Definition Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome, complete genome.
Accession NC_007681
Length 1,767,403

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The map label for this gene is 84489731

Identifier: 84489731

GI number: 84489731

Start: 1075695

End: 1077602

Strand: Direct

Name: 84489731

Synonym: Msp_0932

Alternate gene names: NA

Gene position: 1075695-1077602 (Clockwise)

Preceding gene: 84489727

Following gene: 84489739

Centisome position: 60.86

GC content: 25.21

Gene sequence:

>1908_bases
ATGAATATAAAACATAAAAATTTAATTGAAAAACTAGACTTACTTGTTTGTGATGATTTTCATCCAAATTATGTTAGTAT
TCTTATTATAACAACTATACTACTTATAACAACAACCTTTTTTCATTTAATAAATATACATAATGTGGATACTTTAATAC
TAATAACAGGTATTTTCATTGGAATTGTATTATCACTACCACTACCACTTACATATATTCGAAAAATAATGCTATTATTT
CTTATAATGCTACCTATTGCAACAATTACAGCACTACTTAGTTGTATAAGTCCCATGATACAATTTATTTGTATATTATT
ATGGATATTATTCTTTGTAAGTTGTAATCTACTTGGAAATTCATTGAAAACCTTGAGTTTTGTGGGAGTATTGTATTATT
TATACACATTCCACATAGCATTTAGTAACATAGACTTTAATATTACTCTATCAAGTATGTTATGGTATGGACTTGTTACA
ATACTTATTGTTATAATAGAATTTATGCCATATATACTCTACTGTTTATATAAACATGACCCTGTGGGACGTAAAATATT
AACAAGTCTATTTAAAAATGAAGATAAGTTCTATAAAAAACTAGAAATACTCTATAAAACACATGATACATACACAAGTA
ATATGATATATGTAGCACTCCTTTTAAAATCAAATAAAAAGGTATGTGACTACCTATATAATCAATATAAAATAAGACAA
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AGATACAGAAGAACTTGAAGACTTATATGCAACTACAACTGATATGAGAATAAAAAATCTAATAGACAGATACATAAAAG
CATATGATGTATTTAATAATATACAAGAGGGTAAATACATACATCTAGATGTGGAAAAATCAATGAAAACCACATATAGA
CGTGATTATCTAACACTAGAAAATAATGATATTAGATATGGAATACAGTTTATGATAACATTCATATTATCACGTATAAT
TGACGTGTTTTTTGTAACATTTCATTCAACAACAATAACAACATCAGCACTATTTACAACAAAAAATACTCTAAGCTACA
CTGTAGATAAGATACTTATGAAGATATTTGGAAATATAATAGGACTAGTATTTGCAATTGTTGTATCAACTATCATAATA
CACTACAATCAACTATACCTACTTAACATACTATGTGTAATGTGTGTTCTACTATTATTTGGTTTTATACCAAATCATTC
AGATAAGTCAGGATTTCTAGTAATGGCAACACTAGTATTTATATCAAAAAATCAATTTGTAGGCCTAAATAGAATTACAT
ACGTGGTAATAGGATGTATGATATCACTTATTATTGGATATTATATCTTCCCAATACATGAGAAAATAAACATGACACAG
ACAGTTACTAAGAAAATAGGACATATCAATAACTTATTAGAAAATATACTAAAAACAGAATCTATTGAAGGAGAACTTCA
TGAAATATTTATAATTAATTCAAAGATAAAAACACACCTTGAAAGACTAGAAAATACATATCATCTAGAGAGTGAAGTAG
AAGATATAAGAGAAATACATGCCATGACAAACAATCTACTTGAAGTTATAATTAATTTAAAACTAGAAATAAAAAATACA
CAAAGTAATAATCTAATAAAACAGGTAAATGAAAACTTCAAAACTTGCATAAATTCAATAGATTCTAATAAAACAATAAA
TATTAATGAAATTACAGTACCATTATCTAATAAAACACCACTTAGAGAGTATAATCTGTGGATTATGGAATATGCATCTA
TCATAGTAGATGAGATTAATAAATCAATTGAAAATGAGACATTTAAGAAATTAAATCAAAATCTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCAATATGTGTCTATCAGTCATATGTAATGAGGAAATCTTAAAACTTAATAAGTAACATATATATGACTATAGAAAAAA
TAGTTGTTAGTTGTGTTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAAAGATAATTAGAGTGTAATATAACTACACTCCATTATTAAAATGAACGATAGTAACTTGCACCACGTGGACCATA
TATTATTCCATGTTTTGTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 635; Mature: 635

Protein sequence:

>635_residues
MNIKHKNLIEKLDLLVCDDFHPNYVSILIITTILLITTTFFHLINIHNVDTLILITGIFIGIVLSLPLPLTYIRKIMLLF
LIMLPIATITALLSCISPMIQFICILLWILFFVSCNLLGNSLKTLSFVGVLYYLYTFHIAFSNIDFNITLSSMLWYGLVT
ILIVIIEFMPYILYCLYKHDPVGRKILTSLFKNEDKFYKKLEILYKTHDTYTSNMIYVALLLKSNKKVCDYLYNQYKIRQ
LETLDKITQTLTSNIIEIINTPHRHVLDTEELEDLYATTTDMRIKNLIDRYIKAYDVFNNIQEGKYIHLDVEKSMKTTYR
RDYLTLENNDIRYGIQFMITFILSRIIDVFFVTFHSTTITTSALFTTKNTLSYTVDKILMKIFGNIIGLVFAIVVSTIII
HYNQLYLLNILCVMCVLLLFGFIPNHSDKSGFLVMATLVFISKNQFVGLNRITYVVIGCMISLIIGYYIFPIHEKINMTQ
TVTKKIGHINNLLENILKTESIEGELHEIFIINSKIKTHLERLENTYHLESEVEDIREIHAMTNNLLEVIINLKLEIKNT
QSNNLIKQVNENFKTCINSIDSNKTININEITVPLSNKTPLREYNLWIMEYASIIVDEINKSIENETFKKLNQNL

Sequences:

>Translated_635_residues
MNIKHKNLIEKLDLLVCDDFHPNYVSILIITTILLITTTFFHLINIHNVDTLILITGIFIGIVLSLPLPLTYIRKIMLLF
LIMLPIATITALLSCISPMIQFICILLWILFFVSCNLLGNSLKTLSFVGVLYYLYTFHIAFSNIDFNITLSSMLWYGLVT
ILIVIIEFMPYILYCLYKHDPVGRKILTSLFKNEDKFYKKLEILYKTHDTYTSNMIYVALLLKSNKKVCDYLYNQYKIRQ
LETLDKITQTLTSNIIEIINTPHRHVLDTEELEDLYATTTDMRIKNLIDRYIKAYDVFNNIQEGKYIHLDVEKSMKTTYR
RDYLTLENNDIRYGIQFMITFILSRIIDVFFVTFHSTTITTSALFTTKNTLSYTVDKILMKIFGNIIGLVFAIVVSTIII
HYNQLYLLNILCVMCVLLLFGFIPNHSDKSGFLVMATLVFISKNQFVGLNRITYVVIGCMISLIIGYYIFPIHEKINMTQ
TVTKKIGHINNLLENILKTESIEGELHEIFIINSKIKTHLERLENTYHLESEVEDIREIHAMTNNLLEVIINLKLEIKNT
QSNNLIKQVNENFKTCINSIDSNKTININEITVPLSNKTPLREYNLWIMEYASIIVDEINKSIENETFKKLNQNL
>Mature_635_residues
MNIKHKNLIEKLDLLVCDDFHPNYVSILIITTILLITTTFFHLINIHNVDTLILITGIFIGIVLSLPLPLTYIRKIMLLF
LIMLPIATITALLSCISPMIQFICILLWILFFVSCNLLGNSLKTLSFVGVLYYLYTFHIAFSNIDFNITLSSMLWYGLVT
ILIVIIEFMPYILYCLYKHDPVGRKILTSLFKNEDKFYKKLEILYKTHDTYTSNMIYVALLLKSNKKVCDYLYNQYKIRQ
LETLDKITQTLTSNIIEIINTPHRHVLDTEELEDLYATTTDMRIKNLIDRYIKAYDVFNNIQEGKYIHLDVEKSMKTTYR
RDYLTLENNDIRYGIQFMITFILSRIIDVFFVTFHSTTITTSALFTTKNTLSYTVDKILMKIFGNIIGLVFAIVVSTIII
HYNQLYLLNILCVMCVLLLFGFIPNHSDKSGFLVMATLVFISKNQFVGLNRITYVVIGCMISLIIGYYIFPIHEKINMTQ
TVTKKIGHINNLLENILKTESIEGELHEIFIINSKIKTHLERLENTYHLESEVEDIREIHAMTNNLLEVIINLKLEIKNT
QSNNLIKQVNENFKTCINSIDSNKTININEITVPLSNKTPLREYNLWIMEYASIIVDEINKSIENETFKKLNQNL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 73892; Mature: 73892

Theoretical pI: Translated: 7.44; Mature: 7.44

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNIKHKNLIEKLDLLVCDDFHPNYVSILIITTILLITTTFFHLINIHNVDTLILITGIFI
CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
GIVLSLPLPLTYIRKIMLLFLIMLPIATITALLSCISPMIQFICILLWILFFVSCNLLGN
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SLKTLSFVGVLYYLYTFHIAFSNIDFNITLSSMLWYGLVTILIVIIEFMPYILYCLYKHD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PVGRKILTSLFKNEDKFYKKLEILYKTHDTYTSNMIYVALLLKSNKKVCDYLYNQYKIRQ
CCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
LETLDKITQTLTSNIIEIINTPHRHVLDTEELEDLYATTTDMRIKNLIDRYIKAYDVFNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQEGKYIHLDVEKSMKTTYRRDYLTLENNDIRYGIQFMITFILSRIIDVFFVTFHSTTIT
HCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TSALFTTKNTLSYTVDKILMKIFGNIIGLVFAIVVSTIIIHYNQLYLLNILCVMCVLLLF
HHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFIPNHSDKSGFLVMATLVFISKNQFVGLNRITYVVIGCMISLIIGYYIFPIHEKINMTQ
HCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
TVTKKIGHINNLLENILKTESIEGELHEIFIINSKIKTHLERLENTYHLESEVEDIREIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMTNNLLEVIINLKLEIKNTQSNNLIKQVNENFKTCINSIDSNKTININEITVPLSNKTP
HHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCCC
LREYNLWIMEYASIIVDEINKSIENETFKKLNQNL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNIKHKNLIEKLDLLVCDDFHPNYVSILIITTILLITTTFFHLINIHNVDTLILITGIFI
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SLKTLSFVGVLYYLYTFHIAFSNIDFNITLSSMLWYGLVTILIVIIEFMPYILYCLYKHD
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CCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
LETLDKITQTLTSNIIEIINTPHRHVLDTEELEDLYATTTDMRIKNLIDRYIKAYDVFNN
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HCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TSALFTTKNTLSYTVDKILMKIFGNIIGLVFAIVVSTIIIHYNQLYLLNILCVMCVLLLF
HHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFIPNHSDKSGFLVMATLVFISKNQFVGLNRITYVVIGCMISLIIGYYIFPIHEKINMTQ
HCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
TVTKKIGHINNLLENILKTESIEGELHEIFIINSKIKTHLERLENTYHLESEVEDIREIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMTNNLLEVIINLKLEIKNTQSNNLIKQVNENFKTCINSIDSNKTININEITVPLSNKTP
HHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCCC
LREYNLWIMEYASIIVDEINKSIENETFKKLNQNL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA