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The map label for this gene is cstA [C]

Identifier: 59711754

GI number: 59711754

Start: 1272010

End: 1273476

Strand: Reverse

Name: cstA [C]

Synonym: VF_1147

Alternate gene names: 59711754

Gene position: 1273476-1272010 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59711755

Following gene: 59711747

Centisome position: 43.95

GC content: 40.97

Gene sequence:

>1467_bases
ATGCTTTGGTTTTTAACTTGTGTTGCAGCACTTATCGGTGGTTACTTTCTGTATGGTGCTTTTATAGAAAAAGTATTCGG
TATTAAAGTAGACCGTCAAACTCCCGCTCATACAAAAACAGACGGTGTTGATTATGTTCCAATGTCGACACCAAAAGTAT
ACTTAGTTCAACTTCTTAATATTGCAGGTGTCGGCCCAATTTTTGGCCCAATCATGGGTGCCCTTTACGGCCCTGCAGCT
ATGTTATGGATTGTGCTAGGTTGTGTTTTTGCAGGTGCAGTTCACGATTACTTCTCAGGTATGTTATCTGTTCGTAATGG
TGGTGCTTCTGTACCAAGTATTACTGGTAAATACTTAGGTAATGGCGCAAAACACTTTATGAATGTATTTGCAATTGTAC
TGCTGCTTCTTGTTGGTGTTGTTTTCGTATCAGCCCCTGCAAGCATGTTAACTAACCTAATGAATGACCAATTTAATTTA
GGCATTACCATGACAGCAATGGTAGTTATCATTTTCGCCTACTACATTATTGCGACAATTGTTCCTGTAGATAAAATCAT
TGGTCGTTTCTACCCACTCTTTGGTGGCCTACTCATCTTCATGTCTGTTGGTCTTATTTCAGCGATTGCGATTTCTAGTG
ACCATTCAGTATTAGGTGGTTACGAACCAAGTCAAATGTTCACCAACATGAACCCTAATGATTTGCCATTATGGCCTGCG
CTATTCATTACCATTGCTTGTGGTGCTATCTCTGGCTTCCACGCGACACAATCGCCATTAATGGCTCGTTGTATGGAAAA
TGAAAAGAACGGTCGTTTCGTATTCTACGGTGCGATGATTGGTGAAGGTATTATCGCTCTTATCTGGTGTGCTATCGCTC
TATCATTCTTTGATGGTATGGAAGCACTTCAAGCAGCGGTTGCTAACGGTGGCCCAGGTAATGTGGTATACAGCTCTGCA
TTTGGTCTATTAGGTACATTCGGTGGCATCATTGCTTTCTTAGGTGTGGTAATTCTACCAATCACTTCTGGTGACACAGC
ATTCCGTTCAAGCCGTCTAATCCTTGCTGAATACTTCAACATGGAACAAAAAACATTACGTAACCGTCTATTAATGGCAC
TACCACTGTTTGTTATCGGTGGCATTCTAACTCAAGTAGATTTCGGTATTATCTGGCGCTACTTCGGTTTTGCTAACCAA
ACGACTGCGGTAATGATGCTTTGGACAGCAACGGCTTACCTAGTTCGTCATAACAAACTACACTGGATCACAACCGTTCC
TGCAGTATTTATGACAAGTGTTTGTATTACTTTCATTCTAAACAACAGTCAGTTAGGTTTTGGTTTACCAATGACGCTAT
CAACGATTACAGGTGTAGTATCAGCGGTAGCCATTGCAGCTCTTGTAATTATTAAATCAAGAAACAGTGGCGAAGTTGAT
TCTGAAGAAGAAAGCCTTCAATCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCACTCACCTTTTTTGGGCGTGAACTCTTTACGCCCAACAGTATTATACGCAGCATCTAATTATAAAATTTACTTAGCTA
ACTCTTACAAGGAATAGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATCAAGTTAAATAAAAAATCCCCATTAATCATTATTAATGGGGATTTTTGTATATTAGTACTTACCCTTCTCACTTCT
TAAGCGTTCAACATCTGCTA

Product: peptide transporter induced by carbon starvation

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 488; Mature: 488

Protein sequence:

>488_residues
MLWFLTCVAALIGGYFLYGAFIEKVFGIKVDRQTPAHTKTDGVDYVPMSTPKVYLVQLLNIAGVGPIFGPIMGALYGPAA
MLWIVLGCVFAGAVHDYFSGMLSVRNGGASVPSITGKYLGNGAKHFMNVFAIVLLLLVGVVFVSAPASMLTNLMNDQFNL
GITMTAMVVIIFAYYIIATIVPVDKIIGRFYPLFGGLLIFMSVGLISAIAISSDHSVLGGYEPSQMFTNMNPNDLPLWPA
LFITIACGAISGFHATQSPLMARCMENEKNGRFVFYGAMIGEGIIALIWCAIALSFFDGMEALQAAVANGGPGNVVYSSA
FGLLGTFGGIIAFLGVVILPITSGDTAFRSSRLILAEYFNMEQKTLRNRLLMALPLFVIGGILTQVDFGIIWRYFGFANQ
TTAVMMLWTATAYLVRHNKLHWITTVPAVFMTSVCITFILNNSQLGFGLPMTLSTITGVVSAVAIAALVIIKSRNSGEVD
SEEESLQS

Sequences:

>Translated_488_residues
MLWFLTCVAALIGGYFLYGAFIEKVFGIKVDRQTPAHTKTDGVDYVPMSTPKVYLVQLLNIAGVGPIFGPIMGALYGPAA
MLWIVLGCVFAGAVHDYFSGMLSVRNGGASVPSITGKYLGNGAKHFMNVFAIVLLLLVGVVFVSAPASMLTNLMNDQFNL
GITMTAMVVIIFAYYIIATIVPVDKIIGRFYPLFGGLLIFMSVGLISAIAISSDHSVLGGYEPSQMFTNMNPNDLPLWPA
LFITIACGAISGFHATQSPLMARCMENEKNGRFVFYGAMIGEGIIALIWCAIALSFFDGMEALQAAVANGGPGNVVYSSA
FGLLGTFGGIIAFLGVVILPITSGDTAFRSSRLILAEYFNMEQKTLRNRLLMALPLFVIGGILTQVDFGIIWRYFGFANQ
TTAVMMLWTATAYLVRHNKLHWITTVPAVFMTSVCITFILNNSQLGFGLPMTLSTITGVVSAVAIAALVIIKSRNSGEVD
SEEESLQS
>Mature_488_residues
MLWFLTCVAALIGGYFLYGAFIEKVFGIKVDRQTPAHTKTDGVDYVPMSTPKVYLVQLLNIAGVGPIFGPIMGALYGPAA
MLWIVLGCVFAGAVHDYFSGMLSVRNGGASVPSITGKYLGNGAKHFMNVFAIVLLLLVGVVFVSAPASMLTNLMNDQFNL
GITMTAMVVIIFAYYIIATIVPVDKIIGRFYPLFGGLLIFMSVGLISAIAISSDHSVLGGYEPSQMFTNMNPNDLPLWPA
LFITIACGAISGFHATQSPLMARCMENEKNGRFVFYGAMIGEGIIALIWCAIALSFFDGMEALQAAVANGGPGNVVYSSA
FGLLGTFGGIIAFLGVVILPITSGDTAFRSSRLILAEYFNMEQKTLRNRLLMALPLFVIGGILTQVDFGIIWRYFGFANQ
TTAVMMLWTATAYLVRHNKLHWITTVPAVFMTSVCITFILNNSQLGFGLPMTLSTITGVVSAVAIAALVIIKSRNSGEVD
SEEESLQS

Specific function: Unknown

COG id: COG1966

COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CstA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=350, Percent_Identity=26.8571428571429, Blast_Score=91, Evalue=1e-19,
Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=132, Percent_Identity=33.3333333333333, Blast_Score=70, Evalue=3e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003706 [H]

Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52473; Mature: 52473

Theoretical pI: Translated: 7.15; Mature: 7.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
4.7 %Met     (Translated Protein)
5.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
4.7 %Met     (Mature Protein)
5.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLWFLTCVAALIGGYFLYGAFIEKVFGIKVDRQTPAHTKTDGVDYVPMSTPKVYLVQLLN
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
IAGVGPIFGPIMGALYGPAAMLWIVLGCVFAGAVHDYFSGMLSVRNGGASVPSITGKYLG
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHC
NGAKHFMNVFAIVLLLLVGVVFVSAPASMLTNLMNDQFNLGITMTAMVVIIFAYYIIATI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VPVDKIIGRFYPLFGGLLIFMSVGLISAIAISSDHSVLGGYEPSQMFTNMNPNDLPLWPA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHH
LFITIACGAISGFHATQSPLMARCMENEKNGRFVFYGAMIGEGIIALIWCAIALSFFDGM
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EALQAAVANGGPGNVVYSSAFGLLGTFGGIIAFLGVVILPITSGDTAFRSSRLILAEYFN
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHCCCHHHHHHHC
MEQKTLRNRLLMALPLFVIGGILTQVDFGIIWRYFGFANQTTAVMMLWTATAYLVRHNKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE
HWITTVPAVFMTSVCITFILNNSQLGFGLPMTLSTITGVVSAVAIAALVIIKSRNSGEVD
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
SEEESLQS
CHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]