Definition Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome.
Accession NC_006840
Length 2,897,536

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 59711986

Identifier: 59711986

GI number: 59711986

Start: 1525111

End: 1527999

Strand: Reverse

Name: 59711986

Synonym: VF_1379

Alternate gene names: NA

Gene position: 1527999-1525111 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59711987

Following gene: 59711984

Centisome position: 52.73

GC content: 37.59

Gene sequence:

>2889_bases
ATGGAAAAGGAAATTAAAGTGAAAAAAAGAACGGTGTCGTCGTTATTAGGAATGAGTGCGTTATCATTTTCTATGTTGAG
CTTGCCATGTTCCGCAAATATCAGTGCAGTGCCTGTTGTTGGCGGTATTGTTAATTCAAGCGAGATCTTAAAACATCAAA
TCAATGATTCTATTACTTATACGACAACCACCGTTCGTGACGCTGCTATTTTTACTATTGCAGGCCTTACGCTAGATGCT
TACATTTTATCTCTACCGCTTGATAGTAGCGTCAAAAAACGCGTTATTGCACAATTATCTAATCCTTATTACGCCATTCC
TCTTGGGCATTTTCTTTATACTTTCGTTGATAAATACGGAAACATGGATAATGAAGATGCGTTTAAAGCTTATTTAAAAA
CTAAATACAGTGAAGAAGAATTACAGCGTTTTAGCCATTCTTTGTTCACACTTAATGAGCTTCAAAAAGAAGAAGATGCA
TCGAAACCATCAGAAGGACATCATCAAGGATTGAAGGTTGATCGTAAATTTATCGCCAATATGGTAGTGGTTTATGATGA
ATTGGTTCAAATTGGTGAGTGGAAAGATCTTAATACCTTACCGGATCGCTATACGTATCTTTCAGATAGCCCGGAAGACA
AAGCCATTATCGATAAGATTCAGCCAATTATATTATCTGGTTTAGAGAAATCTGTGCTTGGTATGGATAAGGGAGAGATG
CGAAGTGCATTAGAGCTTATTATTGCAGATGGTAAACCCGAGAATAAAAACAAAGTAAATAATAAAGCAGAAGCCCTGAC
CATAACATTGATTGATTTTGTTCGTCTTAACGTGCTGAAATCTTATCGTCAATTTGTGTATCAAGAGCAACGACAAATTG
CATTAAACTCGTGGTTACAAGAAACATTTAAAGACAACCCTGACACCTTAGTTGCATATTTAGCATCACGTCAACAGCGT
CGATTGGCCGTACAAGTTACGGTAGATGGCCTGCAACAAGGACTTATTGAAGGCTTAGTTACACCAACAGAAAAAACGTT
TTTAAAGCAGATATATCAAGACCACTTAAATCGCAATGAATATAAGCCTCAGGGGGAGCCAACTTCTCAACCTGAGCATG
AACAGCAACTTACTTTCTTAAAAACCATGATAGAAAAGGGTTATCAAGACCCAAACTATTTGCCTTTTTTTAGTCAGTTA
TATCAAGAGTATGAAAAGAGCATTGTTAATGTTGGCATTTCATCAACACCTACGATAAGCGTTCGTAATTTACCAATAAT
CAAAACAGGAGCAAAGGTATCTGGCGAGGGAGGAACTGGGATCCCTAATTTCCACTTTGTTGACAGACAAGATGACCGAG
CCTATTACTTTTTTGGTAATGATGCGTTGCAGTTAGATCGATTAATGGATGCAAATAAAGTTCAAACTATGTTTGATCGC
CTAGATTACTTAGTTACGCTCAACTGCAATGCTCAGTATGATTGGAATGCACATACAACTTACGATGGTTTAGTTAATTT
AGGGGCAGGAGAAAGCCTGCGTGATTTTGGGGAAAAACGGTGTTTACGTGAATTAACTCAAAGAGCAAAAACAGAAAAAA
CCATAACAGAAATGAGAGCAGAGCTAATTGAAGAGATTGGCATTTATCAAAATATTTTTGTGTTGGATATTTACAGTAAG
CTCACACAGAAATGGAAGATTCAGCAAGAATTAGAAACGCTCTCTAAGTTAGAGCAAAAAGGGATGCCGGATTACGCTCT
TATTTATAACCCATGGCCAGATCACTTTGCTCATTTTACTGGCCCTTTTAGTGATGAAATATTGATGCCAACGGGGGAGC
TTAACCGCTTGGATTATTGGTTAACGCAAATTTCAGATGTGTATAAATCCGCTAATGTTTATGATCGCACGTTGTGGGGA
ATGGCGGGTGATCATGGTTTGGCTCCAGTTTATTATTCATTAAACCCTGAGAAACAAGTATTTGAAACGCTTCAGGCTGA
GCTAGATTACCCTTTAGTCATTAAGAAAATATCATCGGATGAAGGAGAGGGTCCAAAAATTACGAATGCCTTAAATTATG
AGAGTAATAAAGAGGTTGATGTTGTTGTGGCTTCTACTGCTGGTGGTAATTTTATGATGGACTTTTTTAATTCTCAACAA
GGATGGAAAGTACAACCTACGTATAGCGAACTCACAACATGGATACCCGTTAATGCACCTGAAGATCAACCGATTAATAT
TGTGAATGAAATTGCTTCACGTTTAAAAGAGTCGTTAGATTATTTAGTTGTGAGAGAAACACCTTGTTCGTTAGATGAAT
GTCAGATACGAGTTATTGGATTTAAAGACGACATAAGAGTTGATGAATTGATCTCTAAGAAGGGCAACCGACTGTTTTAT
CAACCTGTTGCTGGCTCATCTCAATTACTTGAGGTCGATGTACTTAATATCTATAAACCACAGTTAAACGAGACTGAACA
AAAGCAATATGATGAACTATACCAACGTTGCATGATCTCAGCTGATGCTAATGAAGATAGTTCATGGTGTACAGAGCAAG
AATGGCGAACATTAACATCATTTACAGCTCGTCCTGATGTGGTAAACCAATTAGCCTATTTGTACGAAGAAGACAGAGCA
GGAACGATCAATTTATTTCCTAAGTTTGGTGTTGGCTTTAACACCAAGGTGCCAGGTCGTCATGCGGGAGAGCATTATTT
AGAGAAAGATGCGTTCTTAGGGTTTTGGGGTAAGCCTATAAAGAATAAGATGGCACCACTTATCATTGAAGAGAACGGTT
CTTTAGCTCCAACACTGTATCAATATTTAACCGAAGAAAAAGTGATAAAAAATGAAAACGGTTGGGGATATCCTTCTTTG
TTAAATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACTGAATTTTGGTTTTCACCAGAACGAGAAGTTGGCTACATTCAAATGTGTAATTATAAATATTTAAAAATGCCACCACT
GAACAACATTGTTCAGCAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAACGTTTTTATATTGTTTCACGGCCTCAAAAGTAAGTTTAACTGACTCCATTGTCATCAGATTTACTGGCGTATCAAT
ATAAGCAACAGAAAATTGAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 962; Mature: 962

Protein sequence:

>962_residues
MEKEIKVKKRTVSSLLGMSALSFSMLSLPCSANISAVPVVGGIVNSSEILKHQINDSITYTTTTVRDAAIFTIAGLTLDA
YILSLPLDSSVKKRVIAQLSNPYYAIPLGHFLYTFVDKYGNMDNEDAFKAYLKTKYSEEELQRFSHSLFTLNELQKEEDA
SKPSEGHHQGLKVDRKFIANMVVVYDELVQIGEWKDLNTLPDRYTYLSDSPEDKAIIDKIQPIILSGLEKSVLGMDKGEM
RSALELIIADGKPENKNKVNNKAEALTITLIDFVRLNVLKSYRQFVYQEQRQIALNSWLQETFKDNPDTLVAYLASRQQR
RLAVQVTVDGLQQGLIEGLVTPTEKTFLKQIYQDHLNRNEYKPQGEPTSQPEHEQQLTFLKTMIEKGYQDPNYLPFFSQL
YQEYEKSIVNVGISSTPTISVRNLPIIKTGAKVSGEGGTGIPNFHFVDRQDDRAYYFFGNDALQLDRLMDANKVQTMFDR
LDYLVTLNCNAQYDWNAHTTYDGLVNLGAGESLRDFGEKRCLRELTQRAKTEKTITEMRAELIEEIGIYQNIFVLDIYSK
LTQKWKIQQELETLSKLEQKGMPDYALIYNPWPDHFAHFTGPFSDEILMPTGELNRLDYWLTQISDVYKSANVYDRTLWG
MAGDHGLAPVYYSLNPEKQVFETLQAELDYPLVIKKISSDEGEGPKITNALNYESNKEVDVVVASTAGGNFMMDFFNSQQ
GWKVQPTYSELTTWIPVNAPEDQPINIVNEIASRLKESLDYLVVRETPCSLDECQIRVIGFKDDIRVDELISKKGNRLFY
QPVAGSSQLLEVDVLNIYKPQLNETEQKQYDELYQRCMISADANEDSSWCTEQEWRTLTSFTARPDVVNQLAYLYEEDRA
GTINLFPKFGVGFNTKVPGRHAGEHYLEKDAFLGFWGKPIKNKMAPLIIEENGSLAPTLYQYLTEEKVIKNENGWGYPSL
LN

Sequences:

>Translated_962_residues
MEKEIKVKKRTVSSLLGMSALSFSMLSLPCSANISAVPVVGGIVNSSEILKHQINDSITYTTTTVRDAAIFTIAGLTLDA
YILSLPLDSSVKKRVIAQLSNPYYAIPLGHFLYTFVDKYGNMDNEDAFKAYLKTKYSEEELQRFSHSLFTLNELQKEEDA
SKPSEGHHQGLKVDRKFIANMVVVYDELVQIGEWKDLNTLPDRYTYLSDSPEDKAIIDKIQPIILSGLEKSVLGMDKGEM
RSALELIIADGKPENKNKVNNKAEALTITLIDFVRLNVLKSYRQFVYQEQRQIALNSWLQETFKDNPDTLVAYLASRQQR
RLAVQVTVDGLQQGLIEGLVTPTEKTFLKQIYQDHLNRNEYKPQGEPTSQPEHEQQLTFLKTMIEKGYQDPNYLPFFSQL
YQEYEKSIVNVGISSTPTISVRNLPIIKTGAKVSGEGGTGIPNFHFVDRQDDRAYYFFGNDALQLDRLMDANKVQTMFDR
LDYLVTLNCNAQYDWNAHTTYDGLVNLGAGESLRDFGEKRCLRELTQRAKTEKTITEMRAELIEEIGIYQNIFVLDIYSK
LTQKWKIQQELETLSKLEQKGMPDYALIYNPWPDHFAHFTGPFSDEILMPTGELNRLDYWLTQISDVYKSANVYDRTLWG
MAGDHGLAPVYYSLNPEKQVFETLQAELDYPLVIKKISSDEGEGPKITNALNYESNKEVDVVVASTAGGNFMMDFFNSQQ
GWKVQPTYSELTTWIPVNAPEDQPINIVNEIASRLKESLDYLVVRETPCSLDECQIRVIGFKDDIRVDELISKKGNRLFY
QPVAGSSQLLEVDVLNIYKPQLNETEQKQYDELYQRCMISADANEDSSWCTEQEWRTLTSFTARPDVVNQLAYLYEEDRA
GTINLFPKFGVGFNTKVPGRHAGEHYLEKDAFLGFWGKPIKNKMAPLIIEENGSLAPTLYQYLTEEKVIKNENGWGYPSL
LN
>Mature_962_residues
MEKEIKVKKRTVSSLLGMSALSFSMLSLPCSANISAVPVVGGIVNSSEILKHQINDSITYTTTTVRDAAIFTIAGLTLDA
YILSLPLDSSVKKRVIAQLSNPYYAIPLGHFLYTFVDKYGNMDNEDAFKAYLKTKYSEEELQRFSHSLFTLNELQKEEDA
SKPSEGHHQGLKVDRKFIANMVVVYDELVQIGEWKDLNTLPDRYTYLSDSPEDKAIIDKIQPIILSGLEKSVLGMDKGEM
RSALELIIADGKPENKNKVNNKAEALTITLIDFVRLNVLKSYRQFVYQEQRQIALNSWLQETFKDNPDTLVAYLASRQQR
RLAVQVTVDGLQQGLIEGLVTPTEKTFLKQIYQDHLNRNEYKPQGEPTSQPEHEQQLTFLKTMIEKGYQDPNYLPFFSQL
YQEYEKSIVNVGISSTPTISVRNLPIIKTGAKVSGEGGTGIPNFHFVDRQDDRAYYFFGNDALQLDRLMDANKVQTMFDR
LDYLVTLNCNAQYDWNAHTTYDGLVNLGAGESLRDFGEKRCLRELTQRAKTEKTITEMRAELIEEIGIYQNIFVLDIYSK
LTQKWKIQQELETLSKLEQKGMPDYALIYNPWPDHFAHFTGPFSDEILMPTGELNRLDYWLTQISDVYKSANVYDRTLWG
MAGDHGLAPVYYSLNPEKQVFETLQAELDYPLVIKKISSDEGEGPKITNALNYESNKEVDVVVASTAGGNFMMDFFNSQQ
GWKVQPTYSELTTWIPVNAPEDQPINIVNEIASRLKESLDYLVVRETPCSLDECQIRVIGFKDDIRVDELISKKGNRLFY
QPVAGSSQLLEVDVLNIYKPQLNETEQKQYDELYQRCMISADANEDSSWCTEQEWRTLTSFTARPDVVNQLAYLYEEDRA
GTINLFPKFGVGFNTKVPGRHAGEHYLEKDAFLGFWGKPIKNKMAPLIIEENGSLAPTLYQYLTEEKVIKNENGWGYPSL
LN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 109740; Mature: 109740

Theoretical pI: Translated: 4.79; Mature: 4.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEKEIKVKKRTVSSLLGMSALSFSMLSLPCSANISAVPVVGGIVNSSEILKHQINDSITY
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCEEE
TTTTVRDAAIFTIAGLTLDAYILSLPLDSSVKKRVIAQLSNPYYAIPLGHFLYTFVDKYG
EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHC
NMDNEDAFKAYLKTKYSEEELQRFSHSLFTLNELQKEEDASKPSEGHHQGLKVDRKFIAN
CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
MVVVYDELVQIGEWKDLNTLPDRYTYLSDSPEDKAIIDKIQPIILSGLEKSVLGMDKGEM
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
RSALELIIADGKPENKNKVNNKAEALTITLIDFVRLNVLKSYRQFVYQEQRQIALNSWLQ
HHHHHEEEECCCCCCCHHCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ETFKDNPDTLVAYLASRQQRRLAVQVTVDGLQQGLIEGLVTPTEKTFLKQIYQDHLNRNE
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC
YKPQGEPTSQPEHEQQLTFLKTMIEKGYQDPNYLPFFSQLYQEYEKSIVNVGISSTPTIS
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEE
VRNLPIIKTGAKVSGEGGTGIPNFHFVDRQDDRAYYFFGNDALQLDRLMDANKVQTMFDR
ECCCEEEECCCEECCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
LDYLVTLNCNAQYDWNAHTTYDGLVNLGAGESLRDFGEKRCLRELTQRAKTEKTITEMRA
CCEEEEEECCCEECCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELIEEIGIYQNIFVLDIYSKLTQKWKIQQELETLSKLEQKGMPDYALIYNPWPDHFAHFT
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHCC
GPFSDEILMPTGELNRLDYWLTQISDVYKSANVYDRTLWGMAGDHGLAPVYYSLNPEKQV
CCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHH
FETLQAELDYPLVIKKISSDEGEGPKITNALNYESNKEVDVVVASTAGGNFMMDFFNSQQ
HHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHCCCC
GWKVQPTYSELTTWIPVNAPEDQPINIVNEIASRLKESLDYLVVRETPCSLDECQIRVIG
CCEECCCHHHHCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEE
FKDDIRVDELISKKGNRLFYQPVAGSSQLLEVDVLNIYKPQLNETEQKQYDELYQRCMIS
CCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEC
ADANEDSSWCTEQEWRTLTSFTARPDVVNQLAYLYEEDRAGTINLFPKFGVGFNTKVPGR
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCC
HAGEHYLEKDAFLGFWGKPIKNKMAPLIIEENGSLAPTLYQYLTEEKVIKNENGWGYPSL
CCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
LN
CC
>Mature Secondary Structure
MEKEIKVKKRTVSSLLGMSALSFSMLSLPCSANISAVPVVGGIVNSSEILKHQINDSITY
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCEEE
TTTTVRDAAIFTIAGLTLDAYILSLPLDSSVKKRVIAQLSNPYYAIPLGHFLYTFVDKYG
EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHC
NMDNEDAFKAYLKTKYSEEELQRFSHSLFTLNELQKEEDASKPSEGHHQGLKVDRKFIAN
CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
MVVVYDELVQIGEWKDLNTLPDRYTYLSDSPEDKAIIDKIQPIILSGLEKSVLGMDKGEM
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
RSALELIIADGKPENKNKVNNKAEALTITLIDFVRLNVLKSYRQFVYQEQRQIALNSWLQ
HHHHHEEEECCCCCCCHHCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ETFKDNPDTLVAYLASRQQRRLAVQVTVDGLQQGLIEGLVTPTEKTFLKQIYQDHLNRNE
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC
YKPQGEPTSQPEHEQQLTFLKTMIEKGYQDPNYLPFFSQLYQEYEKSIVNVGISSTPTIS
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEE
VRNLPIIKTGAKVSGEGGTGIPNFHFVDRQDDRAYYFFGNDALQLDRLMDANKVQTMFDR
ECCCEEEECCCEECCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
LDYLVTLNCNAQYDWNAHTTYDGLVNLGAGESLRDFGEKRCLRELTQRAKTEKTITEMRA
CCEEEEEECCCEECCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELIEEIGIYQNIFVLDIYSKLTQKWKIQQELETLSKLEQKGMPDYALIYNPWPDHFAHFT
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHCC
GPFSDEILMPTGELNRLDYWLTQISDVYKSANVYDRTLWGMAGDHGLAPVYYSLNPEKQV
CCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCHHHH
FETLQAELDYPLVIKKISSDEGEGPKITNALNYESNKEVDVVVASTAGGNFMMDFFNSQQ
HHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHCCCC
GWKVQPTYSELTTWIPVNAPEDQPINIVNEIASRLKESLDYLVVRETPCSLDECQIRVIG
CCEECCCHHHHCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEE
FKDDIRVDELISKKGNRLFYQPVAGSSQLLEVDVLNIYKPQLNETEQKQYDELYQRCMIS
CCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEC
ADANEDSSWCTEQEWRTLTSFTARPDVVNQLAYLYEEDRAGTINLFPKFGVGFNTKVPGR
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCC
HAGEHYLEKDAFLGFWGKPIKNKMAPLIIEENGSLAPTLYQYLTEEKVIKNENGWGYPSL
CCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
LN
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA