Definition Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome, complete genome.
Accession NC_007413
Length 6,365,727

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The map label for this gene is mcrD [C]

Identifier: 75909460

GI number: 75909460

Start: 4047419

End: 4053700

Strand: Direct

Name: mcrD [C]

Synonym: Ava_3253

Alternate gene names: 75909460

Gene position: 4047419-4053700 (Clockwise)

Preceding gene: 75909459

Following gene: 75909463

Centisome position: 63.58

GC content: 39.57

Gene sequence:

>6282_bases
ATGAAAAACAACAGCAACTACCTTGACCCGATCGCCGCAGTTGAGCAACCCCGCCAAGATTTTATTCGTTATCTGCTAAC
TGCTTACCCACTACGAGATCCTCATCTACGCTACGGTTTAAAACAGCAGCTAGAAGTACCTGGAACAGTTTGGCAGCATC
CTTATTTAGAAGGTTCTCAACCTTATCGGCCTGCTAACAGTGTGAATGCGCTGGTAAGTCAGGGTGTTTTGCATCCAGAA
ATGGCAAGTTTATTCACTCCCAATCAGCGTCCTCTCTACGAACACCAAGAAAACGCTGTCAAGGCAGTTATTCAGCAAAA
ACAAAACATCGTTGTTGCTACTGGTACAGGTTCAGGTAAAACAGAGTGTTTCCTAATTCCCATGTTGGATATGCTGCTGA
AAGAAGAAGCAAATTTAGCAATAGCTGGGGTTAGAGCGTTAATTTTGTACCCCATGAACGCTTTAGTAAATGACCAAGTT
AAGCGTTTAAGAAAATTACTATGTAGTCAAGAAACTATAAAAATTAGATTCGGATTTTATACTAGCCGCACTGAAAATGA
TAGGCACAAAGCAGAAGAAGCATTGGCGGAAGAATTACAAGCTTATGAGTCTGAAGAACTTTGGGAGTTATTTACACAAA
AAGAAAAATCATCTCTCAATCTCAGCACTCGTGAAAGATTAATTGATGAAGCTATTGCCAAAATTCAAAAAATCCAAGCA
ATTTCTAGGCAAGAAATTTGGGAGAAGCCGCCTCATATATTAGTCACCAACTATTCTATGTTGGAGCATATGTTAATTCG
TCCCGTGGAACGCAACAAAGTTTTTGCTACTTCAGCATCAACTTTTAAAATGTTAGTCGTGGATGAGGCACACACATACA
ACGGCTCGACTGGTAGTGAAGTGTCGATGTTGATAGAACGGCTAAAAGTTGCTGTCGAACAAGAAAAACCTGGAAAGATT
CGCTGTATTGCTACCAGTGCCAGTTTAGGCGATGCTTCAGTTAATAATGAAATATTAGAGTTTGCTACAAAATTTTTTGG
GGAATCTTTTAATCAAGTAATTCGCGGCGATCGCGTCAAGGCTATCGAAAGATTAGGTGAACCTTATCTATTATCTGCTG
AACTTACTCACGAAGAAATATTAGCATATTTAAGCATATTAGAATTGCCTAAAATTGATGATGATTTAAGTATTTGGTTC
GACAGACTGAGTGGCTTTGTACCTACTGAACATCTAAAAGCAGCAGAGACGAAAGCGCAAGGTGATGTTCACCAGTTTCT
CTGGTATGCACTTAAACAACATCCTATAGTCCACCGCCTCATTGAATTTCTAAGCCGTCAACCCCAGCCTTGGGAGAAAA
TTACACAATCAACAGAATTCTGGTGTGTAAATTTACCGTTCAAATCTGACGGCACTATTGATGATACTGAGACAAAATTT
GCCCTCGCTCATTTATTACAATTAGGCACTCTTGCTCGTGAGAATTCAGAAAGCTTACCATTACTGCCAGTTAGAATCCA
CCTTTTATTTCGTAGTTTAGAAGGGATGTATGCTTGCATTAATCCTCAATGTCCTGGTGGAGTTTGTGATCCAAATTATG
AAGACAAACCTCGGCGATATGGTCGATTATATTTGAACGAAAAAAGAACCTGTGATGATTGCAATTCTCCAGTTTTAGAA
CTGGGTAGTTGTTATCAGTGCGGTCAAGCTTATGCCTTTACTCAAATAAATGGTGTATCTAAATTAGAACCATTACCGCG
CTCAAATCAAGGTTTAAGAGAAAATGACAAAATATACACCCTGACTTCAGGATTATTAGACAGCATTACGGAGGAAGAAG
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ACATCAGTAACATTTACGAATAAATCTTCTGAACCAAATGAATTTTATTTAGCATGGCATCGCCCAAGAGATAAAGATGC
AAAAGATTTAAGTGGCTGCTACCTTCCTAGATGTGCTGCCTGTGGAACACGGCCAATTCGCGCTCAAGCGATAAACCGCT
TTGTAGCTTATACAGATGAACCTTTAGAGGCGATGATTGATAGCCTGTTTGATTTATTACCTGAATCTCAAGAAGATCAA
GGTAGTGCGTCAAAACGCAAGCTATTAACATTTTCTGATGGTCGTCAGGATGCGGCATTCTTTGCTTCAGACTACCAGCG
CACTCATACAGAAACAGTTTATCGGCAAATAATTTGGCAAGCATTTCAAGAGCTTAATCCTGATGATGATATTGTTTCCA
TTAATCAACTGATTAATAAAGTAAAACAGCAATTTTTAGAAACATCCATTCCTCATCCAGACCGAGATTCTAGAAAGAAC
TATCTCAGTTACTATCCTGATGATGAGGAAAGTTTAGAAAATTATAGAGACTGTCAAGATAGTGCAGAAGCTCGTGCTAA
GGAATTATTATTACGGGAATTTGCCCTGCCTTTTAATCGTCGCTCTACATTGGAAGCCTATGCTTTATTTGCTTGTCATA
TTGAATTGAGGGATGAACGGTTAATTGAATTGGTAGCTCGTGAATTTGAGATTTCAAATGCTGAAGCCAAGATTTTCTTG
ATAGTTCTCACAGATATCATTCGTCGCACAGGAATTGTGAGTATTGATGGTGCATCGCGTTACTTCCCTGAAACTGGTGG
AGTTGAAGGCGTTAGACCAGAAATGGTGGACATTCAAGGAAGGTCTAAAAATTATCTGTTTTTAGAAAAGTCACCTGATG
AACAGAAGAAATTTAAAGATTCACCGTCATTTATACCAAAGTGGAAGCAAAAAACAGGTGAAGTTAGTCAAGTTCAAAAT
AGACTTGGTTGGTATTACCTACAGCTATTTGGTGACAACTTACCAAACAGAGATAAGTTTGTTGCTCTATTTAAACAATT
AGAACAATTACGCTTATTAGAAAAAGCTAAAAATGGCCATCAATTGAACTGGACAAGATTAAATATTATTAAAACTCAGC
ATGATTGGTATCAGTGCGATCGCTGTCAACAAATTATCCATGTTCCAGGTTTATCTGATGTCCAAAAATCTCAGACTAAG
TTGAATATTTTCGGTTGTCCAGCCTTCAAATGCACTGGTCAACTTCAGCCTTACTATGCGGAGAAAATAGAGCAAGTCAG
AAACGAGCATTATCAGCAGTATATTATCAAAAATCGCCTACCTTTGCCGTTGCGATCGCAAGAACATACAGCGCAGTTAG
GAGTCACCGAACTAGAAAGACGCGAAAACCGTTTTCGTCGCGGTCAAATTAATCTCCTGAGTTGTTCTACAACCTTAGAA
ATGGGTGTAGACATCGGCGAACTGCAAGCTGTGGTTTTACGCAACTTTCCACCCCATGTTAGTAACTACCAACAACGCGC
AGGACGCGCAGGACGGCGTACTGATGGAGTGGCGATTACTTTAATGTATGGCCAGCGTCGTCCCCATGACCGATTTTATT
TCGAGCAGCCTGAACAATTAATCGCAGGTAGTAATCAAATTCCTAAGCTTGATGCTGATAACTTCCAAATTCAACAGCGT
CATATTCGCGCTGAATTACTAGCTGAGTTTTTGAAGACAAAGGAAAGAGGTGCAGAGAAAGTTACCATTGCTGAATTTTT
CAGCTTACCTGTGCATAAGTTTGATTCTTTAGACACACCGCCACCCACAGCAATAGTTAGTGAATTACAAGAGTGGCTGC
ATAGTGATGATGCTCATAATTTGGCACAATTATGGATCAATAAGCTGAAAATTTCTTATGCTGCCACCGATATATTAAAT
CAATTTGTTGCCGCAATTTTAGTGTTTCAGCAAGCACAATTAGCAGATTGGAATGATTTAGTATTACTGCTTAAAGATAT
TCAAGACAGTATTACTGCTGAAACTGACCGTACAAAACGTAAGGGGATAGAGAAGCGACGGGATGGTATTGAAGCGGAGT
TAGAAAAAATTGGGAAGCGCAGACTGCACGATGAATTAGTTCAAGCCAGTATACTACCGATTTATGGTTTTCCGATTGAT
GTAGTGCGGTTATTGACAGGGGAAAGTGATGAGTTTAAATCATCTCAAGGAAAGCATAGACTAGAACGCGATCGCCGTCT
TGCACTTGGTGAATATGCACCTAGCCAAGATATTGTAGTTGACGACCGAGTGTATCAGAGTGTTGGCATTCTCAGACCGA
GTGATTTAGAGCAAAAATACTATTGGGTTTGCAAGAATTGTAATCATTTTGAATCATCAATTTCTGAACAAATAATTGAA
CAATGTTCTGTCTGTGGATGCAAACCTACTCCGGCTGCTGCTGGCAAGATGAAGCTTTACAAAGTTCCTAAAGCCTTTAC
TACAGACTGGTCAGTTACGCCAAAAGTTACGCCATATACTAAACCGCAACGCCAACTAACCTCACAGGTATTTTTAGCCA
AGTCTGGAGAAGACCAAGAACAATTAGAATCTGAATTTTACAAACTCACGGTCAATAAAGGCGGGATTCTATTTCTCGCA
AATCAAGGAAGTTTGGGACGTGGTAAAGGCTTCAGTAAAGAAGGTTTTGCAATTTGCCAATACTGTGGGAGAGACCTAAG
TGAACTGGTACAAAAACAGCGTGAAGCAAATAACGCCAAAGGTGGTAGCAAAAAAGCTAGTTCTAAAGCCTCATCAACTG
CCCATAAACACCCAATTACTGCTAAAGATTGTTCAGGTACTGGATATCCACATATTCATTTAGGGCATGAATTTCGCAGT
GATTTGTTAAAAATTGAGTTTCAGAAAATAGCAAACCTCAAACCTTTATTTGGTGACGTTGTTCATTATGGGGATGGTGG
CACAGTTGCGTCTGTAACCGAACAAATATATCATGACACCGATGGTATGGCATTTTGGCGATCGCTAACCTATGCACTGA
TAGCCGCAGCCGCACAAGTAATTGATGTGCCTCGTTCAGAATTGGATGGTTTGTTTACACCATTACCAAATCAACTTGCC
CAAATTATTATATATGACAACGTTCCAGGGGGAGCAGGTTATAGCAAGCGCATTGCTGATCACTTTTTTCAGGTATTAGA
GAAAGCTTTAGAAATTACTGCGTCTTGTAGTTGTGATACAAGCTGCTATGACTGCTTAAGAACTTATTCAAATCAGCCAT
TTCATGCAGAACTCAATCGAAAAATAGTTGCTAATTTTCTCACGGATTTGGTTGTCAAACCAGACCCAGAACTACAAGCT
TTTGCACCTAATGCGAATCGAGTGAAATTGTCCCAAATGGCTACACGCGTGCCTGCAATTTGTCGTATGGCTGGTAAGGA
AAGTATGATTTACTTACCCAGCTTGATCGATACATTTAATTTAAATAATGGCTCGCCACTTCCTTGGTTAAAGCTGCTAA
AAGATGCGGTTTATTCAATGCAGCGCAGTAATATTGCACTAGAATTAATTTTAAATCAATTACCAGAACCGAATACTGCT
GCTTCTGATGCAACCAGGAGGAATTTGCAATTATTACAGAAGCATTTGCAACAGTGGGTAGACCAAGAATTACTCAAGCT
GTATCAAACATCTGTTAATGATGTGCCAATTTTATGTTTAAGCACTCAGCAACAAAATCGCATTGCTTTACAATTACATC
AACAGGAATGGTTTGAAACCAGAAGTGGTGAAGGTGTAGATACTGTATTTCAACGTTTACAAAACTTGCGATCGCAAGCT
CGACCTGTAGAGGCAATAGAACTAGAAGACCCTAATACTACAGTTATCTTCCCTGATAGAACCTGGAGTAATTTAACAAT
AACGCAACTACGGCAAAGACTCGGCATAGACCGTGTTTTTTCTGGTGGAGGTGTGAAGATAGTTTATCGCGATCGCTACC
TGAATGAAAAAGGAGGGAAAATCCTGGCTGATCTCTTACAAGGTGATGGCATAAATGAAAATTCCTCTGTCACAATTTGG
GTTCTAGAAGATTATAAAGGAGAGTTAGGTTCTCAGCGAAAAGCTAATTTGGAGGCGGCACTTACTCAAATTCAACGTAT
GGGAGTTTCTACAACTGTGAAAGTTCAGCCTTGGTATGAACGCTCTTATTTTCCTCATTCCCGCGAGATGGAAGTGCTGA
CAGCAAATGGTCAGCGATACAAAATTATGTTTGATAAAGGGATGGATTTCTTAGAGCTAAAAGCAACTGGTGTTTATTCA
GTAACAGAATCGACATATGTTGTAATTAATAAGCAGGATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATCTGAGCCTGATAGTGAGCGATATAGAACTCGTATTATCGAGCATCAGCATCACCCCTTAGTGGAAACTATATTTCAG
CGTTTAGGATGCCTTTTGGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATAAAATCAGCCTAGATTATGAAACTAAATTGTTGTCTTTGTCAGATTCTTTTTCCTTTAATTCATGAAATATCTTCAA
AAGTTTTCGATATAGAGGGT

Product: DEAD/DEAH box helicase-like protein

Products: NA

Alternate protein names: DEAD/DEAH Box Helicase Domain Protein; Helicase; DEAD/DEAH Box Helicase; Helicase Superfamily Protein; DEAD/DEAH Box Helicase-Like Protein; Helicase Family Protein; RNA Helicase; Dead/Deah Box Helicase Domain Protein; DEAD-Box ATP Dependent DNA Helicase; ATP-Dependent Helicase Lhr; Dead/Deah Box Helicase; Helicase Domain-Containing Protein; DEAD/DEAH Box Helicase Domain Containing Protein; Helicase Related Protein; Serine/Threonine-Protein Kinase; Dead/Deah Box Helicase Domain-Containing Protein; Helicase Conserved C-Terminal Domain Protein; ATP-Dependent Helicase; Type III Restriction Res Subunit Family; DEAD/DEAH Box Helicase-Like; DeaD/DeaH Box Helicase; Helicase C-TerminalDEAD/DEAH Box Helicase N-Terminal; Helicase Fragment; DNA Helicase; Helicase Domain Protein

Number of amino acids: Translated: 2093; Mature: 2093

Protein sequence:

>2093_residues
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Sequences:

>Translated_2093_residues
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VTESTYVVINKQD

Specific function: Inhibits Mcre Restriction. [C]

COG id: COG1205

COG function: function code R; Distinct helicase family with a unique C-terminal domain including a metal-binding cysteine cluster

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6320497, Length=135, Percent_Identity=33.3333333333333, Blast_Score=68, Evalue=1e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 238562; Mature: 238562

Theoretical pI: Translated: 6.57; Mature: 6.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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CEEEEHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEE
TSRTENDRHKAEEALAEELQAYESEELWELFTQKEKSSLNLSTRERLIDEAIAKIQKIQA
ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISRQEIWEKPPHILVTNYSMLEHMLIRPVERNKVFATSASTFKMLVVDEAHTYNGSTGSE
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VSMLIERLKVAVEQEKPGKIRCIATSASLGDASVNNEILEFATKFFGESFNQVIRGDRVK
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
AIERLGEPYLLSAELTHEEILAYLSILELPKIDDDLSIWFDRLSGFVPTEHLKAAETKAQ
HHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHC
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CHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHH
ALAHLLQLGTLARENSESLPLLPVRIHLLFRSLEGMYACINPQCPGGVCDPNYEDKPRRY
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHH
GRLYLNEKRTCDDCNSPVLELGSCYQCGQAYAFTQINGVSKLEPLPRSNQGLRENDKIYT
CCEEECCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHCCCEEEHEECCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEE
LTSGLLDSITEEEEIGEEEQESSPTNTLIIRQRDGWIGLPTSVTFTNKSSEPNEFYLAWH
EHHHHHHHHCCHHHCCCHHHHCCCCCEEEEEECCCCEECCCEEEECCCCCCCCEEEEEEC
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CCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHH
VKQQFLETSIPHPDRDSRKNYLSYYPDDEESLENYRDCQDSAEARAKELLLREFALPFNR
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
RSTLEAYALFACHIELRDERLIELVAREFEISNAEAKIFLIVLTDIIRRTGIVSIDGASR
CHHHHHHEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCEEEECCCCC
YFPETGGVEGVRPEMVDIQGRSKNYLFLEKSPDEQKKFKDSPSFIPKWKQKTGEVSQVQN
CCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHH
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HHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHH
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