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The map label for this gene is 71908047

Identifier: 71908047

GI number: 71908047

Start: 2623559

End: 2626828

Strand: Reverse

Name: 71908047

Synonym: Daro_2429

Alternate gene names: NA

Gene position: 2626828-2623559 (Counterclockwise)

Preceding gene: 71908048

Following gene: 71908046

Centisome position: 58.36

GC content: 48.96

Gene sequence:

>3270_bases
ATGAAATCTCCTGTCGATCAAGTAGATGGCCGGTTAGCCTTCCCCTTCATGATCTGGGTGGGTTATCTTTTTTTTCTCGC
CTACGGAAGTCTGGTTCCTTTTGAGTACCAGTACGTCTCATGGTCGGATGCCTGGGAGCAATTCAAGCATATACCGATGT
ACCGCTTGGATGTCGATACGCGTGCCGACTGGGTTGCTAACCTCATTCTTGCTATTCCAACGGGGTTCCTGACAACTCAC
TTATTGTTGGATAGATTCTCCAAGGCGAATAAGGCTTCCCTATTTTTTATTTCAGGGCTTTTCTCTCTCTCTTTTGTAAT
CTGTATCGAGTTTGCCCAGCTTTTTTTCCCTCCGCGGACTTGTTCGCTTAATGACATAGTCTCTCAGTCAGTGGGCGCTT
TGATTGGTTTGGTCTTGGCAGCCAAATACTCAGATTGGTTTAAAGATTTTTTTTCTATTGATGGCGATTCCAGGCGATTG
GCTTTTCGACTGCTCGAGGCCTATCTTGTTGGCTATGCTGCCTTCAGTCTTTTCCCATACGACTTCCTGTTTTCTGGAGC
GGAGCTCGAGCAAAAACTTTCGGGGGGCAATTGGGGATGGCTAATGGCAAGAGGTGGTTCGCAATTAGGGGCGCTCAGCG
GTATTAAGCTGTTGTTCGAAATTATCCTGACATTGCCATTTGGTCTGTTTCTTGGATATCGCTCAGAAAGTCAGTCCGGA
AGTTATAGGCAGGCGCTATTTCTTGGCATCCTGTTGGGGGCTTCCATCGAGATTCTGCAGTTCTTCATGGCATCGGGAAT
CAGCGAAGGGCTTTCGATATTGACGCGCGTAACCGGCGTTTGTGGCGGTTTGGCGCTATGGAAACACCATGCAACTTGCT
CACCAAAAAGGTTTCAGGCGCTGATACGCCAATTTCTGTACCCGCTTGGTGCTATTTACATGTTGGTCCTGTTGCAGGCG
AATGGCTGGTTTTCTGGTCACTGGGATGGACTTGGTTTTGCTGGTGCGCAGCTGACTGAACTGCATTTCACGCCCTTTTA
CTACCATTACTTCACTTCAGAGGCCAAAGCTTTGGTCAGTGTTGTAATGGTTGTGATGATGTATGCCCCAATCGGATTAG
TAGTTTGGCTAATGCGGGGCTCACCAAGGCAGGCACTTTTCTCTGCCGTCTTGCTTGCTTCTGGCATAGAGGTCGGCAAG
CTTTTTTTGCAAGGCATGCATCCCGATCCAACGAATGTGTTGCTAGGCGGATTGTCTGGATGGGGCGCATTTTGTTCAAC
CAGGGCTCTTTCAGCGATGAGTGCGCTGTTCTCCGTCAAGGAAGTAGGAGAAAGACATATGCAGAAGTCGACCAAAATGC
CTCCGCACTCTTCGCAATTTGGTGTAACTACGCCATTTGCTGGAAGATCCAATCGCCAGGGAAAACTTCGCTTCGCGCAT
GTCGCATTGCTGCCCCTGCTGCTATTTTCAGCATATTGGGCCATTACCTTTCCGACTCAACCGATATTGCTCAGTCTCTT
TCTCTCCGTATGCGCAGTCGCCATATGGCTTAGGCCGGTACTGATCGCCGTCATTATTCCGTTCGCGTTGCCGTCGCTCG
ATCTGGCCCAGTGGAGCGGGCGCTTCTATTTTGATGAATTCGACTTGCTGTTGCTGGTCGCTCTTAGTATCGGGTTTGCT
CGCATTCCTTCTAAACGCCACAAGCGGAGAGCAAACACCTTCTTCGTTCTTGCTTGTGGACTTGTGGCGCTTAGCTTATT
CATTAGCGCCATTCGGGGGATGCTTCCGTTCCAATTTCCAGATTCCAACTCATTTAGCAATTATTACAGTGCCTATAATT
CACTTCGCATTGCTAAAGGTGCGATTTGGGCTTTTCTGAGCTTTGGATTGCTGCGTCGCATGCTTGCTTCAGAAATGGAT
ATCGAGCGTCCGTTGACGACTGGTGCAATCGCTGGTCTTGCTTTTACAGTTGGGGTCATTCTCTGGGAGCGACTGACGTT
TAGTGGGTTATTCAATTTTTCCAGTGATTACCGTGTTACCGGTCCATTCTCTTCCATGCATACGGGCGGGGCTTACATTG
AGTGTTTTCTTGCAGTTTCAACGCCATTCCTGTTACTGCTGGTACTGCAAACGAAAAGTTGGCTGGTCAGGCTGCTGGGC
GGGGGGCTGTTGCTCGCAGCGACCTATGCCCTGATGGTTACGTTTTCACGTAATGGTTATATGGCATTTGGTGTGGCATC
GGCGATCACCATGTTTTTTGCGTTGTTTAAATCTGCTCGCTGGAAACAACGCGGTCTGATCTTGGTAGCTCTGACAGGTG
CCATGTTTGCGGTGGCCATGCCAGTCTTTACCGGGCAGTTTGCGCAGGAGCGGATCGCTACGCTGGGGAACGACTACTAT
GTCCGTCAAGCTCATTGGGAGGATGCGCTTGACATTCGCAGCCCGGATTTGCTGACGACGCTATTTGGTATGGGGCTCGG
TCGCTATCCGGAAAGCCATTATCTCTTAAGCAGGGAAGAGAATCACGCTGGTACTTATCAGCTGGTTTCAGAAGAGGGCA
ACAGCTTTCTGCGACTGGTCTCCGGAAGCTCAATCTATTTGGGGCAACGCGTCTCTGTTGAACCTCTGCAAAAATACATT
CTAAAACTTGATGCGCGTGCCAATAGACCAGATGCCACAATCACGATTCCAATTTGTGAAAAATGGCTGATTTCCTCCTT
TGAATGCATCTGGAGCACGATTGAGATCGGCAAAGAGATAGGGATTTGGCATCATTTCGAAAGGGTTATTACTTCCGATC
ACTTCAATGCCAGTCATTGGTATTCCCAGCGACCAATAAAGTTCGCTCTCTACAACGGCAACCTCAAGACAATTGTTGAT
GTGGACAATGTAAGACTTGAAACGCTCCAAGGCGACAATCTGCTACGAAATGGTGACTTCTCGAAAGAACTGGATCACTG
GCTCTTTACCGCCGACAGCCATTTGGAATGGCATGTCAAAAGTCTTCCCATTTCGGTCATCTTCGATCAGGGTTGGTTTG
GCTTGGTCGCTATCGGCTTGTTTTCCTTGCTCGCCATAAAAGGTGCAATGGGTCGAGCGTGGCAAGGAGATCTTGGGGCT
GCCGCCTTGCTGGCATCCTTTAGTGGATTTCTGGTGGTTGGGCTGTTTGACACACTTATCGATGCTCCGCGCTTCCTGTT
TTTGTTTTTGATGCTTGGAGGATTCTGTGGTTATGACGTTGACAAGAAAAAGATAGTCCAAAGGGCGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCGGTTGCTACTGGTGTTACTGATTGGCTCCAGCGTAGATTCAATTAGAGTATCTGAAGCACCGCGACGGCCACCTCCT
AACCCAAGACGACGAAGCCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCGAGGTTGGCTCAAATACACTGTGGGTCTTCGCGGTGAGGTCGGCTGTTGCGTAATCACAAACGTAGAATCCGGGGGG
CTCGTCCACGTTGTTCTTCG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Heparinase II/III Family Protein; VanZ Like Protein

Number of amino acids: Translated: 1089; Mature: 1089

Protein sequence:

>1089_residues
MKSPVDQVDGRLAFPFMIWVGYLFFLAYGSLVPFEYQYVSWSDAWEQFKHIPMYRLDVDTRADWVANLILAIPTGFLTTH
LLLDRFSKANKASLFFISGLFSLSFVICIEFAQLFFPPRTCSLNDIVSQSVGALIGLVLAAKYSDWFKDFFSIDGDSRRL
AFRLLEAYLVGYAAFSLFPYDFLFSGAELEQKLSGGNWGWLMARGGSQLGALSGIKLLFEIILTLPFGLFLGYRSESQSG
SYRQALFLGILLGASIEILQFFMASGISEGLSILTRVTGVCGGLALWKHHATCSPKRFQALIRQFLYPLGAIYMLVLLQA
NGWFSGHWDGLGFAGAQLTELHFTPFYYHYFTSEAKALVSVVMVVMMYAPIGLVVWLMRGSPRQALFSAVLLASGIEVGK
LFLQGMHPDPTNVLLGGLSGWGAFCSTRALSAMSALFSVKEVGERHMQKSTKMPPHSSQFGVTTPFAGRSNRQGKLRFAH
VALLPLLLFSAYWAITFPTQPILLSLFLSVCAVAIWLRPVLIAVIIPFALPSLDLAQWSGRFYFDEFDLLLLVALSIGFA
RIPSKRHKRRANTFFVLACGLVALSLFISAIRGMLPFQFPDSNSFSNYYSAYNSLRIAKGAIWAFLSFGLLRRMLASEMD
IERPLTTGAIAGLAFTVGVILWERLTFSGLFNFSSDYRVTGPFSSMHTGGAYIECFLAVSTPFLLLLVLQTKSWLVRLLG
GGLLLAATYALMVTFSRNGYMAFGVASAITMFFALFKSARWKQRGLILVALTGAMFAVAMPVFTGQFAQERIATLGNDYY
VRQAHWEDALDIRSPDLLTTLFGMGLGRYPESHYLLSREENHAGTYQLVSEEGNSFLRLVSGSSIYLGQRVSVEPLQKYI
LKLDARANRPDATITIPICEKWLISSFECIWSTIEIGKEIGIWHHFERVITSDHFNASHWYSQRPIKFALYNGNLKTIVD
VDNVRLETLQGDNLLRNGDFSKELDHWLFTADSHLEWHVKSLPISVIFDQGWFGLVAIGLFSLLAIKGAMGRAWQGDLGA
AALLASFSGFLVVGLFDTLIDAPRFLFLFLMLGGFCGYDVDKKKIVQRA

Sequences:

>Translated_1089_residues
MKSPVDQVDGRLAFPFMIWVGYLFFLAYGSLVPFEYQYVSWSDAWEQFKHIPMYRLDVDTRADWVANLILAIPTGFLTTH
LLLDRFSKANKASLFFISGLFSLSFVICIEFAQLFFPPRTCSLNDIVSQSVGALIGLVLAAKYSDWFKDFFSIDGDSRRL
AFRLLEAYLVGYAAFSLFPYDFLFSGAELEQKLSGGNWGWLMARGGSQLGALSGIKLLFEIILTLPFGLFLGYRSESQSG
SYRQALFLGILLGASIEILQFFMASGISEGLSILTRVTGVCGGLALWKHHATCSPKRFQALIRQFLYPLGAIYMLVLLQA
NGWFSGHWDGLGFAGAQLTELHFTPFYYHYFTSEAKALVSVVMVVMMYAPIGLVVWLMRGSPRQALFSAVLLASGIEVGK
LFLQGMHPDPTNVLLGGLSGWGAFCSTRALSAMSALFSVKEVGERHMQKSTKMPPHSSQFGVTTPFAGRSNRQGKLRFAH
VALLPLLLFSAYWAITFPTQPILLSLFLSVCAVAIWLRPVLIAVIIPFALPSLDLAQWSGRFYFDEFDLLLLVALSIGFA
RIPSKRHKRRANTFFVLACGLVALSLFISAIRGMLPFQFPDSNSFSNYYSAYNSLRIAKGAIWAFLSFGLLRRMLASEMD
IERPLTTGAIAGLAFTVGVILWERLTFSGLFNFSSDYRVTGPFSSMHTGGAYIECFLAVSTPFLLLLVLQTKSWLVRLLG
GGLLLAATYALMVTFSRNGYMAFGVASAITMFFALFKSARWKQRGLILVALTGAMFAVAMPVFTGQFAQERIATLGNDYY
VRQAHWEDALDIRSPDLLTTLFGMGLGRYPESHYLLSREENHAGTYQLVSEEGNSFLRLVSGSSIYLGQRVSVEPLQKYI
LKLDARANRPDATITIPICEKWLISSFECIWSTIEIGKEIGIWHHFERVITSDHFNASHWYSQRPIKFALYNGNLKTIVD
VDNVRLETLQGDNLLRNGDFSKELDHWLFTADSHLEWHVKSLPISVIFDQGWFGLVAIGLFSLLAIKGAMGRAWQGDLGA
AALLASFSGFLVVGLFDTLIDAPRFLFLFLMLGGFCGYDVDKKKIVQRA
>Mature_1089_residues
MKSPVDQVDGRLAFPFMIWVGYLFFLAYGSLVPFEYQYVSWSDAWEQFKHIPMYRLDVDTRADWVANLILAIPTGFLTTH
LLLDRFSKANKASLFFISGLFSLSFVICIEFAQLFFPPRTCSLNDIVSQSVGALIGLVLAAKYSDWFKDFFSIDGDSRRL
AFRLLEAYLVGYAAFSLFPYDFLFSGAELEQKLSGGNWGWLMARGGSQLGALSGIKLLFEIILTLPFGLFLGYRSESQSG
SYRQALFLGILLGASIEILQFFMASGISEGLSILTRVTGVCGGLALWKHHATCSPKRFQALIRQFLYPLGAIYMLVLLQA
NGWFSGHWDGLGFAGAQLTELHFTPFYYHYFTSEAKALVSVVMVVMMYAPIGLVVWLMRGSPRQALFSAVLLASGIEVGK
LFLQGMHPDPTNVLLGGLSGWGAFCSTRALSAMSALFSVKEVGERHMQKSTKMPPHSSQFGVTTPFAGRSNRQGKLRFAH
VALLPLLLFSAYWAITFPTQPILLSLFLSVCAVAIWLRPVLIAVIIPFALPSLDLAQWSGRFYFDEFDLLLLVALSIGFA
RIPSKRHKRRANTFFVLACGLVALSLFISAIRGMLPFQFPDSNSFSNYYSAYNSLRIAKGAIWAFLSFGLLRRMLASEMD
IERPLTTGAIAGLAFTVGVILWERLTFSGLFNFSSDYRVTGPFSSMHTGGAYIECFLAVSTPFLLLLVLQTKSWLVRLLG
GGLLLAATYALMVTFSRNGYMAFGVASAITMFFALFKSARWKQRGLILVALTGAMFAVAMPVFTGQFAQERIATLGNDYY
VRQAHWEDALDIRSPDLLTTLFGMGLGRYPESHYLLSREENHAGTYQLVSEEGNSFLRLVSGSSIYLGQRVSVEPLQKYI
LKLDARANRPDATITIPICEKWLISSFECIWSTIEIGKEIGIWHHFERVITSDHFNASHWYSQRPIKFALYNGNLKTIVD
VDNVRLETLQGDNLLRNGDFSKELDHWLFTADSHLEWHVKSLPISVIFDQGWFGLVAIGLFSLLAIKGAMGRAWQGDLGA
AALLASFSGFLVVGLFDTLIDAPRFLFLFLMLGGFCGYDVDKKKIVQRA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 121414; Mature: 121414

Theoretical pI: Translated: 8.98; Mature: 8.98

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSPVDQVDGRLAFPFMIWVGYLFFLAYGSLVPFEYQYVSWSDAWEQFKHIPMYRLDVDT
CCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCEEEEECCC
RADWVANLILAIPTGFLTTHLLLDRFSKANKASLFFISGLFSLSFVICIEFAQLFFPPRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
CSLNDIVSQSVGALIGLVLAAKYSDWFKDFFSIDGDSRRLAFRLLEAYLVGYAAFSLFPY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
DFLFSGAELEQKLSGGNWGWLMARGGSQLGALSGIKLLFEIILTLPFGLFLGYRSESQSG
HHHHCCHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
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HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH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PVFTGQFAQERIATLGNDYYVRQAHWEDALDIRSPDLLTTLFGMGLGRYPESHYLLSREE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCC
NHAGTYQLVSEEGNSFLRLVSGSSIYLGQRVSVEPLQKYILKLDARANRPDATITIPICE
CCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHH
KWLISSFECIWSTIEIGKEIGIWHHFERVITSDHFNASHWYSQRPIKFALYNGNLKTIVD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCEEEEEECCCEEEEEE
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FSLLAIKGAMGRAWQGDLGAAALLASFSGFLVVGLFDTLIDAPRFLFLFLMLGGFCGYDV
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
DKKKIVQRA
CHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKSPVDQVDGRLAFPFMIWVGYLFFLAYGSLVPFEYQYVSWSDAWEQFKHIPMYRLDVDT
CCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCEEEEECCC
RADWVANLILAIPTGFLTTHLLLDRFSKANKASLFFISGLFSLSFVICIEFAQLFFPPRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
CSLNDIVSQSVGALIGLVLAAKYSDWFKDFFSIDGDSRRLAFRLLEAYLVGYAAFSLFPY
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
DFLFSGAELEQKLSGGNWGWLMARGGSQLGALSGIKLLFEIILTLPFGLFLGYRSESQSG
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHH
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CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LWERLTFSGLFNFSSDYRVTGPFSSMHTGGAYIECFLAVSTPFLLLLVLQTKSWLVRLLG
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GGLLLAATYALMVTFSRNGYMAFGVASAITMFFALFKSARWKQRGLILVALTGAMFAVAM
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PVFTGQFAQERIATLGNDYYVRQAHWEDALDIRSPDLLTTLFGMGLGRYPESHYLLSREE
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CCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHH
KWLISSFECIWSTIEIGKEIGIWHHFERVITSDHFNASHWYSQRPIKFALYNGNLKTIVD
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VDNVRLETLQGDNLLRNGDFSKELDHWLFTADSHLEWHVKSLPISVIFDQGWFGLVAIGL
ECCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHEEECCCCCEEEEEECCEEEEECCCHHHHHHHHH
FSLLAIKGAMGRAWQGDLGAAALLASFSGFLVVGLFDTLIDAPRFLFLFLMLGGFCGYDV
HHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
DKKKIVQRA
CHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA