| Definition | Mycoplasma pneumoniae M129, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_000912 |
| Length | 816,394 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 13507824
Identifier: 13507824
GI number: 13507824
Start: 107273
End: 108595
Strand: Direct
Name: 13507824
Synonym: MPN085
Alternate gene names: NA
Gene position: 107273-108595 (Clockwise)
Preceding gene: 13507823
Following gene: 13507825
Centisome position: 13.14
GC content: 27.74
Gene sequence:
>1323_bases ATGCAATTAACTACAAGTCAACAAATGCAAACTAACTTTCTTACTACAAATAAACATCACTTATTGAAATACACCAACGG TTTGATTTGGTGTTGGTGATTATTTGTTATTTCTTTAGTTTTAGCTTCATCGACATTTAGAGGTTTCTTTCTCGGCACTA TCAATATTGTGAATTTTGTGTTTTGGATATTAGCACTGATTTTTGGTGTAGCTGTCGCTTTCATTAATGGTGTTTTGAGT AGTGAATTAAAAGAAAATTCAGTTTTTCAAGAAGAACAAAAACGATTCTTCTTGGGCTTTTTCTTTCCACAAATGGCTTT CTGTAATGCGCTTTGACTGAAACTTAAATTAAGCTATCTAAATTCTGAAAGAGAAAACTTATTAGAAAAAATAAAGCAAA AACTAAAGAAGCTTACCTTGTCTGTTTTTGTTGTTTGAGGAATTTATTGTGTTTTAGCAACCTCAATTTATTTACCAAAT GCATTAAGAATTTTAAACATTTATCAAATACCTAACTTAATCGCTTTAATAAATAATAGATTGAGTGAAATTTTGCCAGA TGGTAACCGTTATTTTTTAGGTCATTCTTCATTCGCTTTTCATTACTATGAAATAGTTTCAAGGATTCCTTTTTTAGTTT TCTTTATTATTCCAACAATAACCTTAATTACTTTAGGTTGCTATTTATTCGCTTACTTAAGGTTTATAAACTCAAATAAG TTAAGAAAACCACTTTCTACTTTATCAATAGTTATCATGCTGACTGATGTTGTGGGAATAATTCAATGAATAATTATTGA TATCTTATTAATTTGGCTTAATGTACCCTTTGTTATATTTGTAATTTTTTGAGTAATAAAACTTGTTTTGCCTTTAGCAA TGATAGGTACGTTTGTCAGCTCCTTAACTATTTACAAAAAAGTAACAAGCAAAGAATGATTAGCAATAAAAGAAGAACAA ATTAATTTAACGACAATGAATATTAATATTAATATGGGAGAGCAATCATCCAAAAACATGAATTCTTTTGAAAATCATGA ATCAAATGAACGAAATAGTCTTCAAATTTATCAACAACATTCATCTATGATGTCAGAAACAAAGAGAAAACAAAGTAGCT TAAGTTATGATGCCAGAATCCTTTTACCTAAAAGTCCCTATAACACAAAGAAAACTTTATTTTTAATTATTTTCTTTTCC ATTATCTCCTTGATATTGGCAACTATAGGTAGTGTGTTCATTTCTTTTGCTATAGTTCAAATTTCTATACCTTTTTACGT TATAGGTGGAGTTATTTGATTTTTTACTTTTATTTCTTTATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCGCATTTCAATAATTGAAGAGTTGGTTAGCACAAATTTAAATTTAAGGCTAGTTTAATGACTATTTATTTTTAATTAG TCAACAGTGATTTAAATTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAACTTTTGTAGCAATTGTAAGGTTCATAGCAGAGTACTTCGCTAATAAGTTAAATGCACTTACATGAAAAGTGGATCTT TCTGGACTAGAGATTAAACC
Product: adhesin P1
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 440; Mature: 440
Protein sequence:
>440_residues MQLTTSQQMQTNFLTTNKHHLLKYTNGLIWCWWLFVISLVLASSTFRGFFLGTINIVNFVFWILALIFGVAVAFINGVLS SELKENSVFQEEQKRFFLGFFFPQMAFCNALWLKLKLSYLNSERENLLEKIKQKLKKLTLSVFVVWGIYCVLATSIYLPN ALRILNIYQIPNLIALINNRLSEILPDGNRYFLGHSSFAFHYYEIVSRIPFLVFFIIPTITLITLGCYLFAYLRFINSNK LRKPLSTLSIVIMLTDVVGIIQWIIIDILLIWLNVPFVIFVIFWVIKLVLPLAMIGTFVSSLTIYKKVTSKEWLAIKEEQ INLTTMNININMGEQSSKNMNSFENHESNERNSLQIYQQHSSMMSETKRKQSSLSYDARILLPKSPYNTKKTLFLIIFFS IISLILATIGSVFISFAIVQISIPFYVIGGVIWFFTFISL
Sequences:
>Translated_440_residues MQLTTSQQMQTNFLTTNKHHLLKYTNGLIWCW*LFVISLVLASSTFRGFFLGTINIVNFVFWILALIFGVAVAFINGVLS SELKENSVFQEEQKRFFLGFFFPQMAFCNAL*LKLKLSYLNSERENLLEKIKQKLKKLTLSVFVV*GIYCVLATSIYLPN ALRILNIYQIPNLIALINNRLSEILPDGNRYFLGHSSFAFHYYEIVSRIPFLVFFIIPTITLITLGCYLFAYLRFINSNK LRKPLSTLSIVIMLTDVVGIIQ*IIIDILLIWLNVPFVIFVIF*VIKLVLPLAMIGTFVSSLTIYKKVTSKE*LAIKEEQ INLTTMNININMGEQSSKNMNSFENHESNERNSLQIYQQHSSMMSETKRKQSSLSYDARILLPKSPYNTKKTLFLIIFFS IISLILATIGSVFISFAIVQISIPFYVIGGVI*FFTFISL >Mature_440_residues MQLTTSQQMQTNFLTTNKHHLLKYTNGLIWCW*LFVISLVLASSTFRGFFLGTINIVNFVFWILALIFGVAVAFINGVLS SELKENSVFQEEQKRFFLGFFFPQMAFCNAL*LKLKLSYLNSERENLLEKIKQKLKKLTLSVFVV*GIYCVLATSIYLPN ALRILNIYQIPNLIALINNRLSEILPDGNRYFLGHSSFAFHYYEIVSRIPFLVFFIIPTITLITLGCYLFAYLRFINSNK LRKPLSTLSIVIMLTDVVGIIQ*IIIDILLIWLNVPFVIFVIF*VIKLVLPLAMIGTFVSSLTIYKKVTSKE*LAIKEEQ INLTTMNININMGEQSSKNMNSFENHESNERNSLQIYQQHSSMMSETKRKQSSLSYDARILLPKSPYNTKKTLFLIIFFS IISLILATIGSVFISFAIVQISIPFYVIGGVI*FFTFISL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To M.pneumoniae MPN_087 [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49507; Mature: 49507
Theoretical pI: Translated: 10.01; Mature: 10.01
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQLTTSQQMQTNFLTTNKHHLLKYTNGLIWCWLFVISLVLASSTFRGFFLGTINIVNFVF CCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WILALIFGVAVAFINGVLSSELKENSVFQEEQKRFFLGFFFPQMAFCNALLKLKLSYLNS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC ERENLLEKIKQKLKKLTLSVFVVGIYCVLATSIYLPNALRILNIYQIPNLIALINNRLSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILPDGNRYFLGHSSFAFHYYEIVSRIPFLVFFIIPTITLITLGCYLFAYLRFINSNKLRK HCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHC PLSTLSIVIMLTDVVGIIQIIIDILLIWLNVPFVIFVIFVIKLVLPLAMIGTFVSSLTIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKVTSKELAIKEEQINLTTMNININMGEQSSKNMNSFENHESNERNSLQIYQQHSSMMSE HHHHHHHHHEEHHEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TKRKQSSLSYDARILLPKSPYNTKKTLFLIIFFSIISLILATIGSVFISFAIVQISIPFY HHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIGGVIFFTFISL HHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MQLTTSQQMQTNFLTTNKHHLLKYTNGLIWCWLFVISLVLASSTFRGFFLGTINIVNFVF CCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WILALIFGVAVAFINGVLSSELKENSVFQEEQKRFFLGFFFPQMAFCNALLKLKLSYLNS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC ERENLLEKIKQKLKKLTLSVFVVGIYCVLATSIYLPNALRILNIYQIPNLIALINNRLSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILPDGNRYFLGHSSFAFHYYEIVSRIPFLVFFIIPTITLITLGCYLFAYLRFINSNKLRK HCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHC PLSTLSIVIMLTDVVGIIQIIIDILLIWLNVPFVIFVIFVIKLVLPLAMIGTFVSSLTIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKVTSKELAIKEEQINLTTMNININMGEQSSKNMNSFENHESNERNSLQIYQQHSSMMSE HHHHHHHHHEEHHEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH TKRKQSSLSYDARILLPKSPYNTKKTLFLIIFFSIISLILATIGSVFISFAIVQISIPFY HHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIGGVIFFTFISL HHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8948633 [H]