| Definition | Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_000909 |
| Length | 1,664,970 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is rgy
Identifier: 15669706
GI number: 15669706
Start: 1483752
End: 1488593
Strand: Direct
Name: rgy
Synonym: MJ1512
Alternate gene names: 15669706
Gene position: 1483752-1488593 (Clockwise)
Preceding gene: 15669705
Following gene: 15669708
Centisome position: 89.12
GC content: 30.94
Gene sequence:
>4842_bases ATGATACCGATGATATATAAAGAGATGTGTCCTAACTGTAACGGAGAGATAACGAGTGAAAGGTTAGCTATAGGAGTTTG TGAAAAATGTTTAAAAGAAGAAAATGTTTTTGAAAAACTAAAATTATGTGAAAAACTTAGAGAAGAGAAAACTTTGAAAA ATTTAAAAGATTATTGTATTATTTGGAATGAATTTAAAGAATTTGAAGAATTTGTAAAAGATTTAGGATTTGAACTTTTA AGTATTCAAAAGATGTGGGCTAAAAGGGTTTTAAAGAACAAGAGTTTTTCAATCGTAGTACCAACTGGAGTTGGAAAGAG CTTTTTTGGAATACTTATGAGCCTATTCTTAGCTAAGAAAGGGAAAAGATGTTATATAATTCTACCAACAACACTACTGG TTAAGCAAACTTATGAAAAAATATCCTCCTTAACAGAAAAAAATAACTTAAATATAAGAGTAGTTGCATATCATTCAGAA CTCTCAACAAAGGAAAAGAAAGAGGTAAAGGAGAGGATTGAAAACAACGATTATGATGTTTTGATAACAACATCCAACTA TCTAACAAAAAACATGCCAAAATGCAAATTTGACTTTGTATTTGTTGATGATGTCGATGCATTGTTAAAAGCATCTAAAA ACATTGACAGAACTTTAAAGTTGTTAGGATTTGATGAAGAGATAATAAATGAGGCATATAAAATCATCTACCTAATAAAG ATTGGAAAGATAGAGGATGCAATGAAAAAGAGAGAAATTTTAAAGAAAAAAATATCTAAAATAAAGCATGGCTGTTTAAT AATTGCTTCTGCAACTGGAAAGAGTTATGGGGATAGAGTTAAGCTTTACAGAGAGCTTTTAGACTTTGAAATTGGATTTG GAATGAATAAGCTTAGGGATGTTGTTGATATCTACGACGAGGAATTTAGCAAAGAGAAGATTTTGGAGTATATAAAATTA TTTGGTTCTGGCGGAATTGTGTTCGTTTCAATTGACTACGGAGTTGAGAAAGCCCAAGAGATTGAAAAATATCTATTAGA AAATAATATCAAGGCAAAATTAATCCATTCAAAGGATAAGAAGGGATTTGATGATTTCAGAGAGGGAAAGATTGATGTTT TGATTGGAGTGGCATCATACTATGGTGTCTTGGTTAGAGGTTTAGACATGCCGGAAAGGGTTAGATATGCTATCTTTTAT GGCATTCCGAAGTTTAAAATTAGATTAAAGGAGTATATAAACAGCTTAAAGGAGAAGGGAGAGTTAAAAGAAGATATTAA CATAGAAGGAAAGACTGAGGAGGAAATTAGGCAGATAATAACTGAGAAATTAAAGATAAAGAACTTCTCTCTAAGGAAGG AGGATGATGAATATCTATTGTTAATTCCAGATGTAAAAACCTATATCCAAGCATCTGGAAGAACTTCAAGGATGACAGAG TTTGGTTTGACTAAAGGGGCAAGTATTGTATTGGTGGATGAGAAAGAGATTTTTGAAGCCCTCAAAAAGTATATGCTCTT TATGTATGAGAGTGAATTTAAAAGAATAGATGAGGTAAACTTAGAGGAGCTAATTAAAAAGATTGATGAAGATAGGGAGA AAATAAAAGTTGGAAGAGCCAAAGGAAAAGTCCCAGATTTGCTAAAATCTGTCTTAATGGTTGTAGAAAGCCCTAATAAG GCAAGAACTATAGCAAACTTCTTTGGAAAGCCCTCTGTTAGAAAGATAAACAACAGAAATGTCTATGAGGTTTGTATTGG AGATTTAAACTTGATTATAACTGCGAGTGGAGGGCATGTATTTGATTTGGTTACAAAAGAGGGTTTCTATGGGGTTAAAA TAGAAAATAACTTGTATATTCCAATATATACATCAATTAAAAAAGTGAATGGAGAGCAATTTACCGACCAAAAGGATTTG GAGGAGTTGATAAAGCAGTTAATGGAGAAAGGAGAGAGAGTAAATGCAATGGATGCTAAGGAGAACATAGAGATTATTAG GGAGATAGCCGATGAGGTTGATGCAATATTCATAGCAACCGATATCGATACAGAGGGAGAGAAGATAGGATATGACATAG CCATAAATGCCCTCCCATTCAATAGAAATATCTACAGAGTAGGATTTAATGAGATTACAAAGAGGGCAATATTAAAGGCA GTTGAATCATTTAAAAAAGGAGAAGAACTTAGCTTAGATGAAAATAAAGTTAAAGGACAGGTAGTTAGAAGGATAGAAGA TAGATGGATTGGATTTAGGTTGAGTCAAAAGCTTTGGGAGGTATTTAATAAAAACTACCTCTCAGCTGGTAGAGTTCAAA CACCAGTGTTAGGATGGATTATTGAGAGATACAATGAACATAAAATAAAAGTCCCTTATCTATCTCTAAAATTGGAAAAT GACATATATATTGGAAAGATTTGGGAAGATGAGTTTGATAAGGATGAGGTTGAAGTTGAAGTTAAAGTTTATGAGAAGGA GATTCCTCCATTACCTCCATTCACAACAGACACATTGTTAGAGGAAGCTACAAAGAGATTTGGATTAAGCACCGATGAAA TAATGTCTATAGCTCAAGAGCTTTTTGAGTTAGGGTTATGTTTAACTCCAGATACCTATGTTGTGTTAGGGGATGGAAGA ATTGAAACAATTGAAGACATTGTTAATGCTAAGGAAAGAAATGTTTTATCATTAGATTTAGATAATTTATCAATAAAAAT AGATACAGCCATTAAATTCTGGAAATTGAGATATAATGGAAACCTAAGTAAAATTACTCTTTCGAACAATTATGAGCTAA AGGCAACTCCAGACCATTGCTTATTGGTTTTAAGAGACAATCAACTAAAATGGATTCCTGCAAAAGATATTAAGGAAAAT GATTACATTGCAATGCCATTTAACTATAAAGTTGAAAGAAAGCCAATCTCCCTATTAAATCTTCTGAAATATTTGGATAT TACTGATGTATTAATAGAGTTTGATGAAAACTCCACAATATTTGAAAAAATAGCTGAATATATTAGAAACAATATTAAAA CAAGCACAAAATACAAATATCTAAGAAATAGAAGAGTCCCGTTAAAATATCTAATTGAGTGGAATTTTGATTTGGATGAG ATTGAGAAAGAGGCAAAATACATATATAAAAGCGTTGCAGGAACTAAAAAAATTCCATTGTTTAAGTTAGATGAGAGGTT TTGGTATTTTGCAGGTTTGGTATTGGGAGATGGAAGCATTCAAGATAGCAAAATTAGAATTGCACAAACACCATTAAAGG ATGTTAAAAGCATATTGGATGAGACATTCCCATTCTTACACAATTGGATTTCTGGTAACCAAGTGATTATTTCAAATCCA ATTATTGCTGAAATTTTGGAAAAATTAGGAATGAGAAATGGAAAATTAAACGGAATTATCTTCTCTCTCCCAGAAAGTTA TATAAATGCATTAATTGCTGGATATTTTGATACAGATGGATGCTTCTCCCTACTTTATGATAAAAAGGCAAAAAAACATA ATTTAAGAATGGTTTTAACATCAAAAAGAAGAGATGTTTTAGAAAAGATAGGCATTTATCTAAACTCAATTGGTATTCTA AATACTTTACACAAAAGTAGAGAAGTTTATTCCTTAATAATAAGCAATAAGTCCTTAGAAACCTTTAAGGAAAAGATTGC GAAATATTTAAAGATTAGAAAAGAGGCATTTATAAATGGTTATAAAACATATAAGAAGGAGCATGAAGAAAGATTTGAAT GTGATTTATTGCCAGTAAAAGAGGTATTTAAGAAATTAACATTTGAAAAGGGAAGAAAGGAAATTCTAAAAGATAGCAAA ATACACATTGAAAATTGGTATAAAGAGAAAACAAATAACATCCCAAGAGAAAAATTAAAGACAGTGCTAAGATATGCAAA TAATTCAGAACATAAAGAGTTTTTAGAAAAGATTGTTAATGGAGATATATCCTTTGTTAGAGTTAAAAAAGTAGAAAATA TTCCTTATGATGGATATGTCTATGATTTAAGCATTAAACATAACCAAAACTTTATATCAAATGGAGTTATCTCACACAAT TGCACATATCACAGAACCTCTTCAACAAGAGTTTCATTGGATGGGATGAGAGTAGCAAGAGAGTATCTAAAACTAAACAA TTTAGAGGATTATTTAAAAAATAGAGAATACTTTATGGAAGGAGCTCATGAATGTATAAGACCAACAAAACCAATGAATA CCGATGAGTTAATAGAGTTTTTAAAGGAAAATAACATAAAGCTAACTAAAAATCATATAAAAGTTTATGATTTGATATTT AGAAGATTTATAGCCTCTCAGATGAAAGAGGCTGTTGTTGAATATGAAGAGATTTATATAAAAGATTTAGATGAGAAGGT TGAGGGATATGTTGATATAAAGTTTGATGGTTGGAGTAGAATTTATAATCTAAAATTAAAAAAGCTTCCAAGGATTGAAA AGAGCAGTTTAAAAGTTTTAGACAAAAAACTTAGAAAGATTCCAAAAGTTCCATTGTATGATGAGGGAGAGGTTGTTAAG TTGATGAAAGAGAGGGGTATTGGAAGACCTTCAACCTATGCCCAAATTATTAAAAAGCTGTTAGATAGGGGATACGTAGT TAAAAGTAAAGATAAGAATAAGTTAATCCCAACAAAGCTGGGAATTGAAGTCTATAATTATTTGATAAACAATTATCCTC ACTTAATATCTGAAGAGAGAACAAGGGAGTTGGAGGAGATTATGGATAAGATTGAAAATGGAGAAGTTGATTACATAGAA GTGCTAAAAGCTTTACATGAGGAGATTTTGAGTATAAGATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AAATAATAAAGTTTTTAAACCCAAATAAACCAAATGAACATAAAAATTAAATTATAATCTATCAGATTCTCTAATAAATA TTCATTGACTTGGTGTTATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAATTATCCAACGTAGTTCAGTAGCATTTTCCCTTTTTCACTTATTCTTATATATTTTGACTTACCTATTTTTTCTGGT TTTTCTATCAATTCCAATTC
Product: reverse gyrase
Products: NA
Alternate protein names: Helicase; Topoisomerase
Number of amino acids: Translated: 1613; Mature: 1613
Protein sequence:
>1613_residues MIPMIYKEMCPNCNGEITSERLAIGVCEKCLKEENVFEKLKLCEKLREEKTLKNLKDYCIIWNEFKEFEEFVKDLGFELL SIQKMWAKRVLKNKSFSIVVPTGVGKSFFGILMSLFLAKKGKRCYIILPTTLLVKQTYEKISSLTEKNNLNIRVVAYHSE LSTKEKKEVKERIENNDYDVLITTSNYLTKNMPKCKFDFVFVDDVDALLKASKNIDRTLKLLGFDEEIINEAYKIIYLIK IGKIEDAMKKREILKKKISKIKHGCLIIASATGKSYGDRVKLYRELLDFEIGFGMNKLRDVVDIYDEEFSKEKILEYIKL FGSGGIVFVSIDYGVEKAQEIEKYLLENNIKAKLIHSKDKKGFDDFREGKIDVLIGVASYYGVLVRGLDMPERVRYAIFY GIPKFKIRLKEYINSLKEKGELKEDINIEGKTEEEIRQIITEKLKIKNFSLRKEDDEYLLLIPDVKTYIQASGRTSRMTE FGLTKGASIVLVDEKEIFEALKKYMLFMYESEFKRIDEVNLEELIKKIDEDREKIKVGRAKGKVPDLLKSVLMVVESPNK ARTIANFFGKPSVRKINNRNVYEVCIGDLNLIITASGGHVFDLVTKEGFYGVKIENNLYIPIYTSIKKVNGEQFTDQKDL EELIKQLMEKGERVNAMDAKENIEIIREIADEVDAIFIATDIDTEGEKIGYDIAINALPFNRNIYRVGFNEITKRAILKA VESFKKGEELSLDENKVKGQVVRRIEDRWIGFRLSQKLWEVFNKNYLSAGRVQTPVLGWIIERYNEHKIKVPYLSLKLEN DIYIGKIWEDEFDKDEVEVEVKVYEKEIPPLPPFTTDTLLEEATKRFGLSTDEIMSIAQELFELGLCLTPDTYVVLGDGR IETIEDIVNAKERNVLSLDLDNLSIKIDTAIKFWKLRYNGNLSKITLSNNYELKATPDHCLLVLRDNQLKWIPAKDIKEN DYIAMPFNYKVERKPISLLNLLKYLDITDVLIEFDENSTIFEKIAEYIRNNIKTSTKYKYLRNRRVPLKYLIEWNFDLDE IEKEAKYIYKSVAGTKKIPLFKLDERFWYFAGLVLGDGSIQDSKIRIAQTPLKDVKSILDETFPFLHNWISGNQVIISNP IIAEILEKLGMRNGKLNGIIFSLPESYINALIAGYFDTDGCFSLLYDKKAKKHNLRMVLTSKRRDVLEKIGIYLNSIGIL NTLHKSREVYSLIISNKSLETFKEKIAKYLKIRKEAFINGYKTYKKEHEERFECDLLPVKEVFKKLTFEKGRKEILKDSK IHIENWYKEKTNNIPREKLKTVLRYANNSEHKEFLEKIVNGDISFVRVKKVENIPYDGYVYDLSIKHNQNFISNGVISHN CTYHRTSSTRVSLDGMRVAREYLKLNNLEDYLKNREYFMEGAHECIRPTKPMNTDELIEFLKENNIKLTKNHIKVYDLIF RRFIASQMKEAVVEYEEIYIKDLDEKVEGYVDIKFDGWSRIYNLKLKKLPRIEKSSLKVLDKKLRKIPKVPLYDEGEVVK LMKERGIGRPSTYAQIIKKLLDRGYVVKSKDKNKLIPTKLGIEVYNYLINNYPHLISEERTRELEEIMDKIENGEVDYIE VLKALHEEILSIR
Sequences:
>Translated_1613_residues MIPMIYKEMCPNCNGEITSERLAIGVCEKCLKEENVFEKLKLCEKLREEKTLKNLKDYCIIWNEFKEFEEFVKDLGFELL SIQKMWAKRVLKNKSFSIVVPTGVGKSFFGILMSLFLAKKGKRCYIILPTTLLVKQTYEKISSLTEKNNLNIRVVAYHSE LSTKEKKEVKERIENNDYDVLITTSNYLTKNMPKCKFDFVFVDDVDALLKASKNIDRTLKLLGFDEEIINEAYKIIYLIK IGKIEDAMKKREILKKKISKIKHGCLIIASATGKSYGDRVKLYRELLDFEIGFGMNKLRDVVDIYDEEFSKEKILEYIKL FGSGGIVFVSIDYGVEKAQEIEKYLLENNIKAKLIHSKDKKGFDDFREGKIDVLIGVASYYGVLVRGLDMPERVRYAIFY GIPKFKIRLKEYINSLKEKGELKEDINIEGKTEEEIRQIITEKLKIKNFSLRKEDDEYLLLIPDVKTYIQASGRTSRMTE FGLTKGASIVLVDEKEIFEALKKYMLFMYESEFKRIDEVNLEELIKKIDEDREKIKVGRAKGKVPDLLKSVLMVVESPNK ARTIANFFGKPSVRKINNRNVYEVCIGDLNLIITASGGHVFDLVTKEGFYGVKIENNLYIPIYTSIKKVNGEQFTDQKDL EELIKQLMEKGERVNAMDAKENIEIIREIADEVDAIFIATDIDTEGEKIGYDIAINALPFNRNIYRVGFNEITKRAILKA VESFKKGEELSLDENKVKGQVVRRIEDRWIGFRLSQKLWEVFNKNYLSAGRVQTPVLGWIIERYNEHKIKVPYLSLKLEN DIYIGKIWEDEFDKDEVEVEVKVYEKEIPPLPPFTTDTLLEEATKRFGLSTDEIMSIAQELFELGLCLTPDTYVVLGDGR IETIEDIVNAKERNVLSLDLDNLSIKIDTAIKFWKLRYNGNLSKITLSNNYELKATPDHCLLVLRDNQLKWIPAKDIKEN DYIAMPFNYKVERKPISLLNLLKYLDITDVLIEFDENSTIFEKIAEYIRNNIKTSTKYKYLRNRRVPLKYLIEWNFDLDE IEKEAKYIYKSVAGTKKIPLFKLDERFWYFAGLVLGDGSIQDSKIRIAQTPLKDVKSILDETFPFLHNWISGNQVIISNP IIAEILEKLGMRNGKLNGIIFSLPESYINALIAGYFDTDGCFSLLYDKKAKKHNLRMVLTSKRRDVLEKIGIYLNSIGIL NTLHKSREVYSLIISNKSLETFKEKIAKYLKIRKEAFINGYKTYKKEHEERFECDLLPVKEVFKKLTFEKGRKEILKDSK IHIENWYKEKTNNIPREKLKTVLRYANNSEHKEFLEKIVNGDISFVRVKKVENIPYDGYVYDLSIKHNQNFISNGVISHN CTYHRTSSTRVSLDGMRVAREYLKLNNLEDYLKNREYFMEGAHECIRPTKPMNTDELIEFLKENNIKLTKNHIKVYDLIF RRFIASQMKEAVVEYEEIYIKDLDEKVEGYVDIKFDGWSRIYNLKLKKLPRIEKSSLKVLDKKLRKIPKVPLYDEGEVVK LMKERGIGRPSTYAQIIKKLLDRGYVVKSKDKNKLIPTKLGIEVYNYLINNYPHLISEERTRELEEIMDKIENGEVDYIE VLKALHEEILSIR >Mature_1613_residues MIPMIYKEMCPNCNGEITSERLAIGVCEKCLKEENVFEKLKLCEKLREEKTLKNLKDYCIIWNEFKEFEEFVKDLGFELL SIQKMWAKRVLKNKSFSIVVPTGVGKSFFGILMSLFLAKKGKRCYIILPTTLLVKQTYEKISSLTEKNNLNIRVVAYHSE LSTKEKKEVKERIENNDYDVLITTSNYLTKNMPKCKFDFVFVDDVDALLKASKNIDRTLKLLGFDEEIINEAYKIIYLIK IGKIEDAMKKREILKKKISKIKHGCLIIASATGKSYGDRVKLYRELLDFEIGFGMNKLRDVVDIYDEEFSKEKILEYIKL FGSGGIVFVSIDYGVEKAQEIEKYLLENNIKAKLIHSKDKKGFDDFREGKIDVLIGVASYYGVLVRGLDMPERVRYAIFY GIPKFKIRLKEYINSLKEKGELKEDINIEGKTEEEIRQIITEKLKIKNFSLRKEDDEYLLLIPDVKTYIQASGRTSRMTE FGLTKGASIVLVDEKEIFEALKKYMLFMYESEFKRIDEVNLEELIKKIDEDREKIKVGRAKGKVPDLLKSVLMVVESPNK ARTIANFFGKPSVRKINNRNVYEVCIGDLNLIITASGGHVFDLVTKEGFYGVKIENNLYIPIYTSIKKVNGEQFTDQKDL EELIKQLMEKGERVNAMDAKENIEIIREIADEVDAIFIATDIDTEGEKIGYDIAINALPFNRNIYRVGFNEITKRAILKA VESFKKGEELSLDENKVKGQVVRRIEDRWIGFRLSQKLWEVFNKNYLSAGRVQTPVLGWIIERYNEHKIKVPYLSLKLEN DIYIGKIWEDEFDKDEVEVEVKVYEKEIPPLPPFTTDTLLEEATKRFGLSTDEIMSIAQELFELGLCLTPDTYVVLGDGR IETIEDIVNAKERNVLSLDLDNLSIKIDTAIKFWKLRYNGNLSKITLSNNYELKATPDHCLLVLRDNQLKWIPAKDIKEN DYIAMPFNYKVERKPISLLNLLKYLDITDVLIEFDENSTIFEKIAEYIRNNIKTSTKYKYLRNRRVPLKYLIEWNFDLDE IEKEAKYIYKSVAGTKKIPLFKLDERFWYFAGLVLGDGSIQDSKIRIAQTPLKDVKSILDETFPFLHNWISGNQVIISNP IIAEILEKLGMRNGKLNGIIFSLPESYINALIAGYFDTDGCFSLLYDKKAKKHNLRMVLTSKRRDVLEKIGIYLNSIGIL NTLHKSREVYSLIISNKSLETFKEKIAKYLKIRKEAFINGYKTYKKEHEERFECDLLPVKEVFKKLTFEKGRKEILKDSK IHIENWYKEKTNNIPREKLKTVLRYANNSEHKEFLEKIVNGDISFVRVKKVENIPYDGYVYDLSIKHNQNFISNGVISHN CTYHRTSSTRVSLDGMRVAREYLKLNNLEDYLKNREYFMEGAHECIRPTKPMNTDELIEFLKENNIKLTKNHIKVYDLIF RRFIASQMKEAVVEYEEIYIKDLDEKVEGYVDIKFDGWSRIYNLKLKKLPRIEKSSLKVLDKKLRKIPKVPLYDEGEVVK LMKERGIGRPSTYAQIIKKLLDRGYVVKSKDKNKLIPTKLGIEVYNYLINNYPHLISEERTRELEEIMDKIENGEVDYIE VLKALHEEILSIR
Specific function: Modifies the topological state of DNA by introducing positive supercoils in an ATP-dependent process. It cleaves transiently a single DNA strand and remains covalently bound to the 5' DNA end through a tyrosine residue. May be involved in rewinding the DN
COG id: COG1110
COG function: function code L; Reverse gyrase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 Toprim domain
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787529, Length=258, Percent_Identity=31.3953488372093, Blast_Score=103, Evalue=1e-22,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): RGYR_METJA (Q58907)
Other databases:
- EMBL: L77117 - PIR: G64488 - RefSeq: NP_248519.1 - ProteinModelPortal: Q58907 - GeneID: 1452419 - GenomeReviews: L77117_GR - KEGG: mja:MJ_1512 - NMPDR: fig|243232.1.peg.1556 - TIGR: MJ1512 - HOGENOM: HBG312311 - OMA: TSTKYKY - ProtClustDB: PRK14701 - BioCyc: MJAN243232:MJ_1512-MONOMER - BRENDA: 5.99.1.3 - GO: GO:0005694 - HAMAP: MF_01125 - InterPro: IPR014001 - InterPro: IPR011545 - InterPro: IPR001982 - InterPro: IPR003586 - InterPro: IPR003587 - InterPro: IPR001650 - InterPro: IPR014021 - InterPro: IPR006142 - InterPro: IPR004042 - InterPro: IPR006141 - InterPro: IPR005736 - InterPro: IPR003601 - InterPro: IPR013497 - InterPro: IPR013824 - InterPro: IPR013826 - InterPro: IPR000380 - InterPro: IPR003602 - InterPro: IPR006171 - Gene3D: G3DSA:1.10.460.10 - Gene3D: G3DSA:1.10.290.10 - PANTHER: PTHR11390 - PRINTS: PR00379 - PRINTS: PR00417 - SMART: SM00487 - SMART: SM00490 - SMART: SM00305 - SMART: SM00306 - SMART: SM00437 - SMART: SM00436 - SMART: SM00493 - TIGRFAMs: TIGR01443 - TIGRFAMs: TIGR01445 - TIGRFAMs: TIGR01054
