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The map label for this gene is yccS [C]

Identifier: 16273567

GI number: 16273567

Start: 1748553

End: 1750709

Strand: Reverse

Name: yccS [C]

Synonym: HI1680

Alternate gene names: 16273567

Gene position: 1750709-1748553 (Counterclockwise)

Preceding gene: 16273568

Following gene: 16273563

Centisome position: 95.66

GC content: 37.41

Gene sequence:

>2157_bases
ATGAATATTCGGTTAAATGCTAAAGTAATTTCTACAATTCCTGTTTTTATTGCCGTAAATATTGCGGCAGTGGGAATATG
GTTTTTTGATATTTCTTCGCAATCAATGCCTTTGATTCTAGGGATTATTGCAGGTGGTTTGGTGGATTTGGATAACCGTT
TAACTGGACGATTGAAAAACGTATTTTTTACCCTTATTGCCTTTTCTATTTCTTCCTTTATTGTGCAGTTACATATTGGC
AAGCCTATCCAATATATTGTGTTAATGACGGTGCTGACATTTATTTTCACTATGATTGGTGCCGTGGGGCAGCGTTATAG
CACCATTGCTTTCGGTTCATTAGTGGTTGCGCTTTACACCACATTAACTTATATCCCAGAGGTAAATGTATGGTTTATTA
ACCCTGTAATGATTTTATGCGGTACCTTGCTGTATAGCGTGGTGACTCTGATTGTTTACCTGTTTTTCCCAAATCGCCCC
GTGCAAGAAAGTGTCGCTAAAGCGTTTTGTGCGTTGGGCGAATATTTAGATACCAAATCCTGTTTTTTTGATCCTGACGA
AGTGGCTGAGATTGAAAAAAAACATCTTAATTTCGCGATGAAAAATGCGAATGTTGTCACGGCATTTAATATTGTTCGCA
CCGCGCTTTTTTATCGCATTAGAGGGCAACATCGCCATCCTCTTACTCAGAGAATGTTACGTTACTATTTTGCCGCACAA
GACATTCATGAGCGCGCCAATTCTACGCATTTTGATTATCAACAAATAACGGAAAAACTAAAAAATACAGATTTGATTTT
CCGTATTCAACGTTTGTTAGAACTACAAGCACAATCCTGTAAAGAAATTACGGCGAGTTTGCGTGAAAATAAACCCTATC
ATTTTAATAAACGTGTCGAACGTGCGCTTTTAGGCACCTTGCATTCCTTTGATCTATATCGAGCACAACATCTTAATGAT
CAAGATGAACTGATTGATATTCAAACCTTGTTAGATAATTTACAAAGTATTAACTGGCAACTTCGCCAGTTAGCACAAGA
CACGACGGTTACAGAACAATTAGCTCAAATTCATACGGAACAAATCACTGGGTTAAAAAATATCAGTGCGGTGATTTTTA
GCCATTTTACTTTTGAGTCACCGTTGTTCCGTCATGCAGTACGCTTATCTATTGTGGTATTTTTGTGCTGTGCAATTGTT
GAGTTTTTCCAATTTAATCTTGGTTATTGGATTTTATTGACCACTGTATTTGTGTGTCAGCCAAATTATTCTGCAACTAA
AGTACGTTTACGTCAGCGCATTATCGGCACGATATTAGGCGTAGTGGTGGGGTCTCTATTACCTTATTTAAATCCAACCT
TAGAATTAAAACTGGGTCTTGTGGTGCTTACAAGCACGTTGTTCTTTTTCTTTCGTAGTAATAATTACAGTTTCTCGACC
TTTTTCATCACACTGCAAGTATTGCTCAGTTTTGATGTCATGGGATTTGATACGGCAGCCGCCTTAATGCCTCGTTTACT
TGATACATTACTTGGTGCCGCGATTTCATGGTTTGCCGTATCTTACTTATGGCCAGATTGGAAATATTTGCAACTTGATA
AAGTGAGCCATCAAGCATTGCGTAGTGATGCGGTGTATTTATTGCATATTATTAGCCAATTGCAATTTGGTAAAAGTGAC
GATCTTAAATATCGCATAGCACGTCGCAATGCGCATCAATATGCAGCCGCACTGAGTACAACGCTTTCTAATATGAATAA
TGAGCCAGTGAAATATAAGGCATATTTACAGAAAGGTTTTGATTTGCTCAAACTTAATTATTCTCTATTAAGCTATATTT
CAGCACTGGGAGCTTATCGCGACAGAATGAAAAATTTGCAACAGACCGCACAGTTTTTATCTGGTTTTTATCCTGTGGCA
AAGAAAATTATTTATACCTTAGAACATATTGAAGAAATACCTGAGGCTATTTTTAACCAACAGCAAGAAAGTATCGAAAC
ACATTTAAAAGAATTGGAAAAACAAGAGATGACCGCAGAAGAACGCGCCGTCTTTAGTTTGCCGTATCAACAATTGAATT
TGATTACCCAACTATTGCCACAATTTTATGGGTATTTTAAGAAAGAGATAAACTGTCAGAGTGCGGGAGCGTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGTTTCTTAAACTGGGCAAAATCCCATAAATAATGACCGCACTTTATACAATAAAAAGTGAGCCTTGTTGCTCACTTTTC
TATTTTGATAAGGATTTGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATAAAAGTGCGGTTGATTTTTGAGAGATTTTAAAACGCTTTGAAAATTGACCGCACTTTATTTTTTATTAGGCAATAA
CATTGACGAATGAGTTATTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 718; Mature: 718

Protein sequence:

>718_residues
MNIRLNAKVISTIPVFIAVNIAAVGIWFFDISSQSMPLILGIIAGGLVDLDNRLTGRLKNVFFTLIAFSISSFIVQLHIG
KPIQYIVLMTVLTFIFTMIGAVGQRYSTIAFGSLVVALYTTLTYIPEVNVWFINPVMILCGTLLYSVVTLIVYLFFPNRP
VQESVAKAFCALGEYLDTKSCFFDPDEVAEIEKKHLNFAMKNANVVTAFNIVRTALFYRIRGQHRHPLTQRMLRYYFAAQ
DIHERANSTHFDYQQITEKLKNTDLIFRIQRLLELQAQSCKEITASLRENKPYHFNKRVERALLGTLHSFDLYRAQHLND
QDELIDIQTLLDNLQSINWQLRQLAQDTTVTEQLAQIHTEQITGLKNISAVIFSHFTFESPLFRHAVRLSIVVFLCCAIV
EFFQFNLGYWILLTTVFVCQPNYSATKVRLRQRIIGTILGVVVGSLLPYLNPTLELKLGLVVLTSTLFFFFRSNNYSFST
FFITLQVLLSFDVMGFDTAAALMPRLLDTLLGAAISWFAVSYLWPDWKYLQLDKVSHQALRSDAVYLLHIISQLQFGKSD
DLKYRIARRNAHQYAAALSTTLSNMNNEPVKYKAYLQKGFDLLKLNYSLLSYISALGAYRDRMKNLQQTAQFLSGFYPVA
KKIIYTLEHIEEIPEAIFNQQQESIETHLKELEKQEMTAEERAVFSLPYQQLNLITQLLPQFYGYFKKEINCQSAGAL

Sequences:

>Translated_718_residues
MNIRLNAKVISTIPVFIAVNIAAVGIWFFDISSQSMPLILGIIAGGLVDLDNRLTGRLKNVFFTLIAFSISSFIVQLHIG
KPIQYIVLMTVLTFIFTMIGAVGQRYSTIAFGSLVVALYTTLTYIPEVNVWFINPVMILCGTLLYSVVTLIVYLFFPNRP
VQESVAKAFCALGEYLDTKSCFFDPDEVAEIEKKHLNFAMKNANVVTAFNIVRTALFYRIRGQHRHPLTQRMLRYYFAAQ
DIHERANSTHFDYQQITEKLKNTDLIFRIQRLLELQAQSCKEITASLRENKPYHFNKRVERALLGTLHSFDLYRAQHLND
QDELIDIQTLLDNLQSINWQLRQLAQDTTVTEQLAQIHTEQITGLKNISAVIFSHFTFESPLFRHAVRLSIVVFLCCAIV
EFFQFNLGYWILLTTVFVCQPNYSATKVRLRQRIIGTILGVVVGSLLPYLNPTLELKLGLVVLTSTLFFFFRSNNYSFST
FFITLQVLLSFDVMGFDTAAALMPRLLDTLLGAAISWFAVSYLWPDWKYLQLDKVSHQALRSDAVYLLHIISQLQFGKSD
DLKYRIARRNAHQYAAALSTTLSNMNNEPVKYKAYLQKGFDLLKLNYSLLSYISALGAYRDRMKNLQQTAQFLSGFYPVA
KKIIYTLEHIEEIPEAIFNQQQESIETHLKELEKQEMTAEERAVFSLPYQQLNLITQLLPQFYGYFKKEINCQSAGAL
>Mature_718_residues
MNIRLNAKVISTIPVFIAVNIAAVGIWFFDISSQSMPLILGIIAGGLVDLDNRLTGRLKNVFFTLIAFSISSFIVQLHIG
KPIQYIVLMTVLTFIFTMIGAVGQRYSTIAFGSLVVALYTTLTYIPEVNVWFINPVMILCGTLLYSVVTLIVYLFFPNRP
VQESVAKAFCALGEYLDTKSCFFDPDEVAEIEKKHLNFAMKNANVVTAFNIVRTALFYRIRGQHRHPLTQRMLRYYFAAQ
DIHERANSTHFDYQQITEKLKNTDLIFRIQRLLELQAQSCKEITASLRENKPYHFNKRVERALLGTLHSFDLYRAQHLND
QDELIDIQTLLDNLQSINWQLRQLAQDTTVTEQLAQIHTEQITGLKNISAVIFSHFTFESPLFRHAVRLSIVVFLCCAIV
EFFQFNLGYWILLTTVFVCQPNYSATKVRLRQRIIGTILGVVVGSLLPYLNPTLELKLGLVVLTSTLFFFFRSNNYSFST
FFITLQVLLSFDVMGFDTAAALMPRLLDTLLGAAISWFAVSYLWPDWKYLQLDKVSHQALRSDAVYLLHIISQLQFGKSD
DLKYRIARRNAHQYAAALSTTLSNMNNEPVKYKAYLQKGFDLLKLNYSLLSYISALGAYRDRMKNLQQTAQFLSGFYPVA
KKIIYTLEHIEEIPEAIFNQQQESIETHLKELEKQEMTAEERAVFSLPYQQLNLITQLLPQFYGYFKKEINCQSAGAL

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the yccS/yhfK family

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081808, Length=701, Percent_Identity=38.0884450784593, Blast_Score=459, Evalue=1e-130,
Organism=Escherichia coli, GI87082248, Length=170, Percent_Identity=28.2352941176471, Blast_Score=89, Evalue=1e-18,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): Y1680_HAEIN (P44289)

Other databases:

- EMBL:   L42023
- PIR:   B64040
- RefSeq:   NP_439822.1
- GeneID:   950508
- GenomeReviews:   L42023_GR
- KEGG:   hin:HI1680
- NMPDR:   fig|71421.1.peg.1593
- TIGR:   HI_1680
- HOGENOM:   HBG644242
- OMA:   YSTIAFG
- ProtClustDB:   CLSK865871
- BioCyc:   HINF71421:HI_1680-MONOMER
- InterPro:   IPR010019
- InterPro:   IPR010020
- TIGRFAMs:   TIGR01666
- TIGRFAMs:   TIGR01667

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82375; Mature: 82375

Theoretical pI: Translated: 8.83; Mature: 8.83

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0xe416d48)-; HASH(0xd91aae4)-; HASH(0xe27fdcc)-; HASH(0xee7a740)-; HASH(0xef2c4c0)-; HASH(0xd04a4e8)-;

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNIRLNAKVISTIPVFIAVNIAAVGIWFFDISSQSMPLILGIIAGGLVDLDNRLTGRLKN
CCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
VFFTLIAFSISSFIVQLHIGKPIQYIVLMTVLTFIFTMIGAVGQRYSTIAFGSLVVALYT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
TLTYIPEVNVWFINPVMILCGTLLYSVVTLIVYLFFPNRPVQESVAKAFCALGEYLDTKS
HHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
CFFDPDEVAEIEKKHLNFAMKNANVVTAFNIVRTALFYRIRGQHRHPLTQRMLRYYFAAQ
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
DIHERANSTHFDYQQITEKLKNTDLIFRIQRLLELQAQSCKEITASLRENKPYHFNKRVE
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
RALLGTLHSFDLYRAQHLNDQDELIDIQTLLDNLQSINWQLRQLAQDTTVTEQLAQIHTE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QITGLKNISAVIFSHFTFESPLFRHAVRLSIVVFLCCAIVEFFQFNLGYWILLTTVFVCQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCC
PNYSATKVRLRQRIIGTILGVVVGSLLPYLNPTLELKLGLVVLTSTLFFFFRSNNYSFST
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
FFITLQVLLSFDVMGFDTAAALMPRLLDTLLGAAISWFAVSYLWPDWKYLQLDKVSHQAL
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHH
RSDAVYLLHIISQLQFGKSDDLKYRIARRNAHQYAAALSTTLSNMNNEPVKYKAYLQKGF
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCC
DLLKLNYSLLSYISALGAYRDRMKNLQQTAQFLSGFYPVAKKIIYTLEHIEEIPEAIFNQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QQESIETHLKELEKQEMTAEERAVFSLPYQQLNLITQLLPQFYGYFKKEINCQSAGAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
>Mature Secondary Structure
MNIRLNAKVISTIPVFIAVNIAAVGIWFFDISSQSMPLILGIIAGGLVDLDNRLTGRLKN
CCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
VFFTLIAFSISSFIVQLHIGKPIQYIVLMTVLTFIFTMIGAVGQRYSTIAFGSLVVALYT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
TLTYIPEVNVWFINPVMILCGTLLYSVVTLIVYLFFPNRPVQESVAKAFCALGEYLDTKS
HHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
CFFDPDEVAEIEKKHLNFAMKNANVVTAFNIVRTALFYRIRGQHRHPLTQRMLRYYFAAQ
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
DIHERANSTHFDYQQITEKLKNTDLIFRIQRLLELQAQSCKEITASLRENKPYHFNKRVE
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
RALLGTLHSFDLYRAQHLNDQDELIDIQTLLDNLQSINWQLRQLAQDTTVTEQLAQIHTE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QITGLKNISAVIFSHFTFESPLFRHAVRLSIVVFLCCAIVEFFQFNLGYWILLTTVFVCQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCC
PNYSATKVRLRQRIIGTILGVVVGSLLPYLNPTLELKLGLVVLTSTLFFFFRSNNYSFST
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
FFITLQVLLSFDVMGFDTAAALMPRLLDTLLGAAISWFAVSYLWPDWKYLQLDKVSHQAL
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHH
RSDAVYLLHIISQLQFGKSDDLKYRIARRNAHQYAAALSTTLSNMNNEPVKYKAYLQKGF
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCC
DLLKLNYSLLSYISALGAYRDRMKNLQQTAQFLSGFYPVAKKIIYTLEHIEEIPEAIFNQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QQESIETHLKELEKQEMTAEERAVFSLPYQQLNLITQLLPQFYGYFKKEINCQSAGAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800