| Definition | Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006840 |
| Length | 2,897,536 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is glnE [H]
Identifier: 59712842
GI number: 59712842
Start: 2508016
End: 2510871
Strand: Reverse
Name: glnE [H]
Synonym: VF_2235
Alternate gene names: 59712842
Gene position: 2510871-2508016 (Counterclockwise)
Preceding gene: 59712843
Following gene: 59712841
Centisome position: 86.66
GC content: 39.99
Gene sequence:
>2856_bases ATGTCTTTGCCATCATCTCTACTTTCTCTCGCTGAACATCGTTTGCAAGAGCTTACATATCGTGACCATATTCAATCGTG GCCTGAAACGTTTAAAACTCAATTAATGATAGCTTTGGGGTGCAGTGACTTTCTTCATGAGGCGTTTGAACAAGATGAAT ATCTTTGTCAGCATTTTCCACGTTTATTCGAGGTGGAGTGCCGTGGTGAACAATATCGAGAGTTATTACAAGCTCAGTTA GTGAAATGTACCGATGAAAATAGCTTAATGCGGGAGCTTCGCTATTTTCGCCGTCGAGAGATGAGTTACATTGCATGGCT GGATTTTAATTTAGCTCATAATGAGATATCCAATTGGTCATTAGAGCAAAGCTTATCTCACCTATCTTTACTGGCTGAAA CCCTAATTGTTGAGTCGTATCAATGGCTATATAAGCAAGCGTGTATTGATTGGGGAACACCTAAGAACGCGAAAGGTGAA GAGCAACCCATGCTCATTATCGGTATGGGGAAATTGGGTGGTGGAGAGTTGAATTTCTCATCCGATATAGATTTGATTTT TACGTATCCTGAAAACGGTGAGACAGAAGGCGCTCGTCGTAGCATTGCTAATGCGCAATTTTTTACTCGATTAGGGCAAA AGCTGATTAAAGCATTAGATCAAAAAACATTTGATGGTTTCTGTTATCGAGTTGATTTACGACTTCGTCCATTTGGAGAT AGTGGACCATTAGTCATGAGTTACGCTGCGTTGGAAGACTATTATCAAGAGCAAGGGCGTGACTGGGAACGTTATGCAAT GATAAAAGCGCGAGTAATGGGTAAAGAAACGTATAGCCATTATCAAGAACTTCGCCAAATGCTGCGTCCCTTTGTTTTCC GTCGTTATATTGATTTTGGTGCCATTCAAGCATTACGTCGAATGAAATCCATGATCACCAGTGAAGTTCGCCGTCGTGGA TTAAGTAACAATATTAAATTAGGTGCAGGTGGTATTAGAGAAGTTGAGTTCATTGCTCAAGTATTCCAACTCATTCGTGG TGGGCGTGAACCATCATTACGTGGTCGTGGGTTATTAGAAACCTTATCTGCGATTAAAGAATTAGGACAACTTTCTGTTT CAGATGTTGATACCTTGATGGCGGGATATTGCTTTTTAAGACGTTTAGAAAATTTGTTACAAGCCATCAATGACAAACAA ACGCAGACGCTACCTGATGATGAAAGAGATCAAATACGTTTAGCTTTTGCGATGGGAATGCAAGATTGGTCAACCTTGTA TGCAGAAATACAGCAACATATGACATCAATTCATGCGGTGTTTCATGACCTGATTGGCGATGACGACGAGTCAGATAACA GTACCGATTCATCCTACCGTGAGTTATGGGATATGTCTCATAACAAAGAAGTACTAGAACACATTCTCGAAGAGCTCAAT CCAGAGCAATCAGTACAACTCACTAATCAGATTATTGACTTTAAAGGTGAGCTTAAAAAGAAAACCTTAGGGCCAAGAGG GCGAGATGCGATTACGCATTTAATGCCGAAATTGTTCAATATTGTGATTAAGCGAGAAGACGCAGCAGATACTTTACCTC GCTTAACTAAATTGATTCAGGCCATTGCAACTAGAACAACGTACCTTGAACTATTGGATGAACATAATGGAGCATTGCAG CATTTAGTTCGTTTGTGTTCAGCAAGTCCAATGGTTGCAGAGCAATTAACGCGATATCCAATATTATTAGATGAACTATT GGATATTAACCAACTCTATAATCCTATTGAATTAAGCCAATATAAAGTCGAATTGCGCGAGTTTTTAGCTCGTATTCCTG AAGATGATATGGAACAGCAAATGGAAGCGTTGCGTCAGTTTAAGCAAATAGGCTTGCTTAGGATTGCTGCATCAGACATT GCTGGTGGATTATCGTTAATGAAAGTGAGTGATCACTTAACTTATCTATCAGAAGCAATAGTAGAAGCGGTTGTAAACCA AGCTTGGTTACAAGTAACAGAGAAGTTTGGTGAACCCTCTCATTTAGAAGGTAGAGATAGTAAAGGTTTTGCGGTTATTG GTTATGGTAAAGTGGGCGGATGGGAGTTAGGTTATAACTCCGATCTCGATATCGTATTCATGCACGATTGTGATGTGAAT ACGTATACCAATGGTAAAAAAGAGATTGATGGACGTCAGTTTTATCTACGATTAGCGCAGCGCATTATTCATATCTTTTC AGTTCGTACCGCATCAGGCATTTTGTATGAAGTGGATACTCGTTTGCGTCCATCTGGCGCATCGGGTCTACTGGTTAGTA CGAGTGAGGCGTTTGATGAATATCAAAGAGAAGATGCGTGGACATGGGAGCATCAAGCTCTGGTTCGAGCTCGTATGATT TATGGCGATGAACAACTGCAGCAGGTTTTTAAAGTCACGCGTCATGAGATTTTGTGCTTAGAGCGAGAAGATGAAAAGCT AAAACAAGATGTTCTTGATATGCGAGAAAAAATGCGTGATCACCTTGGTGGGAAAAAAGCACATCGCTTCATGATTAAGC AAGATGCTGGGGGAATTACAGATATTGAGTTTTTGGCACAATATCTTGTTTTGAAATACAGTCATACGCTTCCAAAGTTA ACCCATTGGTCAGATAACGTTAGAATATTTGAAAGTTTTGCTCAGCAAGATGTGATGGACAATGGTACTGCAAATGAGCT CATTGAGGCTTATTGCACATTAAGAAATGAAATACATCACCGTAATTTACTTGGTTTTGATGCCGACGTTGAAGACGATA AATTCAGTGGTGAAAGAAACGCAGTAATAAAAGCTTGGGAGCATTGGCTTAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTACTAATCCAAATAAGTATATGGCTATTTTGCTTGTTAACATAACCGATTCATTTATTCGATTGAATTGGAATGAATGG AATTTTCGATAAGGAATATC
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGTTAACGTTAGGTTTAAAACGACTAAGTTGGCGTAGAACTTGCGTAAATGCTACCATTTGTAACAGTAGATTTTTTAT AAATAGCTCGAACCAATAAT
Product: bifunctional glutamine-synthetase adenylyltransferase/deadenyltransferase
Products: NA
Alternate protein names: Glutamine-synthetase adenylyltransferase; ATase; [Glutamate--ammonia-ligase] adenylyltransferase [H]
Number of amino acids: Translated: 951; Mature: 950
Protein sequence:
>951_residues MSLPSSLLSLAEHRLQELTYRDHIQSWPETFKTQLMIALGCSDFLHEAFEQDEYLCQHFPRLFEVECRGEQYRELLQAQL VKCTDENSLMRELRYFRRREMSYIAWLDFNLAHNEISNWSLEQSLSHLSLLAETLIVESYQWLYKQACIDWGTPKNAKGE EQPMLIIGMGKLGGGELNFSSDIDLIFTYPENGETEGARRSIANAQFFTRLGQKLIKALDQKTFDGFCYRVDLRLRPFGD SGPLVMSYAALEDYYQEQGRDWERYAMIKARVMGKETYSHYQELRQMLRPFVFRRYIDFGAIQALRRMKSMITSEVRRRG LSNNIKLGAGGIREVEFIAQVFQLIRGGREPSLRGRGLLETLSAIKELGQLSVSDVDTLMAGYCFLRRLENLLQAINDKQ TQTLPDDERDQIRLAFAMGMQDWSTLYAEIQQHMTSIHAVFHDLIGDDDESDNSTDSSYRELWDMSHNKEVLEHILEELN PEQSVQLTNQIIDFKGELKKKTLGPRGRDAITHLMPKLFNIVIKREDAADTLPRLTKLIQAIATRTTYLELLDEHNGALQ HLVRLCSASPMVAEQLTRYPILLDELLDINQLYNPIELSQYKVELREFLARIPEDDMEQQMEALRQFKQIGLLRIAASDI AGGLSLMKVSDHLTYLSEAIVEAVVNQAWLQVTEKFGEPSHLEGRDSKGFAVIGYGKVGGWELGYNSDLDIVFMHDCDVN TYTNGKKEIDGRQFYLRLAQRIIHIFSVRTASGILYEVDTRLRPSGASGLLVSTSEAFDEYQREDAWTWEHQALVRARMI YGDEQLQQVFKVTRHEILCLEREDEKLKQDVLDMREKMRDHLGGKKAHRFMIKQDAGGITDIEFLAQYLVLKYSHTLPKL THWSDNVRIFESFAQQDVMDNGTANELIEAYCTLRNEIHHRNLLGFDADVEDDKFSGERNAVIKAWEHWLK
Sequences:
>Translated_951_residues MSLPSSLLSLAEHRLQELTYRDHIQSWPETFKTQLMIALGCSDFLHEAFEQDEYLCQHFPRLFEVECRGEQYRELLQAQL VKCTDENSLMRELRYFRRREMSYIAWLDFNLAHNEISNWSLEQSLSHLSLLAETLIVESYQWLYKQACIDWGTPKNAKGE EQPMLIIGMGKLGGGELNFSSDIDLIFTYPENGETEGARRSIANAQFFTRLGQKLIKALDQKTFDGFCYRVDLRLRPFGD SGPLVMSYAALEDYYQEQGRDWERYAMIKARVMGKETYSHYQELRQMLRPFVFRRYIDFGAIQALRRMKSMITSEVRRRG LSNNIKLGAGGIREVEFIAQVFQLIRGGREPSLRGRGLLETLSAIKELGQLSVSDVDTLMAGYCFLRRLENLLQAINDKQ TQTLPDDERDQIRLAFAMGMQDWSTLYAEIQQHMTSIHAVFHDLIGDDDESDNSTDSSYRELWDMSHNKEVLEHILEELN PEQSVQLTNQIIDFKGELKKKTLGPRGRDAITHLMPKLFNIVIKREDAADTLPRLTKLIQAIATRTTYLELLDEHNGALQ HLVRLCSASPMVAEQLTRYPILLDELLDINQLYNPIELSQYKVELREFLARIPEDDMEQQMEALRQFKQIGLLRIAASDI AGGLSLMKVSDHLTYLSEAIVEAVVNQAWLQVTEKFGEPSHLEGRDSKGFAVIGYGKVGGWELGYNSDLDIVFMHDCDVN TYTNGKKEIDGRQFYLRLAQRIIHIFSVRTASGILYEVDTRLRPSGASGLLVSTSEAFDEYQREDAWTWEHQALVRARMI YGDEQLQQVFKVTRHEILCLEREDEKLKQDVLDMREKMRDHLGGKKAHRFMIKQDAGGITDIEFLAQYLVLKYSHTLPKL THWSDNVRIFESFAQQDVMDNGTANELIEAYCTLRNEIHHRNLLGFDADVEDDKFSGERNAVIKAWEHWLK >Mature_950_residues SLPSSLLSLAEHRLQELTYRDHIQSWPETFKTQLMIALGCSDFLHEAFEQDEYLCQHFPRLFEVECRGEQYRELLQAQLV KCTDENSLMRELRYFRRREMSYIAWLDFNLAHNEISNWSLEQSLSHLSLLAETLIVESYQWLYKQACIDWGTPKNAKGEE QPMLIIGMGKLGGGELNFSSDIDLIFTYPENGETEGARRSIANAQFFTRLGQKLIKALDQKTFDGFCYRVDLRLRPFGDS GPLVMSYAALEDYYQEQGRDWERYAMIKARVMGKETYSHYQELRQMLRPFVFRRYIDFGAIQALRRMKSMITSEVRRRGL SNNIKLGAGGIREVEFIAQVFQLIRGGREPSLRGRGLLETLSAIKELGQLSVSDVDTLMAGYCFLRRLENLLQAINDKQT QTLPDDERDQIRLAFAMGMQDWSTLYAEIQQHMTSIHAVFHDLIGDDDESDNSTDSSYRELWDMSHNKEVLEHILEELNP EQSVQLTNQIIDFKGELKKKTLGPRGRDAITHLMPKLFNIVIKREDAADTLPRLTKLIQAIATRTTYLELLDEHNGALQH LVRLCSASPMVAEQLTRYPILLDELLDINQLYNPIELSQYKVELREFLARIPEDDMEQQMEALRQFKQIGLLRIAASDIA GGLSLMKVSDHLTYLSEAIVEAVVNQAWLQVTEKFGEPSHLEGRDSKGFAVIGYGKVGGWELGYNSDLDIVFMHDCDVNT YTNGKKEIDGRQFYLRLAQRIIHIFSVRTASGILYEVDTRLRPSGASGLLVSTSEAFDEYQREDAWTWEHQALVRARMIY GDEQLQQVFKVTRHEILCLEREDEKLKQDVLDMREKMRDHLGGKKAHRFMIKQDAGGITDIEFLAQYLVLKYSHTLPKLT HWSDNVRIFESFAQQDVMDNGTANELIEAYCTLRNEIHHRNLLGFDADVEDDKFSGERNAVIKAWEHWLK
Specific function: Adenylation and deadenylation of glutamate--ammonia ligase [H]
COG id: COG1391
COG function: function code OT; Glutamine synthetase adenylyltransferase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the glnE family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789433, Length=935, Percent_Identity=58.6096256684492, Blast_Score=1086, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR023057 - InterPro: IPR005190 - InterPro: IPR013546 [H]
Pfam domain/function: PF08335 GlnD_UR_UTase; PF03710 GlnE [H]
EC number: =2.7.7.42 [H]
Molecular weight: Translated: 110016; Mature: 109884
Theoretical pI: Translated: 5.28; Mature: 5.28
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSLPSSLLSLAEHRLQELTYRDHIQSWPETFKTQLMIALGCSDFLHEAFEQDEYLCQHFP CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCC RLFEVECRGEQYRELLQAQLVKCTDENSLMRELRYFRRREMSYIAWLDFNLAHNEISNWS HHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHCCCC LEQSLSHLSLLAETLIVESYQWLYKQACIDWGTPKNAKGEEQPMLIIGMGKLGGGELNFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCC SDIDLIFTYPENGETEGARRSIANAQFFTRLGQKLIKALDQKTFDGFCYRVDLRLRPFGD CCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCC SGPLVMSYAALEDYYQEQGRDWERYAMIKARVMGKETYSHYQELRQMLRPFVFRRYIDFG CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIQALRRMKSMITSEVRRRGLSNNIKLGAGGIREVEFIAQVFQLIRGGREPSLRGRGLLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH TLSAIKELGQLSVSDVDTLMAGYCFLRRLENLLQAINDKQTQTLPDDERDQIRLAFAMGM HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCH QDWSTLYAEIQQHMTSIHAVFHDLIGDDDESDNSTDSSYRELWDMSHNKEVLEHILEELN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCC PEQSVQLTNQIIDFKGELKKKTLGPRGRDAITHLMPKLFNIVIKREDAADTLPRLTKLIQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH AIATRTTYLELLDEHNGALQHLVRLCSASPMVAEQLTRYPILLDELLDINQLYNPIELSQ HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH YKVELREFLARIPEDDMEQQMEALRQFKQIGLLRIAASDIAGGLSLMKVSDHLTYLSEAI HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VEAVVNQAWLQVTEKFGEPSHLEGRDSKGFAVIGYGKVGGWELGYNSDLDIVFMHDCDVN HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEECCCCCCCCEEEEECCCCC TYTNGKKEIDGRQFYLRLAQRIIHIFSVRTASGILYEVDTRLRPSGASGLLVSTSEAFDE CCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEECHHHHHH YQREDAWTWEHQALVRARMIYGDEQLQQVFKVTRHEILCLEREDEKLKQDVLDMREKMRD HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH HLGGKKAHRFMIKQDAGGITDIEFLAQYLVLKYSHTLPKLTHWSDNVRIFESFAQQDVMD HCCCHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHC NGTANELIEAYCTLRNEIHHRNLLGFDADVEDDKFSGERNAVIKAWEHWLK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SLPSSLLSLAEHRLQELTYRDHIQSWPETFKTQLMIALGCSDFLHEAFEQDEYLCQHFP CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCC RLFEVECRGEQYRELLQAQLVKCTDENSLMRELRYFRRREMSYIAWLDFNLAHNEISNWS HHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHCCCC LEQSLSHLSLLAETLIVESYQWLYKQACIDWGTPKNAKGEEQPMLIIGMGKLGGGELNFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCC SDIDLIFTYPENGETEGARRSIANAQFFTRLGQKLIKALDQKTFDGFCYRVDLRLRPFGD CCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCC SGPLVMSYAALEDYYQEQGRDWERYAMIKARVMGKETYSHYQELRQMLRPFVFRRYIDFG CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIQALRRMKSMITSEVRRRGLSNNIKLGAGGIREVEFIAQVFQLIRGGREPSLRGRGLLE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH TLSAIKELGQLSVSDVDTLMAGYCFLRRLENLLQAINDKQTQTLPDDERDQIRLAFAMGM HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCH QDWSTLYAEIQQHMTSIHAVFHDLIGDDDESDNSTDSSYRELWDMSHNKEVLEHILEELN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCC PEQSVQLTNQIIDFKGELKKKTLGPRGRDAITHLMPKLFNIVIKREDAADTLPRLTKLIQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH AIATRTTYLELLDEHNGALQHLVRLCSASPMVAEQLTRYPILLDELLDINQLYNPIELSQ HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH YKVELREFLARIPEDDMEQQMEALRQFKQIGLLRIAASDIAGGLSLMKVSDHLTYLSEAI HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH VEAVVNQAWLQVTEKFGEPSHLEGRDSKGFAVIGYGKVGGWELGYNSDLDIVFMHDCDVN HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEECCCCCCCCEEEEECCCCC TYTNGKKEIDGRQFYLRLAQRIIHIFSVRTASGILYEVDTRLRPSGASGLLVSTSEAFDE CCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEECHHHHHH YQREDAWTWEHQALVRARMIYGDEQLQQVFKVTRHEILCLEREDEKLKQDVLDMREKMRD HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH HLGGKKAHRFMIKQDAGGITDIEFLAQYLVLKYSHTLPKLTHWSDNVRIFESFAQQDVMD HCCCHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHC NGTANELIEAYCTLRNEIHHRNLLGFDADVEDDKFSGERNAVIKAWEHWLK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 12620739 [H]