Definition Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome.
Accession NC_007880
Length 1,895,994

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The map label for this gene is 89255585

Identifier: 89255585

GI number: 89255585

Start: 154695

End: 156569

Strand: Direct

Name: 89255585

Synonym: FTL_0148

Alternate gene names: NA

Gene position: 154695-156569 (Clockwise)

Preceding gene: 89255584

Following gene: 89255586

Centisome position: 8.16

GC content: 32.59

Gene sequence:

>1875_bases
ATGGAGCTATTTGTACATTCGTCTAATTATATTTTACTAGCATCTGGCTTAATATTGTTTTTTGCTATTGTTTCACAGTT
TTTATCTTGGAGATTAAAGCTACCATCGATACTTTTTTTAATTTTAAGTGGAATTATCCTCGGACCTCTATCAGAAGCAA
TATTCCAAACTGGCTTCAAGCTGGTTGATGGTAATGTTATATTTGGTGAGGCGTTGTCACCTTTTGTTTCAATCTGTGTG
GCAATAATTCTTTTTGAGGGCAGCTTATCGCTAAATTTTAGTAAGATAAAAAGTGTAAGTAGTGTTGTTATACTTCTGAT
TACTGTAGGTTTAGCAATTACTGTTGTACTTACAGCCTTGTTCTGTTATTACGTTGTTGGTTTGAATCTAGAACTATCTA
TGCTTATCGGTGGTATTACCTGTGTGAGTGGGCCAACCGTTGTACCACCTTTTATGAGGACTGTTAGACCAAAAAAACAT
ATTGCAAATATCCTAAAATGGGAGTCTATACTCGTAGATCCAATAGGAGCGTTAGTTGTAGTCTTTATGCTAGCATGGTT
TGTTATTGGTGGCAATTTTGCTAATCAACCTAATGCAGTAAGTACATTTATAGCATATATGGTGTTTGTATGTATTTTAG
GAATAACCTCAGGATTTATTTTTGGTTATTTAATTGGCTTAAGCTTTAGAAAACATTATATTCCAGAGTATCTAAAGAGT
TTTTTCGTACTTGCGGTAATTGTGTTAGGTTTTATTATTTCTGATGCAATTATGCATGGTGCGGGACTATTAATGGTAAC
AGTAGCAGGTCTGGTAATGGCAAATATGAAAGATATCAAAATGTCTGATATTGTTTCATTTAAAGAGAATCTAAGCATTG
TGATTATCTCAGTTCTTTTTATTGTCTTAGGAGCTGAAATTGACTTTAGTTTATTTAAAGATTATTGGTTAGATTTGATT
GAGGTTTTTTTATTTTTACAGTTTATATTACGACCAATAGTTGTTTTCTTGTGTTGCCTAGGATCTAAAACAACTTTTGC
AGAAAGAGTTGTTTTGGGGATTATTTATCCTCGTGGGATTGTGGCAGCATCAGTAGCAGCATTAGTAGCGGTTAAGATTA
TTAAATCACATCCTGAGCTATACAGTGAGGCAAATACTTTAGTATTCTTTGTCTTTATGATAATTGTTTTTACTGTTGTT
TTTCAAAGTATCGTTACACCATATATTTCAAAAGCGCTTGGAGTTACTGAACCAGAGGGTAAAGGATTTTTGATAATTGG
GGGTAATAGATTTGCACGTGAGTTAGCAGAAATTTTTGTCAAAAATGATATTGAAGTTGTAATTACAGACTCTTCTTGGG
GTAATGTGCAAAAATGTCGACAGTTGGGTTTAAATACTTATTATGGTAGTCCTGTTTCAATTCATGCTGATTGGAGTATT
AATTTAGTCGGCATCGGTGCGATGCTGGGATTATCAACAAGTGAGTATGTAAATGCAGTATCAGCGATGAAATATAAATA
TGAATTTGGCTCAAATAATGTCTATGTACTACGTACAGCACAAAAAGAGAGTTACAAAGGTATTGGTGCTATAGAAACAA
ATCTTGCTAATTTATTATTTGATGAGGGAGTTGATTTTAATATCTTGATAGAGATGCTTAATCAAGGAGCTACAATTAGA
AGTACAAATATTACCCCTAACTATACTTTAGAGAAGTTTTTTAGTGATAATCCCAACGCTATTGGATTATTTATCATTGA
TGATAATGGTTATGCACAACCTTTTAGTAAGAATAAAAAGATTAAATTTGAGAGTTATAATTTGATATCATTAAGGGATG
ATAAAAGTAAGGATCAGCTATGTCTAGATGTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTATCCTTGTAAGATTGATAAACAAATTAATATCATATAATATTTAGAATTCTTATGATGATATTTTTATATTCAGGG
TATTTATTTTGAGTAATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAGCTTTAATGGTAAATATCCTAAAGTAGCTGATTCAGCTTATGTTGATGAGTCAGCAGCAGTAATTGGTGATGTTATC
TTAAAAGAAGATTCATCTAT

Product: Sodium/hydrogen exchanger (antiporter) family protein

Products: NA

Alternate protein names: MjNhaP1 [H]

Number of amino acids: Translated: 624; Mature: 624

Protein sequence:

>624_residues
MELFVHSSNYILLASGLILFFAIVSQFLSWRLKLPSILFLILSGIILGPLSEAIFQTGFKLVDGNVIFGEALSPFVSICV
AIILFEGSLSLNFSKIKSVSSVVILLITVGLAITVVLTALFCYYVVGLNLELSMLIGGITCVSGPTVVPPFMRTVRPKKH
IANILKWESILVDPIGALVVVFMLAWFVIGGNFANQPNAVSTFIAYMVFVCILGITSGFIFGYLIGLSFRKHYIPEYLKS
FFVLAVIVLGFIISDAIMHGAGLLMVTVAGLVMANMKDIKMSDIVSFKENLSIVIISVLFIVLGAEIDFSLFKDYWLDLI
EVFLFLQFILRPIVVFLCCLGSKTTFAERVVLGIIYPRGIVAASVAALVAVKIIKSHPELYSEANTLVFFVFMIIVFTVV
FQSIVTPYISKALGVTEPEGKGFLIIGGNRFARELAEIFVKNDIEVVITDSSWGNVQKCRQLGLNTYYGSPVSIHADWSI
NLVGIGAMLGLSTSEYVNAVSAMKYKYEFGSNNVYVLRTAQKESYKGIGAIETNLANLLFDEGVDFNILIEMLNQGATIR
STNITPNYTLEKFFSDNPNAIGLFIIDDNGYAQPFSKNKKIKFESYNLISLRDDKSKDQLCLDV

Sequences:

>Translated_624_residues
MELFVHSSNYILLASGLILFFAIVSQFLSWRLKLPSILFLILSGIILGPLSEAIFQTGFKLVDGNVIFGEALSPFVSICV
AIILFEGSLSLNFSKIKSVSSVVILLITVGLAITVVLTALFCYYVVGLNLELSMLIGGITCVSGPTVVPPFMRTVRPKKH
IANILKWESILVDPIGALVVVFMLAWFVIGGNFANQPNAVSTFIAYMVFVCILGITSGFIFGYLIGLSFRKHYIPEYLKS
FFVLAVIVLGFIISDAIMHGAGLLMVTVAGLVMANMKDIKMSDIVSFKENLSIVIISVLFIVLGAEIDFSLFKDYWLDLI
EVFLFLQFILRPIVVFLCCLGSKTTFAERVVLGIIYPRGIVAASVAALVAVKIIKSHPELYSEANTLVFFVFMIIVFTVV
FQSIVTPYISKALGVTEPEGKGFLIIGGNRFARELAEIFVKNDIEVVITDSSWGNVQKCRQLGLNTYYGSPVSIHADWSI
NLVGIGAMLGLSTSEYVNAVSAMKYKYEFGSNNVYVLRTAQKESYKGIGAIETNLANLLFDEGVDFNILIEMLNQGATIR
STNITPNYTLEKFFSDNPNAIGLFIIDDNGYAQPFSKNKKIKFESYNLISLRDDKSKDQLCLDV
>Mature_624_residues
MELFVHSSNYILLASGLILFFAIVSQFLSWRLKLPSILFLILSGIILGPLSEAIFQTGFKLVDGNVIFGEALSPFVSICV
AIILFEGSLSLNFSKIKSVSSVVILLITVGLAITVVLTALFCYYVVGLNLELSMLIGGITCVSGPTVVPPFMRTVRPKKH
IANILKWESILVDPIGALVVVFMLAWFVIGGNFANQPNAVSTFIAYMVFVCILGITSGFIFGYLIGLSFRKHYIPEYLKS
FFVLAVIVLGFIISDAIMHGAGLLMVTVAGLVMANMKDIKMSDIVSFKENLSIVIISVLFIVLGAEIDFSLFKDYWLDLI
EVFLFLQFILRPIVVFLCCLGSKTTFAERVVLGIIYPRGIVAASVAALVAVKIIKSHPELYSEANTLVFFVFMIIVFTVV
FQSIVTPYISKALGVTEPEGKGFLIIGGNRFARELAEIFVKNDIEVVITDSSWGNVQKCRQLGLNTYYGSPVSIHADWSI
NLVGIGAMLGLSTSEYVNAVSAMKYKYEFGSNNVYVLRTAQKESYKGIGAIETNLANLLFDEGVDFNILIEMLNQGATIR
STNITPNYTLEKFFSDNPNAIGLFIIDDNGYAQPFSKNKKIKFESYNLISLRDDKSKDQLCLDV

Specific function: This is a Na(+)/H(+) antiporter. Can also transport lithium [H]

COG id: COG0025

COG function: function code P; NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the monovalent cation:proton antiporter 1 (CPA1) transporter (TC 2.A.36) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 68773; Mature: 68773

Theoretical pI: Translated: 6.77; Mature: 6.77

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MELFVHSSNYILLASGLILFFAIVSQFLSWRLKLPSILFLILSGIILGPLSEAIFQTGFK
CEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE
LVDGNVIFGEALSPFVSICVAIILFEGSLSLNFSKIKSVSSVVILLITVGLAITVVLTAL
EECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FCYYVVGLNLELSMLIGGITCVSGPTVVPPFMRTVRPKKHIANILKWESILVDPIGALVV
HHHHHHHCCEEEHHHHCCEEECCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFMLAWFVIGGNFANQPNAVSTFIAYMVFVCILGITSGFIFGYLIGLSFRKHYIPEYLKS
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFVLAVIVLGFIISDAIMHGAGLLMVTVAGLVMANMKDIKMSDIVSFKENLSIVIISVLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
IVLGAEIDFSLFKDYWLDLIEVFLFLQFILRPIVVFLCCLGSKTTFAERVVLGIIYPRGI
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHH
VAASVAALVAVKIIKSHPELYSEANTLVFFVFMIIVFTVVFQSIVTPYISKALGVTEPEG
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
KGFLIIGGNRFARELAEIFVKNDIEVVITDSSWGNVQKCRQLGLNTYYGSPVSIHADWSI
CEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCEE
NLVGIGAMLGLSTSEYVNAVSAMKYKYEFGSNNVYVLRTAQKESYKGIGAIETNLANLLF
EEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
DEGVDFNILIEMLNQGATIRSTNITPNYTLEKFFSDNPNAIGLFIIDDNGYAQPFSKNKK
HCCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCC
IKFESYNLISLRDDKSKDQLCLDV
EEEECEEEEEECCCCCCCCEEECC
>Mature Secondary Structure
MELFVHSSNYILLASGLILFFAIVSQFLSWRLKLPSILFLILSGIILGPLSEAIFQTGFK
CEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE
LVDGNVIFGEALSPFVSICVAIILFEGSLSLNFSKIKSVSSVVILLITVGLAITVVLTAL
EECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FCYYVVGLNLELSMLIGGITCVSGPTVVPPFMRTVRPKKHIANILKWESILVDPIGALVV
HHHHHHHCCEEEHHHHCCEEECCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFMLAWFVIGGNFANQPNAVSTFIAYMVFVCILGITSGFIFGYLIGLSFRKHYIPEYLKS
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFVLAVIVLGFIISDAIMHGAGLLMVTVAGLVMANMKDIKMSDIVSFKENLSIVIISVLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
IVLGAEIDFSLFKDYWLDLIEVFLFLQFILRPIVVFLCCLGSKTTFAERVVLGIIYPRGI
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHH
VAASVAALVAVKIIKSHPELYSEANTLVFFVFMIIVFTVVFQSIVTPYISKALGVTEPEG
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
KGFLIIGGNRFARELAEIFVKNDIEVVITDSSWGNVQKCRQLGLNTYYGSPVSIHADWSI
CEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCEE
NLVGIGAMLGLSTSEYVNAVSAMKYKYEFGSNNVYVLRTAQKESYKGIGAIETNLANLLF
EEEEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
DEGVDFNILIEMLNQGATIRSTNITPNYTLEKFFSDNPNAIGLFIIDDNGYAQPFSKNKK
HCCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCC
IKFESYNLISLRDDKSKDQLCLDV
EEEECEEEEEECCCCCCCCEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]