| Definition | Ehrlichia ruminantium str. Gardel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006831 |
| Length | 1,499,920 |
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The map label for this gene is 58617462
Identifier: 58617462
GI number: 58617462
Start: 1169548
End: 1172247
Strand: Reverse
Name: 58617462
Synonym: ERGA_CDS_07350
Alternate gene names: NA
Gene position: 1172247-1169548 (Counterclockwise)
Preceding gene: 58617463
Following gene: 58617461
Centisome position: 78.15
GC content: 33.19
Gene sequence:
>2700_bases TTGTTTATATTAAAAAATTATATATTATTAATGATAACCTATAAAGAAGTATTAAATATGAATATAAGAATGCTCATGCT TATTATATTTACGGTATTCATTATTATGCTCGTAATTGCTAGTTGTATAGTGTATTGTTGTAAGAGAATTTATGAAAGAG AAGGAAGAAATACTTTAATAAATAGTAATCTAGAGGGGGAATCTGAGCCTTCTTCAGTAAGTTCTAAAACTATAGCTGGT AAAGAATTAGAAGAGCGAAAAGATTGCGTCATTGGAGTAGATCCTTCTGATAGTGAAAGTGTTAATTTAAATGATCAAAA TAGTGAAAGTTTTCCTGAGGGTCTAGATGGTATGACGGAGACGGGTATGGAGACTGTAGAATATAAATATGGTGATCAAT TTATATATGATGAGCAAGGTAGTAAAAGATTACAAGAAGATGGTGTTCTTACTACTGATAGTATGGAAGAATGTGATGAG TTTTTTAGTAATGGTATACAAAGATGGGGTAGACCTTGTAGAATATTAAATCAGTGTGATGGTGAAGATATTGTTCAAAA AAAGCGTTCCTATTCCATAACTAACTTATCTTCAGAAGTTGAACATTTCGATAGTTATTTATCTCCAAAGCGTAGAGTTT TTCTGGATGGTTTGTGTTTGTGTGATAATCCAAAAGTTGGGCAATATGCTAGTGATAGCTTTATTGGTGGTGGTGGATTA TTAGGTAAATCTGCTTTCTCTCAACAATATAGAATGGAGTTTGGATTCCATGGTAGTCTTGGAACACTTGACCAGAGTTT AGGTGGGAATGACTTTATTGTTCGATCTGATAAACAGAACGATTTTATATTTGCAAGTGCTGATACTCGCTGGTTGAGAA ATTTGTCCAGGTATAGGGATACTAAGTCTACTGGTTGTGATATAAGTGACCTTGCTATTCGTGGCATTGATATGCAAGAT GCTCTTTCAGATACACCATGTAAAGGTTTGGAAGGGGTTGTATCATCTGGACATAGTTTTCTAGTTGGTCAAGAAGATAC AACTGGTAAACTCTCAGATTCTTGTACACAATTTTCATATTCTAAAAAGGCTAGTAGTACAAGTACTGCTGTTTCTGATA ATAATCAGACTGCTATGTCTTCGCGAGATTTAGGACTTGTAATCAGAACTATGATAAGTGGTAATGCTGGTGATCAACGA TTGTTAAGTCAGATGACAAGTATGACCTGTGAAAATCTGTTCAAACTATTATCAAATGTATGTCTGAATGTAAGCTTAAT GCTGAGTAATCCACGAGTTAATATGTATTTGATGTTTAATAATCCAATGACTAGTATGTCCTTGATTTTTAGTAATCCGC AAGCTTTTCGAGAAGCTATAATCTATGCTGGGCGTGCTATAGTTGAGAGTGGTAATAGATCTGTAGGGATTATGAATGCA AGAAATAGAAAAGTGTGTTCTAATAGTAAGAAGAGTGATACTAAGCATGTTAAAGATGCTGATGAGCATCGTAAGAGAAA AGAGACCGAGCCTATAAGTCGTCGTACTAGACTGTCATTAGTAAGTCCAGCAATTAGTCATGGTCAGAAAGTTAGTGTGG CTTCTAGTAGGGTAGGTGGTATTCATGATACTAGTGGTGTTCGTGAAAGTAGAAAAAATGAAAGTAGTGTAGATCGTACT GTATTACCACATGTAAATTTAAGATCTGTAAAGCATAGGGTTGAAAGTGAAGGTAGATTTATAGGTCAAGAGTCTACTTG TTTGAATGCAGATAAGTTAAGGGAGAATCGAGGTTTAAGTAATACTACATACTTGTTTAGAGATGATGAATATGACGTGT CTCAAATAATGGTTCACCACAAAACACAAGAAGTAATGAAAATTGATCCTCATGATTTATTGGTATCAGCATGGGATATC GAGAGTGATAGACTAGATAGTTTGTTGTCGGAAATAAATGATGAGAATTTACAGAATAAAATTAAGCATGAATGTATTGA TGCATATAGTCTGATGTTGAATGCTATACAACGTATGGATAAACAAGTAATGCCTGTTATTATACGTGACTTTGCTGCTC AGCGTGGTATGACATTGTATAAAAAGTCTAAAGCATCACTTGTAAAAGAATGTGTTTACTTATTGGCAAGGGATATGGGA GTATATGATGCTAATCCCGGTGATCGAGAGTTTTTGATTTCTGAATTAGAGAATCAAGTAAAATCTTATATGTGTTCTGA ATATGTCACACAAGTATATGATAGTATTCAAAAAGAAGCGATCACAGTAGCATATAAGAATGTTTTGATCATGGCGGTTA GTAAAATGCGGTTTAAATATAGGGCTGTACATAATATGGTAACCAGATATATAGAACATGAAAATCATTCTCAAAGTTCA GTGTTCGGTACATTAATGTCTAAAGTGATGAATAATGATAAATGGGAACTTGATATATTGAAATCAATTCAGAAATTGAC TTCATTTTTTAGTGATAAGATAGAAAAGAAAGCTACAGTTCTAGTTAAAGAATATTTAAAAAACAATATAAGAGAAGTTT CAAGCGCTATTATTGTAAGTAATGTTGTAGAACGGATTAAGAACAATAAGATATATATTCCTTCAGAAAAGTTACCATCT TATACTGATGTGAGTTGTGTAATGAGTGATAGTAGATCTTCTATAAGAAGTAGTATTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTTATATCAATAACTTGTTACATGTTATGATATATATTTATAATTTTAAGAATTATCATAAAAATTTCCGTTAAAATAG TATATTTTTATTAAATAGTC
Downstream 100 bases:
>100_bases CCACTTTATGATGTGCTAATATAGTAAAGATTATCATTTGATATTAGTTTATTTATATTAAAAATTAGTATTATTTAAAA ATATAATATAGATTTAATAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 899; Mature: 899
Protein sequence:
>899_residues MFILKNYILLMITYKEVLNMNIRMLMLIIFTVFIIMLVIASCIVYCCKRIYEREGRNTLINSNLEGESEPSSVSSKTIAG KELEERKDCVIGVDPSDSESVNLNDQNSESFPEGLDGMTETGMETVEYKYGDQFIYDEQGSKRLQEDGVLTTDSMEECDE FFSNGIQRWGRPCRILNQCDGEDIVQKKRSYSITNLSSEVEHFDSYLSPKRRVFLDGLCLCDNPKVGQYASDSFIGGGGL LGKSAFSQQYRMEFGFHGSLGTLDQSLGGNDFIVRSDKQNDFIFASADTRWLRNLSRYRDTKSTGCDISDLAIRGIDMQD ALSDTPCKGLEGVVSSGHSFLVGQEDTTGKLSDSCTQFSYSKKASSTSTAVSDNNQTAMSSRDLGLVIRTMISGNAGDQR LLSQMTSMTCENLFKLLSNVCLNVSLMLSNPRVNMYLMFNNPMTSMSLIFSNPQAFREAIIYAGRAIVESGNRSVGIMNA RNRKVCSNSKKSDTKHVKDADEHRKRKETEPISRRTRLSLVSPAISHGQKVSVASSRVGGIHDTSGVRESRKNESSVDRT VLPHVNLRSVKHRVESEGRFIGQESTCLNADKLRENRGLSNTTYLFRDDEYDVSQIMVHHKTQEVMKIDPHDLLVSAWDI ESDRLDSLLSEINDENLQNKIKHECIDAYSLMLNAIQRMDKQVMPVIIRDFAAQRGMTLYKKSKASLVKECVYLLARDMG VYDANPGDREFLISELENQVKSYMCSEYVTQVYDSIQKEAITVAYKNVLIMAVSKMRFKYRAVHNMVTRYIEHENHSQSS VFGTLMSKVMNNDKWELDILKSIQKLTSFFSDKIEKKATVLVKEYLKNNIREVSSAIIVSNVVERIKNNKIYIPSEKLPS YTDVSCVMSDSRSSIRSSI
Sequences:
>Translated_899_residues MFILKNYILLMITYKEVLNMNIRMLMLIIFTVFIIMLVIASCIVYCCKRIYEREGRNTLINSNLEGESEPSSVSSKTIAG KELEERKDCVIGVDPSDSESVNLNDQNSESFPEGLDGMTETGMETVEYKYGDQFIYDEQGSKRLQEDGVLTTDSMEECDE FFSNGIQRWGRPCRILNQCDGEDIVQKKRSYSITNLSSEVEHFDSYLSPKRRVFLDGLCLCDNPKVGQYASDSFIGGGGL LGKSAFSQQYRMEFGFHGSLGTLDQSLGGNDFIVRSDKQNDFIFASADTRWLRNLSRYRDTKSTGCDISDLAIRGIDMQD ALSDTPCKGLEGVVSSGHSFLVGQEDTTGKLSDSCTQFSYSKKASSTSTAVSDNNQTAMSSRDLGLVIRTMISGNAGDQR LLSQMTSMTCENLFKLLSNVCLNVSLMLSNPRVNMYLMFNNPMTSMSLIFSNPQAFREAIIYAGRAIVESGNRSVGIMNA RNRKVCSNSKKSDTKHVKDADEHRKRKETEPISRRTRLSLVSPAISHGQKVSVASSRVGGIHDTSGVRESRKNESSVDRT VLPHVNLRSVKHRVESEGRFIGQESTCLNADKLRENRGLSNTTYLFRDDEYDVSQIMVHHKTQEVMKIDPHDLLVSAWDI ESDRLDSLLSEINDENLQNKIKHECIDAYSLMLNAIQRMDKQVMPVIIRDFAAQRGMTLYKKSKASLVKECVYLLARDMG VYDANPGDREFLISELENQVKSYMCSEYVTQVYDSIQKEAITVAYKNVLIMAVSKMRFKYRAVHNMVTRYIEHENHSQSS VFGTLMSKVMNNDKWELDILKSIQKLTSFFSDKIEKKATVLVKEYLKNNIREVSSAIIVSNVVERIKNNKIYIPSEKLPS YTDVSCVMSDSRSSIRSSI >Mature_899_residues MFILKNYILLMITYKEVLNMNIRMLMLIIFTVFIIMLVIASCIVYCCKRIYEREGRNTLINSNLEGESEPSSVSSKTIAG KELEERKDCVIGVDPSDSESVNLNDQNSESFPEGLDGMTETGMETVEYKYGDQFIYDEQGSKRLQEDGVLTTDSMEECDE FFSNGIQRWGRPCRILNQCDGEDIVQKKRSYSITNLSSEVEHFDSYLSPKRRVFLDGLCLCDNPKVGQYASDSFIGGGGL LGKSAFSQQYRMEFGFHGSLGTLDQSLGGNDFIVRSDKQNDFIFASADTRWLRNLSRYRDTKSTGCDISDLAIRGIDMQD ALSDTPCKGLEGVVSSGHSFLVGQEDTTGKLSDSCTQFSYSKKASSTSTAVSDNNQTAMSSRDLGLVIRTMISGNAGDQR LLSQMTSMTCENLFKLLSNVCLNVSLMLSNPRVNMYLMFNNPMTSMSLIFSNPQAFREAIIYAGRAIVESGNRSVGIMNA RNRKVCSNSKKSDTKHVKDADEHRKRKETEPISRRTRLSLVSPAISHGQKVSVASSRVGGIHDTSGVRESRKNESSVDRT VLPHVNLRSVKHRVESEGRFIGQESTCLNADKLRENRGLSNTTYLFRDDEYDVSQIMVHHKTQEVMKIDPHDLLVSAWDI ESDRLDSLLSEINDENLQNKIKHECIDAYSLMLNAIQRMDKQVMPVIIRDFAAQRGMTLYKKSKASLVKECVYLLARDMG VYDANPGDREFLISELENQVKSYMCSEYVTQVYDSIQKEAITVAYKNVLIMAVSKMRFKYRAVHNMVTRYIEHENHSQSS VFGTLMSKVMNNDKWELDILKSIQKLTSFFSDKIEKKATVLVKEYLKNNIREVSSAIIVSNVVERIKNNKIYIPSEKLPS YTDVSCVMSDSRSSIRSSI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 101505; Mature: 101505
Theoretical pI: Translated: 6.92; Mature: 6.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.2 %Cys (Translated Protein) 3.9 %Met (Translated Protein) 6.1 %Cys+Met (Translated Protein) 2.2 %Cys (Mature Protein) 3.9 %Met (Mature Protein) 6.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFILKNYILLMITYKEVLNMNIRMLMLIIFTVFIIMLVIASCIVYCCKRIYEREGRNTLI CEEHHHHHHHHEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE NSNLEGESEPSSVSSKTIAGKELEERKDCVIGVDPSDSESVNLNDQNSESFPEGLDGMTE CCCCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEECCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHCCCHHH TGMETVEYKYGDQFIYDEQGSKRLQEDGVLTTDSMEECDEFFSNGIQRWGRPCRILNQCD CCCHHHEEECCCEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCC GEDIVQKKRSYSITNLSSEVEHFDSYLSPKRRVFLDGLCLCDNPKVGQYASDSFIGGGGL CHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCH LGKSAFSQQYRMEFGFHGSLGTLDQSLGGNDFIVRSDKQNDFIFASADTRWLRNLSRYRD HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHC TKSTGCDISDLAIRGIDMQDALSDTPCKGLEGVVSSGHSFLVGQEDTTGKLSDSCTQFSY CCCCCCCHHHHHEECCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHH SKKASSTSTAVSDNNQTAMSSRDLGLVIRTMISGNAGDQRLLSQMTSMTCENLFKLLSNV HHCCCCCCCEECCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CLNVSLMLSNPRVNMYLMFNNPMTSMSLIFSNPQAFREAIIYAGRAIVESGNRSVGIMNA HCEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECC RNRKVCSNSKKSDTKHVKDADEHRKRKETEPISRRTRLSLVSPAISHGQKVSVASSRVGG CCCHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHCCCC IHDTSGVRESRKNESSVDRTVLPHVNLRSVKHRVESEGRFIGQESTCLNADKLRENRGLS CCCCHHHHHHHCCHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCHHHHHHCCCCC NTTYLFRDDEYDVSQIMVHHKTQEVMKIDPHDLLVSAWDIESDRLDSLLSEINDENLQNK CCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHH IKHECIDAYSLMLNAIQRMDKQVMPVIIRDFAAQRGMTLYKKSKASLVKECVYLLARDMG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC VYDANPGDREFLISELENQVKSYMCSEYVTQVYDSIQKEAITVAYKNVLIMAVSKMRFKY CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RAVHNMVTRYIEHENHSQSSVFGTLMSKVMNNDKWELDILKSIQKLTSFFSDKIEKKATV HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVKEYLKNNIREVSSAIIVSNVVERIKNNKIYIPSEKLPSYTDVSCVMSDSRSSIRSSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MFILKNYILLMITYKEVLNMNIRMLMLIIFTVFIIMLVIASCIVYCCKRIYEREGRNTLI CEEHHHHHHHHEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE NSNLEGESEPSSVSSKTIAGKELEERKDCVIGVDPSDSESVNLNDQNSESFPEGLDGMTE CCCCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHCCCCEEEECCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHCCCHHH TGMETVEYKYGDQFIYDEQGSKRLQEDGVLTTDSMEECDEFFSNGIQRWGRPCRILNQCD CCCHHHEEECCCEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCC GEDIVQKKRSYSITNLSSEVEHFDSYLSPKRRVFLDGLCLCDNPKVGQYASDSFIGGGGL CHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCH LGKSAFSQQYRMEFGFHGSLGTLDQSLGGNDFIVRSDKQNDFIFASADTRWLRNLSRYRD HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHC TKSTGCDISDLAIRGIDMQDALSDTPCKGLEGVVSSGHSFLVGQEDTTGKLSDSCTQFSY CCCCCCCHHHHHEECCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHH SKKASSTSTAVSDNNQTAMSSRDLGLVIRTMISGNAGDQRLLSQMTSMTCENLFKLLSNV HHCCCCCCCEECCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CLNVSLMLSNPRVNMYLMFNNPMTSMSLIFSNPQAFREAIIYAGRAIVESGNRSVGIMNA HCEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECC RNRKVCSNSKKSDTKHVKDADEHRKRKETEPISRRTRLSLVSPAISHGQKVSVASSRVGG CCCHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHCCCC IHDTSGVRESRKNESSVDRTVLPHVNLRSVKHRVESEGRFIGQESTCLNADKLRENRGLS CCCCHHHHHHHCCHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCHHHHHHCCCCC NTTYLFRDDEYDVSQIMVHHKTQEVMKIDPHDLLVSAWDIESDRLDSLLSEINDENLQNK CCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHH IKHECIDAYSLMLNAIQRMDKQVMPVIIRDFAAQRGMTLYKKSKASLVKECVYLLARDMG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC VYDANPGDREFLISELENQVKSYMCSEYVTQVYDSIQKEAITVAYKNVLIMAVSKMRFKY CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RAVHNMVTRYIEHENHSQSSVFGTLMSKVMNNDKWELDILKSIQKLTSFFSDKIEKKATV HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVKEYLKNNIREVSSAIIVSNVVERIKNNKIYIPSEKLPSYTDVSCVMSDSRSSIRSSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA