| Definition | Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006840 |
| Length | 2,897,536 |
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The map label for this gene is 59711986
Identifier: 59711986
GI number: 59711986
Start: 1525111
End: 1527999
Strand: Reverse
Name: 59711986
Synonym: VF_1379
Alternate gene names: NA
Gene position: 1527999-1525111 (Counterclockwise)
Preceding gene: 59711987
Following gene: 59711984
Centisome position: 52.73
GC content: 37.59
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TTAACGTTTTTATATTGTTTCACGGCCTCAAAAGTAAGTTTAACTGACTCCATTGTCATCAGATTTACTGGCGTATCAAT ATAAGCAACAGAAAATTGAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 962; Mature: 962
Protein sequence:
>962_residues MEKEIKVKKRTVSSLLGMSALSFSMLSLPCSANISAVPVVGGIVNSSEILKHQINDSITYTTTTVRDAAIFTIAGLTLDA YILSLPLDSSVKKRVIAQLSNPYYAIPLGHFLYTFVDKYGNMDNEDAFKAYLKTKYSEEELQRFSHSLFTLNELQKEEDA SKPSEGHHQGLKVDRKFIANMVVVYDELVQIGEWKDLNTLPDRYTYLSDSPEDKAIIDKIQPIILSGLEKSVLGMDKGEM RSALELIIADGKPENKNKVNNKAEALTITLIDFVRLNVLKSYRQFVYQEQRQIALNSWLQETFKDNPDTLVAYLASRQQR RLAVQVTVDGLQQGLIEGLVTPTEKTFLKQIYQDHLNRNEYKPQGEPTSQPEHEQQLTFLKTMIEKGYQDPNYLPFFSQL YQEYEKSIVNVGISSTPTISVRNLPIIKTGAKVSGEGGTGIPNFHFVDRQDDRAYYFFGNDALQLDRLMDANKVQTMFDR LDYLVTLNCNAQYDWNAHTTYDGLVNLGAGESLRDFGEKRCLRELTQRAKTEKTITEMRAELIEEIGIYQNIFVLDIYSK LTQKWKIQQELETLSKLEQKGMPDYALIYNPWPDHFAHFTGPFSDEILMPTGELNRLDYWLTQISDVYKSANVYDRTLWG MAGDHGLAPVYYSLNPEKQVFETLQAELDYPLVIKKISSDEGEGPKITNALNYESNKEVDVVVASTAGGNFMMDFFNSQQ GWKVQPTYSELTTWIPVNAPEDQPINIVNEIASRLKESLDYLVVRETPCSLDECQIRVIGFKDDIRVDELISKKGNRLFY QPVAGSSQLLEVDVLNIYKPQLNETEQKQYDELYQRCMISADANEDSSWCTEQEWRTLTSFTARPDVVNQLAYLYEEDRA GTINLFPKFGVGFNTKVPGRHAGEHYLEKDAFLGFWGKPIKNKMAPLIIEENGSLAPTLYQYLTEEKVIKNENGWGYPSL LN
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 109740; Mature: 109740
Theoretical pI: Translated: 4.79; Mature: 4.79
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEKEIKVKKRTVSSLLGMSALSFSMLSLPCSANISAVPVVGGIVNSSEILKHQINDSITY CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCEEE TTTTVRDAAIFTIAGLTLDAYILSLPLDSSVKKRVIAQLSNPYYAIPLGHFLYTFVDKYG EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHC NMDNEDAFKAYLKTKYSEEELQRFSHSLFTLNELQKEEDASKPSEGHHQGLKVDRKFIAN CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH MVVVYDELVQIGEWKDLNTLPDRYTYLSDSPEDKAIIDKIQPIILSGLEKSVLGMDKGEM HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH RSALELIIADGKPENKNKVNNKAEALTITLIDFVRLNVLKSYRQFVYQEQRQIALNSWLQ HHHHHEEEECCCCCCCHHCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETFKDNPDTLVAYLASRQQRRLAVQVTVDGLQQGLIEGLVTPTEKTFLKQIYQDHLNRNE HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC YKPQGEPTSQPEHEQQLTFLKTMIEKGYQDPNYLPFFSQLYQEYEKSIVNVGISSTPTIS CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEE VRNLPIIKTGAKVSGEGGTGIPNFHFVDRQDDRAYYFFGNDALQLDRLMDANKVQTMFDR ECCCEEEECCCEECCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHH LDYLVTLNCNAQYDWNAHTTYDGLVNLGAGESLRDFGEKRCLRELTQRAKTEKTITEMRA CCEEEEEECCCEECCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELIEEIGIYQNIFVLDIYSKLTQKWKIQQELETLSKLEQKGMPDYALIYNPWPDHFAHFT HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHCC GPFSDEILMPTGELNRLDYWLTQISDVYKSANVYDRTLWGMAGDHGLAPVYYSLNPEKQV CCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHH FETLQAELDYPLVIKKISSDEGEGPKITNALNYESNKEVDVVVASTAGGNFMMDFFNSQQ HHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHCCCC GWKVQPTYSELTTWIPVNAPEDQPINIVNEIASRLKESLDYLVVRETPCSLDECQIRVIG CCEECCCHHHHCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEE FKDDIRVDELISKKGNRLFYQPVAGSSQLLEVDVLNIYKPQLNETEQKQYDELYQRCMIS CCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEC ADANEDSSWCTEQEWRTLTSFTARPDVVNQLAYLYEEDRAGTINLFPKFGVGFNTKVPGR CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCC HAGEHYLEKDAFLGFWGKPIKNKMAPLIIEENGSLAPTLYQYLTEEKVIKNENGWGYPSL CCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC LN CC >Mature Secondary Structure MEKEIKVKKRTVSSLLGMSALSFSMLSLPCSANISAVPVVGGIVNSSEILKHQINDSITY CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCEEE TTTTVRDAAIFTIAGLTLDAYILSLPLDSSVKKRVIAQLSNPYYAIPLGHFLYTFVDKYG EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHC NMDNEDAFKAYLKTKYSEEELQRFSHSLFTLNELQKEEDASKPSEGHHQGLKVDRKFIAN CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH MVVVYDELVQIGEWKDLNTLPDRYTYLSDSPEDKAIIDKIQPIILSGLEKSVLGMDKGEM HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH RSALELIIADGKPENKNKVNNKAEALTITLIDFVRLNVLKSYRQFVYQEQRQIALNSWLQ HHHHHEEEECCCCCCCHHCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETFKDNPDTLVAYLASRQQRRLAVQVTVDGLQQGLIEGLVTPTEKTFLKQIYQDHLNRNE HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC YKPQGEPTSQPEHEQQLTFLKTMIEKGYQDPNYLPFFSQLYQEYEKSIVNVGISSTPTIS CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEE VRNLPIIKTGAKVSGEGGTGIPNFHFVDRQDDRAYYFFGNDALQLDRLMDANKVQTMFDR ECCCEEEECCCEECCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHH LDYLVTLNCNAQYDWNAHTTYDGLVNLGAGESLRDFGEKRCLRELTQRAKTEKTITEMRA CCEEEEEECCCEECCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELIEEIGIYQNIFVLDIYSKLTQKWKIQQELETLSKLEQKGMPDYALIYNPWPDHFAHFT HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHCC GPFSDEILMPTGELNRLDYWLTQISDVYKSANVYDRTLWGMAGDHGLAPVYYSLNPEKQV CCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHH FETLQAELDYPLVIKKISSDEGEGPKITNALNYESNKEVDVVVASTAGGNFMMDFFNSQQ HHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHCCCC GWKVQPTYSELTTWIPVNAPEDQPINIVNEIASRLKESLDYLVVRETPCSLDECQIRVIG CCEECCCHHHHCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEE FKDDIRVDELISKKGNRLFYQPVAGSSQLLEVDVLNIYKPQLNETEQKQYDELYQRCMIS CCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEC ADANEDSSWCTEQEWRTLTSFTARPDVVNQLAYLYEEDRAGTINLFPKFGVGFNTKVPGR CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCC HAGEHYLEKDAFLGFWGKPIKNKMAPLIIEENGSLAPTLYQYLTEEKVIKNENGWGYPSL CCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC LN CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA