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The map label for this gene is 78043165

Identifier: 78043165

GI number: 78043165

Start: 187584

End: 189989

Strand: Direct

Name: 78043165

Synonym: CHY_0219

Alternate gene names: NA

Gene position: 187584-189989 (Clockwise)

Preceding gene: 78043239

Following gene: 78045052

Centisome position: 7.81

GC content: 37.82

Gene sequence:

>2406_bases
ATGGCTGTGGACGGTGAGAGAACATTTAAATTTAAAATTCCTTATCTAGATGAAGCAAAGCTTATACACTCCAAAGAAAG
CATTGGAACACTTAAATTTAAAATTCCTTATCTAGATGAAGTAAAGCCTTATAAAACAATGTGGTTTATCTTACTTTTAG
GATTCAGCCTTTTATTTTTATTACCGCCTTTTTACCGGGGCCTATTTTTTGAATATGAGCAGGAAGTAGCAACTCTCTGG
GCAATTATTTTAGTTTGGCTAGTTTATACTTTAGAGCTTGGGGAGAAAAAGCCAAAGTTTTTACAATTAACTTTAGATTA
TGCCGTGTTGGCACTACCAATAATTTATTTAATTTCAATAATTAATGCGGCCAATATAGGCTTTGCTGTCGATGAATTTG
TCCAAAACATTTTATACTTTTTGGTATTCTGGCTGGCTACCCGCTTTGGAGCTGACCAGAATGCGCGAAGGGTTTTACTT
CATGCGGTTTATCTGGCAGCAATTGGTGTATCCCTTGCAGGCCTTATGACGGCAACGGGAGTAATTAATATTCGGGATGG
GTATTTAAGTGGTCGAATTTACTCTTCTTTTCAATATCCCAATGCTTTGGCAAGTTATTTAGCAGCGGCTTTTTTAATTG
GTATTTACCTGTGGGTAAGTTCCAATAAAGCTTTACGTTATTTTTACGGGATTGGAAACTATATTATTTTAACGGTACTT
CTCGGGACCAAATCCAACGGTGGCTTAATGGTATTTTTAGCCATAATGGTTTTATACTTTATTTTTCAGCCGCCAGGGAA
AAGATTTGCCATTTTCTTTCATTTATTTTTAAATTTAGCATTAGCTTTTGTGGTGATAAAAAGCTTTATATATCATGTGG
ATGTTACGGGTCAGACCGGGAACTCGTGGCTCTGGTTTTTAGTTGGCTTAATTATAGCAATAATGATCGAGGTTATTATC
CAGTTCATAGTTTTAAATAAAGCAGTTATTACAATCTTTACAAAATACAAGAAACCATTAATTTATATGTTTCTTGGATT
TATGGTGGTGGCTTTAATAGGCGGTTTGATTTTGGTTTTATCTAATGAAGTATTAAGGGAAAAAATTTACGAATTGCTGC
GAATTCGTAACGCTAGCGAACGGGGTTATTTTTACCGGGATGCCCTGAAAATGTTTTTTAAAAGCCCTCTTATTGGCTGG
GGTGGTGGAGGCTGGGGGGAAGCTTACCGGGCATTTCAAAGTTATTTTTATATTTCCACCCAGGTGCACAGTTACTACCT
GCAGCTCTTTGTTGAAACGGGAGTGTTAGGGGTAGCAACTATTGTTACCATAATCGGAAGTTTTTTCAAATATTTTATTA
ATCTTTGGAGAAAAACCAGCGATTACTGGCTTTCCTTTGAGGTCGTTACCCTGGGAGCGGTAATTATAAATATTGCTGGT
CATGCGGCGATTGATTTTGATTTGTCGTTAGCCGCCCTTTCCTTGGTTTTGTTTTTAGCCCTGGGCTTTATAAGAACTCT
ATACTTCACAGCTATTTCTAAACCACTACCGGAGAAAAACAAAAGGAAAGTACAGTTTAACAGCATCCCCTATTTTACCT
TAATCTCAGTTATTGCGATTGGGCTTTTAATTTTTGTGGGAATGCTTGCTACTGCAAGTCATTATGAATATTCTGCATAC
AGCTACTATCAAGCTCAAGATTTACAAGGTCTAAAAAATGTAATGGAAAATGCTGCTCGCTATAATCCCTTTAATGCTTC
TTATAACGAAAAATTAAGGGATATTTACAAGTCTTTTGGTGATTTAAATAATGCCCTCCTCCAGGCGGAAAAAGCGGTGG
CAAAAAGCAAATATGATCCCTACAAAAAAATTGAACTTTCTTACCTCTATTACCAGACCGGGCAGATAGATAAAGCGGCG
GATTTAACCGATAAATTTATAAGCGATGCGCCGTTCATGGCGGTAGTTTATGATGCTGCAGCGCGGGTAAACATGATGTG
CGGTTTAGCAGCGGTGAGAAATGGTGACCTAACAAAGGCGCGGGAGTATTTTAATAAAGTAGTTAAAGTGCGGGATTTGG
AAGAAAAACAAATTACCAAATACACTCCCGAAACCCGAAAACTTCAGGTGGTAGCTCCGGTACTTTCAGTTACCCCGGAG
GTAAAGTTAAATGTGGGGATTGCTTATTATTTCTTAAAAGATTTTGCTAAGGCCCGGGAAAATCTTTTGGTTTCTAAAGA
GAAAACCGATTTAGCGGCGGAAAGTCTTTTGTGGCTTACGGTTTTGGAAAGCAAAGCAGGTAATACCGAACTTGCGGGCA
AATACAAAAAAGAATTAGAGAAAGCTCCGGGAGGGGGTCAACTTGTAAATAAAATTGGTGAGTTTTTGAGTTTGCCACTG
CTATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATACAAAAATCCTTCTAATTAAAAGTATTATTTTTTAAAGGTGCTATCTTTTGGCAGCAGGATTTTTCCTATGTTAAACG
AATAGAAAATAAGGGAGGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTAAGCTGTGAAGGGAAAACAAAAGAAGAATATAGTTTTTATCATAGAAATTAACGGCTCGGTGGAGCCGTTTTTTTAT
GGCAGTGGTGGGATAAATTT

Product: putative O-antigen polymerase

Products: NA

Alternate protein names: TPR Repeat-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 801; Mature: 800

Protein sequence:

>801_residues
MAVDGERTFKFKIPYLDEAKLIHSKESIGTLKFKIPYLDEVKPYKTMWFILLLGFSLLFLLPPFYRGLFFEYEQEVATLW
AIILVWLVYTLELGEKKPKFLQLTLDYAVLALPIIYLISIINAANIGFAVDEFVQNILYFLVFWLATRFGADQNARRVLL
HAVYLAAIGVSLAGLMTATGVINIRDGYLSGRIYSSFQYPNALASYLAAAFLIGIYLWVSSNKALRYFYGIGNYIILTVL
LGTKSNGGLMVFLAIMVLYFIFQPPGKRFAIFFHLFLNLALAFVVIKSFIYHVDVTGQTGNSWLWFLVGLIIAIMIEVII
QFIVLNKAVITIFTKYKKPLIYMFLGFMVVALIGGLILVLSNEVLREKIYELLRIRNASERGYFYRDALKMFFKSPLIGW
GGGGWGEAYRAFQSYFYISTQVHSYYLQLFVETGVLGVATIVTIIGSFFKYFINLWRKTSDYWLSFEVVTLGAVIINIAG
HAAIDFDLSLAALSLVLFLALGFIRTLYFTAISKPLPEKNKRKVQFNSIPYFTLISVIAIGLLIFVGMLATASHYEYSAY
SYYQAQDLQGLKNVMENAARYNPFNASYNEKLRDIYKSFGDLNNALLQAEKAVAKSKYDPYKKIELSYLYYQTGQIDKAA
DLTDKFISDAPFMAVVYDAAARVNMMCGLAAVRNGDLTKAREYFNKVVKVRDLEEKQITKYTPETRKLQVVAPVLSVTPE
VKLNVGIAYYFLKDFAKARENLLVSKEKTDLAAESLLWLTVLESKAGNTELAGKYKKELEKAPGGGQLVNKIGEFLSLPL
L

Sequences:

>Translated_801_residues
MAVDGERTFKFKIPYLDEAKLIHSKESIGTLKFKIPYLDEVKPYKTMWFILLLGFSLLFLLPPFYRGLFFEYEQEVATLW
AIILVWLVYTLELGEKKPKFLQLTLDYAVLALPIIYLISIINAANIGFAVDEFVQNILYFLVFWLATRFGADQNARRVLL
HAVYLAAIGVSLAGLMTATGVINIRDGYLSGRIYSSFQYPNALASYLAAAFLIGIYLWVSSNKALRYFYGIGNYIILTVL
LGTKSNGGLMVFLAIMVLYFIFQPPGKRFAIFFHLFLNLALAFVVIKSFIYHVDVTGQTGNSWLWFLVGLIIAIMIEVII
QFIVLNKAVITIFTKYKKPLIYMFLGFMVVALIGGLILVLSNEVLREKIYELLRIRNASERGYFYRDALKMFFKSPLIGW
GGGGWGEAYRAFQSYFYISTQVHSYYLQLFVETGVLGVATIVTIIGSFFKYFINLWRKTSDYWLSFEVVTLGAVIINIAG
HAAIDFDLSLAALSLVLFLALGFIRTLYFTAISKPLPEKNKRKVQFNSIPYFTLISVIAIGLLIFVGMLATASHYEYSAY
SYYQAQDLQGLKNVMENAARYNPFNASYNEKLRDIYKSFGDLNNALLQAEKAVAKSKYDPYKKIELSYLYYQTGQIDKAA
DLTDKFISDAPFMAVVYDAAARVNMMCGLAAVRNGDLTKAREYFNKVVKVRDLEEKQITKYTPETRKLQVVAPVLSVTPE
VKLNVGIAYYFLKDFAKARENLLVSKEKTDLAAESLLWLTVLESKAGNTELAGKYKKELEKAPGGGQLVNKIGEFLSLPL
L
>Mature_800_residues
AVDGERTFKFKIPYLDEAKLIHSKESIGTLKFKIPYLDEVKPYKTMWFILLLGFSLLFLLPPFYRGLFFEYEQEVATLWA
IILVWLVYTLELGEKKPKFLQLTLDYAVLALPIIYLISIINAANIGFAVDEFVQNILYFLVFWLATRFGADQNARRVLLH
AVYLAAIGVSLAGLMTATGVINIRDGYLSGRIYSSFQYPNALASYLAAAFLIGIYLWVSSNKALRYFYGIGNYIILTVLL
GTKSNGGLMVFLAIMVLYFIFQPPGKRFAIFFHLFLNLALAFVVIKSFIYHVDVTGQTGNSWLWFLVGLIIAIMIEVIIQ
FIVLNKAVITIFTKYKKPLIYMFLGFMVVALIGGLILVLSNEVLREKIYELLRIRNASERGYFYRDALKMFFKSPLIGWG
GGGWGEAYRAFQSYFYISTQVHSYYLQLFVETGVLGVATIVTIIGSFFKYFINLWRKTSDYWLSFEVVTLGAVIINIAGH
AAIDFDLSLAALSLVLFLALGFIRTLYFTAISKPLPEKNKRKVQFNSIPYFTLISVIAIGLLIFVGMLATASHYEYSAYS
YYQAQDLQGLKNVMENAARYNPFNASYNEKLRDIYKSFGDLNNALLQAEKAVAKSKYDPYKKIELSYLYYQTGQIDKAAD
LTDKFISDAPFMAVVYDAAARVNMMCGLAAVRNGDLTKAREYFNKVVKVRDLEEKQITKYTPETRKLQVVAPVLSVTPEV
KLNVGIAYYFLKDFAKARENLLVSKEKTDLAAESLLWLTVLESKAGNTELAGKYKKELEKAPGGGQLVNKIGEFLSLPLL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90745; Mature: 90614

Theoretical pI: Translated: 9.64; Mature: 9.64

Prosite motif: PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAVDGERTFKFKIPYLDEAKLIHSKESIGTLKFKIPYLDEVKPYKTMWFILLLGFSLLFL
CCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPPFYRGLFFEYEQEVATLWAIILVWLVYTLELGEKKPKFLQLTLDYAVLALPIIYLISI
HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
INAANIGFAVDEFVQNILYFLVFWLATRFGADQNARRVLLHAVYLAAIGVSLAGLMTATG
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VINIRDGYLSGRIYSSFQYPNALASYLAAAFLIGIYLWVSSNKALRYFYGIGNYIILTVL
EEEEECCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHCCHHHEEHEE
LGTKSNGGLMVFLAIMVLYFIFQPPGKRFAIFFHLFLNLALAFVVIKSFIYHVDVTGQTG
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCC
NSWLWFLVGLIIAIMIEVIIQFIVLNKAVITIFTKYKKPLIYMFLGFMVVALIGGLILVL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNEVLREKIYELLRIRNASERGYFYRDALKMFFKSPLIGWGGGGWGEAYRAFQSYFYIST
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
QVHSYYLQLFVETGVLGVATIVTIIGSFFKYFINLWRKTSDYWLSFEVVTLGAVIINIAG
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCC
HAAIDFDLSLAALSLVLFLALGFIRTLYFTAISKPLPEKNKRKVQFNSIPYFTLISVIAI
CCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHH
GLLIFVGMLATASHYEYSAYSYYQAQDLQGLKNVMENAARYNPFNASYNEKLRDIYKSFG
HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
DLNNALLQAEKAVAKSKYDPYKKIELSYLYYQTGQIDKAADLTDKFISDAPFMAVVYDAA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
ARVNMMCGLAAVRNGDLTKAREYFNKVVKVRDLEEKQITKYTPETRKLQVVAPVLSVTPE
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHCCCC
VKLNVGIAYYFLKDFAKARENLLVSKEKTDLAAESLLWLTVLESKAGNTELAGKYKKELE
EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
KAPGGGQLVNKIGEFLSLPLL
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AVDGERTFKFKIPYLDEAKLIHSKESIGTLKFKIPYLDEVKPYKTMWFILLLGFSLLFL
CCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPPFYRGLFFEYEQEVATLWAIILVWLVYTLELGEKKPKFLQLTLDYAVLALPIIYLISI
HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
INAANIGFAVDEFVQNILYFLVFWLATRFGADQNARRVLLHAVYLAAIGVSLAGLMTATG
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VINIRDGYLSGRIYSSFQYPNALASYLAAAFLIGIYLWVSSNKALRYFYGIGNYIILTVL
EEEEECCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHCCHHHEEHEE
LGTKSNGGLMVFLAIMVLYFIFQPPGKRFAIFFHLFLNLALAFVVIKSFIYHVDVTGQTG
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCC
NSWLWFLVGLIIAIMIEVIIQFIVLNKAVITIFTKYKKPLIYMFLGFMVVALIGGLILVL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNEVLREKIYELLRIRNASERGYFYRDALKMFFKSPLIGWGGGGWGEAYRAFQSYFYIST
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QVHSYYLQLFVETGVLGVATIVTIIGSFFKYFINLWRKTSDYWLSFEVVTLGAVIINIAG
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HAAIDFDLSLAALSLVLFLALGFIRTLYFTAISKPLPEKNKRKVQFNSIPYFTLISVIAI
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GLLIFVGMLATASHYEYSAYSYYQAQDLQGLKNVMENAARYNPFNASYNEKLRDIYKSFG
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DLNNALLQAEKAVAKSKYDPYKKIELSYLYYQTGQIDKAADLTDKFISDAPFMAVVYDAA
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ARVNMMCGLAAVRNGDLTKAREYFNKVVKVRDLEEKQITKYTPETRKLQVVAPVLSVTPE
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHCCCC
VKLNVGIAYYFLKDFAKARENLLVSKEKTDLAAESLLWLTVLESKAGNTELAGKYKKELE
EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
KAPGGGQLVNKIGEFLSLPLL
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA