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The map label for this gene is ygxB [H]

Identifier: 93007231

GI number: 93007231

Start: 2963317

End: 2965014

Strand: Direct

Name: ygxB [H]

Synonym: Pcryo_2407

Alternate gene names: 93007231

Gene position: 2963317-2965014 (Clockwise)

Preceding gene: 93007229

Following gene: 93007233

Centisome position: 96.84

GC content: 40.93

Gene sequence:

>1698_bases
ATGAATCCAATGTTTACATCTTTCAACGGTTATCTGGGTGGCCCTATCGGCTCCATCATCGGCGCTATTCTTATTTTTAT
CATTGGTTGGCTTGTCGCCTTGGGCATAGCTGCTCTGGTACGCGGCGTGCTGTCTAAAATCAATCTCAATCAACGTATGA
ACTCTTCAACGGGTAAAAGCTATGACTTAGAGGGCATCATCTCTAAGATTGTTTTTTGGTTTATTTTCGTTATCGCTATT
TCTGGCGCGTTAAGTCAGTTAAACCTAAACTCTATTTCAGCACCGTTTGCCAATATGGTAAACCAAGTACTCACCTTTAT
CCCTAATCTTATCGCTGCTATTGCAGTTGGTGTGATCGGTTGGGTAATTGCAACAGTTGCACGTACTGCCATCAATGCTG
CACTTTCAAAAACCTCAATGGATGAGCGTTTGAGTGCAAAAGCTGGTGTAAAACCAATGAGCAGCACGATTGCTGACATG
GTTTATTGGTTCATTCTATTAGTAGTATTGACCATGGTATTAGGTCAACTAGAGCTTGACGGTTTATTTGCTCCATTAAC
TAATATGGTTGATAAAATCTTCAGCTTTATCCCTAATATTCTGATTGCTGCTGTAGTATTCGTAGTAGGTTACATCATCG
CCAAAGTGGTACGTGGCATCGTAACCAACCTTGTTTCTACTTTTGATGTCCAAAAGCTTGCAACCAAAGCTGGTTTAAGT
GAACAGAATAGCTTACCTAACATTGCAGGTTCTTTAGCCTTTCTAGTAGTGATTATTCCAACAATCATTGCTGCTTTAAA
TGCCCTAAAAATTGATGTAATTGCTCGCCCTGCAACCAACATGCTAAACAAAATCATGGAAGCCTTGCCAAATATCTTTA
TGGCAATTGCTATCTTGGTTGTGACTTTTTATGTTGTACGTATGGTTGCAAACATCATCAAAGGCTTGCTTGAAAATACG
CAAATCAATCAGTTACCTGCCAAAGTTGGTCTTCAACAGACCATGGGTGATAAAAAGGTTTCTGACTTAGTTGGCTATGC
CATCGTATTTTTTGCCATGTTATTTGCCTCTATCGCTGCTGCTGACTTATTAGGTTTTGAGCCTATCTCAGCCATTATTG
CGATGTTTATTGCTTTCGGTGCTAATATCATCCTAGGCGCAATCATCCTATTCATCGGTTTTTGGCTTGCCAACATCATC
GCTGGTGTCGTTGAGCGCTCTGAACAAGGTTCACAGTTCCTAGCAAATATCGTGCGCGTTTTGATCATGGGCTTAGTACT
TGCCATGGGTCTAAAAGCAATGGGTATCGCTGACTCTATTGTCAACCTAGCATTTGGTCTAACTTTAGGTGCAGTTGCCG
TAGCATTTGCCCTATCGTTTGGTCTAGGTGGTCAAGAAGCAGCAGCACGTTTCTTACGCAAAATGCAGGATAAAATGGAC
AGAGAACGTGACGAAGCAAAAGCAAAATCTGCTTTGACGCCAAGCTCATCGACTCAAGATAAGGTTGCTGCTTCAGTACG
TGACAATACGCCAAGTACAGCTACTGATACGTTTGGTAGCAGCACAACCCAAGTAGATAATAATATCATCACACCTAATA
ACTTAAGCTCTACCAGTGATGTAAATTCTTCTACGGTTGATATCAATCATATTGCAACTGATGATAGTGATATCGATGGT
CCTAATAATCTAAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATACTAATAAATAGGTGTGTGTTTGCCTCAGATGAAACGCTTGAATTAAAGTGATTTTCTTATCTTATAGCAGACACAT
GATCATTAGAGGAGGACAGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTATCGTTATTGATTTATTTTATAAAAAAGACAGCTTAGGCTGTCTTTTTTTATGTTTGATAATAAGTAATTTTAGTCA
GTATTATTAGGGCGAGATGC

Product: TM helix protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF1 [H]

Number of amino acids: Translated: 565; Mature: 565

Protein sequence:

>565_residues
MNPMFTSFNGYLGGPIGSIIGAILIFIIGWLVALGIAALVRGVLSKINLNQRMNSSTGKSYDLEGIISKIVFWFIFVIAI
SGALSQLNLNSISAPFANMVNQVLTFIPNLIAAIAVGVIGWVIATVARTAINAALSKTSMDERLSAKAGVKPMSSTIADM
VYWFILLVVLTMVLGQLELDGLFAPLTNMVDKIFSFIPNILIAAVVFVVGYIIAKVVRGIVTNLVSTFDVQKLATKAGLS
EQNSLPNIAGSLAFLVVIIPTIIAALNALKIDVIARPATNMLNKIMEALPNIFMAIAILVVTFYVVRMVANIIKGLLENT
QINQLPAKVGLQQTMGDKKVSDLVGYAIVFFAMLFASIAAADLLGFEPISAIIAMFIAFGANIILGAIILFIGFWLANII
AGVVERSEQGSQFLANIVRVLIMGLVLAMGLKAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALSFGLGGQEAAARFLRKMQDKMD
RERDEAKAKSALTPSSSTQDKVAASVRDNTPSTATDTFGSSTTQVDNNIITPNNLSSTSDVNSSTVDINHIATDDSDIDG
PNNLR

Sequences:

>Translated_565_residues
MNPMFTSFNGYLGGPIGSIIGAILIFIIGWLVALGIAALVRGVLSKINLNQRMNSSTGKSYDLEGIISKIVFWFIFVIAI
SGALSQLNLNSISAPFANMVNQVLTFIPNLIAAIAVGVIGWVIATVARTAINAALSKTSMDERLSAKAGVKPMSSTIADM
VYWFILLVVLTMVLGQLELDGLFAPLTNMVDKIFSFIPNILIAAVVFVVGYIIAKVVRGIVTNLVSTFDVQKLATKAGLS
EQNSLPNIAGSLAFLVVIIPTIIAALNALKIDVIARPATNMLNKIMEALPNIFMAIAILVVTFYVVRMVANIIKGLLENT
QINQLPAKVGLQQTMGDKKVSDLVGYAIVFFAMLFASIAAADLLGFEPISAIIAMFIAFGANIILGAIILFIGFWLANII
AGVVERSEQGSQFLANIVRVLIMGLVLAMGLKAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALSFGLGGQEAAARFLRKMQDKMD
RERDEAKAKSALTPSSSTQDKVAASVRDNTPSTATDTFGSSTTQVDNNIITPNNLSSTSDVNSSTVDINHIATDDSDIDG
PNNLR
>Mature_565_residues
MNPMFTSFNGYLGGPIGSIIGAILIFIIGWLVALGIAALVRGVLSKINLNQRMNSSTGKSYDLEGIISKIVFWFIFVIAI
SGALSQLNLNSISAPFANMVNQVLTFIPNLIAAIAVGVIGWVIATVARTAINAALSKTSMDERLSAKAGVKPMSSTIADM
VYWFILLVVLTMVLGQLELDGLFAPLTNMVDKIFSFIPNILIAAVVFVVGYIIAKVVRGIVTNLVSTFDVQKLATKAGLS
EQNSLPNIAGSLAFLVVIIPTIIAALNALKIDVIARPATNMLNKIMEALPNIFMAIAILVVTFYVVRMVANIIKGLLENT
QINQLPAKVGLQQTMGDKKVSDLVGYAIVFFAMLFASIAAADLLGFEPISAIIAMFIAFGANIILGAIILFIGFWLANII
AGVVERSEQGSQFLANIVRVLIMGLVLAMGLKAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALSFGLGGQEAAARFLRKMQDKMD
RERDEAKAKSALTPSSSTQDKVAASVRDNTPSTATDTFGSSTTQVDNNIITPNNLSSTSDVNSSTVDINHIATDDSDIDG
PNNLR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR008910 [H]

Pfam domain/function: PF05552 TM_helix [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59971; Mature: 59971

Theoretical pI: Translated: 8.73; Mature: 8.73

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCCCEEEHHEECCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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CCCCCEEEHHEECCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377; 8144469 [H]