| Definition | Mycoplasma pneumoniae M129, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_000912 |
| Length | 816,394 |
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The map label for this gene is 13508047
Identifier: 13508047
GI number: 13508047
Start: 362400
End: 364097
Strand: Direct
Name: 13508047
Synonym: MPN308
Alternate gene names: NA
Gene position: 362400-364097 (Clockwise)
Preceding gene: 13508046
Following gene: 13508048
Centisome position: 44.39
GC content: 41.34
Gene sequence:
>1698_bases ATGAAACAACAAAAACCCAAAATTAGCTTTATAGCAGCGATGCTAATTGTTATCGGCTCGTCCATAGGTGCTGGTATCTT TTTTAAATCCAGCACTGTTTTGGAAAATTCCCAGGCCTCTTTAGTGCTAGCGATTTTTAACTGGTTGGTAGCTTCAGTGG CAGTGATTGCTATGGCCTTGGCATTAATTGAAATTGCCAGTGTTCGCAACGATAATCTCTCGATTATTAGCTGGGTCAAA GTGTTTAACCGGCGCTGGTTGTACCATGGTTGTAAGAATTTTATGACCTATTTGTACCTACCGTTGACCTTCTTCTTTAT GCCGCTGTACTTTATCTGTTCCATTCAAGATGGGTTTCGCGGTTTGTTGGGACTGGAAACCGGAGCGCATTTCAATACTA GTGTGGACTGGTTAATCTGGTTAGCTTTAGCACTTATTATTACCACTTACTTCTTGACAATTCCACCACTGTACGCTAAG GTAGGGAACATCCAAAACATGGTGGTAAGCGCCGTGAAGTTTATTCCTTTAGTGTTTGTGCCTATCATCGGTTTTATTGT AGCGGGTACAGGTAACGGTGAATTAAAAAACGTTAAGGCATTAGTGCAACCCCCACAAATTAATGGTGCGACTGCTTCCT TTACCCAATTAGTACAAGCGGGGTATGGAATTACTCGTTTTACGGGAATTGGTGCTGGGATGGGTTCCTTTATTTCGATT GCCGCCATTTTCTTTGCGTACGATGGTTTTTACGTAACAGCTGGACTGCAGTCAGAGATGCGTGAACCGAAAAAAACACC GTGAGCTTTGTTTTTAGGTTTACTAATTACTACGCTGTTTTACCTTATCTTAGCAGTGGCACTTTCCATTAACGGTGGTT TGTTTAGTGGTATGGAAGAGTCCATGGGAAAGCTGTTTAACAATAAGCGTGCCGGGCAAATTGTCTTTGGTGTTGTTAAC CTAATGATTGGCATAGGTGTCTTGGGTATTATTAACGGTTTTGCACTGTGAGCACCACGGTTTGTGGAAGACTTATTAGC CCAAGGTGATTTACCTTTTTGAAAGCAAGTGCAGGGCAGATTGAACCCCAACAAGCCAGTGGTGGGGGTAATTTACTGTT TGGTACTTTCTTTGACTGTTCAAGTGCTGTTTACGGTAATAGGTGCTTTGGCTTACCTCCCGACAGTAGCGGATTACAAA AATTACGTTAACACTGAAATTGACAAGCTCAATTCGATGCAATGGTTGTATTCGTTTTCCGATTTAATGGCTACTTGAAC TTCGCTGTTTACCTTCGCCTTTATTGCCTGTGCCATCTTTGGTGCCATTGTTAATCGCAAAACCAAGAAGATTACGATTG CCAATCCAAAGCGTTATTTTCTCCCAGCGGCTTGGATTGCCGTAGTGGTTAACTGCATTAGTGTTTTTGTAACTATCATT GAGCCCTTCATTAACCTCTTTTTACTGTTTGGTTATGATGAAACAGTGGCACACACAGTGCTGGGTAATGACTTCATTGA ATTGAATGAATTAGTGATAGGACGGGTAATGCTGATAGTAGTGTTAGTTTTCTTTGCCATAATTAGCTTTCTCCCTGTTT ATGTGGAGGATCAATACCACAAACGTAAGTTTGGTAGTTTAGCTAACTATCAGCAATATGTACAACAACATTTAGCACAC TCCACCATTAACGGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTGTCCAGTCGGGTACCAATAAGACGGCCATTATTGCCCAATTAGACCAATTAGCTGCGGCCATTGCGGGCAAGATTGGT ACTAAAATTGTCAAGTAGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAGTTTTGTAAGGCTTGCAAGCTTTGCCGTCATTTTCATTTAAATAGCATTTATTCATTTGCATTTTTTTAGATAAATT AAAATTAATGGTATAGTGTC
Product: aa_permeases
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 565; Mature: 565
Protein sequence:
>565_residues MKQQKPKISFIAAMLIVIGSSIGAGIFFKSSTVLENSQASLVLAIFNWLVASVAVIAMALALIEIASVRNDNLSIISWVK VFNRRWLYHGCKNFMTYLYLPLTFFFMPLYFICSIQDGFRGLLGLETGAHFNTSVDWLIWLALALIITTYFLTIPPLYAK VGNIQNMVVSAVKFIPLVFVPIIGFIVAGTGNGELKNVKALVQPPQINGATASFTQLVQAGYGITRFTGIGAGMGSFISI AAIFFAYDGFYVTAGLQSEMREPKKTPWALFLGLLITTLFYLILAVALSINGGLFSGMEESMGKLFNNKRAGQIVFGVVN LMIGIGVLGIINGFALWAPRFVEDLLAQGDLPFWKQVQGRLNPNKPVVGVIYCLVLSLTVQVLFTVIGALAYLPTVADYK NYVNTEIDKLNSMQWLYSFSDLMATWTSLFTFAFIACAIFGAIVNRKTKKITIANPKRYFLPAAWIAVVVNCISVFVTII EPFINLFLLFGYDETVAHTVLGNDFIELNELVIGRVMLIVVLVFFAIISFLPVYVEDQYHKRKFGSLANYQQYVQQHLAH STING
Sequences:
>Translated_565_residues MKQQKPKISFIAAMLIVIGSSIGAGIFFKSSTVLENSQASLVLAIFNWLVASVAVIAMALALIEIASVRNDNLSIISWVK VFNRRWLYHGCKNFMTYLYLPLTFFFMPLYFICSIQDGFRGLLGLETGAHFNTSVDWLIWLALALIITTYFLTIPPLYAK VGNIQNMVVSAVKFIPLVFVPIIGFIVAGTGNGELKNVKALVQPPQINGATASFTQLVQAGYGITRFTGIGAGMGSFISI AAIFFAYDGFYVTAGLQSEMREPKKTP*ALFLGLLITTLFYLILAVALSINGGLFSGMEESMGKLFNNKRAGQIVFGVVN LMIGIGVLGIINGFAL*APRFVEDLLAQGDLPF*KQVQGRLNPNKPVVGVIYCLVLSLTVQVLFTVIGALAYLPTVADYK NYVNTEIDKLNSMQWLYSFSDLMAT*TSLFTFAFIACAIFGAIVNRKTKKITIANPKRYFLPAAWIAVVVNCISVFVTII EPFINLFLLFGYDETVAHTVLGNDFIELNELVIGRVMLIVVLVFFAIISFLPVYVEDQYHKRKFGSLANYQQYVQQHLAH STING >Mature_565_residues MKQQKPKISFIAAMLIVIGSSIGAGIFFKSSTVLENSQASLVLAIFNWLVASVAVIAMALALIEIASVRNDNLSIISWVK VFNRRWLYHGCKNFMTYLYLPLTFFFMPLYFICSIQDGFRGLLGLETGAHFNTSVDWLIWLALALIITTYFLTIPPLYAK VGNIQNMVVSAVKFIPLVFVPIIGFIVAGTGNGELKNVKALVQPPQINGATASFTQLVQAGYGITRFTGIGAGMGSFISI AAIFFAYDGFYVTAGLQSEMREPKKTP*ALFLGLLITTLFYLILAVALSINGGLFSGMEESMGKLFNNKRAGQIVFGVVN LMIGIGVLGIINGFAL*APRFVEDLLAQGDLPF*KQVQGRLNPNKPVVGVIYCLVLSLTVQVLFTVIGALAYLPTVADYK NYVNTEIDKLNSMQWLYSFSDLMAT*TSLFTFAFIACAIFGAIVNRKTKKITIANPKRYFLPAAWIAVVVNCISVFVTII EPFINLFLLFGYDETVAHTVLGNDFIELNELVIGRVMLIVVLVFFAIISFLPVYVEDQYHKRKFGSLANYQQYVQQHLAH STING
Specific function: Unknown
COG id: COG0531
COG function: function code E; Amino acid transporters
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To M.pneumoniae MPN_095 and MPN_096 [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002293 [H]
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 61744; Mature: 61744
