Definition Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome, complete genome.
Accession NC_000909
Length 1,664,970

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15669821

Identifier: 15669821

GI number: 15669821

Start: 1600078

End: 1602375

Strand: Reverse

Name: 15669821

Synonym: MJ1626

Alternate gene names: NA

Gene position: 1602375-1600078 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15669823

Following gene: 15669820

Centisome position: 96.24

GC content: 26.68

Gene sequence:

>2298_bases
ATGCTTATAACAAGCTCTCTACTCCCGCCCTCAGGAACATGGATTTTTAATATCAACTCTCTGTTTTGCTCATTATCAAT
CAAAAACGCTTTATCTAATCTACCGTTAATGAGGTTTTGTAATTCATCCACAACACAGCACACATCAACATTAGTTATCT
CACTCTTCATAATCTCACCAGAAAATATTATATTTTTCTTTAGGATATTTTATTATTGTGATAATATGGAGAGGGAAGAG
TTTTTAAAGTATTTAAGACAGGGGAAATATGATAAATTAGCTAAGTTAATTAATAGTTATTCAGATATTTTAAGTTTTTT
AGATGAGTTATTTACATCTAACAAAAAAGATGATGTAAGAAGAGCATTGTTGGTTTTAAAAAGGTTAGATAACGAGGTAA
TTGAGAGATATCTATATTATATCCTCTTAAATTTAAATGAAAAAAGAATTATAGCCAAAGAGGCGGAAGAAATATTAAAG
AAAATAACCAACAAAGAGAGTGTTGAAGAGGCAATACTTGAAATTGCAAAAAAACCTTTGGATGAAAAAATAGTTTATTT
ATTCCTACAAAATATGAAAGAAGGAAATATTTTCTTTAGAGCCATCCTTGAACATACAAAAAGTAAAAACATGGAAGAAA
GTATAAAAATCTTATTAAAAAATTATAATTCAGAGATGATATTAAAAATCTTAGCTAATAAGTTATATTCCTCAGAAAAA
GATGAGAGGGAACTTACAATAAATATATTGTTGAATATAGTTGATTCTTTAACTGACGAACAAAAAAATATCCTAAGGGG
TCATTTAAGTGTCTCCTTATTGGGGGATGAAGATAAGAAGCTATATAGAAAATTTAAACAGCTATTTGAAAAATTGGATA
TTCCAGCTGAGTTATCAGATGAGCAAATAAAATCACTACTAAAATCTCATGGAAAAACTACCCTAAATATAATTTTAAGA
GAAAATATCAAACTTCCTGCTAACTTTTACAATAGAGAGTTTTTAAAAGACTTTTTATATACTGGGGATGAAGAGAAGCA
GTTTGTTGGAGTTAAATTAATATCATTAAAAAAAGATTCAAAAAAGAAGGTTGATTTATTATTTAGATTTTTAAATTATG
GATATGGGAAAGCAAAAACCGCTGCCATAAGAGAACTTAAGAAGATAGCTCAAAATAATAATGAGTTAAAAAAATATATA
GAAAATAAAACATTGATGTATGCAAAAAAGATGAATTTAGGATTAAAAATATCATCTCTAAGAATATTAAAAGAATTTGC
AAAAAAAGAGCATTTAGAATTTTTAATTAATGAACATAAGCGATTGAAAGAGTTAGTTTATAAATTAGAAGAAGAGAAAT
TTATGGGAGGATTTAGACATTTGTTAATGATGGAAGAGGAAATAAGGAAATGCAATGTTGCCATGAGATTGATAGAGGAG
ATTGTAGCAGAGATTTGTTTAAAAAATGATATCCATTATAATGATTTAAAGATATCTGAAAAACTTGGTTATGAATTTTA
TAGAACAATGGAATTAATAGGGGTTAAAAATCTAAACCTAATAGATATTCATGAGTTTTTAGAAGATGTTAAAAGAGATG
GAGAACTTATAACTTATTTGTCTGGGATTGTGATTAACAACAATAAAATAGATGATAATTTAGCTAAGAAAATTTTGGAG
GTAACTGAAAAGGCAGAGATGGAAGATAAAGATGTATTAAATGCAAACAAAATTATGATTTATGCATCTTTAAATAGAGT
TGATAAGATTGGAGAGATTATAAATATGGCGGAAGGTTATTATTCAAAATTAGCTTTTATCAATGGGGTTAAAAAGTTTA
TTGATGAGAAATTGTTAGATGAAGAAAAAATAAATTTATTAATTCCAAAGATTGCTGAAATGATATACTCAACAAAGAAA
TTAAGACTAATGGCTTTGGAATTTTTTAAAAACTACCCAAATGAGCTTGTTCTTCCAATATTGATTAATGAAATTGGTAA
TTATAGGGGAGAGGATAAATTAATGATAGATGTTATATCAAACGTTATATTTAAATATCCGAATAACATACATAGTATTA
GGGAGTTGTTGAATACAGATAAGAGAAACTCTGCTTTAAAAATACTGCTTAAAGTTAGTGAGAAAAGACCAGAGCTTTTA
GAAGATTTTATATATTTGCTTGCTGGAATGTATAGTTCTGCAAATGAAGAGGATAAAAAGCTAATAAAGAAGATTTTGAA
AAATATTACTACTGAAGAACAAAAATTAATCTTAAAACCGATAATTGGGGATTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGCATTTTTTAAATATTTTCTTAATAACATGGCAAAAGAGGGTGGAAGTTTTGGTTTTTCCCTCTCATAATTTGTTAAAG
TTATATACTTATATTTACCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTCCGTTACCTTCATAGGCATAATTAAGAGGCACTGCCGAGCGTAGCGAGGTAGTGCATCCGTTTTGATCAACCTTTTA
GTAAAAGGTTGGATGGCTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 765; Mature: 765

