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The map label for this gene is 78779739

Identifier: 78779739

GI number: 78779739

Start: 1271749

End: 1273425

Strand: Direct

Name: 78779739

Synonym: PMT9312_1355

Alternate gene names: NA

Gene position: 1271749-1273425 (Clockwise)

Preceding gene: 78779738

Following gene: 78779746

Centisome position: 74.41

GC content: 25.4

Gene sequence:

>1677_bases
ATGCAACGTGAAATAGAAAATAATTTTAATAATATTTGGGAATCTCAAATTGATCAGTCAGAAGAAGAAATTGATCTGAA
AAACCTCTTTAACATATTTATTGAAAAGAAGAAAACAATAGCAGGAATTACTTTAACCTCTTTCTTATTGGGTTGTTCAT
TTGCATTACTTCAAAAAAAATTATGGCAAGGGCAATTCCAAATTGTTCTTTCTGGTTCAGACATTAACTCATCAATGAAT
TTAGCGTTACCTAAAAACAATCCAATTAATAAACTTTTCAATAATTCATCGAGAAATAATATTAATACAGAACTTGAGAT
CTTAAAAAGTCCTTATATATTGCTTCCTATTTTTGAATACGTAATGTCAGAAAAAAATATATCTGACTACAAGGTTAACA
AATTTGAAGAATGGAAAAAAGATTATTTAGAAGTAAAGTTCAAAAATAATACGAATATACTTGATATTTCATATAAAGAT
AATGATAAAGATTTAATTATTCCTGTACTAACAAAAATTTCAAAAATATATCAACAATATTCTCCAAACAAAAAAATAGA
AACTATAAATACAAAGATTAGTTATTTAGATGATCAGATTGATATTTATAAAGAAAAATACAAAAAATCCTTTGAGAAGG
CTTTAAATTTTTCTTTTGAGAAAGGACTATCAACTAATTTATTTTCAGAAATAAATCCCAATATAATTGATCAAAATGAT
GGGGTTCTGATAAAAAATATAGAAGTCAAATTAGATACTCTCAAAAATTTAGAAGATTCCTCAGCCTTGATTGCATTTTC
AGAAGCAAATCTTATTAGTAGTGAAAAAATAAAAAGAATAAAAACAATTATTTCGGAAAAAGAGATGCAACTAATAATGT
ATTCAAAAGTTTATAAAGATCAAGATGTTGTTATAAAAGATATTAAAAAGGAAATTCTTACTTTATCAAAAATTTTTAAT
GATGAATTAAAGACTTTTTTGAAATCACAAAAAGAAGCGGCTATCAATCGAATCAACGCACAGAATTCTTCAAAAGAAAT
TCTTATTGAACATAAAAAATTAGTTTCTGAAGCAATTAAAAATCAAAGAATACTGATTAACTTTGAAGACACTTTGCGAA
ATATGCAGTTTTTCTTGAGAGAAAAAACTGTCCCTTGGAAACTAATTACTCAACCATTGGTCTCTGAAAACCCAGTTGCT
CCACAGAAAAGACGTATTGCCATTTTATGGACTGCGGCAGGTTTTGCAATAAGCTTATTTTATGTACTTTTTAGATATCA
ACAAATAGGTTTATTGAAAAGAAATGAAGAGTTACAAAGCGTCCTTAGAATTCCTTTTATTGATAATTTTAATACTAAAG
AAGAATCAAATTTATCGAATTTCTTTAAATTTCTGAATAAAGGCATTATCTCAAAAACTAATATCAAAAAGATCTCCCTA
GTACCCCTAGGAGATATTGAAAATATTAGCTTAAACAAAATCGAGAATTACATCCAAACTAATGATCAAGATAAATTTAC
TTTGAGGGAAAGCTTACAAGAAATTGATAAAGATGATTTAATAATTTTCATTACATCTCTTAAAAATATATTTAAAAAAG
ATGTGATCAAAATTAGAAATAAAATAACTCTAAACAAATTATCTGTTTTTGGATTTTTAATTATCGATAGCGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTATTGCATTACTCTAATCAAAAAATTCTTTATAAGTTATACAATTATAATGATAAAATATTCTAATATTCTTTATTT
TTTAAAAGTTCAAAAACATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTTGTATCTATTTAACAAAAATTCAATAGTAAGAAATTAATAAAATTAAAAATATTTACCTGGAAAAATTAATTTCTAA
TTTATTTTTTTAATTTTATC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 558; Mature: 558

Protein sequence:

>558_residues
MQREIENNFNNIWESQIDQSEEEIDLKNLFNIFIEKKKTIAGITLTSFLLGCSFALLQKKLWQGQFQIVLSGSDINSSMN
LALPKNNPINKLFNNSSRNNINTELEILKSPYILLPIFEYVMSEKNISDYKVNKFEEWKKDYLEVKFKNNTNILDISYKD
NDKDLIIPVLTKISKIYQQYSPNKKIETINTKISYLDDQIDIYKEKYKKSFEKALNFSFEKGLSTNLFSEINPNIIDQND
GVLIKNIEVKLDTLKNLEDSSALIAFSEANLISSEKIKRIKTIISEKEMQLIMYSKVYKDQDVVIKDIKKEILTLSKIFN
DELKTFLKSQKEAAINRINAQNSSKEILIEHKKLVSEAIKNQRILINFEDTLRNMQFFLREKTVPWKLITQPLVSENPVA
PQKRRIAILWTAAGFAISLFYVLFRYQQIGLLKRNEELQSVLRIPFIDNFNTKEESNLSNFFKFLNKGIISKTNIKKISL
VPLGDIENISLNKIENYIQTNDQDKFTLRESLQEIDKDDLIIFITSLKNIFKKDVIKIRNKITLNKLSVFGFLIIDSE

Sequences:

>Translated_558_residues
MQREIENNFNNIWESQIDQSEEEIDLKNLFNIFIEKKKTIAGITLTSFLLGCSFALLQKKLWQGQFQIVLSGSDINSSMN
LALPKNNPINKLFNNSSRNNINTELEILKSPYILLPIFEYVMSEKNISDYKVNKFEEWKKDYLEVKFKNNTNILDISYKD
NDKDLIIPVLTKISKIYQQYSPNKKIETINTKISYLDDQIDIYKEKYKKSFEKALNFSFEKGLSTNLFSEINPNIIDQND
GVLIKNIEVKLDTLKNLEDSSALIAFSEANLISSEKIKRIKTIISEKEMQLIMYSKVYKDQDVVIKDIKKEILTLSKIFN
DELKTFLKSQKEAAINRINAQNSSKEILIEHKKLVSEAIKNQRILINFEDTLRNMQFFLREKTVPWKLITQPLVSENPVA
PQKRRIAILWTAAGFAISLFYVLFRYQQIGLLKRNEELQSVLRIPFIDNFNTKEESNLSNFFKFLNKGIISKTNIKKISL
VPLGDIENISLNKIENYIQTNDQDKFTLRESLQEIDKDDLIIFITSLKNIFKKDVIKIRNKITLNKLSVFGFLIIDSE
>Mature_558_residues
MQREIENNFNNIWESQIDQSEEEIDLKNLFNIFIEKKKTIAGITLTSFLLGCSFALLQKKLWQGQFQIVLSGSDINSSMN
LALPKNNPINKLFNNSSRNNINTELEILKSPYILLPIFEYVMSEKNISDYKVNKFEEWKKDYLEVKFKNNTNILDISYKD
NDKDLIIPVLTKISKIYQQYSPNKKIETINTKISYLDDQIDIYKEKYKKSFEKALNFSFEKGLSTNLFSEINPNIIDQND
GVLIKNIEVKLDTLKNLEDSSALIAFSEANLISSEKIKRIKTIISEKEMQLIMYSKVYKDQDVVIKDIKKEILTLSKIFN
DELKTFLKSQKEAAINRINAQNSSKEILIEHKKLVSEAIKNQRILINFEDTLRNMQFFLREKTVPWKLITQPLVSENPVA
PQKRRIAILWTAAGFAISLFYVLFRYQQIGLLKRNEELQSVLRIPFIDNFNTKEESNLSNFFKFLNKGIISKTNIKKISL
VPLGDIENISLNKIENYIQTNDQDKFTLRESLQEIDKDDLIIFITSLKNIFKKDVIKIRNKITLNKLSVFGFLIIDSE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 65098; Mature: 65098

Theoretical pI: Translated: 9.57; Mature: 9.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQREIENNFNNIWESQIDQSEEEIDLKNLFNIFIEKKKTIAGITLTSFLLGCSFALLQKK
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LWQGQFQIVLSGSDINSSMNLALPKNNPINKLFNNSSRNNINTELEILKSPYILLPIFEY
HCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHH
VMSEKNISDYKVNKFEEWKKDYLEVKFKNNTNILDISYKDNDKDLIIPVLTKISKIYQQY
HHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
SPNKKIETINTKISYLDDQIDIYKEKYKKSFEKALNFSFEKGLSTNLFSEINPNIIDQND
CCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHCCCCEECCCC
GVLIKNIEVKLDTLKNLEDSSALIAFSEANLISSEKIKRIKTIISEKEMQLIMYSKVYKD
CEEEEEEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QDVVIKDIKKEILTLSKIFNDELKTFLKSQKEAAINRINAQNSSKEILIEHKKLVSEAIK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
NQRILINFEDTLRNMQFFLREKTVPWKLITQPLVSENPVAPQKRRIAILWTAAGFAISLF
CCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHH
YVLFRYQQIGLLKRNEELQSVLRIPFIDNFNTKEESNLSNFFKFLNKGIISKTNIKKISL
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEE
VPLGDIENISLNKIENYIQTNDQDKFTLRESLQEIDKDDLIIFITSLKNIFKKDVIKIRN
EECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
KITLNKLSVFGFLIIDSE
HHEEEEEEEEEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MQREIENNFNNIWESQIDQSEEEIDLKNLFNIFIEKKKTIAGITLTSFLLGCSFALLQKK
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LWQGQFQIVLSGSDINSSMNLALPKNNPINKLFNNSSRNNINTELEILKSPYILLPIFEY
HCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHH
VMSEKNISDYKVNKFEEWKKDYLEVKFKNNTNILDISYKDNDKDLIIPVLTKISKIYQQY
HHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
SPNKKIETINTKISYLDDQIDIYKEKYKKSFEKALNFSFEKGLSTNLFSEINPNIIDQND
CCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHCCCCEECCCC
GVLIKNIEVKLDTLKNLEDSSALIAFSEANLISSEKIKRIKTIISEKEMQLIMYSKVYKD
CEEEEEEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QDVVIKDIKKEILTLSKIFNDELKTFLKSQKEAAINRINAQNSSKEILIEHKKLVSEAIK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
NQRILINFEDTLRNMQFFLREKTVPWKLITQPLVSENPVAPQKRRIAILWTAAGFAISLF
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YVLFRYQQIGLLKRNEELQSVLRIPFIDNFNTKEESNLSNFFKFLNKGIISKTNIKKISL
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEE
VPLGDIENISLNKIENYIQTNDQDKFTLRESLQEIDKDDLIIFITSLKNIFKKDVIKIRN
EECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
KITLNKLSVFGFLIIDSE
HHEEEEEEEEEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA