| Definition | Ehrlichia ruminantium str. Gardel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006831 |
| Length | 1,499,920 |
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The map label for this gene is 58617561
Identifier: 58617561
GI number: 58617561
Start: 1337783
End: 1341610
Strand: Reverse
Name: 58617561
Synonym: ERGA_CDS_08340
Alternate gene names: NA
Gene position: 1341610-1337783 (Counterclockwise)
Preceding gene: 58617562
Following gene: 58617560
Centisome position: 89.45
GC content: 30.67
Gene sequence:
>3828_bases ATGAGAATACAGCATTATAGCAGTGTAATTTTATTATTAATAATTTTGATAAAACCATTGTTATTGTATGCTGATACAGA AAAACATATTGGCCAACTTGAAATGGGATTCTATATGGTTGGTGAAAAGGTGTTTGTTGGAGATAAAGTTTTTCATATGT CTTATTTTACAAGACGCTCTATGATTAATCATGAAGGTTATTATGGATTACATTTTCTTGATTATTATACTCCACTTGAT GATGGTGAGTCTCGTAATGAGTCTGTTACTATAAGATTTGCTCAATATAATATAGATAATCGTGAAAAATATTATGGCCG TTATTTAAATGGTTGGTATCCAGATCAAGAAAATAAATTAATTGATAGTTTAAATATTCCTCGTGACAGAAGTAAACGTA ATTTTGCAGAACATGAAGTCATGTTTATAGCATTATCTTCTTATTGGGGAAACGTTACATTGCATACTCTACCTGTAGGT AGTTGTAAAATGTTATATGGAGGTAGCACTTTTTATGATTCTATTGCTGTGATAACTTTTAATGAAATGATGAAAGAACA TGAGTATGTTTGTATATGTTTTGTCAAGGATTGTAGTTCTAAGCCTGTAATAGAATCATGTGATTTCAAAAGTTTACACT GTACTCGTAGAAAATTACCTGTGAATCCTCCGCCATTTTGTGAAATGTTTGATATAAAAAATATAGTAACAATTGTGCCT TTAGCGTTTTCCAGCCAAACCTTCTTTAAGTCTGGTGCACGAGTATATATTCGTGCAGGATCTGAAACGCCTCATGTGAT AGATTTATATGCAAAATCTTATAAAATAGGTGAAAAAAGCACTTATAATATTGAGTATAAAGGAGTGCCATATGTATTTC AGGTTTATAAGAAAGGATATGATACAGTGTGTGTTGACTATACAGATAATGGTATACCTGAAAAAACGGTTTGTGTTCCT TCCCCAAGTTTAGTGCGTCCTAAGATAAGTTTTAGTAATAATAGTGTTAATATCAAATATCAAGATTGTCAGGATTCTCC TGTGTGTGATGTTAATGTACCAGTAGGTACACATGATAAGGATTTATCATTTTCTGTAATAAAGCCTAAAATTAACAAGG ATGATTATACATTATTGACTGAGTATAAATGTGCAGATGGTCAGATAGTATATGATGCAGATAAGTGTCCTGATATTAAT TCAGTTAAAAAATTGGGATATGCTCATGATGATAATGGTAATGTAACATGTGTTATTAATATGCCATTTGTTCCTACTGT ATATTCTATTAAAAAAAATAATAGAGATCTATGGCTACGTAGACATGAAAACATGTTGCAAGGTTATGGTATAGTTATAG AAAAAACTGTAGATGGTAAAAAGAGTGAAAAATATGTACAATGTGATTATAAATATGCAATAGACATTACTAAGCTAACA CAAGACCAGCTTGCTCAAATGAGAAGAATGAAAAGTGTATTTTTTAATATTCCTGGTCACTACAATCCTAAAGATAGGGC ATGTCAAGGTAGTGTAATATATAAGTATGATAGTAATAGGTTATATGAAAAAGGTAAGGAAATATCTTGCAAAGATGTTG TTACCTGGAGTGATGAGCAAAGTACTTTTTATGGGTGTAGTTCATTATATTTCAATGATGATGATTTTACTAATTTCTTC CATGAAAATAGTGATGTACAAAATATAAAACCTCTTAATCCAATATTACAAGGTATGTGTGTTAGTAATTTTCCTTCTAA TACATATAGAGTTAGAGAGAATAGAAAAGTATTACCTACAAGTTATGCATTGCGTATTAATGAAAAGAAAACATCGTGTG ATTTTATAAAGATAGAAGCATGGGGTGGTGGAGAGTCTGGATCAGTAGGATCAACCAGATCTGGTAAAGCTGGTAACTAT ATTATGGGGGTGTTAAAGTTAGATAAAAGTGTAATGGAGAAGAGATTAATAATTGATATAGGTGCTGGTGGTAAGGGAGA TCGTCATTTAAGTAATGCTGGTGGTAATACTAGTGTCAAATTGTGTACTAGTGATAATGGTAGCGATTGTGTGATAAGTT TAATAGCTCAAGGTGGAAGTAAAGGAGATGATTATTTACAAGATAAATCTTCTGGAACTAACTTGCTTGCTCATTATAGA TTATTTTCTGGACATCGTAATGTGGAAGAGGGTGAAATACTAATACCATATCAAAATCCTGATTTATTTGAGGGCAAAAT ATCAAAGCAAGCAGAAGAATGTATGTATCGTAATCCAGAATTAGAAAAGAATTCTAATAAATATCCTGGAGCTGGTGGTT GCTCTGACGTGCATGCAAATGGACAAGAAGGTGCTAATGGTATTGTGAAATTGACTTGTGAAAAATGGTCAGGTACTCCA GGTACAATAGAGTTTGAGGATGAAAATGCATGCAATACTGCGCTAGTAACGTTTATAGAGGAAATTAATCACTCAAAAGA TTATCTGCCTAAGAAAATAAAAGAATTTTTGAAAAAAATTAGTCAAATAAGTATTTGTAGAGAATTAAAGAGTTTACCAA AGTTAGTATCAAATCTTTCTGGATATTTTATGTCAGTAAAGACTTTATTAACTGACAAAGCTAATTATCCAGCATTAATA AAATCCCGTAAAAGCTTATTAGCAGAGTTAAATGATAGTAAAGTTAAAGAAGCCTTAAAAAGAATAGGTATTGATTATTC ACCTGATATGACACTCTTATACATTGATGCACTTGTTTTTAATTTTGGTGCTAATGTTTTGAATAAACCTGGTCAATATT TATTGAATTACTATGTTGCAGATAATGATGATTCTTCAGTCAGTGTTGATAGTAAAGTTATACCAGATGAATTAGCATTT GCAATGAATGCAACTAGTAATCAATCAAAATCACGTGACTTTAGTGTTAAAATAAGTGATCAACAGTTCATAAAAAAATA TAGGTCATTTATTGAAGCAATGGAAATGTATACTAGAGATAAAAAAGCTGGTCATAATAAAGAAAACGACAATGTTGTGA TGTCGTGGATGTATACTTTCTTTAAAGCTGATAAACGTCTTTTTGATATGTATGCTCAACTTTTTGTTGAATTAATGTTA GGTATGGACCTAACTGAATTTATAGAGTGGTATCATTGTTCCGAAGATATACTGCAGTTATTTAAAAAAATAAATCAATA TAAACAGAAGTTACCTTTAAAAGTACAAAACTTTATTACAAAAATTAGCGGAGAAGATAAATTTTGTAGTGAGATGTCTC GATATATACAGGTTAATCAATTGTTGCATAACTATGCAAACAATATGAAGTATTTTGTAAACAATATTTTTCAAGATGAT ATTGATAATTGGCCATTTGTGACACATGATATGCAACCATTAATTAATCAATGGAATGACTTTTTAGATAAATCAGACAT ACGCAATATTTTTACTAGAGTAGGTGTAACGGAAAATAATGATGAAATAAGGTTGTTGTTTGATGCGGTTGTACTTAATA GTATATTATCAGAATATAATGCTTATGAAGGCTCTATATTTGATCAGGTAAGAAACTCTAAGGTAGGAAATCGTGCGTTT AAATGCGTAGATTTTCCTGCAAGTGATCTTTCTATGTTACAAGATAATTGTAATAAGATGGAGTGTGGTGACAATGGTCT TTATAGATTTGACATCGTCTCATTGTGGGCCTTTGTAGCATTTTATATAGATGATCAGTTTAACGACAAACATTTTGAGT ATTTTGTTAAATTAATGTTAGATCAGGATCTACAAAAGCTTAGTGATGCTAGTGAAAAGTCTACATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATATCCTCTTATATGAAGGAATTTTCATATAATTTTCGTACCTCTTGTGTGATAAAAATTGTGTAAATAACTTTTGAAC TAGTAATTAATAAAAGTCTT
Downstream 100 bases:
>100_bases CAAATACTTGCTGAGCTTATTGATAACATTAAGAAATATAGGAATAAATTGCCTAAGGTGACAAATGATTTTATCGATAA AATTAGTACTCATAGGTTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1275; Mature: 1275
Protein sequence:
>1275_residues MRIQHYSSVILLLIILIKPLLLYADTEKHIGQLEMGFYMVGEKVFVGDKVFHMSYFTRRSMINHEGYYGLHFLDYYTPLD DGESRNESVTIRFAQYNIDNREKYYGRYLNGWYPDQENKLIDSLNIPRDRSKRNFAEHEVMFIALSSYWGNVTLHTLPVG SCKMLYGGSTFYDSIAVITFNEMMKEHEYVCICFVKDCSSKPVIESCDFKSLHCTRRKLPVNPPPFCEMFDIKNIVTIVP LAFSSQTFFKSGARVYIRAGSETPHVIDLYAKSYKIGEKSTYNIEYKGVPYVFQVYKKGYDTVCVDYTDNGIPEKTVCVP SPSLVRPKISFSNNSVNIKYQDCQDSPVCDVNVPVGTHDKDLSFSVIKPKINKDDYTLLTEYKCADGQIVYDADKCPDIN SVKKLGYAHDDNGNVTCVINMPFVPTVYSIKKNNRDLWLRRHENMLQGYGIVIEKTVDGKKSEKYVQCDYKYAIDITKLT QDQLAQMRRMKSVFFNIPGHYNPKDRACQGSVIYKYDSNRLYEKGKEISCKDVVTWSDEQSTFYGCSSLYFNDDDFTNFF HENSDVQNIKPLNPILQGMCVSNFPSNTYRVRENRKVLPTSYALRINEKKTSCDFIKIEAWGGGESGSVGSTRSGKAGNY IMGVLKLDKSVMEKRLIIDIGAGGKGDRHLSNAGGNTSVKLCTSDNGSDCVISLIAQGGSKGDDYLQDKSSGTNLLAHYR LFSGHRNVEEGEILIPYQNPDLFEGKISKQAEECMYRNPELEKNSNKYPGAGGCSDVHANGQEGANGIVKLTCEKWSGTP GTIEFEDENACNTALVTFIEEINHSKDYLPKKIKEFLKKISQISICRELKSLPKLVSNLSGYFMSVKTLLTDKANYPALI KSRKSLLAELNDSKVKEALKRIGIDYSPDMTLLYIDALVFNFGANVLNKPGQYLLNYYVADNDDSSVSVDSKVIPDELAF AMNATSNQSKSRDFSVKISDQQFIKKYRSFIEAMEMYTRDKKAGHNKENDNVVMSWMYTFFKADKRLFDMYAQLFVELML GMDLTEFIEWYHCSEDILQLFKKINQYKQKLPLKVQNFITKISGEDKFCSEMSRYIQVNQLLHNYANNMKYFVNNIFQDD IDNWPFVTHDMQPLINQWNDFLDKSDIRNIFTRVGVTENNDEIRLLFDAVVLNSILSEYNAYEGSIFDQVRNSKVGNRAF KCVDFPASDLSMLQDNCNKMECGDNGLYRFDIVSLWAFVAFYIDDQFNDKHFEYFVKLMLDQDLQKLSDASEKST
Sequences:
>Translated_1275_residues MRIQHYSSVILLLIILIKPLLLYADTEKHIGQLEMGFYMVGEKVFVGDKVFHMSYFTRRSMINHEGYYGLHFLDYYTPLD DGESRNESVTIRFAQYNIDNREKYYGRYLNGWYPDQENKLIDSLNIPRDRSKRNFAEHEVMFIALSSYWGNVTLHTLPVG SCKMLYGGSTFYDSIAVITFNEMMKEHEYVCICFVKDCSSKPVIESCDFKSLHCTRRKLPVNPPPFCEMFDIKNIVTIVP LAFSSQTFFKSGARVYIRAGSETPHVIDLYAKSYKIGEKSTYNIEYKGVPYVFQVYKKGYDTVCVDYTDNGIPEKTVCVP SPSLVRPKISFSNNSVNIKYQDCQDSPVCDVNVPVGTHDKDLSFSVIKPKINKDDYTLLTEYKCADGQIVYDADKCPDIN SVKKLGYAHDDNGNVTCVINMPFVPTVYSIKKNNRDLWLRRHENMLQGYGIVIEKTVDGKKSEKYVQCDYKYAIDITKLT QDQLAQMRRMKSVFFNIPGHYNPKDRACQGSVIYKYDSNRLYEKGKEISCKDVVTWSDEQSTFYGCSSLYFNDDDFTNFF HENSDVQNIKPLNPILQGMCVSNFPSNTYRVRENRKVLPTSYALRINEKKTSCDFIKIEAWGGGESGSVGSTRSGKAGNY IMGVLKLDKSVMEKRLIIDIGAGGKGDRHLSNAGGNTSVKLCTSDNGSDCVISLIAQGGSKGDDYLQDKSSGTNLLAHYR LFSGHRNVEEGEILIPYQNPDLFEGKISKQAEECMYRNPELEKNSNKYPGAGGCSDVHANGQEGANGIVKLTCEKWSGTP GTIEFEDENACNTALVTFIEEINHSKDYLPKKIKEFLKKISQISICRELKSLPKLVSNLSGYFMSVKTLLTDKANYPALI KSRKSLLAELNDSKVKEALKRIGIDYSPDMTLLYIDALVFNFGANVLNKPGQYLLNYYVADNDDSSVSVDSKVIPDELAF AMNATSNQSKSRDFSVKISDQQFIKKYRSFIEAMEMYTRDKKAGHNKENDNVVMSWMYTFFKADKRLFDMYAQLFVELML GMDLTEFIEWYHCSEDILQLFKKINQYKQKLPLKVQNFITKISGEDKFCSEMSRYIQVNQLLHNYANNMKYFVNNIFQDD IDNWPFVTHDMQPLINQWNDFLDKSDIRNIFTRVGVTENNDEIRLLFDAVVLNSILSEYNAYEGSIFDQVRNSKVGNRAF KCVDFPASDLSMLQDNCNKMECGDNGLYRFDIVSLWAFVAFYIDDQFNDKHFEYFVKLMLDQDLQKLSDASEKST >Mature_1275_residues MRIQHYSSVILLLIILIKPLLLYADTEKHIGQLEMGFYMVGEKVFVGDKVFHMSYFTRRSMINHEGYYGLHFLDYYTPLD DGESRNESVTIRFAQYNIDNREKYYGRYLNGWYPDQENKLIDSLNIPRDRSKRNFAEHEVMFIALSSYWGNVTLHTLPVG SCKMLYGGSTFYDSIAVITFNEMMKEHEYVCICFVKDCSSKPVIESCDFKSLHCTRRKLPVNPPPFCEMFDIKNIVTIVP LAFSSQTFFKSGARVYIRAGSETPHVIDLYAKSYKIGEKSTYNIEYKGVPYVFQVYKKGYDTVCVDYTDNGIPEKTVCVP SPSLVRPKISFSNNSVNIKYQDCQDSPVCDVNVPVGTHDKDLSFSVIKPKINKDDYTLLTEYKCADGQIVYDADKCPDIN SVKKLGYAHDDNGNVTCVINMPFVPTVYSIKKNNRDLWLRRHENMLQGYGIVIEKTVDGKKSEKYVQCDYKYAIDITKLT QDQLAQMRRMKSVFFNIPGHYNPKDRACQGSVIYKYDSNRLYEKGKEISCKDVVTWSDEQSTFYGCSSLYFNDDDFTNFF HENSDVQNIKPLNPILQGMCVSNFPSNTYRVRENRKVLPTSYALRINEKKTSCDFIKIEAWGGGESGSVGSTRSGKAGNY IMGVLKLDKSVMEKRLIIDIGAGGKGDRHLSNAGGNTSVKLCTSDNGSDCVISLIAQGGSKGDDYLQDKSSGTNLLAHYR LFSGHRNVEEGEILIPYQNPDLFEGKISKQAEECMYRNPELEKNSNKYPGAGGCSDVHANGQEGANGIVKLTCEKWSGTP GTIEFEDENACNTALVTFIEEINHSKDYLPKKIKEFLKKISQISICRELKSLPKLVSNLSGYFMSVKTLLTDKANYPALI KSRKSLLAELNDSKVKEALKRIGIDYSPDMTLLYIDALVFNFGANVLNKPGQYLLNYYVADNDDSSVSVDSKVIPDELAF AMNATSNQSKSRDFSVKISDQQFIKKYRSFIEAMEMYTRDKKAGHNKENDNVVMSWMYTFFKADKRLFDMYAQLFVELML GMDLTEFIEWYHCSEDILQLFKKINQYKQKLPLKVQNFITKISGEDKFCSEMSRYIQVNQLLHNYANNMKYFVNNIFQDD IDNWPFVTHDMQPLINQWNDFLDKSDIRNIFTRVGVTENNDEIRLLFDAVVLNSILSEYNAYEGSIFDQVRNSKVGNRAF KCVDFPASDLSMLQDNCNKMECGDNGLYRFDIVSLWAFVAFYIDDQFNDKHFEYFVKLMLDQDLQKLSDASEKST
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 146015; Mature: 146015
Theoretical pI: Translated: 6.60; Mature: 6.60
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.5 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 5.2 %Cys+Met (Translated Protein) 2.5 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 5.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRIQHYSSVILLLIILIKPLLLYADTEKHIGQLEMGFYMVGEKVFVGDKVFHMSYFTRRS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHCCHHEECEEEECCEEEECCEEHHHHHHHHHH MINHEGYYGLHFLDYYTPLDDGESRNESVTIRFAQYNIDNREKYYGRYLNGWYPDQENKL HHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCH IDSLNIPRDRSKRNFAEHEVMFIALSSYWGNVTLHTLPVGSCKMLYGGSTFYDSIAVITF HHHCCCCCCCCCCCCCHHEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHCEEEEEH NEMMKEHEYVCICFVKDCSSKPVIESCDFKSLHCTRRKLPVNPPPFCEMFDIKNIVTIVP HHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEE LAFSSQTFFKSGARVYIRAGSETPHVIDLYAKSYKIGEKSTYNIEYKGVPYVFQVYKKGY ECCCCCHHHCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEHHHEECCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCC DTVCVDYTDNGIPEKTVCVPSPSLVRPKISFSNNSVNIKYQDCQDSPVCDVNVPVGTHDK CEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCCEEEECCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCC DLSFSVIKPKINKDDYTLLTEYKCADGQIVYDADKCPDINSVKKLGYAHDDNGNVTCVIN CCEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEE MPFVPTVYSIKKNNRDLWLRRHENMLQGYGIVIEKTVDGKKSEKYVQCDYKYAIDITKLT 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PDB accession: NA
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Structure class: Alpha Beta
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General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
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