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The map label for this gene is ygjI [H]

Identifier: 59713528

GI number: 59713528

Start: 383125

End: 384555

Strand: Reverse

Name: ygjI [H]

Synonym: VF_A0345

Alternate gene names: 59713528

Gene position: 384555-383125 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59713529

Following gene: 59713524

Centisome position: 28.91

GC content: 39.06

Gene sequence:

>1431_bases
ATGTCTACATCAACTCGTGGCACGATAGGCAAATTCGCCTTACTGTCTATGACTTTTGCTGCAGTTTATAGCTTCAATAA
TATCATTAACAACAATATTGAAATCGGGCTATCTTCTGCACCCATGTTCTTCTTAGCTACCCTCTTCTATTTTGTTCCAT
TCTGTTTAATCGTAGCCGAATTTGTATCTTTAAATAAAAACTCAGAAGCCGGCGTATACGCTTGGGTAAAAAGCTCATTA
GGCGGTCGTTGGGCTTTCATTACCGCTTATACTTATTGGTTTGTTAACCTATTTTTCTTCACCTCACTTCTACCAAGAAT
CATCGCTTATGCCTCTTATGCATTCTTAGGGTTTGAATACATATTTACTCCACTAACTACGGCAGTATTAAGTACCTTAT
TATTTGCAGTAGCGACTCATGTATCCAATAACGGTGCAAAATTATTAGGCCCAATTACTTCTTTAACCTCATCATTAATG
CTTCTGCTTACTCTGTCTTACATTCTATTATCAGGTGGAGCATTAATTGGCGGTATTGAACCTGCAGATCCGATTACCAT
TGAAGCAATGACTCCATCATTTAACTGGGCATTCCTTGGTGTAATCACATGGATCTTCATGGCGGCTGGCGGTGCTGAAT
CGGTAGCGGTTTACGTTAACGACATCAAAGGTGGTCATAAGTCTTTCGTTAAAGTTATCATCATCGCAGGTATCTTTATC
GGTGCGCTTTACTCTGTTGGCTCTATCTTAGCGAACGTATTTGTACCTCGTGAAGTTCTTAAGTTTACTGGTGGTTCAGT
TCAAGTATTTGAAGGTTTAGCAAGACACTTTGGTTTATCTGAAATCTTAATGAATCGCTTTGTTGGTGTGGTTTCATTTA
CAGCAATGCTTGGCTCGCTACTAATGTGGACTGCAACACCAGTTAAAATCTTCTTCTCTGAAATTCCAAAAGGTATTTTT
GGTGAAAAAACAGTAGCTTTAAACAAACAAGGTGTTCCAGAACGTGCTGCATGGATTCAATTCTTAATCGTAATTCCACT
GATGTTCATCCCAACATTGGCATCAGATACGGTACAAGACTTAATGAGTACTATCATTAACATGACAGCGGCGGCTTCTA
TGCTTCCACCACTGTTCATCATGATTGCTTACTTAAACCTACGTTTAAAACTGGATCACCTAGAGCGTGATTTCAGAATG
GGCTCTCGCTTTACTGGTTTAGTCGTAGTTTCTATTCTTATTAGTATTTTTACGGTTGGTTTCTTTGCTTCAACCTTCCC
AACAGGTGCTGACATTATGACTATCATTTTCTACAACGTTGGTGGCATCGTAATCTTCCTTGGGTTTGCATGGTGGAAAT
ACAGCCAATATGAAAAATCGCTAACAAAAGAACAGCTAATTGAAGAATCAAAAGCGGCCGTTCAACAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATTGGTTCCAACCATGACCAAATCCCTCCACACCAATACCATTACTTATATAATAAATGGATTGGTATCCCTACAATAT
GTGATTCATCGGAGTACCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAATACCTTAGCACCTAAAGATCCGTGAATAATATTCTCGGATCTTTTTTCATTTATGCGCCTTTTGTTTTAATCACGC
ATTATGGAATGAAAATTATC

Product: transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 476; Mature: 475

Protein sequence:

>476_residues
MSTSTRGTIGKFALLSMTFAAVYSFNNIINNNIEIGLSSAPMFFLATLFYFVPFCLIVAEFVSLNKNSEAGVYAWVKSSL
GGRWAFITAYTYWFVNLFFFTSLLPRIIAYASYAFLGFEYIFTPLTTAVLSTLLFAVATHVSNNGAKLLGPITSLTSSLM
LLLTLSYILLSGGALIGGIEPADPITIEAMTPSFNWAFLGVITWIFMAAGGAESVAVYVNDIKGGHKSFVKVIIIAGIFI
GALYSVGSILANVFVPREVLKFTGGSVQVFEGLARHFGLSEILMNRFVGVVSFTAMLGSLLMWTATPVKIFFSEIPKGIF
GEKTVALNKQGVPERAAWIQFLIVIPLMFIPTLASDTVQDLMSTIINMTAAASMLPPLFIMIAYLNLRLKLDHLERDFRM
GSRFTGLVVVSILISIFTVGFFASTFPTGADIMTIIFYNVGGIVIFLGFAWWKYSQYEKSLTKEQLIEESKAAVQQ

Sequences:

>Translated_476_residues
MSTSTRGTIGKFALLSMTFAAVYSFNNIINNNIEIGLSSAPMFFLATLFYFVPFCLIVAEFVSLNKNSEAGVYAWVKSSL
GGRWAFITAYTYWFVNLFFFTSLLPRIIAYASYAFLGFEYIFTPLTTAVLSTLLFAVATHVSNNGAKLLGPITSLTSSLM
LLLTLSYILLSGGALIGGIEPADPITIEAMTPSFNWAFLGVITWIFMAAGGAESVAVYVNDIKGGHKSFVKVIIIAGIFI
GALYSVGSILANVFVPREVLKFTGGSVQVFEGLARHFGLSEILMNRFVGVVSFTAMLGSLLMWTATPVKIFFSEIPKGIF
GEKTVALNKQGVPERAAWIQFLIVIPLMFIPTLASDTVQDLMSTIINMTAAASMLPPLFIMIAYLNLRLKLDHLERDFRM
GSRFTGLVVVSILISIFTVGFFASTFPTGADIMTIIFYNVGGIVIFLGFAWWKYSQYEKSLTKEQLIEESKAAVQQ
>Mature_475_residues
STSTRGTIGKFALLSMTFAAVYSFNNIINNNIEIGLSSAPMFFLATLFYFVPFCLIVAEFVSLNKNSEAGVYAWVKSSLG
GRWAFITAYTYWFVNLFFFTSLLPRIIAYASYAFLGFEYIFTPLTTAVLSTLLFAVATHVSNNGAKLLGPITSLTSSLML
LLTLSYILLSGGALIGGIEPADPITIEAMTPSFNWAFLGVITWIFMAAGGAESVAVYVNDIKGGHKSFVKVIIIAGIFIG
ALYSVGSILANVFVPREVLKFTGGSVQVFEGLARHFGLSEILMNRFVGVVSFTAMLGSLLMWTATPVKIFFSEIPKGIFG
EKTVALNKQGVPERAAWIQFLIVIPLMFIPTLASDTVQDLMSTIINMTAAASMLPPLFIMIAYLNLRLKLDHLERDFRMG
SRFTGLVVVSILISIFTVGFFASTFPTGADIMTIIFYNVGGIVIFLGFAWWKYSQYEKSLTKEQLIEESKAAVQQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the amino acid-polyamine-organocation (APC) superfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI48994921, Length=474, Percent_Identity=80.379746835443, Blast_Score=745, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI87081798, Length=377, Percent_Identity=23.342175066313, Blast_Score=107, Evalue=2e-24,
Organism=Escherichia coli, GI87082380, Length=428, Percent_Identity=25.2336448598131, Blast_Score=97, Evalue=3e-21,
Organism=Escherichia coli, GI1787768, Length=430, Percent_Identity=23.2558139534884, Blast_Score=69, Evalue=6e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004841
- InterPro:   IPR002293 [H]

Pfam domain/function: PF00324 AA_permease [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52181; Mature: 52050

Theoretical pI: Translated: 9.04; Mature: 9.04

Prosite motif: PS00589 PTS_HPR_SER

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSTSTRGTIGKFALLSMTFAAVYSFNNIINNNIEIGLSSAPMFFLATLFYFVPFCLIVAE
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVSLNKNSEAGVYAWVKSSLGGRWAFITAYTYWFVNLFFFTSLLPRIIAYASYAFLGFEY
HHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFTPLTTAVLSTLLFAVATHVSNNGAKLLGPITSLTSSLMLLLTLSYILLSGGALIGGIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCC
PADPITIEAMTPSFNWAFLGVITWIFMAAGGAESVAVYVNDIKGGHKSFVKVIIIAGIFI
CCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GALYSVGSILANVFVPREVLKFTGGSVQVFEGLARHFGLSEILMNRFVGVVSFTAMLGSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMWTATPVKIFFSEIPKGIFGEKTVALNKQGVPERAAWIQFLIVIPLMFIPTLASDTVQD
HHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMSTIINMTAAASMLPPLFIMIAYLNLRLKLDHLERDFRMGSRFTGLVVVSILISIFTVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFASTFPTGADIMTIIFYNVGGIVIFLGFAWWKYSQYEKSLTKEQLIEESKAAVQQ
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
STSTRGTIGKFALLSMTFAAVYSFNNIINNNIEIGLSSAPMFFLATLFYFVPFCLIVAE
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVSLNKNSEAGVYAWVKSSLGGRWAFITAYTYWFVNLFFFTSLLPRIIAYASYAFLGFEY
HHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFTPLTTAVLSTLLFAVATHVSNNGAKLLGPITSLTSSLMLLLTLSYILLSGGALIGGIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCC
PADPITIEAMTPSFNWAFLGVITWIFMAAGGAESVAVYVNDIKGGHKSFVKVIIIAGIFI
CCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GALYSVGSILANVFVPREVLKFTGGSVQVFEGLARHFGLSEILMNRFVGVVSFTAMLGSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMWTATPVKIFFSEIPKGIFGEKTVALNKQGVPERAAWIQFLIVIPLMFIPTLASDTVQD
HHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMSTIINMTAAASMLPPLFIMIAYLNLRLKLDHLERDFRMGSRFTGLVVVSILISIFTVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFASTFPTGADIMTIIFYNVGGIVIFLGFAWWKYSQYEKSLTKEQLIEESKAAVQQ
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9278503 [H]