Protein sequence:

>765_residues
MLITSSLLPPSGTWIFNINSLFCSLSIKNALSNLPLMRFCNSSTTQHTSTLVISLFIISPENIIFFFRIFYYCDNMEREE
FLKYLRQGKYDKLAKLINSYSDILSFLDELFTSNKKDDVRRALLVLKRLDNEVIERYLYYILLNLNEKRIIAKEAEEILK
KITNKESVEEAILEIAKKPLDEKIVYLFLQNMKEGNIFFRAILEHTKSKNMEESIKILLKNYNSEMILKILANKLYSSEK
DERELTINILLNIVDSLTDEQKNILRGHLSVSLLGDEDKKLYRKFKQLFEKLDIPAELSDEQIKSLLKSHGKTTLNIILR
ENIKLPANFYNREFLKDFLYTGDEEKQFVGVKLISLKKDSKKKVDLLFRFLNYGYGKAKTAAIRELKKIAQNNNELKKYI
ENKTLMYAKKMNLGLKISSLRILKEFAKKEHLEFLINEHKRLKELVYKLEEEKFMGGFRHLLMMEEEIRKCNVAMRLIEE
IVAEICLKNDIHYNDLKISEKLGYEFYRTMELIGVKNLNLIDIHEFLEDVKRDGELITYLSGIVINNNKIDDNLAKKILE
VTEKAEMEDKDVLNANKIMIYASLNRVDKIGEIINMAEGYYSKLAFINGVKKFIDEKLLDEEKINLLIPKIAEMIYSTKK
LRLMALEFFKNYPNELVLPILINEIGNYRGEDKLMIDVISNVIFKYPNNIHSIRELLNTDKRNSALKILLKVSEKRPELL
EDFIYLLAGMYSSANEEDKKLIKKILKNITTEEQKLILKPIIGDL

Sequences:

>Translated_765_residues
MLITSSLLPPSGTWIFNINSLFCSLSIKNALSNLPLMRFCNSSTTQHTSTLVISLFIISPENIIFFFRIFYYCDNMEREE
FLKYLRQGKYDKLAKLINSYSDILSFLDELFTSNKKDDVRRALLVLKRLDNEVIERYLYYILLNLNEKRIIAKEAEEILK
KITNKESVEEAILEIAKKPLDEKIVYLFLQNMKEGNIFFRAILEHTKSKNMEESIKILLKNYNSEMILKILANKLYSSEK
DERELTINILLNIVDSLTDEQKNILRGHLSVSLLGDEDKKLYRKFKQLFEKLDIPAELSDEQIKSLLKSHGKTTLNIILR
ENIKLPANFYNREFLKDFLYTGDEEKQFVGVKLISLKKDSKKKVDLLFRFLNYGYGKAKTAAIRELKKIAQNNNELKKYI
ENKTLMYAKKMNLGLKISSLRILKEFAKKEHLEFLINEHKRLKELVYKLEEEKFMGGFRHLLMMEEEIRKCNVAMRLIEE
IVAEICLKNDIHYNDLKISEKLGYEFYRTMELIGVKNLNLIDIHEFLEDVKRDGELITYLSGIVINNNKIDDNLAKKILE
VTEKAEMEDKDVLNANKIMIYASLNRVDKIGEIINMAEGYYSKLAFINGVKKFIDEKLLDEEKINLLIPKIAEMIYSTKK
LRLMALEFFKNYPNELVLPILINEIGNYRGEDKLMIDVISNVIFKYPNNIHSIRELLNTDKRNSALKILLKVSEKRPELL
EDFIYLLAGMYSSANEEDKKLIKKILKNITTEEQKLILKPIIGDL
>Mature_765_residues
MLITSSLLPPSGTWIFNINSLFCSLSIKNALSNLPLMRFCNSSTTQHTSTLVISLFIISPENIIFFFRIFYYCDNMEREE
FLKYLRQGKYDKLAKLINSYSDILSFLDELFTSNKKDDVRRALLVLKRLDNEVIERYLYYILLNLNEKRIIAKEAEEILK
KITNKESVEEAILEIAKKPLDEKIVYLFLQNMKEGNIFFRAILEHTKSKNMEESIKILLKNYNSEMILKILANKLYSSEK
DERELTINILLNIVDSLTDEQKNILRGHLSVSLLGDEDKKLYRKFKQLFEKLDIPAELSDEQIKSLLKSHGKTTLNIILR
ENIKLPANFYNREFLKDFLYTGDEEKQFVGVKLISLKKDSKKKVDLLFRFLNYGYGKAKTAAIRELKKIAQNNNELKKYI
ENKTLMYAKKMNLGLKISSLRILKEFAKKEHLEFLINEHKRLKELVYKLEEEKFMGGFRHLLMMEEEIRKCNVAMRLIEE
IVAEICLKNDIHYNDLKISEKLGYEFYRTMELIGVKNLNLIDIHEFLEDVKRDGELITYLSGIVINNNKIDDNLAKKILE
VTEKAEMEDKDVLNANKIMIYASLNRVDKIGEIINMAEGYYSKLAFINGVKKFIDEKLLDEEKINLLIPKIAEMIYSTKK
LRLMALEFFKNYPNELVLPILINEIGNYRGEDKLMIDVISNVIFKYPNNIHSIRELLNTDKRNSALKILLKVSEKRPELL
EDFIYLLAGMYSSANEEDKKLIKKILKNITTEEQKLILKPIIGDL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): Y1626_METJA (Q59019)

Other databases:

- EMBL:   L77117
- PIR:   G64502
- RefSeq:   NP_248635.1
- ProteinModelPortal:   Q59019
- GeneID:   1452534
- GenomeReviews:   L77117_GR
- KEGG:   mja:MJ_1626
- NMPDR:   fig|243232.1.peg.1672
- TIGR:   MJ1626
- OMA:   MALEFFK
- ProtClustDB:   CLSK214893
- BioCyc:   MJAN243232:MJ_1626-MONOMER

