| Definition | Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_000909 |
| Length | 1,664,970 |
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The map label for this gene is 15669098
Identifier: 15669098
GI number: 15669098
Start: 837018
End: 840716
Strand: Direct
Name: 15669098
Synonym: MJ0908
Alternate gene names: NA
Gene position: 837018-840716 (Clockwise)
Preceding gene: 15669096
Following gene: 15669099
Centisome position: 50.27
GC content: 33.06
Gene sequence:
>3699_bases TTGGTGATACTTATGATAAAGATTGGCTTTGTTTCAACAATAGATAGTGATGATTTAGTTTTTGAAGAAGCATATAAAGA GATTAAAAAATATGGCATTGAATTTAAAATATTGGATTATAAATGTAGCAGAAAGGAGTTTGAAGAATTTTTAGAGTTTA TTAAAGAAGCTAATATTGTTTTTACAAAACTCATGGGAGGGAAAAATGCCTTCAAGTATTACGATGAATTGGCTGAGTTT TGTAAAAGGCATAACATCCCATTTCTCCCTCTACCAACAATCTCAGAAATTCATCCAGATTTAGAGAAGGATAGGACAGT AGATGATGACGTAAAGAATAAAGTTGTCAAATATTTGGGATATGAAGGGGTTTATAATTACAAAAATCTTCTTTTATATT TGGCAAATAGGTTTGGAAATTTAAATGTTGAGTATGAAGAACCAAGACCAATGCCATGGCAAGGAATTTACTATAAAGGA AAATACTTTGAAACATTAGATGATTATCTAAACTATCTAAAAGAATTGGGCAGAGATTTAGATAAACCAATTATAGGAGT TTTATTTTATAGAAATTGGTTTGTAGCTAATAACATTGATTATGTTAATGATTTGATTGATATTATTGAGAATAAAGGAG CTATTCCAATAGCTGTTTTTAGCTCTCATTTAAAGAACGAACTCGGCTCTATAGGAACTTTAGAAACATTCAAAAGATTT TTCTACAAAGATGGGAAGCCAATAGTTCATGCCTTAATTAACACTACCATGTTCACTCTTTCAATGGGTGTTAAGGCAGA GTTGTTAAAAGATGAGCCGGAGTTTTTGAAAGAGCTTAATGTTCCAATACTGCAGGGGATTATATCAACTGGATTTATTG AGGATTGGAAAAAGTCAGTATCTGGATTAAATCCAATTGATTTAATTATAGGAATGGCAATGCCAGAGTTTGATGGGGCA ATAATACATTTCCCAATTGGTGGGAAGGAGAAGATAAAAGATGGAGAAGTTGGAGTTCCAATTATTAAGTATAGAGCTAT AAGAGATAGAGCTGAGAAGATAGTTGATTTAGCCCTAAGATATGCAAATTTAAAATTAAAGTCAAATAAAGATAAAAAAA TAGCCATAATTTTCCACAATTATCCACCAAGGAATGACAAGATAGCAAGTGCCTTTGGTTTAGATAGCCCAGAGAGTGTT GTTAATATTTTGAAGGAGATGAAGAAAAGAGGATTTATAGTTGATGAGATTCCAAAGAATGGAACTGAGTTAATAAAAAA GATGTTAAACTATGCCACAAATGATAAGAGATTTCTAACTGAAGAGATGATAAAAAAAGCAGTTGGAAAAGTAAAAAAAG AAGATTACGAGAAGTGGTTTAACTCTCTGTCTGAAAAGGTTAAGCAAGAGCTAATAAAAAATTGGGGAGCCATTCCTGGA GATGTTATGAACTTCGATGGAGAGCTAATAATCCCAGGAATAATTAATGGAAATGTCTTTATCTCAGTTCAGCCACCAAG AGGATTTGGAGAGAATCCCTCTGCCATATACCACTCTCCAGATTTGCCACCAACTCATTACTATATAGCATTTTATAAAT GGATTAAGGATGTTTTCAAAGCAGATGCAATTATGCATATAGGAAAGCATGGAAACTTAGAATGGCTTCCTGGGAAGTGT GTTGGCTTATCTAATGAATGCTATCCAGACATCTGCATGGAATTGCCAAATATTTATCCATTTATTGTAAATAATCCTGG AGAAGGAACTCAAGCAAAGAGGAGGAGTTATGCAACAATTATAAGCCATTTAATCCCACCAATGACAATATCTGATTTGT ATGGTGATTTAGTAGAGTTAGAAAAGAGTATTGATGACTATTATGAAACAGAGAATAAAGAGAAAAAAGAATTTTTAAAG AAAGAGATTTTAAAGAAGATTAAAGAGCTAAAATTAGATGAAGATTTGTTGGATGGAAAAGTTATAGATGAAGAGATAAA TGATGAGAATTTTGAAAAACTCCTAAATAAAATCCACGATTACTTAGAAACTTTAAAGAATAGGCAGATAAATGATGGAT TGCATATAATGGGAGTCCCATTGGAAGGAGATAAGTTAGTTAATATGTTATTCATGATTATTAGGTATCAATTCAACTAT TTGGAGATTTTGGCAGAGATTTTAGATTACAGTTGGGAAGAGTTAAATGAAAATAAAGGAAAGTATCACAAAATCTTAGA TGAAATAAATGAAATAGGATTAAATCTACTAAAAGAGTATATGCAATACAACTTCGATGAAAATAAGATTGATGAGCTAA AAACAGTTAAAATAAACTCTAAATTAAGGGATGTCTTAAAAACCGTCTCGACAATCTATAAAAATCTAATGAAAGTTGAT GAAGAGATTATAAATGCAGTAAATGCCTTAGAGGGTTTTTACATCCCTCCAAGAGTTGCAGGAGCTCCTACGAAAGATAT AAACTGCCTTCCAACTGGAAGGAACTTTTATTCATGTAATCCGCAAGAGATTCCAACAAAATCTGCATATGAGATGGGTA AAAAATTGGCTGAGGACTTAATTAACAAGTATCTAAAAGAAGAAGGGAAATATCCTGAATATATAGGCGTTATCGTCTGG GGATCTCCAACTATGAGAACAAAAGGAGATGATATTGGAGAGATTTTATATTTATTGGGAGTTAAGCCAGTTTGGAATAA GATGGGAAGAGTTGTTGGTTTAGAAGTTATCCCATTGGAAGAGTTAGGGAGACCAAGGATCGATGTAACTTTGAGAATCT CTGGGTTGTTTAGAGACACTTTTCCAAACGTTGTTGAGCTTATAGATGAAGCAATAAAAATGGTTGCTAATTTAGATGAG CCAGACGAGATGAACTATGTAAAGAAGCATTATAGGGAGGAGGTTGAAGAGAAGATAAAGAAGGGTATTGATGAAAAAAC AGCCAAAGAAACCTCATTATATAGGATATTCAGTGATAAACCGGGTTGTTATGGAGCTGGTGTCTCTCATTTAATAGATG AGAAAAACTGGGAATCAATAGAGGACTTTGCAAAGGTTTATGTTGAATGGGGAGGCTATGCTTATGGAAAGGGCTATTAT GGAGTAGAGGCAAAAGAAGAGTTTATAAATCGTCTATCAAAGATTGAATTAACAGTTAAAAATGAAGATAGCCAAGAATG GGATATATTTGAGGGGGATGACTTCAACAGCTATCATGGTGGTTTAATTGCCTCTGTAACCTATTACTCTGGCAAAAAGC CAGTGAGTTATGTTGGAGATACATCAAATCCAAATGATATAAGAACAAAACATCTAAAAGAAGAAGGAAAAGAAATATTC AGAACAAAAATCATGAATCCAAAGTGGATTGAGGGAATGAAGAGGCATGGATATAAAGGAGCCGCTGACTTTTCAAAGTA TGTTGATCATATGTTTGCATGGGATGCAACCTCTGGCATAATAGACGATTGGATGTATGAGAAGATTGCTGAGAAGTATG TGTTTGATAAAGATATGGAAGAGTTTTTTAAAGAAAATAATCCTTATGCTCTGCTAAATATAACTGAAAGGTTGTTGGAG GCAATAGAGAGAGGAATGTGGAAGGCAGATGAGGAGATGAAAGAGAAGTTAAGGAAGAAGTATTTAGAAATAGAGGGAAT GATTGAGGAAAAACTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CCATCCACCAAATTTTTATTATAAAAAGTGATAAAAAGATGATAAATTAAATAATAAACTAAAGATATTGTTAAGTTAAT TAAGATTTTATTTAATATAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AACTTTTTATATCTTAAAAGTTACAAAAAGTAATTTGGGCGATTTTAAATGAGCATCGTTCAATCTTATATTACTGATGA AAAAGGAAATATCAAAGGAG
Product: cobalamin biosynthesis protein CobN
Products: ADP; phosphate; cob(II)yrinic acid a,c-diamide; H+
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1232; Mature: 1232
Protein sequence:
>1232_residues MVILMIKIGFVSTIDSDDLVFEEAYKEIKKYGIEFKILDYKCSRKEFEEFLEFIKEANIVFTKLMGGKNAFKYYDELAEF CKRHNIPFLPLPTISEIHPDLEKDRTVDDDVKNKVVKYLGYEGVYNYKNLLLYLANRFGNLNVEYEEPRPMPWQGIYYKG KYFETLDDYLNYLKELGRDLDKPIIGVLFYRNWFVANNIDYVNDLIDIIENKGAIPIAVFSSHLKNELGSIGTLETFKRF FYKDGKPIVHALINTTMFTLSMGVKAELLKDEPEFLKELNVPILQGIISTGFIEDWKKSVSGLNPIDLIIGMAMPEFDGA IIHFPIGGKEKIKDGEVGVPIIKYRAIRDRAEKIVDLALRYANLKLKSNKDKKIAIIFHNYPPRNDKIASAFGLDSPESV VNILKEMKKRGFIVDEIPKNGTELIKKMLNYATNDKRFLTEEMIKKAVGKVKKEDYEKWFNSLSEKVKQELIKNWGAIPG DVMNFDGELIIPGIINGNVFISVQPPRGFGENPSAIYHSPDLPPTHYYIAFYKWIKDVFKADAIMHIGKHGNLEWLPGKC VGLSNECYPDICMELPNIYPFIVNNPGEGTQAKRRSYATIISHLIPPMTISDLYGDLVELEKSIDDYYETENKEKKEFLK KEILKKIKELKLDEDLLDGKVIDEEINDENFEKLLNKIHDYLETLKNRQINDGLHIMGVPLEGDKLVNMLFMIIRYQFNY LEILAEILDYSWEELNENKGKYHKILDEINEIGLNLLKEYMQYNFDENKIDELKTVKINSKLRDVLKTVSTIYKNLMKVD EEIINAVNALEGFYIPPRVAGAPTKDINCLPTGRNFYSCNPQEIPTKSAYEMGKKLAEDLINKYLKEEGKYPEYIGVIVW GSPTMRTKGDDIGEILYLLGVKPVWNKMGRVVGLEVIPLEELGRPRIDVTLRISGLFRDTFPNVVELIDEAIKMVANLDE PDEMNYVKKHYREEVEEKIKKGIDEKTAKETSLYRIFSDKPGCYGAGVSHLIDEKNWESIEDFAKVYVEWGGYAYGKGYY GVEAKEEFINRLSKIELTVKNEDSQEWDIFEGDDFNSYHGGLIASVTYYSGKKPVSYVGDTSNPNDIRTKHLKEEGKEIF RTKIMNPKWIEGMKRHGYKGAADFSKYVDHMFAWDATSGIIDDWMYEKIAEKYVFDKDMEEFFKENNPYALLNITERLLE AIERGMWKADEEMKEKLRKKYLEIEGMIEEKL
Sequences:
>Translated_1232_residues MVILMIKIGFVSTIDSDDLVFEEAYKEIKKYGIEFKILDYKCSRKEFEEFLEFIKEANIVFTKLMGGKNAFKYYDELAEF CKRHNIPFLPLPTISEIHPDLEKDRTVDDDVKNKVVKYLGYEGVYNYKNLLLYLANRFGNLNVEYEEPRPMPWQGIYYKG KYFETLDDYLNYLKELGRDLDKPIIGVLFYRNWFVANNIDYVNDLIDIIENKGAIPIAVFSSHLKNELGSIGTLETFKRF FYKDGKPIVHALINTTMFTLSMGVKAELLKDEPEFLKELNVPILQGIISTGFIEDWKKSVSGLNPIDLIIGMAMPEFDGA IIHFPIGGKEKIKDGEVGVPIIKYRAIRDRAEKIVDLALRYANLKLKSNKDKKIAIIFHNYPPRNDKIASAFGLDSPESV VNILKEMKKRGFIVDEIPKNGTELIKKMLNYATNDKRFLTEEMIKKAVGKVKKEDYEKWFNSLSEKVKQELIKNWGAIPG DVMNFDGELIIPGIINGNVFISVQPPRGFGENPSAIYHSPDLPPTHYYIAFYKWIKDVFKADAIMHIGKHGNLEWLPGKC VGLSNECYPDICMELPNIYPFIVNNPGEGTQAKRRSYATIISHLIPPMTISDLYGDLVELEKSIDDYYETENKEKKEFLK KEILKKIKELKLDEDLLDGKVIDEEINDENFEKLLNKIHDYLETLKNRQINDGLHIMGVPLEGDKLVNMLFMIIRYQFNY LEILAEILDYSWEELNENKGKYHKILDEINEIGLNLLKEYMQYNFDENKIDELKTVKINSKLRDVLKTVSTIYKNLMKVD EEIINAVNALEGFYIPPRVAGAPTKDINCLPTGRNFYSCNPQEIPTKSAYEMGKKLAEDLINKYLKEEGKYPEYIGVIVW GSPTMRTKGDDIGEILYLLGVKPVWNKMGRVVGLEVIPLEELGRPRIDVTLRISGLFRDTFPNVVELIDEAIKMVANLDE PDEMNYVKKHYREEVEEKIKKGIDEKTAKETSLYRIFSDKPGCYGAGVSHLIDEKNWESIEDFAKVYVEWGGYAYGKGYY GVEAKEEFINRLSKIELTVKNEDSQEWDIFEGDDFNSYHGGLIASVTYYSGKKPVSYVGDTSNPNDIRTKHLKEEGKEIF RTKIMNPKWIEGMKRHGYKGAADFSKYVDHMFAWDATSGIIDDWMYEKIAEKYVFDKDMEEFFKENNPYALLNITERLLE AIERGMWKADEEMKEKLRKKYLEIEGMIEEKL >Mature_1232_residues MVILMIKIGFVSTIDSDDLVFEEAYKEIKKYGIEFKILDYKCSRKEFEEFLEFIKEANIVFTKLMGGKNAFKYYDELAEF CKRHNIPFLPLPTISEIHPDLEKDRTVDDDVKNKVVKYLGYEGVYNYKNLLLYLANRFGNLNVEYEEPRPMPWQGIYYKG KYFETLDDYLNYLKELGRDLDKPIIGVLFYRNWFVANNIDYVNDLIDIIENKGAIPIAVFSSHLKNELGSIGTLETFKRF FYKDGKPIVHALINTTMFTLSMGVKAELLKDEPEFLKELNVPILQGIISTGFIEDWKKSVSGLNPIDLIIGMAMPEFDGA IIHFPIGGKEKIKDGEVGVPIIKYRAIRDRAEKIVDLALRYANLKLKSNKDKKIAIIFHNYPPRNDKIASAFGLDSPESV VNILKEMKKRGFIVDEIPKNGTELIKKMLNYATNDKRFLTEEMIKKAVGKVKKEDYEKWFNSLSEKVKQELIKNWGAIPG DVMNFDGELIIPGIINGNVFISVQPPRGFGENPSAIYHSPDLPPTHYYIAFYKWIKDVFKADAIMHIGKHGNLEWLPGKC VGLSNECYPDICMELPNIYPFIVNNPGEGTQAKRRSYATIISHLIPPMTISDLYGDLVELEKSIDDYYETENKEKKEFLK KEILKKIKELKLDEDLLDGKVIDEEINDENFEKLLNKIHDYLETLKNRQINDGLHIMGVPLEGDKLVNMLFMIIRYQFNY LEILAEILDYSWEELNENKGKYHKILDEINEIGLNLLKEYMQYNFDENKIDELKTVKINSKLRDVLKTVSTIYKNLMKVD EEIINAVNALEGFYIPPRVAGAPTKDINCLPTGRNFYSCNPQEIPTKSAYEMGKKLAEDLINKYLKEEGKYPEYIGVIVW GSPTMRTKGDDIGEILYLLGVKPVWNKMGRVVGLEVIPLEELGRPRIDVTLRISGLFRDTFPNVVELIDEAIKMVANLDE PDEMNYVKKHYREEVEEKIKKGIDEKTAKETSLYRIFSDKPGCYGAGVSHLIDEKNWESIEDFAKVYVEWGGYAYGKGYY GVEAKEEFINRLSKIELTVKNEDSQEWDIFEGDDFNSYHGGLIASVTYYSGKKPVSYVGDTSNPNDIRTKHLKEEGKEIF RTKIMNPKWIEGMKRHGYKGAADFSKYVDHMFAWDATSGIIDDWMYEKIAEKYVFDKDMEEFFKENNPYALLNITERLLE AIERGMWKADEEMKEKLRKKYLEIEGMIEEKL
Specific function: Unknown
COG id: COG1429
COG function: function code H; Cobalamin biosynthesis protein CobN and related Mg-chelatases
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the Mg-chelatase subunit H family
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): Y908_METJA (Q58318)
Other databases:
- EMBL: L77117 - PIR: D64413 - RefSeq: NP_247903.1 - ProteinModelPortal: Q58318 - GeneID: 1451797 - GenomeReviews: L77117_GR - KEGG: mja:MJ_0908 - NMPDR: fig|243232.1.peg.940 - TIGR: MJ0908 - HOGENOM: HBG405820 - OMA: QIRTGLH - ProtClustDB: CLSK796645 - BioCyc: MJAN243232:MJ_0908-MONOMER - InterPro: IPR003672 - InterPro: IPR011991 - Gene3D: G3DSA:1.10.10.10
Pfam domain/function: PF02514 CobN-Mg_chel
EC number: 6.6.1.2
Molecular weight: Translated: 142646; Mature: 142646
Theoretical pI: Translated: 5.14; Mature: 5.14
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVILMIKIGFVSTIDSDDLVFEEAYKEIKKYGIEFKILDYKCSRKEFEEFLEFIKEANIV CEEEEEEECCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHH FTKLMGGKNAFKYYDELAEFCKRHNIPFLPLPTISEIHPDLEKDRTVDDDVKNKVVKYLG EEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHC YEGVYNYKNLLLYLANRFGNLNVEYEEPRPMPWQGIYYKGKYFETLDDYLNYLKELGRDL CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DKPIIGVLFYRNWFVANNIDYVNDLIDIIENKGAIPIAVFSSHLKNELGSIGTLETFKRF CCHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH FYKDGKPIVHALINTTMFTLSMGVKAELLKDEPEFLKELNVPILQGIISTGFIEDWKKSV HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGLNPIDLIIGMAMPEFDGAIIHFPIGGKEKIKDGEVGVPIIKYRAIRDRAEKIVDLALR CCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YANLKLKSNKDKKIAIIFHNYPPRNDKIASAFGLDSPESVVNILKEMKKRGFIVDEIPKN HHHEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCC GTELIKKMLNYATNDKRFLTEEMIKKAVGKVKKEDYEKWFNSLSEKVKQELIKNWGAIPG 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: ATP; Hydrogenobyrinic acid a,c diamide; Co2+
Specific reaction: ATP + hydrogenobyrinic acid a,c-diamide + Co2+ = ADP + phosphate + cob(II)yrinic acid a,c-diamide + H+
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087