Theoretical pI: Translated: 9.43; Mature: 9.43
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKQQKPKISFIAAMLIVIGSSIGAGIFFKSSTVLENSQASLVLAIFNWLVASVAVIAMAL CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALIEIASVRNDNLSIISWVKVFNRRWLYHGCKNFMTYLYLPLTFFFMPLYFICSIQDGFR HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLLGLETGAHFNTSVDWLIWLALALIITTYFLTIPPLYAKVGNIQNMVVSAVKFIPLVFV HHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH PIIGFIVAGTGNGELKNVKALVQPPQINGATASFTQLVQAGYGITRFTGIGAGMGSFISI HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHHHH AAIFFAYDGFYVTAGLQSEMREPKKTPALFLGLLITTLFYLILAVALSINGGLFSGMEES HHHHHHHCCEEEEECCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHH MGKLFNNKRAGQIVFGVVNLMIGIGVLGIINGFALAPRFVEDLLAQGDLPFKQVQGRLNP HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCC NKPVVGVIYCLVLSLTVQVLFTVIGALAYLPTVADYKNYVNTEIDKLNSMQWLYSFSDLM CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ATTSLFTFAFIACAIFGAIVNRKTKKITIANPKRYFLPAAWIAVVVNCISVFVTIIEPFI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLFLLFGYDETVAHTVLGNDFIELNELVIGRVMLIVVLVFFAIISFLPVYVEDQYHKRKF HHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH GSLANYQQYVQQHLAHSTING CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MKQQKPKISFIAAMLIVIGSSIGAGIFFKSSTVLENSQASLVLAIFNWLVASVAVIAMAL CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALIEIASVRNDNLSIISWVKVFNRRWLYHGCKNFMTYLYLPLTFFFMPLYFICSIQDGFR HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLLGLETGAHFNTSVDWLIWLALALIITTYFLTIPPLYAKVGNIQNMVVSAVKFIPLVFV HHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH PIIGFIVAGTGNGELKNVKALVQPPQINGATASFTQLVQAGYGITRFTGIGAGMGSFISI HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHHHH AAIFFAYDGFYVTAGLQSEMREPKKTPALFLGLLITTLFYLILAVALSINGGLFSGMEES HHHHHHHCCEEEEECCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHH MGKLFNNKRAGQIVFGVVNLMIGIGVLGIINGFALAPRFVEDLLAQGDLPFKQVQGRLNP HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCC NKPVVGVIYCLVLSLTVQVLFTVIGALAYLPTVADYKNYVNTEIDKLNSMQWLYSFSDLM CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ATTSLFTFAFIACAIFGAIVNRKTKKITIANPKRYFLPAAWIAVVVNCISVFVTIIEPFI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLFLLFGYDETVAHTVLGNDFIELNELVIGRVMLIVVLVFFAIISFLPVYVEDQYHKRKF HHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH GSLANYQQYVQQHLAHSTING CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8948633; 9098066 [H]