| Definition | Mycoplasma pneumoniae M129, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_000912 |
| Length | 816,394 |
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The map label for this gene is 13508057
Identifier: 13508057
GI number: 13508057
Start: 377208
End: 378683
Strand: Direct
Name: 13508057
Synonym: MPN318
Alternate gene names: NA
Gene position: 377208-378683 (Clockwise)
Preceding gene: 13508056
Following gene: 13508058
Centisome position: 46.2
GC content: 38.14
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TGATTTAAAGGAGCTGGGACTGAAATACGTCAAACAGCAAACCGGATTTAATTATTAGTGGTCTTTCTTCTTTAGAATAA GCTAACTAATAAGAAGGTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases ACCTAACCGGCAACAGTTTAGCGAAAAGCAATTTATTGCTTTTGCTTTTAACTATGTTGCTGGGTTCGGCTTTATTTCCG TGGTGCTAACCATGTTTAAG
Product: amino acid permease
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 491; Mature: 490
Protein sequence:
>491_residues MAVASKKFTERQFLFFVVNYIAGFGFISTALSLFELGPLSWVIFFLVSLISLIVTLAFARVSAIDKNNYGGAYLWAKKAF NSERYSHRLFIFFTGWNNFIASPLYAAIAPLFILSAFKGIDGIQGNAANTWILIAAGFTFYLLLAFLSTKGTSLNKKLIA VFASIKWAVLLSTLIVALIVIGKNGNGYAINNDIKQGPFKEREITLGAVATVFITFFYSYSGAEDISTMTPDVKTTNFRK ILIISFIAVFLFYFVGILIFNGLLNVSQSDDDKGKDGRIASVADIFRLAGGLGALIFYGVGALFNNVSTRLSTIIANSRK ILPLAQDNYLPTTFSKANSKGEFQNAIWFTFGTTIITMTVLFFVPLITSNFDFDKSTEYASSIGSAATLVQYILVFFIIF RLIYKKEQLYQKNWTRELEQILFGIGVFIILLMLLFYLFPVIDGKTKWQLKNTLTLVVYGVLILIGFALFMTQEYKRNKQ KESYVTPRAVT
Sequences:
>Translated_491_residues MAVASKKFTERQFLFFVVNYIAGFGFISTALSLFELGPLS*VIFFLVSLISLIVTLAFARVSAIDKNNYGGAYL*AKKAF NSERYSHRLFIFFTG*NNFIASPLYAAIAPLFILSAFKGIDGIQGNAANT*ILIAAGFTFYLLLAFLSTKGTSLNKKLIA VFASIKWAVLLSTLIVALIVIGKNGNGYAINNDIKQGPFKEREITLGAVATVFITFFYSYSGAEDISTMTPDVKTTNFRK ILIISFIAVFLFYFVGILIFNGLLNVSQSDDDKGKDGRIASVADIFRLAGGLGALIFYGVGALFNNVSTRLSTIIANSRK ILPLAQDNYLPTTFSKANSKGEFQNAIWFTFGTTIITMTVLFFVPLITSNFDFDKSTEYASSIGSAATLVQYILVFFIIF RLIYKKEQLYQKNWTRELEQILFGIGVFIILLMLLFYLFPVIDGKTKWQLKNTLTLVVYGVLILIGFALFMTQEYKRNKQ KESYVTPRAVT >Mature_490_residues AVASKKFTERQFLFFVVNYIAGFGFISTALSLFELGPLS*VIFFLVSLISLIVTLAFARVSAIDKNNYGGAYL*AKKAFN SERYSHRLFIFFTG*NNFIASPLYAAIAPLFILSAFKGIDGIQGNAANT*ILIAAGFTFYLLLAFLSTKGTSLNKKLIAV FASIKWAVLLSTLIVALIVIGKNGNGYAINNDIKQGPFKEREITLGAVATVFITFFYSYSGAEDISTMTPDVKTTNFRKI LIISFIAVFLFYFVGILIFNGLLNVSQSDDDKGKDGRIASVADIFRLAGGLGALIFYGVGALFNNVSTRLSTIIANSRKI LPLAQDNYLPTTFSKANSKGEFQNAIWFTFGTTIITMTVLFFVPLITSNFDFDKSTEYASSIGSAATLVQYILVFFIIFR LIYKKEQLYQKNWTRELEQILFGIGVFIILLMLLFYLFPVIDGKTKWQLKNTLTLVVYGVLILIGFALFMTQEYKRNKQK ESYVTPRAVT
Specific function: Unknown
COG id: COG0531
COG function: function code E; Amino acid transporters
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To M.genitalium MG226 [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004841 - InterPro: IPR002293 [H]
Pfam domain/function: PF00324 AA_permease [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 54108; Mature: 53977
Theoretical pI: Translated: 10.15; Mature: 10.15
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 1.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 0.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAVASKKFTERQFLFFVVNYIAGFGFISTALSLFELGPLSVIFFLVSLISLIVTLAFARV CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SAIDKNNYGGAYLAKKAFNSERYSHRLFIFFTGNNFIASPLYAAIAPLFILSAFKGIDGI HHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC QGNAANTILIAAGFTFYLLLAFLSTKGTSLNKKLIAVFASIKWAVLLSTLIVALIVIGKN CCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GNGYAINNDIKQGPFKEREITLGAVATVFITFFYSYSGAEDISTMTPDVKTTNFRKILII CCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH SFIAVFLFYFVGILIFNGLLNVSQSDDDKGKDGRIASVADIFRLAGGLGALIFYGVGALF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNVSTRLSTIIANSRKILPLAQDNYLPTTFSKANSKGEFQNAIWFTFGTTIITMTVLFFV HHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLITSNFDFDKSTEYASSIGSAATLVQYILVFFIIFRLIYKKEQLYQKNWTRELEQILFG HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGVFIILLMLLFYLFPVIDGKTKWQLKNTLTLVVYGVLILIGFALFMTQEYKRNKQKESY HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHC VTPRAVT CCCCCCC >Mature Secondary Structure AVASKKFTERQFLFFVVNYIAGFGFISTALSLFELGPLSVIFFLVSLISLIVTLAFARV CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SAIDKNNYGGAYLAKKAFNSERYSHRLFIFFTGNNFIASPLYAAIAPLFILSAFKGIDGI HHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC QGNAANTILIAAGFTFYLLLAFLSTKGTSLNKKLIAVFASIKWAVLLSTLIVALIVIGKN CCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GNGYAINNDIKQGPFKEREITLGAVATVFITFFYSYSGAEDISTMTPDVKTTNFRKILII CCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH SFIAVFLFYFVGILIFNGLLNVSQSDDDKGKDGRIASVADIFRLAGGLGALIFYGVGALF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNVSTRLSTIIANSRKILPLAQDNYLPTTFSKANSKGEFQNAIWFTFGTTIITMTVLFFV HHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLITSNFDFDKSTEYASSIGSAATLVQYILVFFIIFRLIYKKEQLYQKNWTRELEQILFG HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGVFIILLMLLFYLFPVIDGKTKWQLKNTLTLVVYGVLILIGFALFMTQEYKRNKQKESY HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHC VTPRAVT CCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8948633 [H]