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89609; Mature: 89609

Theoretical pI: Translated: 9.06; Mature: 9.06

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLITSSLLPPSGTWIFNINSLFCSLSIKNALSNLPLMRFCNSSTTQHTSTLVISLFIISP
CCEECCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCHHHHHEEEEEEEECC
ENIIFFFRIFYYCDNMEREEFLKYLRQGKYDKLAKLINSYSDILSFLDELFTSNKKDDVR
CHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
RALLVLKRLDNEVIERYLYYILLNLNEKRIIAKEAEEILKKITNKESVEEAILEIAKKPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCH
DEKIVYLFLQNMKEGNIFFRAILEHTKSKNMEESIKILLKNYNSEMILKILANKLYSSEK
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
DERELTINILLNIVDSLTDEQKNILRGHLSVSLLGDEDKKLYRKFKQLFEKLDIPAELSD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
EQIKSLLKSHGKTTLNIILRENIKLPANFYNREFLKDFLYTGDEEKQFVGVKLISLKKDS
HHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCC
KKKVDLLFRFLNYGYGKAKTAAIRELKKIAQNNNELKKYIENKTLMYAKKMNLGLKISSL
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCHHHH
RILKEFAKKEHLEFLINEHKRLKELVYKLEEEKFMGGFRHLLMMEEEIRKCNVAMRLIEE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVAEICLKNDIHYNDLKISEKLGYEFYRTMELIGVKNLNLIDIHEFLEDVKRDGELITYL
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHH
SGIVINNNKIDDNLAKKILEVTEKAEMEDKDVLNANKIMIYASLNRVDKIGEIINMAEGY
HCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSKLAFINGVKKFIDEKLLDEEKINLLIPKIAEMIYSTKKLRLMALEFFKNYPNELVLPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
LINEIGNYRGEDKLMIDVISNVIFKYPNNIHSIRELLNTDKRNSALKILLKVSEKRPELL
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHH
EDFIYLLAGMYSSANEEDKKLIKKILKNITTEEQKLILKPIIGDL
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MLITSSLLPPSGTWIFNINSLFCSLSIKNALSNLPLMRFCNSSTTQHTSTLVISLFIISP
CCEECCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCHHHHHEEEEEEEECC
ENIIFFFRIFYYCDNMEREEFLKYLRQGKYDKLAKLINSYSDILSFLDELFTSNKKDDVR
CHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
RALLVLKRLDNEVIERYLYYILLNLNEKRIIAKEAEEILKKITNKESVEEAILEIAKKPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCH
DEKIVYLFLQNMKEGNIFFRAILEHTKSKNMEESIKILLKNYNSEMILKILANKLYSSEK
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
DERELTINILLNIVDSLTDEQKNILRGHLSVSLLGDEDKKLYRKFKQLFEKLDIPAELSD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
EQIKSLLKSHGKTTLNIILRENIKLPANFYNREFLKDFLYTGDEEKQFVGVKLISLKKDS
HHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCC
KKKVDLLFRFLNYGYGKAKTAAIRELKKIAQNNNELKKYIENKTLMYAKKMNLGLKISSL
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCHHHH
RILKEFAKKEHLEFLINEHKRLKELVYKLEEEKFMGGFRHLLMMEEEIRKCNVAMRLIEE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVAEICLKNDIHYNDLKISEKLGYEFYRTMELIGVKNLNLIDIHEFLEDVKRDGELITYL
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHH
SGIVINNNKIDDNLAKKILEVTEKAEMEDKDVLNANKIMIYASLNRVDKIGEIINMAEGY
HCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSKLAFINGVKKFIDEKLLDEEKINLLIPKIAEMIYSTKKLRLMALEFFKNYPNELVLPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
LINEIGNYRGEDKLMIDVISNVIFKYPNNIHSIRELLNTDKRNSALKILLKVSEKRPELL
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHH
EDFIYLLAGMYSSANEEDKKLIKKILKNITTEEQKLILKPIIGDL
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087