| Definition | Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007681 |
| Length | 1,767,403 |
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The map label for this gene is 84489731
Identifier: 84489731
GI number: 84489731
Start: 1075695
End: 1077602
Strand: Direct
Name: 84489731
Synonym: Msp_0932
Alternate gene names: NA
Gene position: 1075695-1077602 (Clockwise)
Preceding gene: 84489727
Following gene: 84489739
Centisome position: 60.86
GC content: 25.21
Gene sequence:
>1908_bases ATGAATATAAAACATAAAAATTTAATTGAAAAACTAGACTTACTTGTTTGTGATGATTTTCATCCAAATTATGTTAGTAT TCTTATTATAACAACTATACTACTTATAACAACAACCTTTTTTCATTTAATAAATATACATAATGTGGATACTTTAATAC TAATAACAGGTATTTTCATTGGAATTGTATTATCACTACCACTACCACTTACATATATTCGAAAAATAATGCTATTATTT CTTATAATGCTACCTATTGCAACAATTACAGCACTACTTAGTTGTATAAGTCCCATGATACAATTTATTTGTATATTATT ATGGATATTATTCTTTGTAAGTTGTAATCTACTTGGAAATTCATTGAAAACCTTGAGTTTTGTGGGAGTATTGTATTATT TATACACATTCCACATAGCATTTAGTAACATAGACTTTAATATTACTCTATCAAGTATGTTATGGTATGGACTTGTTACA ATACTTATTGTTATAATAGAATTTATGCCATATATACTCTACTGTTTATATAAACATGACCCTGTGGGACGTAAAATATT AACAAGTCTATTTAAAAATGAAGATAAGTTCTATAAAAAACTAGAAATACTCTATAAAACACATGATACATACACAAGTA ATATGATATATGTAGCACTCCTTTTAAAATCAAATAAAAAGGTATGTGACTACCTATATAATCAATATAAAATAAGACAA CTTGAAACATTAGATAAAATAACACAGACATTAACAAGTAACATTATAGAAATAATCAACACCCCACATAGACATGTTCT AGATACAGAAGAACTTGAAGACTTATATGCAACTACAACTGATATGAGAATAAAAAATCTAATAGACAGATACATAAAAG CATATGATGTATTTAATAATATACAAGAGGGTAAATACATACATCTAGATGTGGAAAAATCAATGAAAACCACATATAGA CGTGATTATCTAACACTAGAAAATAATGATATTAGATATGGAATACAGTTTATGATAACATTCATATTATCACGTATAAT TGACGTGTTTTTTGTAACATTTCATTCAACAACAATAACAACATCAGCACTATTTACAACAAAAAATACTCTAAGCTACA CTGTAGATAAGATACTTATGAAGATATTTGGAAATATAATAGGACTAGTATTTGCAATTGTTGTATCAACTATCATAATA CACTACAATCAACTATACCTACTTAACATACTATGTGTAATGTGTGTTCTACTATTATTTGGTTTTATACCAAATCATTC AGATAAGTCAGGATTTCTAGTAATGGCAACACTAGTATTTATATCAAAAAATCAATTTGTAGGCCTAAATAGAATTACAT ACGTGGTAATAGGATGTATGATATCACTTATTATTGGATATTATATCTTCCCAATACATGAGAAAATAAACATGACACAG ACAGTTACTAAGAAAATAGGACATATCAATAACTTATTAGAAAATATACTAAAAACAGAATCTATTGAAGGAGAACTTCA TGAAATATTTATAATTAATTCAAAGATAAAAACACACCTTGAAAGACTAGAAAATACATATCATCTAGAGAGTGAAGTAG AAGATATAAGAGAAATACATGCCATGACAAACAATCTACTTGAAGTTATAATTAATTTAAAACTAGAAATAAAAAATACA CAAAGTAATAATCTAATAAAACAGGTAAATGAAAACTTCAAAACTTGCATAAATTCAATAGATTCTAATAAAACAATAAA TATTAATGAAATTACAGTACCATTATCTAATAAAACACCACTTAGAGAGTATAATCTGTGGATTATGGAATATGCATCTA TCATAGTAGATGAGATTAATAAATCAATTGAAAATGAGACATTTAAGAAATTAAATCAAAATCTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATCAATATGTGTCTATCAGTCATATGTAATGAGGAAATCTTAAAACTTAATAAGTAACATATATATGACTATAGAAAAAA TAGTTGTTAGTTGTGTTAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAAAAGATAATTAGAGTGTAATATAACTACACTCCATTATTAAAATGAACGATAGTAACTTGCACCACGTGGACCATA TATTATTCCATGTTTTGTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 635; Mature: 635
Protein sequence:
>635_residues MNIKHKNLIEKLDLLVCDDFHPNYVSILIITTILLITTTFFHLINIHNVDTLILITGIFIGIVLSLPLPLTYIRKIMLLF LIMLPIATITALLSCISPMIQFICILLWILFFVSCNLLGNSLKTLSFVGVLYYLYTFHIAFSNIDFNITLSSMLWYGLVT ILIVIIEFMPYILYCLYKHDPVGRKILTSLFKNEDKFYKKLEILYKTHDTYTSNMIYVALLLKSNKKVCDYLYNQYKIRQ LETLDKITQTLTSNIIEIINTPHRHVLDTEELEDLYATTTDMRIKNLIDRYIKAYDVFNNIQEGKYIHLDVEKSMKTTYR RDYLTLENNDIRYGIQFMITFILSRIIDVFFVTFHSTTITTSALFTTKNTLSYTVDKILMKIFGNIIGLVFAIVVSTIII HYNQLYLLNILCVMCVLLLFGFIPNHSDKSGFLVMATLVFISKNQFVGLNRITYVVIGCMISLIIGYYIFPIHEKINMTQ TVTKKIGHINNLLENILKTESIEGELHEIFIINSKIKTHLERLENTYHLESEVEDIREIHAMTNNLLEVIINLKLEIKNT QSNNLIKQVNENFKTCINSIDSNKTININEITVPLSNKTPLREYNLWIMEYASIIVDEINKSIENETFKKLNQNL
Sequences:
>Translated_635_residues MNIKHKNLIEKLDLLVCDDFHPNYVSILIITTILLITTTFFHLINIHNVDTLILITGIFIGIVLSLPLPLTYIRKIMLLF LIMLPIATITALLSCISPMIQFICILLWILFFVSCNLLGNSLKTLSFVGVLYYLYTFHIAFSNIDFNITLSSMLWYGLVT ILIVIIEFMPYILYCLYKHDPVGRKILTSLFKNEDKFYKKLEILYKTHDTYTSNMIYVALLLKSNKKVCDYLYNQYKIRQ LETLDKITQTLTSNIIEIINTPHRHVLDTEELEDLYATTTDMRIKNLIDRYIKAYDVFNNIQEGKYIHLDVEKSMKTTYR RDYLTLENNDIRYGIQFMITFILSRIIDVFFVTFHSTTITTSALFTTKNTLSYTVDKILMKIFGNIIGLVFAIVVSTIII HYNQLYLLNILCVMCVLLLFGFIPNHSDKSGFLVMATLVFISKNQFVGLNRITYVVIGCMISLIIGYYIFPIHEKINMTQ TVTKKIGHINNLLENILKTESIEGELHEIFIINSKIKTHLERLENTYHLESEVEDIREIHAMTNNLLEVIINLKLEIKNT QSNNLIKQVNENFKTCINSIDSNKTININEITVPLSNKTPLREYNLWIMEYASIIVDEINKSIENETFKKLNQNL >Mature_635_residues MNIKHKNLIEKLDLLVCDDFHPNYVSILIITTILLITTTFFHLINIHNVDTLILITGIFIGIVLSLPLPLTYIRKIMLLF LIMLPIATITALLSCISPMIQFICILLWILFFVSCNLLGNSLKTLSFVGVLYYLYTFHIAFSNIDFNITLSSMLWYGLVT ILIVIIEFMPYILYCLYKHDPVGRKILTSLFKNEDKFYKKLEILYKTHDTYTSNMIYVALLLKSNKKVCDYLYNQYKIRQ LETLDKITQTLTSNIIEIINTPHRHVLDTEELEDLYATTTDMRIKNLIDRYIKAYDVFNNIQEGKYIHLDVEKSMKTTYR RDYLTLENNDIRYGIQFMITFILSRIIDVFFVTFHSTTITTSALFTTKNTLSYTVDKILMKIFGNIIGLVFAIVVSTIII HYNQLYLLNILCVMCVLLLFGFIPNHSDKSGFLVMATLVFISKNQFVGLNRITYVVIGCMISLIIGYYIFPIHEKINMTQ TVTKKIGHINNLLENILKTESIEGELHEIFIINSKIKTHLERLENTYHLESEVEDIREIHAMTNNLLEVIINLKLEIKNT QSNNLIKQVNENFKTCINSIDSNKTININEITVPLSNKTPLREYNLWIMEYASIIVDEINKSIENETFKKLNQNL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 73892; Mature: 73892
Theoretical pI: Translated: 7.44; Mature: 7.44
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNIKHKNLIEKLDLLVCDDFHPNYVSILIITTILLITTTFFHLINIHNVDTLILITGIFI CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH GIVLSLPLPLTYIRKIMLLFLIMLPIATITALLSCISPMIQFICILLWILFFVSCNLLGN HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SLKTLSFVGVLYYLYTFHIAFSNIDFNITLSSMLWYGLVTILIVIIEFMPYILYCLYKHD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PVGRKILTSLFKNEDKFYKKLEILYKTHDTYTSNMIYVALLLKSNKKVCDYLYNQYKIRQ CCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH LETLDKITQTLTSNIIEIINTPHRHVLDTEELEDLYATTTDMRIKNLIDRYIKAYDVFNN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IQEGKYIHLDVEKSMKTTYRRDYLTLENNDIRYGIQFMITFILSRIIDVFFVTFHSTTIT HCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSALFTTKNTLSYTVDKILMKIFGNIIGLVFAIVVSTIIIHYNQLYLLNILCVMCVLLLF HHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GFIPNHSDKSGFLVMATLVFISKNQFVGLNRITYVVIGCMISLIIGYYIFPIHEKINMTQ HCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH TVTKKIGHINNLLENILKTESIEGELHEIFIINSKIKTHLERLENTYHLESEVEDIREIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AMTNNLLEVIINLKLEIKNTQSNNLIKQVNENFKTCINSIDSNKTININEITVPLSNKTP HHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCCC LREYNLWIMEYASIIVDEINKSIENETFKKLNQNL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MNIKHKNLIEKLDLLVCDDFHPNYVSILIITTILLITTTFFHLINIHNVDTLILITGIFI CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH GIVLSLPLPLTYIRKIMLLFLIMLPIATITALLSCISPMIQFICILLWILFFVSCNLLGN HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SLKTLSFVGVLYYLYTFHIAFSNIDFNITLSSMLWYGLVTILIVIIEFMPYILYCLYKHD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PVGRKILTSLFKNEDKFYKKLEILYKTHDTYTSNMIYVALLLKSNKKVCDYLYNQYKIRQ CCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH LETLDKITQTLTSNIIEIINTPHRHVLDTEELEDLYATTTDMRIKNLIDRYIKAYDVFNN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IQEGKYIHLDVEKSMKTTYRRDYLTLENNDIRYGIQFMITFILSRIIDVFFVTFHSTTIT HCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSALFTTKNTLSYTVDKILMKIFGNIIGLVFAIVVSTIIIHYNQLYLLNILCVMCVLLLF HHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GFIPNHSDKSGFLVMATLVFISKNQFVGLNRITYVVIGCMISLIIGYYIFPIHEKINMTQ HCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH TVTKKIGHINNLLENILKTESIEGELHEIFIINSKIKTHLERLENTYHLESEVEDIREIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AMTNNLLEVIINLKLEIKNTQSNNLIKQVNENFKTCINSIDSNKTININEITVPLSNKTP HHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCCC LREYNLWIMEYASIIVDEINKSIENETFKKLNQNL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA