| Definition | Burkholderia sp. 383 chromosome 1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007510 |
| Length | 3,694,126 |
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The map label for this gene is 78064665
Identifier: 78064665
GI number: 78064665
Start: 8410
End: 12585
Strand: Direct
Name: 78064665
Synonym: Bcep18194_A3188
Alternate gene names: NA
Gene position: 8410-12585 (Clockwise)
Preceding gene: 78064664
Following gene: 78064666
Centisome position: 0.23
GC content: 56.13
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTACTGGTGCTGACAGGACGAATGGCTGGTCAGCTTTGCCGCTGCGGGCAGTACACCCTGACTCGTGGAGATCAACCAAT TGTAGAGCTGGAGGGCTGAC
Downstream 100 bases:
>100_bases TCAATGCCCATTGTTAGCGAAAAACCTTTGATCGAAATCCTGTCGCCTGGAGAGCAACACGACAGGTTTGACATCAACTA TTACCTTCCAGAATTCATTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1391; Mature: 1390
Protein sequence:
>1391_residues MALMKDMFDFTPVSSWVENFNESTHDSISRTRTFESFVMLPEVEESARIILDRIHRSQGRGFFITGLYGSGKTIFMAWLS AILTEPTLRKQLLDTKPEWGMDALAPRKFLTINFTAIEVPDETLEQAFWNSVTDHLRHLAPPVTATLSNTDAYLETFYNQ TASGTRSDAEKWIRDNRNLSVNQLRSYDKEYQKTIIEQAVAAMNIQLVQDRTTVTEKVKRLVEIAKERGYEGVLVFIDEL YLHLIQSDEHFNRGTAFLGQLAEAGLAGDQPFWVFGAVQEEIQAIARQAGRNYDTELMGKLSGQSGRFQSINIPVTQFHR IYNHRLFRENSKCVHKLADAFKAEIQPHFRGAFTDFLKRYFREREPITDEAKHFADVYPMHPFGLYCLTAITNRGGRSRG ALGFVQEFIEKRLQDASDWKRIAVLDDVFDYEDLRNKIIQDDPEMAKYYGMFERFCGTARDEVLSRAPYKRWSDADQAAA KVASERLIKSLIVLSMVKEELSVSKLNDALLLRWPGKESDPAGSDQETVRILEKIAQTFPPLRQKGSGDTLSFFLSVEGD GGEREELLVEVERVKNGFAPDIQLESAYRSHLELFLRFPGSPLGGTVPPQNGFSTQLDVEWQRTRRSLDYRLEPVTALTN DHAVIGFVKDVPATKALHLAVLYPSASPLDVEMDAVGHGNGRTLMWLPATLPAQDIDELERSMALVKLYGDYQSQVNAGG ASQSVRRKLELLGEWIDLPAGTKSAQPARKATEILLESFVSGEIRQWNTKDQVWEILCEPAELLSLYQSIPQSERSLERL LEKVAAKALNKVFQFHPDFRETYSFAADLSSAMRRRVLEAIWKGRVTDGDGTAKADLEKYLAPLGLLNTGVPGEVSVTLA VSSVEAFKKSKERIRDNIRKASPPATSIAETRKRLKTTDLGLTDTWVDVLITLLISTGEISGVTIHGKTVSQDDRTIGSP IDWLQELDELRPGTRPDETLWHDLTESLHALSLWKEGNGYSPAAAERLLDLLRDTGTRAQHEFLQAKQSLQTWPGASVPG AVSEWADIFALHEDGGESRVACYSSVRDAMRDMLGLAEDDDIEAANRYTCVEDFAHRVREARDFLDRISELARLTGKLRE LKALGVPPTIDKPCRELLDSIEAYVNSSGATGEMSRITAEWKDLHELYLNQYLSEHAGLHNDLKGLRDVVLSSPSYRVLK DLSLVEGLSAHFSPAVIEAQLTDLLTQVSVQQVCEQSLDDVKTDLSHGWACSTCGYRLGTRLELEPVHFLGLVELGIKEY LDHVRGCEADLQDYVSDTPAATPLLGLLGDTVEQCALDALQDATMRQHLAEALAEAEAVKVSVNELLDQLKPLLLGFFKG GRSEFEQYVQGALGELLKKNGLKEEHPWKVE
Sequences:
>Translated_1391_residues MALMKDMFDFTPVSSWVENFNESTHDSISRTRTFESFVMLPEVEESARIILDRIHRSQGRGFFITGLYGSGKTIFMAWLS AILTEPTLRKQLLDTKPEWGMDALAPRKFLTINFTAIEVPDETLEQAFWNSVTDHLRHLAPPVTATLSNTDAYLETFYNQ TASGTRSDAEKWIRDNRNLSVNQLRSYDKEYQKTIIEQAVAAMNIQLVQDRTTVTEKVKRLVEIAKERGYEGVLVFIDEL YLHLIQSDEHFNRGTAFLGQLAEAGLAGDQPFWVFGAVQEEIQAIARQAGRNYDTELMGKLSGQSGRFQSINIPVTQFHR IYNHRLFRENSKCVHKLADAFKAEIQPHFRGAFTDFLKRYFREREPITDEAKHFADVYPMHPFGLYCLTAITNRGGRSRG ALGFVQEFIEKRLQDASDWKRIAVLDDVFDYEDLRNKIIQDDPEMAKYYGMFERFCGTARDEVLSRAPYKRWSDADQAAA KVASERLIKSLIVLSMVKEELSVSKLNDALLLRWPGKESDPAGSDQETVRILEKIAQTFPPLRQKGSGDTLSFFLSVEGD GGEREELLVEVERVKNGFAPDIQLESAYRSHLELFLRFPGSPLGGTVPPQNGFSTQLDVEWQRTRRSLDYRLEPVTALTN DHAVIGFVKDVPATKALHLAVLYPSASPLDVEMDAVGHGNGRTLMWLPATLPAQDIDELERSMALVKLYGDYQSQVNAGG ASQSVRRKLELLGEWIDLPAGTKSAQPARKATEILLESFVSGEIRQWNTKDQVWEILCEPAELLSLYQSIPQSERSLERL LEKVAAKALNKVFQFHPDFRETYSFAADLSSAMRRRVLEAIWKGRVTDGDGTAKADLEKYLAPLGLLNTGVPGEVSVTLA VSSVEAFKKSKERIRDNIRKASPPATSIAETRKRLKTTDLGLTDTWVDVLITLLISTGEISGVTIHGKTVSQDDRTIGSP IDWLQELDELRPGTRPDETLWHDLTESLHALSLWKEGNGYSPAAAERLLDLLRDTGTRAQHEFLQAKQSLQTWPGASVPG AVSEWADIFALHEDGGESRVACYSSVRDAMRDMLGLAEDDDIEAANRYTCVEDFAHRVREARDFLDRISELARLTGKLRE LKALGVPPTIDKPCRELLDSIEAYVNSSGATGEMSRITAEWKDLHELYLNQYLSEHAGLHNDLKGLRDVVLSSPSYRVLK DLSLVEGLSAHFSPAVIEAQLTDLLTQVSVQQVCEQSLDDVKTDLSHGWACSTCGYRLGTRLELEPVHFLGLVELGIKEY LDHVRGCEADLQDYVSDTPAATPLLGLLGDTVEQCALDALQDATMRQHLAEALAEAEAVKVSVNELLDQLKPLLLGFFKG GRSEFEQYVQGALGELLKKNGLKEEHPWKVE >Mature_1390_residues ALMKDMFDFTPVSSWVENFNESTHDSISRTRTFESFVMLPEVEESARIILDRIHRSQGRGFFITGLYGSGKTIFMAWLSA ILTEPTLRKQLLDTKPEWGMDALAPRKFLTINFTAIEVPDETLEQAFWNSVTDHLRHLAPPVTATLSNTDAYLETFYNQT ASGTRSDAEKWIRDNRNLSVNQLRSYDKEYQKTIIEQAVAAMNIQLVQDRTTVTEKVKRLVEIAKERGYEGVLVFIDELY LHLIQSDEHFNRGTAFLGQLAEAGLAGDQPFWVFGAVQEEIQAIARQAGRNYDTELMGKLSGQSGRFQSINIPVTQFHRI YNHRLFRENSKCVHKLADAFKAEIQPHFRGAFTDFLKRYFREREPITDEAKHFADVYPMHPFGLYCLTAITNRGGRSRGA LGFVQEFIEKRLQDASDWKRIAVLDDVFDYEDLRNKIIQDDPEMAKYYGMFERFCGTARDEVLSRAPYKRWSDADQAAAK VASERLIKSLIVLSMVKEELSVSKLNDALLLRWPGKESDPAGSDQETVRILEKIAQTFPPLRQKGSGDTLSFFLSVEGDG GEREELLVEVERVKNGFAPDIQLESAYRSHLELFLRFPGSPLGGTVPPQNGFSTQLDVEWQRTRRSLDYRLEPVTALTND HAVIGFVKDVPATKALHLAVLYPSASPLDVEMDAVGHGNGRTLMWLPATLPAQDIDELERSMALVKLYGDYQSQVNAGGA SQSVRRKLELLGEWIDLPAGTKSAQPARKATEILLESFVSGEIRQWNTKDQVWEILCEPAELLSLYQSIPQSERSLERLL EKVAAKALNKVFQFHPDFRETYSFAADLSSAMRRRVLEAIWKGRVTDGDGTAKADLEKYLAPLGLLNTGVPGEVSVTLAV SSVEAFKKSKERIRDNIRKASPPATSIAETRKRLKTTDLGLTDTWVDVLITLLISTGEISGVTIHGKTVSQDDRTIGSPI DWLQELDELRPGTRPDETLWHDLTESLHALSLWKEGNGYSPAAAERLLDLLRDTGTRAQHEFLQAKQSLQTWPGASVPGA VSEWADIFALHEDGGESRVACYSSVRDAMRDMLGLAEDDDIEAANRYTCVEDFAHRVREARDFLDRISELARLTGKLREL KALGVPPTIDKPCRELLDSIEAYVNSSGATGEMSRITAEWKDLHELYLNQYLSEHAGLHNDLKGLRDVVLSSPSYRVLKD LSLVEGLSAHFSPAVIEAQLTDLLTQVSVQQVCEQSLDDVKTDLSHGWACSTCGYRLGTRLELEPVHFLGLVELGIKEYL DHVRGCEADLQDYVSDTPAATPLLGLLGDTVEQCALDALQDATMRQHLAEALAEAEAVKVSVNELLDQLKPLLLGFFKGG RSEFEQYVQGALGELLKKNGLKEEHPWKVE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 156155; Mature: 156024
Theoretical pI: Translated: 5.02; Mature: 5.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MALMKDMFDFTPVSSWVENFNESTHDSISRTRTFESFVMLPEVEESARIILDRIHRSQGR CCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC GFFITGLYGSGKTIFMAWLSAILTEPTLRKQLLDTKPEWGMDALAPRKFLTINFTAIEVP EEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCEEEEEEEEEEECC DETLEQAFWNSVTDHLRHLAPPVTATLSNTDAYLETFYNQTASGTRSDAEKWIRDNRNLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC VNQLRSYDKEYQKTIIEQAVAAMNIQLVQDRTTVTEKVKRLVEIAKERGYEGVLVFIDEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHH YLHLIQSDEHFNRGTAFLGQLAEAGLAGDQPFWVFGAVQEEIQAIARQAGRNYDTELMGK HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH LSGQSGRFQSINIPVTQFHRIYNHRLFRENSKCVHKLADAFKAEIQPHFRGAFTDFLKRY HCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH FREREPITDEAKHFADVYPMHPFGLYCLTAITNRGGRSRGALGFVQEFIEKRLQDASDWK HHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH RIAVLDDVFDYEDLRNKIIQDDPEMAKYYGMFERFCGTARDEVLSRAPYKRWSDADQAAA HHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHH KVASERLIKSLIVLSMVKEELSVSKLNDALLLRWPGKESDPAGSDQETVRILEKIAQTFP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC PLRQKGSGDTLSFFLSVEGDGGEREELLVEVERVKNGFAPDIQLESAYRSHLELFLRFPG HHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC SPLGGTVPPQNGFSTQLDVEWQRTRRSLDYRLEPVTALTNDHAVIGFVKDVPATKALHLA CCCCCCCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHCCEECCHHHCCCCCEEEEEHHCCCCCHHEEEE VLYPSASPLDVEMDAVGHGNGRTLMWLPATLPAQDIDELERSMALVKLYGDYQSQVNAGG EECCCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC ASQSVRRKLELLGEWIDLPAGTKSAQPARKATEILLESFVSGEIRQWNTKDQVWEILCEP CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHCCH AELLSLYQSIPQSERSLERLLEKVAAKALNKVFQFHPDFRETYSFAADLSSAMRRRVLEA HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IWKGRVTDGDGTAKADLEKYLAPLGLLNTGVPGEVSVTLAVSSVEAFKKSKERIRDNIRK HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASPPATSIAETRKRLKTTDLGLTDTWVDVLITLLISTGEISGVTIHGKTVSQDDRTIGSP CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCH IDWLQELDELRPGTRPDETLWHDLTESLHALSLWKEGNGYSPAAAERLLDLLRDTGTRAQ HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHH HEFLQAKQSLQTWPGASVPGAVSEWADIFALHEDGGESRVACYSSVRDAMRDMLGLAEDD HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC DIEAANRYTCVEDFAHRVREARDFLDRISELARLTGKLRELKALGVPPTIDKPCRELLDS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH IEAYVNSSGATGEMSRITAEWKDLHELYLNQYLSEHAGLHNDLKGLRDVVLSSPSYRVLK HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH DLSLVEGLSAHFSPAVIEAQLTDLLTQVSVQQVCEQSLDDVKTDLSHGWACSTCGYRLGT HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHCCC RLELEPVHFLGLVELGIKEYLDHVRGCEADLQDYVSDTPAATPLLGLLGDTVEQCALDAL EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QDATMRQHLAEALAEAEAVKVSVNELLDQLKPLLLGFFKGGRSEFEQYVQGALGELLKKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GLKEEHPWKVE CCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure 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KVASERLIKSLIVLSMVKEELSVSKLNDALLLRWPGKESDPAGSDQETVRILEKIAQTFP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC PLRQKGSGDTLSFFLSVEGDGGEREELLVEVERVKNGFAPDIQLESAYRSHLELFLRFPG HHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC SPLGGTVPPQNGFSTQLDVEWQRTRRSLDYRLEPVTALTNDHAVIGFVKDVPATKALHLA CCCCCCCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHCCEECCHHHCCCCCEEEEEHHCCCCCHHEEEE VLYPSASPLDVEMDAVGHGNGRTLMWLPATLPAQDIDELERSMALVKLYGDYQSQVNAGG EECCCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC ASQSVRRKLELLGEWIDLPAGTKSAQPARKATEILLESFVSGEIRQWNTKDQVWEILCEP CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHCCH AELLSLYQSIPQSERSLERLLEKVAAKALNKVFQFHPDFRETYSFAADLSSAMRRRVLEA HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IWKGRVTDGDGTAKADLEKYLAPLGLLNTGVPGEVSVTLAVSSVEAFKKSKERIRDNIRK HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASPPATSIAETRKRLKTTDLGLTDTWVDVLITLLISTGEISGVTIHGKTVSQDDRTIGSP CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCH IDWLQELDELRPGTRPDETLWHDLTESLHALSLWKEGNGYSPAAAERLLDLLRDTGTRAQ HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHH HEFLQAKQSLQTWPGASVPGAVSEWADIFALHEDGGESRVACYSSVRDAMRDMLGLAEDD HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC DIEAANRYTCVEDFAHRVREARDFLDRISELARLTGKLRELKALGVPPTIDKPCRELLDS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH IEAYVNSSGATGEMSRITAEWKDLHELYLNQYLSEHAGLHNDLKGLRDVVLSSPSYRVLK HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH DLSLVEGLSAHFSPAVIEAQLTDLLTQVSVQQVCEQSLDDVKTDLSHGWACSTCGYRLGT HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHCCC RLELEPVHFLGLVELGIKEYLDHVRGCEADLQDYVSDTPAATPLLGLLGDTVEQCALDAL EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QDATMRQHLAEALAEAEAVKVSVNELLDQLKPLLLGFFKGGRSEFEQYVQGALGELLKKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GLKEEHPWKVE CCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
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Cofactors: NA
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General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
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References: NA