Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 84489739

Identifier: 84489739

GI number: 84489739

Start: 1082044

End: 1084110

Strand: Direct

Name: 84489739

Synonym: Msp_0940

Alternate gene names: NA

Gene position: 1082044-1084110 (Clockwise)

Preceding gene: 84489731

Following gene: 84489740

Centisome position: 61.22

GC content: 19.98

Gene sequence:

>2067_bases
ATGATGAATTTAATAGATCTAGGTAAATATTTCTCAAAAGGGAAAGATATTTTCGGTAAAAATACAAAAGATAATGACTT
ATTATTACCTATTCAATATACAAATAATCAGTTAAATATTAAACCAATAATAAGAAAAAGAGACATGAATTTATCCAAAA
ACATATCTAACAAATCCATATTTAGTGAAGATTTATATATTATCACAGATCAAAGAATTATGATTCCATCTAATTCAAAT
ATGCGTGGTTTAACCCCCTTTTTCTTAGAATTAAAAGAAAAAGATTTTATTAAAAAAAATGAAAGAAATGAAGATGGATG
TAAAAAATTTAAACAGAAAATTAAAAGATCTTTGGATGCAAATCATGAAAAAGAGTTTATTAAAGAATTACAAAATTTCT
ATGAAAATCCTGATATTTTTTTAAATTGCACTATGAGAAATAATGATGATATTAAAAACATACATGATTTTTTAGAAAAC
CATTCATTTGAATCTGTAAAATCAGTTATTTTAGATTATTATACATTTTTAGATTTAAATTCTGAATTAATCATAAATAA
CGTTATTGACTATATTCAATCTGATAATTATGATAAAAAAGATAAAAGTAACTTTTATATTTTATGTTTTTTTAATAATG
ACTTTGATTTATTAAATGATATGTTTTATTATTTTAGTAAATTCTTAAAAAAACGAAATGAAACTCCTGATTTCCAAAAA
GGTATTTGTAGTGTTTGTGGTGAGAAAACTATAACACTTCCACTATCAGGAATGTATGTTCAGGATAAAATGTATTTCTT
TAACTTTGAAGAAAATGTTAAGAATTCTAAATTAAGATTATGTCAAAAATGTAATTCATATATTTCTTTGGCTGAAGATA
AGTTAAAAAATTCTTTTACACGTAATATTATGATTATTCCCAAATTAAAGAAATCTTCAGATGATGAACATAGATACAAA
GAATTTAATGAAATTATTACAGATAATGATCTTTCTTCAATTAAAAAGATTAATAATATTTTAGATATTAATGATGATAA
ATATAATTATGATCTTTTAATTTATACTAGAGAACAAGGAGATAGCTATCCTATACGTCATTATATTGAGAATTACAAAG
CATATAAAGTTAAATTTGATAAAATTAGTTTAGTTGAATATTCAAATGAAAATAAATATTATTTAAATTATTTATTTGAT
GAAGAAATAGGTATTTCTAAAAAACAAATAGATTATTATCAATTTAATAATATTCTTGATTTAGAAAGGATTTTTAAAAA
TTTTTTCATATCAATCAATGATGGTTCAATAAAAAATTTACAGAACCTTGATTATTTTTACAAAGTCCATACTGAAGATA
TGAAAGATATAGTTAAAAATCTTAATTCAAAAACAGCCATGTTATTTTCAAAATATAAGTTTAATATTTTTTCATACTTA
TATGAATTAAATACAAATGCTTTAAATAAGAATATTATTAAAGAAATTGTAGAAAATTGTATCTATGAATTAATTAAGGG
AAGTGATTCAAAAACAAACCATTCACCGTCAATAAAACAACACTTGAATGAATATTATATGATTATGATAGAATTATGGA
AGGATAATAATATGATAAAAAATGAAGATATAAAAGAATTAAAAGAATTATTAGACAAATATGCATTAGAAGAAGATGAT
TCTAATGAAAGTGAAGAAACTATAAATAAAATAATATCATTAGTTAACAAAAAAGAATATACTAAATATTATTTTATTGG
TCAATTTATTAGATTAATTGACAATACAAAACACAACAATGGAAAAAATGCTGAAACATTTAAAATTTTCATTACAAATA
GTAATCGAAATAATATTAAAAAAATATTTTCAACAGAGATACTTCAAAAAAATATTCACTATATTGAACGTATGAATAAA
AAAGGTAAATTAGTCTTTAATATAATTGAAACAAATATAGAAACTTTATTTAATGAAAACGATCTTATATTTGAAGATTA
TATTTTAGCTTTAACAACAGGCTATTATACTAAAAATTTATTAAAATCAAATAAAAAAGGAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATCAACATAGTAAACTAAATTGTCACACATTATTGATTTAAAAAAAAGTAAAGGTATAAAAGATTATCTTTCTTTTTAA
ATAAAAAGGAGGACATATAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAATGAGTGATAAAATAAAAAATTATTATCAAGGAATATTTGTAACAGAAACAATACTAGGTAACCCTAATGGAGATT
TTATTGATAATTCTCCACGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 688; Mature: 688

Protein sequence:

>688_residues
MMNLIDLGKYFSKGKDIFGKNTKDNDLLLPIQYTNNQLNIKPIIRKRDMNLSKNISNKSIFSEDLYIITDQRIMIPSNSN
MRGLTPFFLELKEKDFIKKNERNEDGCKKFKQKIKRSLDANHEKEFIKELQNFYENPDIFLNCTMRNNDDIKNIHDFLEN
HSFESVKSVILDYYTFLDLNSELIINNVIDYIQSDNYDKKDKSNFYILCFFNNDFDLLNDMFYYFSKFLKKRNETPDFQK
GICSVCGEKTITLPLSGMYVQDKMYFFNFEENVKNSKLRLCQKCNSYISLAEDKLKNSFTRNIMIIPKLKKSSDDEHRYK
EFNEIITDNDLSSIKKINNILDINDDKYNYDLLIYTREQGDSYPIRHYIENYKAYKVKFDKISLVEYSNENKYYLNYLFD
EEIGISKKQIDYYQFNNILDLERIFKNFFISINDGSIKNLQNLDYFYKVHTEDMKDIVKNLNSKTAMLFSKYKFNIFSYL
YELNTNALNKNIIKEIVENCIYELIKGSDSKTNHSPSIKQHLNEYYMIMIELWKDNNMIKNEDIKELKELLDKYALEEDD
SNESEETINKIISLVNKKEYTKYYFIGQFIRLIDNTKHNNGKNAETFKIFITNSNRNNIKKIFSTEILQKNIHYIERMNK
KGKLVFNIIETNIETLFNENDLIFEDYILALTTGYYTKNLLKSNKKGE

Sequences:

>Translated_688_residues
MMNLIDLGKYFSKGKDIFGKNTKDNDLLLPIQYTNNQLNIKPIIRKRDMNLSKNISNKSIFSEDLYIITDQRIMIPSNSN
MRGLTPFFLELKEKDFIKKNERNEDGCKKFKQKIKRSLDANHEKEFIKELQNFYENPDIFLNCTMRNNDDIKNIHDFLEN
HSFESVKSVILDYYTFLDLNSELIINNVIDYIQSDNYDKKDKSNFYILCFFNNDFDLLNDMFYYFSKFLKKRNETPDFQK
GICSVCGEKTITLPLSGMYVQDKMYFFNFEENVKNSKLRLCQKCNSYISLAEDKLKNSFTRNIMIIPKLKKSSDDEHRYK
EFNEIITDNDLSSIKKINNILDINDDKYNYDLLIYTREQGDSYPIRHYIENYKAYKVKFDKISLVEYSNENKYYLNYLFD
EEIGISKKQIDYYQFNNILDLERIFKNFFISINDGSIKNLQNLDYFYKVHTEDMKDIVKNLNSKTAMLFSKYKFNIFSYL
YELNTNALNKNIIKEIVENCIYELIKGSDSKTNHSPSIKQHLNEYYMIMIELWKDNNMIKNEDIKELKELLDKYALEEDD
SNESEETINKIISLVNKKEYTKYYFIGQFIRLIDNTKHNNGKNAETFKIFITNSNRNNIKKIFSTEILQKNIHYIERMNK
KGKLVFNIIETNIETLFNENDLIFEDYILALTTGYYTKNLLKSNKKGE
>Mature_688_residues
MMNLIDLGKYFSKGKDIFGKNTKDNDLLLPIQYTNNQLNIKPIIRKRDMNLSKNISNKSIFSEDLYIITDQRIMIPSNSN
MRGLTPFFLELKEKDFIKKNERNEDGCKKFKQKIKRSLDANHEKEFIKELQNFYENPDIFLNCTMRNNDDIKNIHDFLEN
HSFESVKSVILDYYTFLDLNSELIINNVIDYIQSDNYDKKDKSNFYILCFFNNDFDLLNDMFYYFSKFLKKRNETPDFQK
GICSVCGEKTITLPLSGMYVQDKMYFFNFEENVKNSKLRLCQKCNSYISLAEDKLKNSFTRNIMIIPKLKKSSDDEHRYK
EFNEIITDNDLSSIKKINNILDINDDKYNYDLLIYTREQGDSYPIRHYIENYKAYKVKFDKISLVEYSNENKYYLNYLFD
EEIGISKKQIDYYQFNNILDLERIFKNFFISINDGSIKNLQNLDYFYKVHTEDMKDIVKNLNSKTAMLFSKYKFNIFSYL
YELNTNALNKNIIKEIVENCIYELIKGSDSKTNHSPSIKQHLNEYYMIMIELWKDNNMIKNEDIKELKELLDKYALEEDD
SNESEETINKIISLVNKKEYTKYYFIGQFIRLIDNTKHNNGKNAETFKIFITNSNRNNIKKIFSTEILQKNIHYIERMNK
KGKLVFNIIETNIETLFNENDLIFEDYILALTTGYYTKNLLKSNKKGE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82226; Mature: 82226

Theoretical pI: Translated: 7.25; Mature: 7.25

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MMNLIDLGKYFSKGKDIFGKNTKDNDLLLPIQYTNNQLNIKPIIRKRDMNLSKNISNKSI
CCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEEHHECCCCCCCCCCCCCCE
FSEDLYIITDQRIMIPSNSNMRGLTPFFLELKEKDFIKKNERNEDGCKKFKQKIKRSLDA
ECCCEEEEECCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
NHEKEFIKELQNFYENPDIFLNCTMRNNDDIKNIHDFLENHSFESVKSVILDYYTFLDLN
CHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SELIINNVIDYIQSDNYDKKDKSNFYILCFFNNDFDLLNDMFYYFSKFLKKRNETPDFQK
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
GICSVCGEKTITLPLSGMYVQDKMYFFNFEENVKNSKLRLCQKCNSYISLAEDKLKNSFT
HHHHHCCCCEEEEEECCEEEECEEEEEECHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
RNIMIIPKLKKSSDDEHRYKEFNEIITDNDLSSIKKINNILDINDDKYNYDLLIYTREQG
CCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCC
DSYPIRHYIENYKAYKVKFDKISLVEYSNENKYYLNYLFDEEIGISKKQIDYYQFNNILD
CCCHHHHHHCCCEEEEEEECEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHEHHHHHCCCHH
LERIFKNFFISINDGSIKNLQNLDYFYKVHTEDMKDIVKNLNSKTAMLFSKYKFNIFSYL
HHHHHHHHEEEECCCCCCCHHCCCCEEEECHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
YELNTNALNKNIIKEIVENCIYELIKGSDSKTNHSPSIKQHLNEYYMIMIELWKDNNMIK
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCC
NEDIKELKELLDKYALEEDDSNESEETINKIISLVNKKEYTKYYFIGQFIRLIDNTKHNN
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GKNAETFKIFITNSNRNNIKKIFSTEILQKNIHYIERMNKKGKLVFNIIETNIETLFNEN
CCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCC
DLIFEDYILALTTGYYTKNLLKSNKKGE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MMNLIDLGKYFSKGKDIFGKNTKDNDLLLPIQYTNNQLNIKPIIRKRDMNLSKNISNKSI
CCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEEHHECCCCCCCCCCCCCCE
FSEDLYIITDQRIMIPSNSNMRGLTPFFLELKEKDFIKKNERNEDGCKKFKQKIKRSLDA
ECCCEEEEECCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
NHEKEFIKELQNFYENPDIFLNCTMRNNDDIKNIHDFLENHSFESVKSVILDYYTFLDLN
CHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SELIINNVIDYIQSDNYDKKDKSNFYILCFFNNDFDLLNDMFYYFSKFLKKRNETPDFQK
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
GICSVCGEKTITLPLSGMYVQDKMYFFNFEENVKNSKLRLCQKCNSYISLAEDKLKNSFT
HHHHHCCCCEEEEEECCEEEECEEEEEECHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
RNIMIIPKLKKSSDDEHRYKEFNEIITDNDLSSIKKINNILDINDDKYNYDLLIYTREQG
CCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCC
DSYPIRHYIENYKAYKVKFDKISLVEYSNENKYYLNYLFDEEIGISKKQIDYYQFNNILD
CCCHHHHHHCCCEEEEEEECEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHEHHHHHCCCHH
LERIFKNFFISINDGSIKNLQNLDYFYKVHTEDMKDIVKNLNSKTAMLFSKYKFNIFSYL
HHHHHHHHEEEECCCCCCCHHCCCCEEEECHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
YELNTNALNKNIIKEIVENCIYELIKGSDSKTNHSPSIKQHLNEYYMIMIELWKDNNMIK
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCC
NEDIKELKELLDKYALEEDDSNESEETINKIISLVNKKEYTKYYFIGQFIRLIDNTKHNN
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GKNAETFKIFITNSNRNNIKKIFSTEILQKNIHYIERMNKKGKLVFNIIETNIETLFNEN
CCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCC
DLIFEDYILALTTGYYTKNLLKSNKKGE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA