| Definition | Chlamydophila felis Fe/C-56, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007899 |
| Length | 1,166,239 |
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The map label for this gene is 89897906
Identifier: 89897906
GI number: 89897906
Start: 115498
End: 117738
Strand: Direct
Name: 89897906
Synonym: CF0099
Alternate gene names: NA
Gene position: 115498-117738 (Clockwise)
Preceding gene: 89897905
Following gene: 89897907
Centisome position: 9.9
GC content: 38.78
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GTGAAGTGATGAAAAACTCTCCAATACAAAGATACCAACAGCCTAATCAGATTTTTGAAGGCCCAGTGTTTGCTGAACGT CGTGTATCTCCTGCGGAGGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 746; Mature: 745
Protein sequence:
>746_residues MTLPPSFLTFNRNVTAALLGDQVDMTTPFSNAVFLFQELDQKARGLKHALGLLQEAEAKLPTPQISSELSREISFDHFPE GKIAPFVMPDVKDVTEILGNPNLAAARLFIEGLNKSFDDCLQTVDNGGVFNPTAAEEKLVKEYKIKLDTLKQQFTAGSNP TEAQYNEIYALPKEFVAALEKLQGKDAPPKSKIIHFWQNIMVVYNAMTSLSYPVSKELNVQLAECSLNIDQANTIIELIR QFSSSLKDLLNPIWNVSPTASNLDGSGYNAMQGGMTRTYLVLGGVYRMLMDKYATQSQDAMSEEVRAGVTTFINALQGLK VNNSVNLANFLSLQYAYLTCVGQFGILPDTVDNKYKEVLQAEKAFWDNRGNNNFSIASGALSTFVNNPYGSSDGIKLFSS EKTPNPTFFKECVELMTKKPTEVMSCTDYQKVIDGMNNGIKQIQAQIDKWTQQSAELMTKKASMEPESLNYFTSMTEGKK IFVETSPIQMVYSSLMLDKYLPNQQYVLETLGVQMTFSNKAAKYMNQIINYVTNFQTADVYYSLGIYLRQMNLHALTDAQ GKAQGVLDKEKVRCRSDIARCERAKAELAKIIAEIESDAELTPSQQRELRMTVSGYEFQFNALIRNLGNLYVFLDEMRLN SVNNPDDIEEAFHILVNGTQSEDWPRFLSAFESFVIEGGDNGVVPGGEQQILQSLEATQQNFTTFNQNQQLALQLESSAI QQEWTMVSAALALMNQVFAKLIRRFK
Sequences:
>Translated_746_residues MTLPPSFLTFNRNVTAALLGDQVDMTTPFSNAVFLFQELDQKARGLKHALGLLQEAEAKLPTPQISSELSREISFDHFPE GKIAPFVMPDVKDVTEILGNPNLAAARLFIEGLNKSFDDCLQTVDNGGVFNPTAAEEKLVKEYKIKLDTLKQQFTAGSNP TEAQYNEIYALPKEFVAALEKLQGKDAPPKSKIIHFWQNIMVVYNAMTSLSYPVSKELNVQLAECSLNIDQANTIIELIR QFSSSLKDLLNPIWNVSPTASNLDGSGYNAMQGGMTRTYLVLGGVYRMLMDKYATQSQDAMSEEVRAGVTTFINALQGLK VNNSVNLANFLSLQYAYLTCVGQFGILPDTVDNKYKEVLQAEKAFWDNRGNNNFSIASGALSTFVNNPYGSSDGIKLFSS EKTPNPTFFKECVELMTKKPTEVMSCTDYQKVIDGMNNGIKQIQAQIDKWTQQSAELMTKKASMEPESLNYFTSMTEGKK IFVETSPIQMVYSSLMLDKYLPNQQYVLETLGVQMTFSNKAAKYMNQIINYVTNFQTADVYYSLGIYLRQMNLHALTDAQ GKAQGVLDKEKVRCRSDIARCERAKAELAKIIAEIESDAELTPSQQRELRMTVSGYEFQFNALIRNLGNLYVFLDEMRLN SVNNPDDIEEAFHILVNGTQSEDWPRFLSAFESFVIEGGDNGVVPGGEQQILQSLEATQQNFTTFNQNQQLALQLESSAI QQEWTMVSAALALMNQVFAKLIRRFK >Mature_745_residues TLPPSFLTFNRNVTAALLGDQVDMTTPFSNAVFLFQELDQKARGLKHALGLLQEAEAKLPTPQISSELSREISFDHFPEG KIAPFVMPDVKDVTEILGNPNLAAARLFIEGLNKSFDDCLQTVDNGGVFNPTAAEEKLVKEYKIKLDTLKQQFTAGSNPT EAQYNEIYALPKEFVAALEKLQGKDAPPKSKIIHFWQNIMVVYNAMTSLSYPVSKELNVQLAECSLNIDQANTIIELIRQ FSSSLKDLLNPIWNVSPTASNLDGSGYNAMQGGMTRTYLVLGGVYRMLMDKYATQSQDAMSEEVRAGVTTFINALQGLKV NNSVNLANFLSLQYAYLTCVGQFGILPDTVDNKYKEVLQAEKAFWDNRGNNNFSIASGALSTFVNNPYGSSDGIKLFSSE KTPNPTFFKECVELMTKKPTEVMSCTDYQKVIDGMNNGIKQIQAQIDKWTQQSAELMTKKASMEPESLNYFTSMTEGKKI FVETSPIQMVYSSLMLDKYLPNQQYVLETLGVQMTFSNKAAKYMNQIINYVTNFQTADVYYSLGIYLRQMNLHALTDAQG KAQGVLDKEKVRCRSDIARCERAKAELAKIIAEIESDAELTPSQQRELRMTVSGYEFQFNALIRNLGNLYVFLDEMRLNS VNNPDDIEEAFHILVNGTQSEDWPRFLSAFESFVIEGGDNGVVPGGEQQILQSLEATQQNFTTFNQNQQLALQLESSAIQ QEWTMVSAALALMNQVFAKLIRRFK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 83557; Mature: 83426
Theoretical pI: Translated: 4.76; Mature: 4.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTLPPSFLTFNRNVTAALLGDQVDMTTPFSNAVFLFQELDQKARGLKHALGLLQEAEAKL CCCCCCCEEECCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PTPQISSELSREISFDHFPEGKIAPFVMPDVKDVTEILGNPNLAAARLFIEGLNKSFDDC CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHH LQTVDNGGVFNPTAAEEKLVKEYKIKLDTLKQQFTAGSNPTEAQYNEIYALPKEFVAALE HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHH KLQGKDAPPKSKIIHFWQNIMVVYNAMTSLSYPVSKELNVQLAECSLNIDQANTIIELIR HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHH QFSSSLKDLLNPIWNVSPTASNLDGSGYNAMQGGMTRTYLVLGGVYRMLMDKYATQSQDA HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH MSEEVRAGVTTFINALQGLKVNNSVNLANFLSLQYAYLTCVGQFGILPDTVDNKYKEVLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH AEKAFWDNRGNNNFSIASGALSTFVNNPYGSSDGIKLFSSEKTPNPTFFKECVELMTKKP HHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC TEVMSCTDYQKVIDGMNNGIKQIQAQIDKWTQQSAELMTKKASMEPESLNYFTSMTEGKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCE IFVETSPIQMVYSSLMLDKYLPNQQYVLETLGVQMTFSNKAAKYMNQIINYVTNFQTADV EEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH YYSLGIYLRQMNLHALTDAQGKAQGVLDKEKVRCRSDIARCERAKAELAKIIAEIESDAE HHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LTPSQQRELRMTVSGYEFQFNALIRNLGNLYVFLDEMRLNSVNNPDDIEEAFHILVNGTQ CCCCHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC SEDWPRFLSAFESFVIEGGDNGVVPGGEQQILQSLEATQQNFTTFNQNQQLALQLESSAI CCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHH QQEWTMVSAALALMNQVFAKLIRRFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure TLPPSFLTFNRNVTAALLGDQVDMTTPFSNAVFLFQELDQKARGLKHALGLLQEAEAKL CCCCCCEEECCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC PTPQISSELSREISFDHFPEGKIAPFVMPDVKDVTEILGNPNLAAARLFIEGLNKSFDDC CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHH LQTVDNGGVFNPTAAEEKLVKEYKIKLDTLKQQFTAGSNPTEAQYNEIYALPKEFVAALE HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHH KLQGKDAPPKSKIIHFWQNIMVVYNAMTSLSYPVSKELNVQLAECSLNIDQANTIIELIR HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHH QFSSSLKDLLNPIWNVSPTASNLDGSGYNAMQGGMTRTYLVLGGVYRMLMDKYATQSQDA HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH MSEEVRAGVTTFINALQGLKVNNSVNLANFLSLQYAYLTCVGQFGILPDTVDNKYKEVLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH AEKAFWDNRGNNNFSIASGALSTFVNNPYGSSDGIKLFSSEKTPNPTFFKECVELMTKKP HHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCC TEVMSCTDYQKVIDGMNNGIKQIQAQIDKWTQQSAELMTKKASMEPESLNYFTSMTEGKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCE IFVETSPIQMVYSSLMLDKYLPNQQYVLETLGVQMTFSNKAAKYMNQIINYVTNFQTADV EEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH YYSLGIYLRQMNLHALTDAQGKAQGVLDKEKVRCRSDIARCERAKAELAKIIAEIESDAE HHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LTPSQQRELRMTVSGYEFQFNALIRNLGNLYVFLDEMRLNSVNNPDDIEEAFHILVNGTQ CCCCHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC SEDWPRFLSAFESFVIEGGDNGVVPGGEQQILQSLEATQQNFTTFNQNQQLALQLESSAI CCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHH QQEWTMVSAALALMNQVFAKLIRRFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA