGTAGTGCCAGTGTTTCGTGATGGGAAATTGCCAGTTATGGCGTAAGCTTTGCCATTATTACGGTTTTGTTGT
TTGTTAACCTCTTTCCTATAACGGCTTGAAAGAACACCAACACCTTTAAGCTAAGTATCCTAGCGGCCTTCTTTGCCTTG
GGTATTGGCTTCTTTATCCACTCGGAAATAAAACACAAAGGACAATTAGTCAAGTCAGTCGAGTGTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAATACCCTCACTTTAGTGGTGTATGGGGTGTTGATTTTAATTGGATTTGCCCTCTTTATGACCCAAGAATATAAGCG
CAATAAACAAAAGGAAAGCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATCACTCCATTAAACCGGTAGAAAAAGCCGTCACGCATTTCGGGTGGCGGTTTTTTCTTGTTCTTTTGACTGCCATAAG
ACAAAAAATACAAAAAGCAT

Product: amino acid permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 503; Mature: 502

Protein sequence:

>503_residues
MSHQEQLHKPNRQQFSEKQFIAFAFNYVAGFGFISVVLTMFKLGPFSYLILGLAALGILGVMLSFSRLSIICGSKAYGGS
YLIAKKALGVKTITARFFTFLSGWNVSLTGPFNGLIVPAVLVLSFADIKAVKDNNGALIGLLVGGFVLFGALNFISLFGL
KMNKNAILFFAIVKWVVVLGGLILGIYLIGTNHGHGFVENNTLGEHIEDLSFLKVISTTVGMLVAFAGTEDLTAITPDVK
SKNIRKCFLLMFGAVTLLYLIGFVIISGISGLNGYGLDGKEKNEKAINTFGSIYFQAGGKYLGIPLLVIFGLGFLLNSLA
SRLGMTITTARKYVALAQDGFLPSFINEQNKHHEYHKAVWASNIMTLAVMVLMIIVPFLPNDENPGKQLVMFDAISVLVE
VAIELAVLISLIQYFITYIFFFMILAKKEGSASVSWWEIASYGVSFAIITVLLFVNLFPITAWKNTNTFKLSILAAFFAL
GIGFFIHSEIKHKGQLVKSVECN

Sequences:

>Translated_503_residues
MSHQEQLHKPNRQQFSEKQFIAFAFNYVAGFGFISVVLTMFKLGPFSYLILGLAALGILGVMLSFSRLSIICGSKAYGGS
YLIAKKALGVKTITARFFTFLSG*NVSLTGPFNGLIVPAVLVLSFADIKAVKDNNGALIGLLVGGFVLFGALNFISLFGL
KMNKNAILFFAIVK*VVVLGGLILGIYLIGTNHGHGFVENNTLGEHIEDLSFLKVISTTVGMLVAFAGTEDLTAITPDVK
SKNIRKCFLLMFGAVTLLYLIGFVIISGISGLNGYGLDGKEKNEKAINTFGSIYFQAGGKYLGIPLLVIFGLGFLLNSLA
SRLGMTITTARKYVALAQDGFLPSFINEQNKHHEYHKAV*ASNIMTLAVMVLMIIVPFLPNDENPGKQLVMFDAISVLVE
VAIELAVLISLIQYFITYIFFFMILAKKEGSASVS*WEIASYGVSFAIITVLLFVNLFPITA*KNTNTFKLSILAAFFAL
GIGFFIHSEIKHKGQLVKSVECN
>Mature_502_residues
SHQEQLHKPNRQQFSEKQFIAFAFNYVAGFGFISVVLTMFKLGPFSYLILGLAALGILGVMLSFSRLSIICGSKAYGGSY
LIAKKALGVKTITARFFTFLSG*NVSLTGPFNGLIVPAVLVLSFADIKAVKDNNGALIGLLVGGFVLFGALNFISLFGLK
MNKNAILFFAIVK*VVVLGGLILGIYLIGTNHGHGFVENNTLGEHIEDLSFLKVISTTVGMLVAFAGTEDLTAITPDVKS
KNIRKCFLLMFGAVTLLYLIGFVIISGISGLNGYGLDGKEKNEKAINTFGSIYFQAGGKYLGIPLLVIFGLGFLLNSLAS
RLGMTITTARKYVALAQDGFLPSFINEQNKHHEYHKAV*ASNIMTLAVMVLMIIVPFLPNDENPGKQLVMFDAISVLVEV
AIELAVLISLIQYFITYIFFFMILAKKEGSASVS*WEIASYGVSFAIITVLLFVNLFPITA*KNTNTFKLSILAAFFALG
IGFFIHSEIKHKGQLVKSVECN

Specific function: Unknown

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.genitalium MG225 [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004841
- InterPro:   IPR002293 [H]

Pfam domain/function: PF00324 AA_permease [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53940; Mature: 53809

Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSHQEQLHKPNRQQFSEKQFIAFAFNYVAGFGFISVVLTMFKLGPFSYLILGLAALGILG
CCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VMLSFSRLSIICGSKAYGGSYLIAKKALGVKTITARFFTFLSGNVSLTGPFNGLIVPAVL
HHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHHH
VLSFADIKAVKDNNGALIGLLVGGFVLFGALNFISLFGLKMNKNAILFFAIVKVVVLGGL
HHHHHHHHEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ILGIYLIGTNHGHGFVENNTLGEHIEDLSFLKVISTTVGMLVAFAGTEDLTAITPDVKSK
HHHHHHEECCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCC
NIRKCFLLMFGAVTLLYLIGFVIISGISGLNGYGLDGKEKNEKAINTFGSIYFQAGGKYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCH
GIPLLVIFGLGFLLNSLASRLGMTITTARKYVALAQDGFLPSFINEQNKHHEYHKAVASN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
IMTLAVMVLMIIVPFLPNDENPGKQLVMFDAISVLVEVAIELAVLISLIQYFITYIFFFM
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILAKKEGSASVSWEIASYGVSFAIITVLLFVNLFPITAKNTNTFKLSILAAFFALGIGFF
HHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IHSEIKHKGQLVKSVECN
HHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SHQEQLHKPNRQQFSEKQFIAFAFNYVAGFGFISVVLTMFKLGPFSYLILGLAALGILG
CCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VMLSFSRLSIICGSKAYGGSYLIAKKALGVKTITARFFTFLSGNVSLTGPFNGLIVPAVL
HHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHHH
VLSFADIKAVKDNNGALIGLLVGGFVLFGALNFISLFGLKMNKNAILFFAIVKVVVLGGL
HHHHHHHHEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ILGIYLIGTNHGHGFVENNTLGEHIEDLSFLKVISTTVGMLVAFAGTEDLTAITPDVKSK
HHHHHHEECCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCC
NIRKCFLLMFGAVTLLYLIGFVIISGISGLNGYGLDGKEKNEKAINTFGSIYFQAGGKYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCH
GIPLLVIFGLGFLLNSLASRLGMTITTARKYVALAQDGFLPSFINEQNKHHEYHKAVASN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
IMTLAVMVLMIIVPFLPNDENPGKQLVMFDAISVLVEVAIELAVLISLIQYFITYIFFFM
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILAKKEGSASVSWEIASYGVSFAIITVLLFVNLFPITAKNTNTFKLSILAAFFALGIGFF
HHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IHSEIKHKGQLVKSVECN
HHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8948633 [H]