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The map label for this gene is 59713905

Identifier: 59713905

GI number: 59713905

Start: 818936

End: 820477

Strand: Reverse

Name: 59713905

Synonym: VF_A0722

Alternate gene names: NA

Gene position: 820477-818936 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59713907

Following gene: 59713904

Centisome position: 61.67

GC content: 40.21

Gene sequence:

>1542_bases
ATGGAACAGACAGACATTACTTCCCTTATCCCCATTGCTATAACGCTGATTATCTCGTTAACGACGCGTAATGTGGTGGT
TGGTCTTTTTGCGGGTGTTTTGAGTGGAGTAGCAATGCTAAACGGTTTGTTTACCACGCTTGGCCCGTTTGAAACATTTG
GTGTTATGGTTAAAAGTTATATCTCTCCTCAACTAACAGATAGCTATAATGCCGGAGTGATTGTATTGCTGGTTTTCATT
GGTGGGTTTGTTGCGCTAATGGAAAAGTCGGGTGGTGGCCTTGCATTTGCAGAAAAAGTAACGCTTTGGGTAAAAAGTAA
ATTTCAGGCACAAACCTCGGCATGGCTAGGGGGGATCATCATTTTCTTCTCTGATTTAGGTACGCCATTAATTGTTGGTC
CAGTTTTTCGTCCTCTTTTCGATAAATTAAAAATCTCTCGTCAAAAGCTGGCCTTCATTATTGATTCAACCTCATCACCT
GTGGCTATTTTAATTCCATTCATTGGTTGGGGTGTGTATATCATGGGGTTAATTCAGAAAGAATTTACTGCATTAAATGT
CACTGATATTACAGATTGGGATGCATTTTTAGGCGCAATTCCATATCAATTCTACGCAATTTTAGCGATAGCGATTGTTC
CACTTGTCGCATTAAAGAAATTGGATTTTGGCCCAATGGCAAAAGCTGAAGCGATAGCAAGTAAGGGCGAACTTCATGCG
TCGTCTGATATTTCAAAAGAAATATTCACGCATAAAAATGCAAAAGCCTCGTTTGTATGGGCACCGCTATTGGTGATGGG
AGCTGTTTTGGTATTTATGCTTGCACCTCTAGGTTTCCCATTTGAAAAAGTCTCTGGTTCAGTGTTTCGTTCTGCTTTGT
CTACCGCTTACTTCTTTGCCGCATTTACACTAATTATTTTAATGGCAATGAATAAGGTAAGAAGTCTATCGGATGGTATT
TCTGTGTACATGAAAGGAATGGGTAACATGATGCAAGTTGCAATCATCCTTATTCTTGCATGGACTCTGAGTTCAGTTGG
TAAAGAGTTAGGTGCGGCAGCTTATATTGCAGAGCAAGCTCAAAACGGCTTTCCATATTGGTTAGTGCCTGCGGTATCTT
TTTTACTGGCAGCGATCATTTCATTTGCTACGGGATCGTCATGGGGAACATTTGCGATTATGATGCATTTGGTTATTCCG
ACAGCTATCACAATTGATGCACCGATGTTTGTATGTATTGGTGCTGTACTTTCTGGTGGTTTGTTTGGCGATCACTGTTC
ACCAATTTCTGAAACAACGATCTTATCTTCAACAGGAGCAGGATGTGATCAGTTTGAACACTTTAAGACACAACTCCCTT
ATGCATTATTAAATGGTGGAATCGCACTTGTCAGCTTTCTAATTGCAGGCATTTTTGATAACCCACTTATTTTCATATTA
GCGTTAATAGCGCAGGTTACATTGGTAGTAACACTCGCTAAATTAACTCCAGAGAATATGTTCAATAAAAGCAAATTGGT
GGCTGGAAATCAGCTAGGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGTGAATAAAAAACTATACATTTGTGATTGTGAAATATATAGTCAATTTAATTGAATAAGTATTTACTCTTTTGCA
GTATAAAAAGGAACGTTACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACGTTTACCTAAAGATGACAGCAATGAAGCGGTCCTTAATTGGGCCGTTTTTTGTTTCACATTAATTCATGAAGAGCGGA
GTATAAAGCTAAGAATGTAA

Product: sodium/proton antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 513; Mature: 513

Protein sequence:

>513_residues
MEQTDITSLIPIAITLIISLTTRNVVVGLFAGVLSGVAMLNGLFTTLGPFETFGVMVKSYISPQLTDSYNAGVIVLLVFI
GGFVALMEKSGGGLAFAEKVTLWVKSKFQAQTSAWLGGIIIFFSDLGTPLIVGPVFRPLFDKLKISRQKLAFIIDSTSSP
VAILIPFIGWGVYIMGLIQKEFTALNVTDITDWDAFLGAIPYQFYAILAIAIVPLVALKKLDFGPMAKAEAIASKGELHA
SSDISKEIFTHKNAKASFVWAPLLVMGAVLVFMLAPLGFPFEKVSGSVFRSALSTAYFFAAFTLIILMAMNKVRSLSDGI
SVYMKGMGNMMQVAIILILAWTLSSVGKELGAAAYIAEQAQNGFPYWLVPAVSFLLAAIISFATGSSWGTFAIMMHLVIP
TAITIDAPMFVCIGAVLSGGLFGDHCSPISETTILSSTGAGCDQFEHFKTQLPYALLNGGIALVSFLIAGIFDNPLIFIL
ALIAQVTLVVTLAKLTPENMFNKSKLVAGNQLG

Sequences:

>Translated_513_residues
MEQTDITSLIPIAITLIISLTTRNVVVGLFAGVLSGVAMLNGLFTTLGPFETFGVMVKSYISPQLTDSYNAGVIVLLVFI
GGFVALMEKSGGGLAFAEKVTLWVKSKFQAQTSAWLGGIIIFFSDLGTPLIVGPVFRPLFDKLKISRQKLAFIIDSTSSP
VAILIPFIGWGVYIMGLIQKEFTALNVTDITDWDAFLGAIPYQFYAILAIAIVPLVALKKLDFGPMAKAEAIASKGELHA
SSDISKEIFTHKNAKASFVWAPLLVMGAVLVFMLAPLGFPFEKVSGSVFRSALSTAYFFAAFTLIILMAMNKVRSLSDGI
SVYMKGMGNMMQVAIILILAWTLSSVGKELGAAAYIAEQAQNGFPYWLVPAVSFLLAAIISFATGSSWGTFAIMMHLVIP
TAITIDAPMFVCIGAVLSGGLFGDHCSPISETTILSSTGAGCDQFEHFKTQLPYALLNGGIALVSFLIAGIFDNPLIFIL
ALIAQVTLVVTLAKLTPENMFNKSKLVAGNQLG
>Mature_513_residues
MEQTDITSLIPIAITLIISLTTRNVVVGLFAGVLSGVAMLNGLFTTLGPFETFGVMVKSYISPQLTDSYNAGVIVLLVFI
GGFVALMEKSGGGLAFAEKVTLWVKSKFQAQTSAWLGGIIIFFSDLGTPLIVGPVFRPLFDKLKISRQKLAFIIDSTSSP
VAILIPFIGWGVYIMGLIQKEFTALNVTDITDWDAFLGAIPYQFYAILAIAIVPLVALKKLDFGPMAKAEAIASKGELHA
SSDISKEIFTHKNAKASFVWAPLLVMGAVLVFMLAPLGFPFEKVSGSVFRSALSTAYFFAAFTLIILMAMNKVRSLSDGI
SVYMKGMGNMMQVAIILILAWTLSSVGKELGAAAYIAEQAQNGFPYWLVPAVSFLLAAIISFATGSSWGTFAIMMHLVIP
TAITIDAPMFVCIGAVLSGGLFGDHCSPISETTILSSTGAGCDQFEHFKTQLPYALLNGGIALVSFLIAGIFDNPLIFIL
ALIAQVTLVVTLAKLTPENMFNKSKLVAGNQLG

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54815; Mature: 54815

Theoretical pI: Translated: 7.55; Mature: 7.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEQTDITSLIPIAITLIISLTTRNVVVGLFAGVLSGVAMLNGLFTTLGPFETFGVMVKSY
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
ISPQLTDSYNAGVIVLLVFIGGFVALMEKSGGGLAFAEKVTLWVKSKFQAQTSAWLGGII
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFFSDLGTPLIVGPVFRPLFDKLKISRQKLAFIIDSTSSPVAILIPFIGWGVYIMGLIQK
HHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFTALNVTDITDWDAFLGAIPYQFYAILAIAIVPLVALKKLDFGPMAKAEAIASKGELHA
HHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCC
SSDISKEIFTHKNAKASFVWAPLLVMGAVLVFMLAPLGFPFEKVSGSVFRSALSTAYFFA
CCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFTLIILMAMNKVRSLSDGISVYMKGMGNMMQVAIILILAWTLSSVGKELGAAAYIAEQA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QNGFPYWLVPAVSFLLAAIISFATGSSWGTFAIMMHLVIPTAITIDAPMFVCIGAVLSGG
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHCCC
LFGDHCSPISETTILSSTGAGCDQFEHFKTQLPYALLNGGIALVSFLIAGIFDNPLIFIL
CCCCCCCCCCHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
ALIAQVTLVVTLAKLTPENMFNKSKLVAGNQLG
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MEQTDITSLIPIAITLIISLTTRNVVVGLFAGVLSGVAMLNGLFTTLGPFETFGVMVKSY
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
ISPQLTDSYNAGVIVLLVFIGGFVALMEKSGGGLAFAEKVTLWVKSKFQAQTSAWLGGII
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFFSDLGTPLIVGPVFRPLFDKLKISRQKLAFIIDSTSSPVAILIPFIGWGVYIMGLIQK
HHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFTALNVTDITDWDAFLGAIPYQFYAILAIAIVPLVALKKLDFGPMAKAEAIASKGELHA
HHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCC
SSDISKEIFTHKNAKASFVWAPLLVMGAVLVFMLAPLGFPFEKVSGSVFRSALSTAYFFA
CCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFTLIILMAMNKVRSLSDGISVYMKGMGNMMQVAIILILAWTLSSVGKELGAAAYIAEQA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QNGFPYWLVPAVSFLLAAIISFATGSSWGTFAIMMHLVIPTAITIDAPMFVCIGAVLSGG
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHCCC
LFGDHCSPISETTILSSTGAGCDQFEHFKTQLPYALLNGGIALVSFLIAGIFDNPLIFIL
CCCCCCCCCCHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
ALIAQVTLVVTLAKLTPENMFNKSKLVAGNQLG
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]