Pfam domain/function: PF00270 DEAD; PF00271 Helicase_C; PF00961 LAGLIDADG_1; PF01131 Topoisom_bac; PF01751 Toprim; SSF56712 Topo_IA_core
EC number: =3.6.4.12; =5.99.1.3
Molecular weight: Translated: 188259; Mature: 188259
Theoretical pI: Translated: 8.90; Mature: 8.90
Prosite motif: PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1; PS51194 HELICASE_CTER; PS50818 INTEIN_C_TER; PS50819 INTEIN_ENDONUCLEASE; PS50817 INTEIN_N_TER
Important sites: ACT_SITE 1363-1363 BINDING 83-83
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIPMIYKEMCPNCNGEITSERLAIGVCEKCLKEENVFEKLKLCEKLREEKTLKNLKDYCI CCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE IWNEFKEFEEFVKDLGFELLSIQKMWAKRVLKNKSFSIVVPTGVGKSFFGILMSLFLAKK EHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCC GKRCYIILPTTLLVKQTYEKISSLTEKNNLNIRVVAYHSELSTKEKKEVKERIENNDYDV CCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEE LITTSNYLTKNMPKCKFDFVFVDDVDALLKASKNIDRTLKLLGFDEEIINEAYKIIYLIK EEEECHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHEEEEEEEE IGKIEDAMKKREILKKKISKIKHGCLIIASATGKSYGDRVKLYRELLDFEIGFGMNKLRD ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH VVDIYDEEFSKEKILEYIKLFGSGGIVFVSIDYGVEKAQEIEKYLLENNIKAKLIHSKDK HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCC KGFDDFREGKIDVLIGVASYYGVLVRGLDMPERVRYAIFYGIPKFKIRLKEYINSLKEKG CCCCHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEEHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCC ELKEDINIEGKTEEEIRQIITEKLKIKNFSLRKEDDEYLLLIPDVKTYIQASGRTSRMTE CCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCCHHHHH FGLTKGASIVLVDEKEIFEALKKYMLFMYESEFKRIDEVNLEELIKKIDEDREKIKVGRA HCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHCCC KGKVPDLLKSVLMVVESPNKARTIANFFGKPSVRKINNRNVYEVCIGDLNLIITASGGHV CCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCEEEEEECCEEEEEEECCCEE FDLVTKEGFYGVKIENNLYIPIYTSIKKVNGEQFTDQKDLEELIKQLMEKGERVNAMDAK EEEEECCCEEEEEECCEEEEEEEHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCH ENIEIIREIADEVDAIFIATDIDTEGEKIGYDIAINALPFNRNIYRVGFNEITKRAILKA HHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCCEECEEEEEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHHHH VESFKKGEELSLDENKVKGQVVRRIEDRWIGFRLSQKLWEVFNKNYLSAGRVQTPVLGWI HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH IERYNEHKIKVPYLSLKLENDIYIGKIWEDEFDKDEVEVEVKVYEKEIPPLPPFTTDTLL HHHCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHH EEATKRFGLSTDEIMSIAQELFELGLCLTPDTYVVLGDGRIETIEDIVNAKERNVLSLDL HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEE DNLSIKIDTAIKFWKLRYNGNLSKITLSNNYELKATPDHCLLVLRDNQLKWIPAKDIKEN CCEEEEEECEEEEEEEEECCCEEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEECCCEEEECCCCCCCC DYIAMPFNYKVERKPISLLNLLKYLDITDVLIEFDENSTIFEKIAEYIRNNIKTSTKYKY CEEEECCCCEECCCHHHHHHHHHHHCHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH LRNRRVPLKYLIEWNFDLDEIEKEAKYIYKSVAGTKKIPLFKLDERFWYFAGLVLGDGSI HHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHEEEEEEEEECCCC QDSKIRIAQTPLKDVKSILDETFPFLHNWISGNQVIISNPIIAEILEKLGMRNGKLNGII CCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEE FSLPESYINALIAGYFDTDGCFSLLYDKKAKKHNLRMVLTSKRRDVLEKIGIYLNSIGIL EECCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NTLHKSREVYSLIISNKSLETFKEKIAKYLKIRKEAFINGYKTYKKEHEERFECDLLPVK HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH EVFKKLTFEKGRKEILKDSKIHIENWYKEKTNNIPREKLKTVLRYANNSEHKEFLEKIVN HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHC GDISFVRVKKVENIPYDGYVYDLSIKHNQNFISNGVISHNCTYHRTSSTRVSLDGMRVAR CCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHCCCEECCCEEEECCCCEEEHHHHHHHH EYLKLNNLEDYLKNREYFMEGAHECIRPTKPMNTDELIEFLKENNIKLTKNHIKVYDLIF HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHH RRFIASQMKEAVVEYEEIYIKDLDEKVEGYVDIKFDGWSRIYNLKLKKLPRIEKSSLKVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHEEEHHHHCCCCCHHHHHHH DKKLRKIPKVPLYDEGEVVKLMKERGIGRPSTYAQIIKKLLDRGYVVKSKDKNKLIPTKL HHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCHHH GIEVYNYLINNYPHLISEERTRELEEIMDKIENGEVDYIEVLKALHEEILSIR HHHHHHHHHHCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MIPMIYKEMCPNCNGEITSERLAIGVCEKCLKEENVFEKLKLCEKLREEKTLKNLKDYCI CCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE IWNEFKEFEEFVKDLGFELLSIQKMWAKRVLKNKSFSIVVPTGVGKSFFGILMSLFLAKK EHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCC GKRCYIILPTTLLVKQTYEKISSLTEKNNLNIRVVAYHSELSTKEKKEVKERIENNDYDV CCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEE LITTSNYLTKNMPKCKFDFVFVDDVDALLKASKNIDRTLKLLGFDEEIINEAYKIIYLIK EEEECHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHEEEEEEEE IGKIEDAMKKREILKKKISKIKHGCLIIASATGKSYGDRVKLYRELLDFEIGFGMNKLRD ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH VVDIYDEEFSKEKILEYIKLFGSGGIVFVSIDYGVEKAQEIEKYLLENNIKAKLIHSKDK HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCC KGFDDFREGKIDVLIGVASYYGVLVRGLDMPERVRYAIFYGIPKFKIRLKEYINSLKEKG CCCCHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEEHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCC ELKEDINIEGKTEEEIRQIITEKLKIKNFSLRKEDDEYLLLIPDVKTYIQASGRTSRMTE CCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCCHHHHH FGLTKGASIVLVDEKEIFEALKKYMLFMYESEFKRIDEVNLEELIKKIDEDREKIKVGRA HCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHCCC KGKVPDLLKSVLMVVESPNKARTIANFFGKPSVRKINNRNVYEVCIGDLNLIITASGGHV CCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCEEEEEECCEEEEEEECCCEE FDLVTKEGFYGVKIENNLYIPIYTSIKKVNGEQFTDQKDLEELIKQLMEKGERVNAMDAK EEEEECCCEEEEEECCEEEEEEEHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCH ENIEIIREIADEVDAIFIATDIDTEGEKIGYDIAINALPFNRNIYRVGFNEITKRAILKA HHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCCEECEEEEEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHHHH VESFKKGEELSLDENKVKGQVVRRIEDRWIGFRLSQKLWEVFNKNYLSAGRVQTPVLGWI HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH IERYNEHKIKVPYLSLKLENDIYIGKIWEDEFDKDEVEVEVKVYEKEIPPLPPFTTDTLL HHHCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHH EEATKRFGLSTDEIMSIAQELFELGLCLTPDTYVVLGDGRIETIEDIVNAKERNVLSLDL HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEE DNLSIKIDTAIKFWKLRYNGNLSKITLSNNYELKATPDHCLLVLRDNQLKWIPAKDIKEN CCEEEEEECEEEEEEEEECCCEEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEECCCEEEECCCCCCCC DYIAMPFNYKVERKPISLLNLLKYLDITDVLIEFDENSTIFEKIAEYIRNNIKTSTKYKY CEEEECCCCEECCCHHHHHHHHHHHCHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH LRNRRVPLKYLIEWNFDLDEIEKEAKYIYKSVAGTKKIPLFKLDERFWYFAGLVLGDGSI HHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHEEEEEEEEECCCC QDSKIRIAQTPLKDVKSILDETFPFLHNWISGNQVIISNPIIAEILEKLGMRNGKLNGII CCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEE FSLPESYINALIAGYFDTDGCFSLLYDKKAKKHNLRMVLTSKRRDVLEKIGIYLNSIGIL EECCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NTLHKSREVYSLIISNKSLETFKEKIAKYLKIRKEAFINGYKTYKKEHEERFECDLLPVK HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH EVFKKLTFEKGRKEILKDSKIHIENWYKEKTNNIPREKLKTVLRYANNSEHKEFLEKIVN HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHC GDISFVRVKKVENIPYDGYVYDLSIKHNQNFISNGVISHNCTYHRTSSTRVSLDGMRVAR CCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHCCCEECCCEEEECCCCEEEHHHHHHHH EYLKLNNLEDYLKNREYFMEGAHECIRPTKPMNTDELIEFLKENNIKLTKNHIKVYDLIF HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHH RRFIASQMKEAVVEYEEIYIKDLDEKVEGYVDIKFDGWSRIYNLKLKKLPRIEKSSLKVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHEEEHHHHCCCCCHHHHHHH DKKLRKIPKVPLYDEGEVVKLMKERGIGRPSTYAQIIKKLLDRGYVVKSKDKNKLIPTKL HHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCHHH GIEVYNYLINNYPHLISEERTRELEEIMDKIENGEVDYIEVLKALHEEILSIR HHHHHHHHHHCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087