| Definition | Staphylococcus aureus RF122, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007622 |
| Length | 2,742,531 |
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The map label for this gene is vraE
Identifier: 82752281
GI number: 82752281
Start: 2731794
End: 2733674
Strand: Direct
Name: vraE
Synonym: SAB2579
Alternate gene names: 82752281
Gene position: 2731794-2733674 (Clockwise)
Preceding gene: 82752280
Following gene: 82752282
Centisome position: 99.61
GC content: 31.47
Gene sequence:
>1881_bases ATGACATTTAACCATATCGTTTTCAAAAACTTACGCCAAAACTTAAAACATTATGCAATGTATTTATTTTCATTATTTTT TAGTATCGTCTTATATTTCAGTTTTACAACCTTACAGTTTACTAAAGGTGTAAATAATGACGACTCGATGGCCATCATTA AGAAAGGTGCTTTAGTCGGATCAATATTTTTATTTATCATTATTGTCATCTTTTTAATGTATGCCAATCATTTATTCGTG AAACGTCGTACACGTGAATTTGCGCTATTTCAGTTGATTGGTTTAACACGACAAAACATTTTGAAAATGTTAGCACTTGA ACAAATGATTGTATTTTTAATCACAGGTGTTGTCGGTGTATTATGTGGCATTGCAGGTGCACAATTATTGCTTTCCATTG TATCTAAATTGATGTCGTTATCGATTAACTTATCGATACATTTCGAACCTATGGCCCTTGTTTTAACTATTTTAATGCTA ATTATTGCGTATATACTGATTTTATTTCAAAGTAGTTTGTTTTTAAAAAGACGCAGTATCTTATCAATGATGAAAGACTC AATTAAAACTGATGTTACAACTGCTAAAGTAACGACTGCAGAGGTTATTTCAGGCGTATTAGGTATTGCTATGATCGCAC TAGGCTATTATATGGCGACAGAAATGTTTGGTACGTTCAAAGCACTAACTATGGCTATGACATCACCGTTTATCATTTTA TTTTTAACGGTTGTAGGCGCCTATTTATTCTTCAGAAGTTCCGTGTCACTGATTTTTAAAACTTTGAAAAAATCTAAAAA TGGACGCGTATCTATTACAGATGTTGTATTTACATCGTCTATTATGTACCGAATGAAGAAAAATGCCATGTCTTTAACTA TCATTGCAATTATTTCTGCAGTTACAGTAACTGTATTGTGTTTTGCGGCATTATCTAAATCAAATACAGATCAAACCCTT ACATCAATGGCACCAAATGAATTTAACGTGGTCGCCTCTCAAGATGCGCAACAATTTGAATCTAAACTAAGCCAACAACA TATTACATTTACTAAAAATTATTATGAAACTATCACTGTAAATAATGTTAAAGATCAGGTTATTACTTTGGAAAATGGTA GTGATTCAGGTCGCACGAATTCTATTTTAAGTGCAAATACAAAGTTAACTGGTAACAATGCCATCATTACAAATACAAAG TCGCTGCCTAACGTGATTAATATCCTTTTAAACAAAGATTTAGTAGTAAAAGGAACTAAGAATGAAACTTTCCGTGTTAC ACAAGAAGACAAAGGTAAGGTTTATCCTTTAAATCTAAGCTTCAACTCACCTGTCGTCGAAGTAAGTCCTGAAAAGTATC AGCAGTTGAAAACACAAAATAATGTTCATACTTTTTATGGGTATGATATTAAACAAACATCACAAAAGGAAAAAGCTCAA GCAATTGCAAAACAGTTTGGAGACAAAGTAATCACGTATGATGACATGAAAAAAGAGGTCGATGCTACTAACGGTATTCT AATATTTGTTACATCATTTTTAGGATTAGCATTTTTAGTAGCAGCTGGATGTATTATTTATATTAAACAAATGGATGAAA CTGAGGATGAACTAAGTAACTTCAGAATATTAAAACGCATAGGCTTTACGCATACAGATATGCTTAAGGGATTATTATTA AAAATTACTTTCAACTTCGGTTTACCATTATTGATTGCTATATTACATGCAGTATTCGCCGCAATAGCATTTATGAAATT GATGGGTAATATTTCCTTCATGCCGGTTATTATAGTAATTGTTGTATACACACTCATTTACATTGCTTTTGCTTTAATCG CTTTTGTACATTCAAACAAATTGATTAAGAAAACCATTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GATGGCCAAATTCATACACAACTTTATCAGGAAGGACGTTCTAAACAGGCCTTTTATGAAGACATTGTACATCTTCAATC AGTATTAGGTGGTGTCTCAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CACTTGTGATTAAAAGATGCTTCATTGAGATTTTGATTTTAAGCAATGCAGTATAACTATTAATTGATTTATAAAAAAGG AGAGATTGAATCATGAAATT
Product: ABC transporter permease
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 626; Mature: 625
Protein sequence:
>626_residues MTFNHIVFKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFV KRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILML IIAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIIL FLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTL TSMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITVNNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTK SLPNVINILLNKDLVVKGTKNETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQ AIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLL KITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIVVYTLIYIAFALIAFVHSNKLIKKTI
Sequences:
>Translated_626_residues MTFNHIVFKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFV KRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILML IIAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIIL FLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTL TSMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITVNNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTK SLPNVINILLNKDLVVKGTKNETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQ AIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLL KITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIVVYTLIYIAFALIAFVHSNKLIKKTI >Mature_625_residues TFNHIVFKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFVK RRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILMLI IAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIILF LTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTLT SMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITVNNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKS LPNVINILLNKDLVVKGTKNETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQA IAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLLK ITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIVVYTLIYIAFALIAFVHSNKLIKKTI
Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]
COG id: COG0577
COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 70023; Mature: 69892
Theoretical pI: Translated: 10.20; Mature: 10.20
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 4.2 %Met (Translated Protein) 4.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 4.0 %Met (Mature Protein) 4.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTFNHIVFKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH SIFLFIIIVIFLMYANHLFVKRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILMLIIAYILILFQSSLFLKRRSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIIL HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH VTVTVLCFAALSKSNTDQTLTSMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITV HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEECCCEEEEEE NNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKSLPNVINILLNKDLVVKGTK CCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEECCCEECCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCEEEECCC NETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQ CCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHH AIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSN HHHHHHCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCHHHHHH FRILKRIGFTHTDMLKGLLLKITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVI HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH VVYTLIYIAFALIAFVHSNKLIKKTI HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCC >Mature Secondary Structure TFNHIVFKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH SIFLFIIIVIFLMYANHLFVKRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILMLIIAYILILFQSSLFLKRRSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIIL HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH VTVTVLCFAALSKSNTDQTLTSMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITV HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEECCCEEEEEE NNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKSLPNVINILLNKDLVVKGTK CCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEECCCEECCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCEEEECCC NETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQ CCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHH AIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSN HHHHHHCCCEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCHHHHHH FRILKRIGFTHTDMLKGLLLKITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVI HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH VVYTLIYIAFALIAFVHSNKLIKKTI HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9387221; 9384377; 14612242; 12890034 [H]