| Definition | Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007514 |
| Length | 2,572,079 |
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The map label for this gene is 78189813
Identifier: 78189813
GI number: 78189813
Start: 2365057
End: 2367453
Strand: Reverse
Name: 78189813
Synonym: Cag_1857
Alternate gene names: NA
Gene position: 2367453-2365057 (Counterclockwise)
Preceding gene: 78189814
Following gene: 78189812
Centisome position: 92.04
GC content: 46.35
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 798; Mature: 798
Protein sequence:
>798_residues MKKQILLFSAIFSGYTFLLLLLYFPLVFQSQVLTAPDSLIPQASSMALDKLQAESGSYPLWQPWIFSGMPTVEAFSYLSG LYYPNLLFNLFHTDGVLLQLLHLAFAGAGTFLLLRDLRLSLLASIAGGLIFLCNPFFSAMLVHGHGSQLMTTAYMPWMLW AAMRFMDRGGVAEAGIFALIAGLQLQRAHVQMAYYSWLMMLLLVVVLFATRRWVVPQAVQRGGLFVIASVTAIAMAAAIY LPASHYAEASVRGAAVGGGGAAWEYATLWSLHPLEAITFLFPGFFGFGGVTYWGFMPFTDFPHYAGLVVLLLALMGLIMR RREPMTWLFAGVGFLALLLAFGRFFSPIFDLFYSFAPLFSRFRVPSMALIMLYFALAALAAIGLHELLERKPQRLLKVLR LSSIVVALLLLIFLALEEVAEHAARSLFPLPQVDSFELVSAINSIRWEQLSSSVIVTLTLLLLVAGVLWLLLSGKISSKY SASLLVLLAVGDLLWVTVQVIYPSAHSLRTPLFADKQQVAPAFQHDDVTRFLASQPKPFRIYPAGNFFTENKFALFGIES VGGYHPAKLKSYDDLLQVSDNLASIALLRMLNVHYIVSPAPIEHPTLTLATSGTLQRANGSAQAFVYRLQEPAPRAWFVS RVVPFSNKQELYSHLLDDTASLSVAYVEAQQWQGAQRFSEGTIQSVTTQPESIKLNVNAPNSSFLVLSEIYYPNGWQVML DGKATSMLRVNGVLRGVNVPAGNHAIHFSYNRHLFEQSQWIALAGFIIALLMIAGGLLWKHLLLSGEKRVVRGFHTIR
Sequences:
>Translated_798_residues MKKQILLFSAIFSGYTFLLLLLYFPLVFQSQVLTAPDSLIPQASSMALDKLQAESGSYPLWQPWIFSGMPTVEAFSYLSG LYYPNLLFNLFHTDGVLLQLLHLAFAGAGTFLLLRDLRLSLLASIAGGLIFLCNPFFSAMLVHGHGSQLMTTAYMPWMLW AAMRFMDRGGVAEAGIFALIAGLQLQRAHVQMAYYSWLMMLLLVVVLFATRRWVVPQAVQRGGLFVIASVTAIAMAAAIY LPASHYAEASVRGAAVGGGGAAWEYATLWSLHPLEAITFLFPGFFGFGGVTYWGFMPFTDFPHYAGLVVLLLALMGLIMR RREPMTWLFAGVGFLALLLAFGRFFSPIFDLFYSFAPLFSRFRVPSMALIMLYFALAALAAIGLHELLERKPQRLLKVLR LSSIVVALLLLIFLALEEVAEHAARSLFPLPQVDSFELVSAINSIRWEQLSSSVIVTLTLLLLVAGVLWLLLSGKISSKY SASLLVLLAVGDLLWVTVQVIYPSAHSLRTPLFADKQQVAPAFQHDDVTRFLASQPKPFRIYPAGNFFTENKFALFGIES VGGYHPAKLKSYDDLLQVSDNLASIALLRMLNVHYIVSPAPIEHPTLTLATSGTLQRANGSAQAFVYRLQEPAPRAWFVS RVVPFSNKQELYSHLLDDTASLSVAYVEAQQWQGAQRFSEGTIQSVTTQPESIKLNVNAPNSSFLVLSEIYYPNGWQVML DGKATSMLRVNGVLRGVNVPAGNHAIHFSYNRHLFEQSQWIALAGFIIALLMIAGGLLWKHLLLSGEKRVVRGFHTIR >Mature_798_residues MKKQILLFSAIFSGYTFLLLLLYFPLVFQSQVLTAPDSLIPQASSMALDKLQAESGSYPLWQPWIFSGMPTVEAFSYLSG LYYPNLLFNLFHTDGVLLQLLHLAFAGAGTFLLLRDLRLSLLASIAGGLIFLCNPFFSAMLVHGHGSQLMTTAYMPWMLW AAMRFMDRGGVAEAGIFALIAGLQLQRAHVQMAYYSWLMMLLLVVVLFATRRWVVPQAVQRGGLFVIASVTAIAMAAAIY LPASHYAEASVRGAAVGGGGAAWEYATLWSLHPLEAITFLFPGFFGFGGVTYWGFMPFTDFPHYAGLVVLLLALMGLIMR RREPMTWLFAGVGFLALLLAFGRFFSPIFDLFYSFAPLFSRFRVPSMALIMLYFALAALAAIGLHELLERKPQRLLKVLR LSSIVVALLLLIFLALEEVAEHAARSLFPLPQVDSFELVSAINSIRWEQLSSSVIVTLTLLLLVAGVLWLLLSGKISSKY SASLLVLLAVGDLLWVTVQVIYPSAHSLRTPLFADKQQVAPAFQHDDVTRFLASQPKPFRIYPAGNFFTENKFALFGIES VGGYHPAKLKSYDDLLQVSDNLASIALLRMLNVHYIVSPAPIEHPTLTLATSGTLQRANGSAQAFVYRLQEPAPRAWFVS RVVPFSNKQELYSHLLDDTASLSVAYVEAQQWQGAQRFSEGTIQSVTTQPESIKLNVNAPNSSFLVLSEIYYPNGWQVML DGKATSMLRVNGVLRGVNVPAGNHAIHFSYNRHLFEQSQWIALAGFIIALLMIAGGLLWKHLLLSGEKRVVRGFHTIR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 88428; Mature: 88428
Theoretical pI: Translated: 9.56; Mature: 9.56
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.9 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKQILLFSAIFSGYTFLLLLLYFPLVFQSQVLTAPDSLIPQASSMALDKLQAESGSYPL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC WQPWIFSGMPTVEAFSYLSGLYYPNLLFNLFHTDGVLLQLLHLAFAGAGTFLLLRDLRLS CCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LLASIAGGLIFLCNPFFSAMLVHGHGSQLMTTAYMPWMLWAAMRFMDRGGVAEAGIFALI HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH AGLQLQRAHVQMAYYSWLMMLLLVVVLFATRRWVVPQAVQRGGLFVIASVTAIAMAAAIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH LPASHYAEASVRGAAVGGGGAAWEYATLWSLHPLEAITFLFPGFFGFGGVTYWGFMPFTD CCCHHHHHHHCCCCEECCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCC FPHYAGLVVLLLALMGLIMRRREPMTWLFAGVGFLALLLAFGRFFSPIFDLFYSFAPLFS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RFRVPSMALIMLYFALAALAAIGLHELLERKPQRLLKVLRLSSIVVALLLLIFLALEEVA HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHAARSLFPLPQVDSFELVSAINSIRWEQLSSSVIVTLTLLLLVAGVLWLLLSGKISSKY HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH SASLLVLLAVGDLLWVTVQVIYPSAHSLRTPLFADKQQVAPAFQHDDVTRFLASQPKPFR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEE IYPAGNFFTENKFALFGIESVGGYHPAKLKSYDDLLQVSDNLASIALLRMLNVHYIVSPA EEECCCCEECCCEEEEEEHHCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC PIEHPTLTLATSGTLQRANGSAQAFVYRLQEPAPRAWFVSRVVPFSNKQELYSHLLDDTA CCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHH SLSVAYVEAQQWQGAQRFSEGTIQSVTTQPESIKLNVNAPNSSFLVLSEIYYPNGWQVML CCEEEEEEHHHCCCHHHHCCCCHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEE DGKATSMLRVNGVLRGVNVPAGNHAIHFSYNRHLFEQSQWIALAGFIIALLMIAGGLLWK CCCCHHHHEEHHHHEECCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HLLLSGEKRVVRGFHTIR HHHHCCCHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKKQILLFSAIFSGYTFLLLLLYFPLVFQSQVLTAPDSLIPQASSMALDKLQAESGSYPL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC WQPWIFSGMPTVEAFSYLSGLYYPNLLFNLFHTDGVLLQLLHLAFAGAGTFLLLRDLRLS CCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LLASIAGGLIFLCNPFFSAMLVHGHGSQLMTTAYMPWMLWAAMRFMDRGGVAEAGIFALI HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH AGLQLQRAHVQMAYYSWLMMLLLVVVLFATRRWVVPQAVQRGGLFVIASVTAIAMAAAIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH LPASHYAEASVRGAAVGGGGAAWEYATLWSLHPLEAITFLFPGFFGFGGVTYWGFMPFTD CCCHHHHHHHCCCCEECCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCC FPHYAGLVVLLLALMGLIMRRREPMTWLFAGVGFLALLLAFGRFFSPIFDLFYSFAPLFS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RFRVPSMALIMLYFALAALAAIGLHELLERKPQRLLKVLRLSSIVVALLLLIFLALEEVA HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHAARSLFPLPQVDSFELVSAINSIRWEQLSSSVIVTLTLLLLVAGVLWLLLSGKISSKY HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH SASLLVLLAVGDLLWVTVQVIYPSAHSLRTPLFADKQQVAPAFQHDDVTRFLASQPKPFR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEE IYPAGNFFTENKFALFGIESVGGYHPAKLKSYDDLLQVSDNLASIALLRMLNVHYIVSPA EEECCCCEECCCEEEEEEHHCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC PIEHPTLTLATSGTLQRANGSAQAFVYRLQEPAPRAWFVSRVVPFSNKQELYSHLLDDTA CCCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHH SLSVAYVEAQQWQGAQRFSEGTIQSVTTQPESIKLNVNAPNSSFLVLSEIYYPNGWQVML CCEEEEEEHHHCCCHHHHCCCCHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEE DGKATSMLRVNGVLRGVNVPAGNHAIHFSYNRHLFEQSQWIALAGFIIALLMIAGGLLWK CCCCHHHHEEHHHHEECCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HLLLSGEKRVVRGFHTIR HHHHCCCHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA