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The map label for this gene is waaL

Identifier: 59710758

GI number: 59710758

Start: 169555

End: 170787

Strand: Reverse

Name: waaL

Synonym: VF_0151

Alternate gene names: NA

Gene position: 170787-169555 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59710759

Following gene: 59710757

Centisome position: 5.89

GC content: 24.33

Gene sequence:

>1233_bases
ATGATAAACAATTATTGCCAAAAAATCTTATCCAGTATAAGTAAATATTGGGTTCTAGCTATAGTTTATATACCTATACT
ATGGACACTTTCATTTAATTTTACGCTCCCAAATGGTAGAAGTATTGCATCAAAGTTACTTGTTATTTCTGCTATATTTT
CCTTTATTTATTTTAGAAAAAGAGTTTTTCTATTTAAAGAAAAACCTAAAACATTTAAAATATTAATCACTAGTTTATTT
ATAATAATTTTATTTAGATCAATACTTTTTCTTTATCATGGAGAACAAACATCAAGCATAAGAGCTTTCGGGATTATTTT
CTTATACATATATTCTTTTCCATATTGGTTAGTAAAAAAAGAACATATTAAAAACCTTACTTTTATAAGTCTTTTCTTAT
TTGGATTAGATGCGTTCATACACGTAATCAATAATGGTTTCACCAGATACGGAGGAAATACAAACCCAAATCCTTATGGA
CTATATGCTGCATTGATTTTTATTTTTGTATATATTTATAATTTAATAAATACTAAAACTCACATACTATATAAAACAAT
TCCATTAATTATCATTGGTTTTTTACCTATAATGATTAGTCAAAGTCGTGGAGTTTGGGTGTCAACTATTTTAACTTTAA
TTATAATTCATATCGCAAGAATAAAATTCAATATAAAAAACATTTCAATATATATTTTAACTATATTAGCAATTGCTTTT
TCCCTGTACTCTACACCTACTGTAAAAAATAGAATAGAAGCAACAAAAATAGAGATTAAGAACATTGAACATCATAATTT
AAGTTCATCATTAGGTGTTAGAATACAGGTTTGGAAAGATTCTATTCCTTTAATTAAAGAATATCCATTCTTTGGCCTCG
GAAACAAATTAAAAGAAATCAATAATACTCGATTTGAAAATAAAAAAATATCACAATATAGTTATTATTACTCAAGAAAT
CATTTACATAGCCAATACTTTGAATTTATAACAAAACAAGGGTTTATTGGTTTTTTCATTATAATTGGTGCGATTATATT
TCCACTTATTATAATGCGAAAAGATAATGATATATTTGTTAAGTTTTGTTCAATTTCATTCTTATGTGTATTATTAATAA
ATTTCATAACTGAAGTTCCTTTCAATTGGATAAACTTTACTTATACATATTTAATTCTTATTTTATGTTTAACTCTACAA
TCTTACCACTCGACAAAAGATATCAGGTCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCTGGTTGTGATGTTGAGTTTAAGTCAGTAGCTGATGGTGTTGCTGAATATATGGCGATGATTAATAAGTAGATTTAAA
TCAGAAATAGAAGCAGTACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATATGAATGTATTTCTAGTTACTTCTCCATTTCAATATATCTGTGCAATCGAAGCAAAATTCCACTACAAGTCTAAGAA
TAATATTCTAATATTAATTG

Product: O-antigen ligase

Products: NA

Alternate protein names: O-Antigen Ligase WaaL

Number of amino acids: Translated: 410; Mature: 410

Protein sequence:

>410_residues
MINNYCQKILSSISKYWVLAIVYIPILWTLSFNFTLPNGRSIASKLLVISAIFSFIYFRKRVFLFKEKPKTFKILITSLF
IIILFRSILFLYHGEQTSSIRAFGIIFLYIYSFPYWLVKKEHIKNLTFISLFLFGLDAFIHVINNGFTRYGGNTNPNPYG
LYAALIFIFVYIYNLINTKTHILYKTIPLIIIGFLPIMISQSRGVWVSTILTLIIIHIARIKFNIKNISIYILTILAIAF
SLYSTPTVKNRIEATKIEIKNIEHHNLSSSLGVRIQVWKDSIPLIKEYPFFGLGNKLKEINNTRFENKKISQYSYYYSRN
HLHSQYFEFITKQGFIGFFIIIGAIIFPLIIMRKDNDIFVKFCSISFLCVLLINFITEVPFNWINFTYTYLILILCLTLQ
SYHSTKDIRS

Sequences:

>Translated_410_residues
MINNYCQKILSSISKYWVLAIVYIPILWTLSFNFTLPNGRSIASKLLVISAIFSFIYFRKRVFLFKEKPKTFKILITSLF
IIILFRSILFLYHGEQTSSIRAFGIIFLYIYSFPYWLVKKEHIKNLTFISLFLFGLDAFIHVINNGFTRYGGNTNPNPYG
LYAALIFIFVYIYNLINTKTHILYKTIPLIIIGFLPIMISQSRGVWVSTILTLIIIHIARIKFNIKNISIYILTILAIAF
SLYSTPTVKNRIEATKIEIKNIEHHNLSSSLGVRIQVWKDSIPLIKEYPFFGLGNKLKEINNTRFENKKISQYSYYYSRN
HLHSQYFEFITKQGFIGFFIIIGAIIFPLIIMRKDNDIFVKFCSISFLCVLLINFITEVPFNWINFTYTYLILILCLTLQ
SYHSTKDIRS
>Mature_410_residues
MINNYCQKILSSISKYWVLAIVYIPILWTLSFNFTLPNGRSIASKLLVISAIFSFIYFRKRVFLFKEKPKTFKILITSLF
IIILFRSILFLYHGEQTSSIRAFGIIFLYIYSFPYWLVKKEHIKNLTFISLFLFGLDAFIHVINNGFTRYGGNTNPNPYG
LYAALIFIFVYIYNLINTKTHILYKTIPLIIIGFLPIMISQSRGVWVSTILTLIIIHIARIKFNIKNISIYILTILAIAF
SLYSTPTVKNRIEATKIEIKNIEHHNLSSSLGVRIQVWKDSIPLIKEYPFFGLGNKLKEINNTRFENKKISQYSYYYSRN
HLHSQYFEFITKQGFIGFFIIIGAIIFPLIIMRKDNDIFVKFCSISFLCVLLINFITEVPFNWINFTYTYLILILCLTLQ
SYHSTKDIRS

Specific function: Unknown

COG id: COG3307

COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48064; Mature: 48064

Theoretical pI: Translated: 10.26; Mature: 10.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
0.7 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
0.7 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MINNYCQKILSSISKYWVLAIVYIPILWTLSFNFTLPNGRSIASKLLVISAIFSFIYFRK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RVFLFKEKPKTFKILITSLFIIILFRSILFLYHGEQTSSIRAFGIIFLYIYSFPYWLVKK
HHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
EHIKNLTFISLFLFGLDAFIHVINNGFTRYGGNTNPNPYGLYAALIFIFVYIYNLINTKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
HILYKTIPLIIIGFLPIMISQSRGVWVSTILTLIIIHIARIKFNIKNISIYILTILAIAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
SLYSTPTVKNRIEATKIEIKNIEHHNLSSSLGVRIQVWKDSIPLIKEYPFFGLGNKLKEI
HHHCCCCHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHH
NNTRFENKKISQYSYYYSRNHLHSQYFEFITKQGFIGFFIIIGAIIFPLIIMRKDNDIFV
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEE
KFCSISFLCVLLINFITEVPFNWINFTYTYLILILCLTLQSYHSTKDIRS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MINNYCQKILSSISKYWVLAIVYIPILWTLSFNFTLPNGRSIASKLLVISAIFSFIYFRK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RVFLFKEKPKTFKILITSLFIIILFRSILFLYHGEQTSSIRAFGIIFLYIYSFPYWLVKK
HHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
EHIKNLTFISLFLFGLDAFIHVINNGFTRYGGNTNPNPYGLYAALIFIFVYIYNLINTKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
HILYKTIPLIIIGFLPIMISQSRGVWVSTILTLIIIHIARIKFNIKNISIYILTILAIAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
SLYSTPTVKNRIEATKIEIKNIEHHNLSSSLGVRIQVWKDSIPLIKEYPFFGLGNKLKEI
HHHCCCCHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHH
NNTRFENKKISQYSYYYSRNHLHSQYFEFITKQGFIGFFIIIGAIIFPLIIMRKDNDIFV
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEE
KFCSISFLCVLLINFITEVPFNWINFTYTYLILILCLTLQSYHSTKDIRS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA