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The map label for this gene is 78189558

Identifier: 78189558

GI number: 78189558

Start: 2087595

End: 2089529

Strand: Reverse

Name: 78189558

Synonym: Cag_1598

Alternate gene names: NA

Gene position: 2089529-2087595 (Counterclockwise)

Preceding gene: 78189559

Following gene: 78189555

Centisome position: 81.24

GC content: 50.59

Gene sequence:

>1935_bases
ATGCTGCTCCCAGCCTCTTGCATGGCTTTGCCGACAGCATCATCCTTGATGCCGCATGTGCAACAAGCTGAATTAAGCTC
GTGGATTTTTTACGCCCCTCTTGTAGCGCCTGTTATGGCATTGGCGGTTAATGTTGCGTTGCCTTTTTATCAACGTGCAA
AGCGTCGGCGGAGTATTGCTAAGCAGCGGGCGGCGCGTCGTGAGCGTTTTGGGCTTGCTACAGAGAATAGTGCGGTGCGT
GGGCGCGTTAAGCATCCCGATAATTATTATCGTCAATGGCTTGCGCGTTGGTGCCAGCAGCAGCAAGGGGCGTTGTTGCC
CGGTGGGGTGGCGTTTGAGAGTATGGATTTTACTGATCTTTTTGTGCTGCCCGATGTGCTGTTGCAAGGTTCAACTCCAA
CGGAACAAGGTGGAGCCGTATCGTTTGACACGGCACTCTCTTTTGCGGCGGAGTCGTCGCGTTTGTTGTTGCTGATAGGC
GAAGATGGTGGTGGTAAAAGTGCGCTTATGCAGTCGTTAGTGCTTGGCAATAAACCGCGTTTATCGGGTTTTTCCGATAA
GTCTCAAATCTTTTTTTTGCCACTGACAGCTTTAGCGGCAATTCCAACGCCATTTCCAGCATTGCCTGATGTGTTGCGGG
AGTGGAGTGGTTTGCAGGAGCAACTGAGTACTTCGTTTTTCCATTCGCATCTTACCACGCATCGAACATTGGTGTTGCTT
GATGGACTTGATGCTTTGCACAATCCTGAGCAGCGTGAAGCGGTGTGCCGCTGGATTGCTGAGGCTGTGGGGGAGTGGCA
GAAAGCCTTTTTTGTGCTAACCACCTCTCCCGATACTTTTGGTGAGCGGGAGCAAGCAGCATTGGCGTGCCATACGCGCA
TTGCGGTGTTGAAGCAGTTTAATAATCAGCAACAGCATCTTTTTTTTCGCCAATGGTTTCGAGCATTGCGCTTGCGTGAA
CTGTGCCGTGAACATGGTGATGTTGCCGAGTGCTCTTTAACCACCATTGAGCGCCATGAGTTAGAGGCGGAGGTGTGTGC
TGATGCGCTTGAGTACTCTTTGCAAAAGGTGGAGCCAACGCTTATGCGCGAAGTTGCTGCAACGCCATTGTTGCTTGGTA
TTCTTGCTCGTTTTTGGGAAGAGCACCATTATGTGCCAACCACGCGTGAAGCGCTTTATGATGCAGCACTTACCTATTTA
TTGAAGGATGCAGTGCAGCAGCCTGATTGTTTGCACCTTTTGCCTCCTATAGCGGAGCTTAAACATTTACTGGGTTCTTT
AGCGCTGTGGATGCAAGATAGCGGGGTGATTGCGGCACCTGTGGAGCAGGTTCATGCTTGGCTTCAGCCTGAAGTTGAGC
GGCTTAATGCGCGTTTTGGTGATGCTTATCGGGTGGATGCTCTTTGTACGCATTTGGCGGCAGGAGGTAGTGTGCTCGGT
CAGCAAGGGGGAGCTTATTTATTTACGCATAATAGCTTTCGTGATTATTTAATTGGTGAACAGCTTTTAAAAGAGGTAGG
GGTAGAACCAACCCGTGCAGCTAAAATGGCTGTGCAGCTTGGTGATGGTTGGTGGGATGAAGCCTTTCTCTTTTTTGCAA
TTCGTGCTGAAGGGCTGTGGTTTACGCGCTTTTTAAAAGCGCTTATGGAATCGCCACAGAGTGAATTGTTGGATGAGGCG
GCGCGTGGGTTGCTGTTGCGCATGGTGGAGCGTGCCGATCCACCTGTAACTTATTTGCGTGATAAGCTGCGCGATCGGCG
CACCAATCGAGTACGGCAGCTTTTATTGTTGGAGTGTTTACAAGTGGTTGGTAGTGTGCAAGCCTATCAAGCAGCGCAAG
AGTTTATTCGCCACCACCGTCGTGCCGATAGCGAGGTGCTCCGTAAAGCGGCAGAGGTAGTGATTCGCCAAACGTCTCAT
CGCAAAATCCATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTTTCCGTTATTGTTTCGGCTTCCAGTTTTCTCTTCATAAGAACTCCTTTCATGTGGGTAAGCAGCTTGTAACAAACG
CATTGTTTAACGGTGCAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAGCAAGCAGAAAAGGCTATCCATATTTCGCGATAGCTTTTTGTTTGCTATGAGAATATTTCCCCCCCCCATATTTTATC
CTATAAAAAAGCTAATGCCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Signal Transduction Protein; GUN4 Domain Protein

Number of amino acids: Translated: 644; Mature: 644

Protein sequence:

>644_residues
MLLPASCMALPTASSLMPHVQQAELSSWIFYAPLVAPVMALAVNVALPFYQRAKRRRSIAKQRAARRERFGLATENSAVR
GRVKHPDNYYRQWLARWCQQQQGALLPGGVAFESMDFTDLFVLPDVLLQGSTPTEQGGAVSFDTALSFAAESSRLLLLIG
EDGGGKSALMQSLVLGNKPRLSGFSDKSQIFFLPLTALAAIPTPFPALPDVLREWSGLQEQLSTSFFHSHLTTHRTLVLL
DGLDALHNPEQREAVCRWIAEAVGEWQKAFFVLTTSPDTFGEREQAALACHTRIAVLKQFNNQQQHLFFRQWFRALRLRE
LCREHGDVAECSLTTIERHELEAEVCADALEYSLQKVEPTLMREVAATPLLLGILARFWEEHHYVPTTREALYDAALTYL
LKDAVQQPDCLHLLPPIAELKHLLGSLALWMQDSGVIAAPVEQVHAWLQPEVERLNARFGDAYRVDALCTHLAAGGSVLG
QQGGAYLFTHNSFRDYLIGEQLLKEVGVEPTRAAKMAVQLGDGWWDEAFLFFAIRAEGLWFTRFLKALMESPQSELLDEA
ARGLLLRMVERADPPVTYLRDKLRDRRTNRVRQLLLLECLQVVGSVQAYQAAQEFIRHHRRADSEVLRKAAEVVIRQTSH
RKIH

Sequences:

>Translated_644_residues
MLLPASCMALPTASSLMPHVQQAELSSWIFYAPLVAPVMALAVNVALPFYQRAKRRRSIAKQRAARRERFGLATENSAVR
GRVKHPDNYYRQWLARWCQQQQGALLPGGVAFESMDFTDLFVLPDVLLQGSTPTEQGGAVSFDTALSFAAESSRLLLLIG
EDGGGKSALMQSLVLGNKPRLSGFSDKSQIFFLPLTALAAIPTPFPALPDVLREWSGLQEQLSTSFFHSHLTTHRTLVLL
DGLDALHNPEQREAVCRWIAEAVGEWQKAFFVLTTSPDTFGEREQAALACHTRIAVLKQFNNQQQHLFFRQWFRALRLRE
LCREHGDVAECSLTTIERHELEAEVCADALEYSLQKVEPTLMREVAATPLLLGILARFWEEHHYVPTTREALYDAALTYL
LKDAVQQPDCLHLLPPIAELKHLLGSLALWMQDSGVIAAPVEQVHAWLQPEVERLNARFGDAYRVDALCTHLAAGGSVLG
QQGGAYLFTHNSFRDYLIGEQLLKEVGVEPTRAAKMAVQLGDGWWDEAFLFFAIRAEGLWFTRFLKALMESPQSELLDEA
ARGLLLRMVERADPPVTYLRDKLRDRRTNRVRQLLLLECLQVVGSVQAYQAAQEFIRHHRRADSEVLRKAAEVVIRQTSH
RKIH
>Mature_644_residues
MLLPASCMALPTASSLMPHVQQAELSSWIFYAPLVAPVMALAVNVALPFYQRAKRRRSIAKQRAARRERFGLATENSAVR
GRVKHPDNYYRQWLARWCQQQQGALLPGGVAFESMDFTDLFVLPDVLLQGSTPTEQGGAVSFDTALSFAAESSRLLLLIG
EDGGGKSALMQSLVLGNKPRLSGFSDKSQIFFLPLTALAAIPTPFPALPDVLREWSGLQEQLSTSFFHSHLTTHRTLVLL
DGLDALHNPEQREAVCRWIAEAVGEWQKAFFVLTTSPDTFGEREQAALACHTRIAVLKQFNNQQQHLFFRQWFRALRLRE
LCREHGDVAECSLTTIERHELEAEVCADALEYSLQKVEPTLMREVAATPLLLGILARFWEEHHYVPTTREALYDAALTYL
LKDAVQQPDCLHLLPPIAELKHLLGSLALWMQDSGVIAAPVEQVHAWLQPEVERLNARFGDAYRVDALCTHLAAGGSVLG
QQGGAYLFTHNSFRDYLIGEQLLKEVGVEPTRAAKMAVQLGDGWWDEAFLFFAIRAEGLWFTRFLKALMESPQSELLDEA
ARGLLLRMVERADPPVTYLRDKLRDRRTNRVRQLLLLECLQVVGSVQAYQAAQEFIRHHRRADSEVLRKAAEVVIRQTSH
RKIH

Specific function: Unknown

COG id: COG5635

COG function: function code T; Predicted NTPase (NACHT family)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 72539; Mature: 72539

Theoretical pI: Translated: 7.08; Mature: 7.08

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLLPASCMALPTASSLMPHVQQAELSSWIFYAPLVAPVMALAVNVALPFYQRAKRRRSIA
CCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KQRAARRERFGLATENSAVRGRVKHPDNYYRQWLARWCQQQQGALLPGGVAFESMDFTDL
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHH
FVLPDVLLQGSTPTEQGGAVSFDTALSFAAESSRLLLLIGEDGGGKSALMQSLVLGNKPR
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCC
LSGFSDKSQIFFLPLTALAAIPTPFPALPDVLREWSGLQEQLSTSFFHSHLTTHRTLVLL
CCCCCCCCCEEEEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
DGLDALHNPEQREAVCRWIAEAVGEWQKAFFVLTTSPDTFGEREQAALACHTRIAVLKQF
ECCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NNQQQHLFFRQWFRALRLRELCREHGDVAECSLTTIERHELEAEVCADALEYSLQKVEPT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
LMREVAATPLLLGILARFWEEHHYVPTTREALYDAALTYLLKDAVQQPDCLHLLPPIAEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHH
KHLLGSLALWMQDSGVIAAPVEQVHAWLQPEVERLNARFGDAYRVDALCTHLAAGGSVLG
HHHHHHHHHHHCCCCCEECCHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHH
QQGGAYLFTHNSFRDYLIGEQLLKEVGVEPTRAAKMAVQLGDGWWDEAFLFFAIRAEGLW
CCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHH
FTRFLKALMESPQSELLDEAARGLLLRMVERADPPVTYLRDKLRDRRTNRVRQLLLLECL
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVVGSVQAYQAAQEFIRHHRRADSEVLRKAAEVVIRQTSHRKIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLLPASCMALPTASSLMPHVQQAELSSWIFYAPLVAPVMALAVNVALPFYQRAKRRRSIA
CCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KQRAARRERFGLATENSAVRGRVKHPDNYYRQWLARWCQQQQGALLPGGVAFESMDFTDL
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHH
FVLPDVLLQGSTPTEQGGAVSFDTALSFAAESSRLLLLIGEDGGGKSALMQSLVLGNKPR
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCC
LSGFSDKSQIFFLPLTALAAIPTPFPALPDVLREWSGLQEQLSTSFFHSHLTTHRTLVLL
CCCCCCCCCEEEEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
DGLDALHNPEQREAVCRWIAEAVGEWQKAFFVLTTSPDTFGEREQAALACHTRIAVLKQF
ECCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NNQQQHLFFRQWFRALRLRELCREHGDVAECSLTTIERHELEAEVCADALEYSLQKVEPT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
LMREVAATPLLLGILARFWEEHHYVPTTREALYDAALTYLLKDAVQQPDCLHLLPPIAEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHH
KHLLGSLALWMQDSGVIAAPVEQVHAWLQPEVERLNARFGDAYRVDALCTHLAAGGSVLG
HHHHHHHHHHHCCCCCEECCHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHH
QQGGAYLFTHNSFRDYLIGEQLLKEVGVEPTRAAKMAVQLGDGWWDEAFLFFAIRAEGLW
CCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHH
FTRFLKALMESPQSELLDEAARGLLLRMVERADPPVTYLRDKLRDRRTNRVRQLLLLECL
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVVGSVQAYQAAQEFIRHHRRADSEVLRKAAEVVIRQTSHRKIH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA