Definition Nitrosospira multiformis ATCC 25196 chromosome, complete genome.
Accession NC_007614
Length 3,184,243

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The map label for this gene is 82701678

Identifier: 82701678

GI number: 82701678

Start: 627117

End: 630680

Strand: Reverse

Name: 82701678

Synonym: Nmul_A0544

Alternate gene names: NA

Gene position: 630680-627117 (Counterclockwise)

Preceding gene: 82701679

Following gene: 82701677

Centisome position: 19.81

GC content: 42.85

Gene sequence:

>3564_bases
ATGGCTAGCTCAAAGCGGATTAGAAATCCAAAAAAGATAAGAAATAAGCAATCAGCTAGACAAGACAGAATTATTGGCGA
GATCGCGAGTGCTATCCGTATGCGAGGGCATTTAGAAATCGCAAAGCTAAAAATACAAACATCTGTAGATGAGCTCTTCA
CCTTCTTTCCAAGAATTTTTCGCCAAAAAAACGCTCTAGATTTCGTTCACGGTCCCGCGTTTCCAGTTAAACCCTCAGAG
CTATTTTCTAAGCCAGCGCTATATCAACCCGCTGGGCCGTTTAACGAGCTTATTTGGGGCGTTTGCCGCTGCCTTCAATT
TAGTGAGGAATTGAAAGACTTCACACATCTCCGCGAAGAATATGAGCGCTCCCTTCTCCGAAACTCAAAGAGCAAATGCA
ATGAAATTCTTAATGTTATTGAGAGAAAATTTGGATGTTCAATCTGGCTCATACAAAACAAGATTGCTGCGGCACAATTC
TGGGAGGGTATTGAAGAAGCCAGGAAACTAGGGCAGCTGTATGAGGACGAGTGCAAGGACCATCAGCTGATGCCTTGGAT
TATACGTTTTATTGGAAAACGAATTGAAGCAACGGGACTTAAAGGTTATCTAAAGACCGAGCTGTTAAGGATGTTTGGGG
ACTACAGCAATCCAATACTTCAAAGCTATTTGAGAGCGAAACTATTTGAGCTATCTCATATACATACTGATGATGTACCT
GCCACTCTATACGTGGAAGCCCAGTCCTGTGTTATCGATCACTACGAAACCTTGGTATTTATCCTTCAATCAGCGGCTCG
AACTCGAGCAATTTCAACCGGAATGATACCGGTAATTGAAAAGCCACTAGTCGCTATCTTTAGAAGGACGCAGGACATTC
GTCTGGCAGGCGTACTTAGGGGGCTAGATATCGTGCCTAGTACTGTTACTGTCTATAACAAGCAAAGGGCAGAGTTAATA
GAATTATATACAAAAGGCGAATACCCACTCATGGCGCAAAATTCGGAGACATATCTACGTGACTTCCCGGAGGATATGTC
CATACAAGTTATGAGATTGAAGGCCTGCTTGCAAGCTGGGATTTCCTACCCCGACCAACAAGGAGTTCTTAAGGAAGCAT
TTAGAAGCTTACACGAGGTGCTCAGTCTATCTACGAATACCTACTCCGCGGCCTTTGCACTCATTACTTTATCCGAACGC
TTCTATGGACACTCTTGGGTTCACTATCTTGAGGCTGTAACTCGATATGAACTACGTCCGGAACAAGCTGCATTCCCACC
CGATCCACTTAGGGATATCTTTATAAGGGAACCTCACGTAACGCCTTTTAGTGCTGTGGCGGCAAATGGTCAAGCCAAAA
TTAAAATTCTTAACGATGAGCAGTTAAAAATATTATTTCCCTATACGCGCGCCGTGTATGACCTGGTAAGTAGCGGGCAG
ATCGACGAACCCCTGCCGATAAGCGAGATAAGAAAGCAGAAATACCTAGCGGTTTATCATCTGGCTTTTGGTAGCCCCAT
ACGAGCTGCAGAACATTTCCAGTGGTTAATTGTGAACACAACCGGCGTCGAAAATATTCGAGCCCGAGGGGGAGCGGCAC
TTGCACTCTTGAAATTAGATCGCATCTCAGAAGCAGTCGATACAACGGTTGCAGCATATATTGAGAATCAGAATGTGCCG
ACCTTATTGCCTATCAAACAGGTTGCTGATGCACTCAAAGAACCCGCAGATTGGCCAAGATCAATATCGACATCATTATT
GTTCCAACTCTACACGTTGTACTGCGGACCGGAAAAGATTGCGCAGTTACGATATTCGTTTGAACTATTCCAAGTAAATA
ATCGGATAAATGAACCATCAGACCTTGCGGAAAGAATCGAAGAGTTCGGGAAGCCTTTTGTTATAGCCTATCTCAGAAAC
ATTTGGACACCAGAAATTATGAGACATACTATTCTTTATTCTGGAACAAGAGAGATTGAAGAGGCTCGAATTAAAGTTTG
CCGCATACTTGCCGAATTAGATCCGGAAGGTGAGGTAGTTTACTTCGATGAAATCAAAGAGCGTGTAAAACAGCAGGAAA
TAGCGAAGGGGACTAGGCTCATTGAGCAGAGCAAAGTTTATGTAGAAATCGAAGCAATAAAAAAATCACTGAAGACGAAA
CTTGAAGATTCATACATTCGTTATAAAAGCTCATCTCAAACGTCAGTATTAAAACCAGAACAATCATTTGCTAAAAATTT
CATCACTAATTTAGGTGCGGTTTTCGCCAAGGAGAACTCGATCTCCGTCCCTTTAGCCCTATCGAAGATACAAACACTTA
ATCTCAATCTCGATATGGGCTCCGAGTCCGACGTACAATTCGAAGCCCTATTTTCGGAAGTCACAAATGAATTTTTACGT
GGGGACCATGGGCTTAACGCATACCTCAGCACTACAATTAGACACGGAACATTAAGTAATACTCTCCGTAAACCAGTTGC
AGATGAGCGACTCATAACCTCACGGGAAGAAGGGAGCAAATCCTATATACGTAACCAATATTGGGGTCACGGAGAGAAGG
GCTATAGTGAATATCAGGCTGAGTGGCAGCTAATTTTAGATGCACTAGATACTTTCTCAAGCGAGTTCGATAGTGTTATT
GAGTATCTTAAAGATGAACTTATTCAGATCAGAATAGTTCACGAACTCAAGGATTCGGGCGAGAACAAGAACGCGCTATT
TGTTTATCGCTCATCGCAATGGGAAAGAAAATTCGTCCAAGAGCAGGATAAAGCTTTTACAAATATGGATGAATTCGTAA
ATTATTACGTAGACATTCTCTGGGAAAAAACTGATCTAAATTTGCGTAATGTTCAATACGTGTTAGATACGGACATACGA
GCCCGCCTGATGGAGCCTTTCGTTAAATTAACAAATCATCTAAATCGTGTCCCTGCCCCAGGTATTAACGACTTATTAAA
CGCTGTAGGAAGAGCAAAAACGAACGTTCAAAATCAGCTAGGTCTAGTTATTTCTTGGTTTAAAAGGAGCGAAGTATATG
ACCGACAGGACTGTGCTGCCGATTTTCCCTTTCACATTGCCCTCAATATGGTAAAAAACACCATGTTCAACGCAACTGGT
TGGAATGGTGCCTCAGTCTCTCTCTCACGAGACACCCCTTTAATGCCAGGTCGCACTTTGGACGGAATGGTGTATGTATT
TCATGTTCTTCTTGAAAACGCTGTGCTGAGGTCGGGATTGGAGATGGATGAATTGACTGTAAAAGCAGAGCTTTCTTTTT
CTAATGGCGTTTTCAATGCGAGAATATCTAATAATCTCGCTCCTGCGAAAGTTACTCAGGCGGAACGCGACAAACTCAGC
AAGCTCCGTGATTCGCTTAGAAGTGATGAGTCTCCACGCCGTGCCCAGCGTGAAGGCCGAAGTGGTTTACATAAGATATG
GCGTACGATTAATTCACCGATATACAAAGAGCCGAAGCTTGATTTCTATCACTTGGAAGACTCATTTGTAGTCGAGGTGA
ATTTCAAACTTGAGAAGAAAGACCATGAATATCTTGGTCATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGGTTTACACGTCTGAGGCTTCTTGAATGCCTTCTAAAGTATCCTAATGCCCCATCTGGAAGATTGAATCAAGAATTT
AAACTACTTTTATCTCAGAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGATGATGAAGATAAGTCAAAGAAAATCGAAGAATTTATTTCTTTGGAATTTCCGGCCGCGAATGTGCAACTCGCTAAAT
CTTTAAATAGTGGACTTAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1187; Mature: 1186

Protein sequence:

>1187_residues
MASSKRIRNPKKIRNKQSARQDRIIGEIASAIRMRGHLEIAKLKIQTSVDELFTFFPRIFRQKNALDFVHGPAFPVKPSE
LFSKPALYQPAGPFNELIWGVCRCLQFSEELKDFTHLREEYERSLLRNSKSKCNEILNVIERKFGCSIWLIQNKIAAAQF
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ATLYVEAQSCVIDHYETLVFILQSAARTRAISTGMIPVIEKPLVAIFRRTQDIRLAGVLRGLDIVPSTVTVYNKQRAELI
ELYTKGEYPLMAQNSETYLRDFPEDMSIQVMRLKACLQAGISYPDQQGVLKEAFRSLHEVLSLSTNTYSAAFALITLSER
FYGHSWVHYLEAVTRYELRPEQAAFPPDPLRDIFIREPHVTPFSAVAANGQAKIKILNDEQLKILFPYTRAVYDLVSSGQ
IDEPLPISEIRKQKYLAVYHLAFGSPIRAAEHFQWLIVNTTGVENIRARGGAALALLKLDRISEAVDTTVAAYIENQNVP
TLLPIKQVADALKEPADWPRSISTSLLFQLYTLYCGPEKIAQLRYSFELFQVNNRINEPSDLAERIEEFGKPFVIAYLRN
IWTPEIMRHTILYSGTREIEEARIKVCRILAELDPEGEVVYFDEIKERVKQQEIAKGTRLIEQSKVYVEIEAIKKSLKTK
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GDHGLNAYLSTTIRHGTLSNTLRKPVADERLITSREEGSKSYIRNQYWGHGEKGYSEYQAEWQLILDALDTFSSEFDSVI
EYLKDELIQIRIVHELKDSGENKNALFVYRSSQWERKFVQEQDKAFTNMDEFVNYYVDILWEKTDLNLRNVQYVLDTDIR
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WNGASVSLSRDTPLMPGRTLDGMVYVFHVLLENAVLRSGLEMDELTVKAELSFSNGVFNARISNNLAPAKVTQAERDKLS
KLRDSLRSDESPRRAQREGRSGLHKIWRTINSPIYKEPKLDFYHLEDSFVVEVNFKLEKKDHEYLGH

Sequences:

>Translated_1187_residues
MASSKRIRNPKKIRNKQSARQDRIIGEIASAIRMRGHLEIAKLKIQTSVDELFTFFPRIFRQKNALDFVHGPAFPVKPSE
LFSKPALYQPAGPFNELIWGVCRCLQFSEELKDFTHLREEYERSLLRNSKSKCNEILNVIERKFGCSIWLIQNKIAAAQF
WEGIEEARKLGQLYEDECKDHQLMPWIIRFIGKRIEATGLKGYLKTELLRMFGDYSNPILQSYLRAKLFELSHIHTDDVP
ATLYVEAQSCVIDHYETLVFILQSAARTRAISTGMIPVIEKPLVAIFRRTQDIRLAGVLRGLDIVPSTVTVYNKQRAELI
ELYTKGEYPLMAQNSETYLRDFPEDMSIQVMRLKACLQAGISYPDQQGVLKEAFRSLHEVLSLSTNTYSAAFALITLSER
FYGHSWVHYLEAVTRYELRPEQAAFPPDPLRDIFIREPHVTPFSAVAANGQAKIKILNDEQLKILFPYTRAVYDLVSSGQ
IDEPLPISEIRKQKYLAVYHLAFGSPIRAAEHFQWLIVNTTGVENIRARGGAALALLKLDRISEAVDTTVAAYIENQNVP
TLLPIKQVADALKEPADWPRSISTSLLFQLYTLYCGPEKIAQLRYSFELFQVNNRINEPSDLAERIEEFGKPFVIAYLRN
IWTPEIMRHTILYSGTREIEEARIKVCRILAELDPEGEVVYFDEIKERVKQQEIAKGTRLIEQSKVYVEIEAIKKSLKTK
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GDHGLNAYLSTTIRHGTLSNTLRKPVADERLITSREEGSKSYIRNQYWGHGEKGYSEYQAEWQLILDALDTFSSEFDSVI
EYLKDELIQIRIVHELKDSGENKNALFVYRSSQWERKFVQEQDKAFTNMDEFVNYYVDILWEKTDLNLRNVQYVLDTDIR
ARLMEPFVKLTNHLNRVPAPGINDLLNAVGRAKTNVQNQLGLVISWFKRSEVYDRQDCAADFPFHIALNMVKNTMFNATG
WNGASVSLSRDTPLMPGRTLDGMVYVFHVLLENAVLRSGLEMDELTVKAELSFSNGVFNARISNNLAPAKVTQAERDKLS
KLRDSLRSDESPRRAQREGRSGLHKIWRTINSPIYKEPKLDFYHLEDSFVVEVNFKLEKKDHEYLGH
>Mature_1186_residues
ASSKRIRNPKKIRNKQSARQDRIIGEIASAIRMRGHLEIAKLKIQTSVDELFTFFPRIFRQKNALDFVHGPAFPVKPSEL
FSKPALYQPAGPFNELIWGVCRCLQFSEELKDFTHLREEYERSLLRNSKSKCNEILNVIERKFGCSIWLIQNKIAAAQFW
EGIEEARKLGQLYEDECKDHQLMPWIIRFIGKRIEATGLKGYLKTELLRMFGDYSNPILQSYLRAKLFELSHIHTDDVPA
TLYVEAQSCVIDHYETLVFILQSAARTRAISTGMIPVIEKPLVAIFRRTQDIRLAGVLRGLDIVPSTVTVYNKQRAELIE
LYTKGEYPLMAQNSETYLRDFPEDMSIQVMRLKACLQAGISYPDQQGVLKEAFRSLHEVLSLSTNTYSAAFALITLSERF
YGHSWVHYLEAVTRYELRPEQAAFPPDPLRDIFIREPHVTPFSAVAANGQAKIKILNDEQLKILFPYTRAVYDLVSSGQI
DEPLPISEIRKQKYLAVYHLAFGSPIRAAEHFQWLIVNTTGVENIRARGGAALALLKLDRISEAVDTTVAAYIENQNVPT
LLPIKQVADALKEPADWPRSISTSLLFQLYTLYCGPEKIAQLRYSFELFQVNNRINEPSDLAERIEEFGKPFVIAYLRNI
WTPEIMRHTILYSGTREIEEARIKVCRILAELDPEGEVVYFDEIKERVKQQEIAKGTRLIEQSKVYVEIEAIKKSLKTKL
EDSYIRYKSSSQTSVLKPEQSFAKNFITNLGAVFAKENSISVPLALSKIQTLNLNLDMGSESDVQFEALFSEVTNEFLRG
DHGLNAYLSTTIRHGTLSNTLRKPVADERLITSREEGSKSYIRNQYWGHGEKGYSEYQAEWQLILDALDTFSSEFDSVIE
YLKDELIQIRIVHELKDSGENKNALFVYRSSQWERKFVQEQDKAFTNMDEFVNYYVDILWEKTDLNLRNVQYVLDTDIRA
RLMEPFVKLTNHLNRVPAPGINDLLNAVGRAKTNVQNQLGLVISWFKRSEVYDRQDCAADFPFHIALNMVKNTMFNATGW
NGASVSLSRDTPLMPGRTLDGMVYVFHVLLENAVLRSGLEMDELTVKAELSFSNGVFNARISNNLAPAKVTQAERDKLSK
LRDSLRSDESPRRAQREGRSGLHKIWRTINSPIYKEPKLDFYHLEDSFVVEVNFKLEKKDHEYLGH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 136337; Mature: 136205

Theoretical pI: Translated: 7.39; Mature: 7.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MASSKRIRNPKKIRNKQSARQDRIIGEIASAIRMRGHLEIAKLKIQTSVDELFTFFPRIF
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
RQKNALDFVHGPAFPVKPSELFSKPALYQPAGPFNELIWGVCRCLQFSEELKDFTHLREE
HCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YERSLLRNSKSKCNEILNVIERKFGCSIWLIQNKIAAAQFWEGIEEARKLGQLYEDECKD
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HQLMPWIIRFIGKRIEATGLKGYLKTELLRMFGDYSNPILQSYLRAKLFELSHIHTDDVP
CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
ATLYVEAQSCVIDHYETLVFILQSAARTRAISTGMIPVIEKPLVAIFRRTQDIRLAGVLR
EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
GLDIVPSTVTVYNKQRAELIELYTKGEYPLMAQNSETYLRDFPEDMSIQVMRLKACLQAG
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ISYPDQQGVLKEAFRSLHEVLSLSTNTYSAAFALITLSERFYGHSWVHYLEAVTRYELRP
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
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CCCCCCCCCHHHHEECCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCC
IDEPLPISEIRKQKYLAVYHLAFGSPIRAAEHFQWLIVNTTGVENIRARGGAALALLKLD
CCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHCCEEEEEEECCCCHHHHHCCCCEEEHHHHH
RISEAVDTTVAAYIENQNVPTLLPIKQVADALKEPADWPRSISTSLLFQLYTLYCGPEKI
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HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHEEEHHHHHHHHHHH
LEDSYIRYKSSSQTSVLKPEQSFAKNFITNLGAVFAKENSISVPLALSKIQTLNLNLDMG
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HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEEEEEECCCHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
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CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
RQKNALDFVHGPAFPVKPSELFSKPALYQPAGPFNELIWGVCRCLQFSEELKDFTHLREE
HCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YERSLLRNSKSKCNEILNVIERKFGCSIWLIQNKIAAAQFWEGIEEARKLGQLYEDECKD
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
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CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
ATLYVEAQSCVIDHYETLVFILQSAARTRAISTGMIPVIEKPLVAIFRRTQDIRLAGVLR
EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
GLDIVPSTVTVYNKQRAELIELYTKGEYPLMAQNSETYLRDFPEDMSIQVMRLKACLQAG
CCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
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CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
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CCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHCCEEEEEEECCCCHHHHHCCCCEEEHHHHH
RISEAVDTTVAAYIENQNVPTLLPIKQVADALKEPADWPRSISTSLLFQLYTLYCGPEKI
HHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEECHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
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HHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHH
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LEDSYIRYKSSSQTSVLKPEQSFAKNFITNLGAVFAKENSISVPLALSKIQTLNLNLDMG
HHHHHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHCEEEEEEEEECC
SESDVQFEALFSEVTNEFLRGDHGLNAYLSTTIRHGTLSNTLRKPVADERLITSREEGSK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCH
SYIRNQYWGHGEKGYSEYQAEWQLILDALDTFSSEFDSVIEYLKDELIQIRIVHELKDSG
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ENKNALFVYRSSQWERKFVQEQDKAFTNMDEFVNYYVDILWEKTDLNLRNVQYVLDTDIR
CCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEEEECCHHH
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CHHHEEEEEEEEECCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
SGLHKIWRTINSPIYKEPKLDFYHLEDSFVVEVNFKLEKKDHEYLGH
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEEEEEECCCHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9163424 [H]