| Definition | Staphylococcus aureus RF122, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007622 |
| Length | 2,742,531 |
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The map label for this gene is 82750689
Identifier: 82750689
GI number: 82750689
Start: 1026020
End: 1027315
Strand: Direct
Name: 82750689
Synonym: SAB0945
Alternate gene names: NA
Gene position: 1026020-1027315 (Clockwise)
Preceding gene: 82750685
Following gene: 82750691
Centisome position: 37.41
GC content: 29.17
Gene sequence:
>1296_bases ATGTCTTTTCTTAGGAAACACACCGAAATTATTTTTAGCTATTTAATCGGTATCGTTTCACTCTTCACTGGTCTCATTAT TTTAATTAACTTGCCATTAATTAAACAATTAAATGGTGGTAAAAAAGTTGATACACATGTTCATAATGTGTGGGAATTTC TGAATGCATTTTTCAGTGAAATTATTAAAGTAATGAGTCGATTTATAGGTAATTTCCCTATAGTTAGTGCAATTGTGATA ATTATATTCGGTATTTTAGTTATGTTGATTGGTCATACATTACTTAGAACTATTAAGTATGACTATGATATTTCTATCTT TTTCTTAGTTATCGGTATCATGTACTTTATTATTACTCTTATATTAATGACACAAGTTTATGGATTCTTTGCAGTGATTT TCATTATTCCATTTACAATTCATATAGGATATATCGTCTATAAAGATGAATTGAATCAGGAAAATGTAAAAAATCATTTC ATGTGGATAATTGTGAGTTATGGTATAAGTTACTTAATTACACAAATTGCATTGTATGGCAGAATTGATGCTAATGAAAT AGAGTCAATTGATATCTTAAGTGTCAATGCTTTCTTTATAATTATGTGGTTACTTGGTCAAATGGCTATTTGGAATTTCT TGTTCTTGCGCCGAGCTTTACCTTTAACAAAGCAAGAATTAGGTGAAGAGGAGCCAGAATTATCAAGAACAAGTAAAGGG AATGTCACGAATCAAACTAAAATTCACTTGAAACAACTCCAAGATAAGACTACAGAATATGCACGTAAGACAAGAAGAAG TGTCGATTTAGATAAAATTAGAGCTAAAAGAGATAAATTCAAAAAGAAAGTTAATGATATTATCGATATTCAAGAAGACG ATATTCCTGATTGGATGAGAAAACCGAAATGGGTTAAACCAATGTATGTCGAACTATTTTGTGGTGTCGTCATCTTTTTA TTCACATTTTTAGAATTTAATAATCGTAATGCATTATTTGTATCTGGTGATTGGAAATTATCACAGACACAATATGTTAT TGAATGGGTTACATTACTAATTCTGCTATTCATTATTATCGCATATATCGCTACAACGTTAACTTTCCACTTGAAAGGTA AGTTTTATTATTTACAACTATTTATGGGGAGCATTTTATTCTTTAAATTGTTAACGGAATTTATAAATATAATGATTCAT GGACTACTACTTTCAGTGTTCATTACGCCAACATTACTATTAATGTTATTGGCAATCATCATTTCTTATTCGTTACAATT ACGAGAGCGACCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTACTTTCGTTAAACTTTTCTAAGTCTATAGCACTATTTATTCATTTATCTAAAGACAACAACATTAGATTAATATATA ATGATTTTGAGGTGAACATA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAAAAGCATTATAAAAGTACTATCTATTAAACATTTTGATGTGTACGCTATAAGTTAGATATATCTCTAACTTATTTAG ATACAGGTCAATGAAGTTTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 431; Mature: 430
Protein sequence:
>431_residues MSFLRKHTEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVI IIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHF MWIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKG NVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFL FTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIH GLLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP
Sequences:
>Translated_431_residues MSFLRKHTEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVI IIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHF MWIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKG NVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFL FTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIH GLLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP >Mature_430_residues SFLRKHTEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVII IFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHFM WIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKGN VTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFLF TFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHG LLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50485; Mature: 50354
Theoretical pI: Translated: 9.64; Mature: 9.64
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSFLRKHTEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIKVMSRFIGNFPIVSAIVIIIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITL HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHFMWIIVSYGISYLITQIALYG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC RIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKG CCCHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCHHCCCCC NVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMR CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHC KPKWVKPMYVELFCGVVIFLFTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIII CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHGLLLSVFITPTLLLMLLAII HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISYSLQLRERP HHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure SFLRKHTEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIKVMSRFIGNFPIVSAIVIIIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITL HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHFMWIIVSYGISYLITQIALYG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC RIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKG CCCHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCHHCCCCC NVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMR CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHC KPKWVKPMYVELFCGVVIFLFTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIII CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHGLLLSVFITPTLLLMLLAII HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISYSLQLRERP HHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA