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The map label for this gene is yoaV [H]

Identifier: 59714238

GI number: 59714238

Start: 1189706

End: 1190581

Strand: Reverse

Name: yoaV [H]

Synonym: VF_A1055

Alternate gene names: 59714238

Gene position: 1190581-1189706 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59714240

Following gene: 59714237

Centisome position: 89.49

GC content: 38.13

Gene sequence:

>876_bases
ATGGTTAATATCTTAAGTTTATTTACGTTAGCTGCTTTGTGGGGAGGCTCATTTTTATTTGTTAGGATTGCGGCTAATCC
GTTAGGCCCTGCGGTTTTAATTGAAGTACGTGTCGCTTTTGCCGCATTGACTCTGCTTGTTGTTTCATTTTTCCTCAAAA
AATCGCTACGTTTTATGTCTAATATTAAACACTTCCTTATTTTAGGTCTGTTTAATTCGGCTTTGCCTTTTTTGTTATTT
GCATATTCTGCGCAAGTGTTAAATGTATCTACTTTGGCTGTTCTTAATTCCACAGCTCCGATTTGGGGAGCCGTTATTGG
AGCTATCTGGACTCGAACAAGATTAAGTAAAGACGTTATATTTGGTCTGATTCTTGGAATGATTGGTGTAAGTGTTTTGG
TTGGGTGGGAAGCGATTAATATTGGCGATGAAGCGATTATTCCAATTATTACTGCGTTAATTGGTGCGTTTAGCTATGGG
GTTGCGACTAATTATGCCAAAAATGCACCAAGCGTTGAGCCGTTTAATAATGCGCACGGTAGTATGTGGGCATCTGTATT
ACTTGTATTGCCTCTTGTTCCTTTCATGCCTGTTCGAGAAGAAGTCACTTCAGATATTATTGCGGCTGTTTTTGCACTTG
GTGCTGTATGTACGGGATTGGCTTATTTATTGTATTTTCGACTTATTAAGGAGCTTGGTGCTTCTTCTGCTTTAACAGTT
ACCTTTATTATTCCTGTTTTTGGGATTTTATGGGGGTATTTGTTCTTAGGTGAAACGGTGGGAGTAAATGCCATTATAGG
TACGATTTTAGTGGTTATTGGCACCATGTTTGTTACTGGATTTGCTTCTAAGTTTATGTCTAAAAAATGTGTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTTAAATGTGAGTAGTTAATGACATTTTTTAATGATAGCGTTGAGTTATTTGTCATTATCGAACACACTCAAAAATCA
ACCACAGTTTGGAGTGACAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGAACATTCGCGGCTGCGCATGTCAATATGAACCCGTTTAAGTGAGAACAGTATGATTATCGAAAATGTGCTTCCTAAA
GACTATGCAGAAATGCTGTC

Product: drug/metabolite exporter family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 291; Mature: 291

Protein sequence:

>291_residues
MVNILSLFTLAALWGGSFLFVRIAANPLGPAVLIEVRVAFAALTLLVVSFFLKKSLRFMSNIKHFLILGLFNSALPFLLF
AYSAQVLNVSTLAVLNSTAPIWGAVIGAIWTRTRLSKDVIFGLILGMIGVSVLVGWEAINIGDEAIIPIITALIGAFSYG
VATNYAKNAPSVEPFNNAHGSMWASVLLVLPLVPFMPVREEVTSDIIAAVFALGAVCTGLAYLLYFRLIKELGASSALTV
TFIIPVFGILWGYLFLGETVGVNAIIGTILVVIGTMFVTGFASKFMSKKCV

Sequences:

>Translated_291_residues
MVNILSLFTLAALWGGSFLFVRIAANPLGPAVLIEVRVAFAALTLLVVSFFLKKSLRFMSNIKHFLILGLFNSALPFLLF
AYSAQVLNVSTLAVLNSTAPIWGAVIGAIWTRTRLSKDVIFGLILGMIGVSVLVGWEAINIGDEAIIPIITALIGAFSYG
VATNYAKNAPSVEPFNNAHGSMWASVLLVLPLVPFMPVREEVTSDIIAAVFALGAVCTGLAYLLYFRLIKELGASSALTV
TFIIPVFGILWGYLFLGETVGVNAIIGTILVVIGTMFVTGFASKFMSKKCV
>Mature_291_residues
MVNILSLFTLAALWGGSFLFVRIAANPLGPAVLIEVRVAFAALTLLVVSFFLKKSLRFMSNIKHFLILGLFNSALPFLLF
AYSAQVLNVSTLAVLNSTAPIWGAVIGAIWTRTRLSKDVIFGLILGMIGVSVLVGWEAINIGDEAIIPIITALIGAFSYG
VATNYAKNAPSVEPFNNAHGSMWASVLLVLPLVPFMPVREEVTSDIIAAVFALGAVCTGLAYLLYFRLIKELGASSALTV
TFIIPVFGILWGYLFLGETVGVNAIIGTILVVIGTMFVTGFASKFMSKKCV

Specific function: Unknown

COG id: COG0697

COG function: function code GER; Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 DUF6 domains [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000620 [H]

Pfam domain/function: PF00892 DUF6 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 31144; Mature: 31144

Theoretical pI: Translated: 9.66; Mature: 9.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVNILSLFTLAALWGGSFLFVRIAANPLGPAVLIEVRVAFAALTLLVVSFFLKKSLRFMS
CCHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIKHFLILGLFNSALPFLLFAYSAQVLNVSTLAVLNSTAPIWGAVIGAIWTRTRLSKDVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGLILGMIGVSVLVGWEAINIGDEAIIPIITALIGAFSYGVATNYAKNAPSVEPFNNAHG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHH
SMWASVLLVLPLVPFMPVREEVTSDIIAAVFALGAVCTGLAYLLYFRLIKELGASSALTV
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
TFIIPVFGILWGYLFLGETVGVNAIIGTILVVIGTMFVTGFASKFMSKKCV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MVNILSLFTLAALWGGSFLFVRIAANPLGPAVLIEVRVAFAALTLLVVSFFLKKSLRFMS
CCHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIKHFLILGLFNSALPFLLFAYSAQVLNVSTLAVLNSTAPIWGAVIGAIWTRTRLSKDVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGLILGMIGVSVLVGWEAINIGDEAIIPIITALIGAFSYGVATNYAKNAPSVEPFNNAHG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHH
SMWASVLLVLPLVPFMPVREEVTSDIIAAVFALGAVCTGLAYLLYFRLIKELGASSALTV
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
TFIIPVFGILWGYLFLGETVGVNAIIGTILVVIGTMFVTGFASKFMSKKCV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 7.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]