| Definition | Ehrlichia ruminantium str. Gardel, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006831 |
| Length | 1,499,920 |
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The map label for this gene is 58617461
Identifier: 58617461
GI number: 58617461
Start: 1165819
End: 1169340
Strand: Reverse
Name: 58617461
Synonym: ERGA_CDS_07340
Alternate gene names: NA
Gene position: 1169340-1165819 (Counterclockwise)
Preceding gene: 58617462
Following gene: 58617460
Centisome position: 77.96
GC content: 32.08
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1173; Mature: 1173
Protein sequence:
>1173_residues MNEIILYTAVSLFFICVYYVLLVVRFVCYVLSVMKYKSKELDISDNYTKSRVTYCSQSEYEKYEMDTLSGKDGIEFLKSV YHNDSDDIGHVLKSKSTVSSTKMDQVTHQVPGVQTIEHDSAIEGHQVMDKENAGVGVHYSHTETTIKTSLSFKSDVMVDT KDKSVEKKVVPENTIRINEKKRDVFVSASIQTDIKSNQVKLSSSVLEKPDEKSDVTDTACTGSTKDKSVEEKVVPEGDTI RINEKKRDVFVSASAQTGDMKSDQVKLSGSRLEKLDERKDVTDTGCAGSTKDKSVEKKVVSEGTAIRDEKESSVARSVGV TFNLQSGNVKDDKVKLSGVDLGKIEDSVLSASSCETTVKDNKPVICVGKESTFQLASSLDLVNTVEDSSRNTRGLSETCS LMLDFDRNGNPVYEEATSKLVPSFYPDNVIYHTKEKHCGVDLPQSEDQLYSCITNVHSQYDVTENSVSVYPRDLVPDDIK QAKQNEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQYDVTENSVSVCQSDLVPDDIKQAKQSEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQYDVTENS VSVYQSDLVSDNIKQAKQNEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQYDMTENSVSVCQSDLVPDGVKQSKQHEDTKQGAFIVTGSV SAKLDIVDVVSLGEKRDIDEKVVKSSGCTTADSVSNPVGMDKVQYCVPDLEMRVKMDLVEDHHNMASMEKCYPDREVVEQ LSNVTTCLVSTPVIEHRVHSVESVAELQVKIGPLDEGKCKDSVVRSSSFTSDTCLKDTGATMTVEEYGNKPSTGLCASRG DDSVSSMIGIGSYFIDKMICDIDTTVQLNNTFSTLEKRKNCFIDNIKKNNEKIFSNLVNIMDLIKETVGIQFFDTKSTDD ISRYVMEQSSGVYDDVMSQMLIQDEKYLFKVFKHIIPVFAKIFFNNDPISSMEWKLVDELFSMRRAVLQDNVYFQRIFYC IVCACEKTAGTIKKIQSLSKQCDEIREKIKKCNLRQGKKKSALSKFTDHFSEKKEDLLCLLDKIEKELNLTKQVYTNLIA EKEALLTGDVAYIRYFVSRIVFDSWKFDDKAKQVVKNIKNLAPYVLCDVLYEEEKKYLGLVKCIVCEYTVFYKDIDNFLP IVQQYHDRRQSRSAAAQKFYDQEIDGVLPMDTLEGVGDLVAMELGQNSKCNAH
Sequences:
>Translated_1173_residues MNEIILYTAVSLFFICVYYVLLVVRFVCYVLSVMKYKSKELDISDNYTKSRVTYCSQSEYEKYEMDTLSGKDGIEFLKSV YHNDSDDIGHVLKSKSTVSSTKMDQVTHQVPGVQTIEHDSAIEGHQVMDKENAGVGVHYSHTETTIKTSLSFKSDVMVDT KDKSVEKKVVPENTIRINEKKRDVFVSASIQTDIKSNQVKLSSSVLEKPDEKSDVTDTACTGSTKDKSVEEKVVPEGDTI RINEKKRDVFVSASAQTGDMKSDQVKLSGSRLEKLDERKDVTDTGCAGSTKDKSVEKKVVSEGTAIRDEKESSVARSVGV TFNLQSGNVKDDKVKLSGVDLGKIEDSVLSASSCETTVKDNKPVICVGKESTFQLASSLDLVNTVEDSSRNTRGLSETCS LMLDFDRNGNPVYEEATSKLVPSFYPDNVIYHTKEKHCGVDLPQSEDQLYSCITNVHSQYDVTENSVSVYPRDLVPDDIK QAKQNEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQYDVTENSVSVCQSDLVPDDIKQAKQSEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQYDVTENS VSVYQSDLVSDNIKQAKQNEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQYDMTENSVSVCQSDLVPDGVKQSKQHEDTKQGAFIVTGSV SAKLDIVDVVSLGEKRDIDEKVVKSSGCTTADSVSNPVGMDKVQYCVPDLEMRVKMDLVEDHHNMASMEKCYPDREVVEQ LSNVTTCLVSTPVIEHRVHSVESVAELQVKIGPLDEGKCKDSVVRSSSFTSDTCLKDTGATMTVEEYGNKPSTGLCASRG DDSVSSMIGIGSYFIDKMICDIDTTVQLNNTFSTLEKRKNCFIDNIKKNNEKIFSNLVNIMDLIKETVGIQFFDTKSTDD ISRYVMEQSSGVYDDVMSQMLIQDEKYLFKVFKHIIPVFAKIFFNNDPISSMEWKLVDELFSMRRAVLQDNVYFQRIFYC IVCACEKTAGTIKKIQSLSKQCDEIREKIKKCNLRQGKKKSALSKFTDHFSEKKEDLLCLLDKIEKELNLTKQVYTNLIA EKEALLTGDVAYIRYFVSRIVFDSWKFDDKAKQVVKNIKNLAPYVLCDVLYEEEKKYLGLVKCIVCEYTVFYKDIDNFLP IVQQYHDRRQSRSAAAQKFYDQEIDGVLPMDTLEGVGDLVAMELGQNSKCNAH >Mature_1173_residues MNEIILYTAVSLFFICVYYVLLVVRFVCYVLSVMKYKSKELDISDNYTKSRVTYCSQSEYEKYEMDTLSGKDGIEFLKSV YHNDSDDIGHVLKSKSTVSSTKMDQVTHQVPGVQTIEHDSAIEGHQVMDKENAGVGVHYSHTETTIKTSLSFKSDVMVDT KDKSVEKKVVPENTIRINEKKRDVFVSASIQTDIKSNQVKLSSSVLEKPDEKSDVTDTACTGSTKDKSVEEKVVPEGDTI RINEKKRDVFVSASAQTGDMKSDQVKLSGSRLEKLDERKDVTDTGCAGSTKDKSVEKKVVSEGTAIRDEKESSVARSVGV TFNLQSGNVKDDKVKLSGVDLGKIEDSVLSASSCETTVKDNKPVICVGKESTFQLASSLDLVNTVEDSSRNTRGLSETCS LMLDFDRNGNPVYEEATSKLVPSFYPDNVIYHTKEKHCGVDLPQSEDQLYSCITNVHSQYDVTENSVSVYPRDLVPDDIK QAKQNEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQYDVTENSVSVCQSDLVPDDIKQAKQSEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQYDVTENS VSVYQSDLVSDNIKQAKQNEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQYDMTENSVSVCQSDLVPDGVKQSKQHEDTKQGAFIVTGSV SAKLDIVDVVSLGEKRDIDEKVVKSSGCTTADSVSNPVGMDKVQYCVPDLEMRVKMDLVEDHHNMASMEKCYPDREVVEQ LSNVTTCLVSTPVIEHRVHSVESVAELQVKIGPLDEGKCKDSVVRSSSFTSDTCLKDTGATMTVEEYGNKPSTGLCASRG DDSVSSMIGIGSYFIDKMICDIDTTVQLNNTFSTLEKRKNCFIDNIKKNNEKIFSNLVNIMDLIKETVGIQFFDTKSTDD ISRYVMEQSSGVYDDVMSQMLIQDEKYLFKVFKHIIPVFAKIFFNNDPISSMEWKLVDELFSMRRAVLQDNVYFQRIFYC IVCACEKTAGTIKKIQSLSKQCDEIREKIKKCNLRQGKKKSALSKFTDHFSEKKEDLLCLLDKIEKELNLTKQVYTNLIA EKEALLTGDVAYIRYFVSRIVFDSWKFDDKAKQVVKNIKNLAPYVLCDVLYEEEKKYLGLVKCIVCEYTVFYKDIDNFLP IVQQYHDRRQSRSAAAQKFYDQEIDGVLPMDTLEGVGDLVAMELGQNSKCNAH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 130823; Mature: 130823
Theoretical pI: Translated: 4.99; Mature: 4.99
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.6 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 4.8 %Cys+Met (Translated Protein) 2.6 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNEIILYTAVSLFFICVYYVLLVVRFVCYVLSVMKYKSKELDISDNYTKSRVTYCSQSEY CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHEECCCCCC EKYEMDTLSGKDGIEFLKSVYHNDSDDIGHVLKSKSTVSSTKMDQVTHQVPGVQTIEHDS HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCC AIEGHQVMDKENAGVGVHYSHTETTIKTSLSFKSDVMVDTKDKSVEKKVVPENTIRINEK CCCCHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHEEECCCCCCEEEECCCCCHHHHCCCCCCEEECCC KRDVFVSASIQTDIKSNQVKLSSSVLEKPDEKSDVTDTACTGSTKDKSVEEKVVPEGDTI CCEEEEEEEEECCCCCCCEEEHHHHHCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCHHHHCCCCCCEE RINEKKRDVFVSASAQTGDMKSDQVKLSGSRLEKLDERKDVTDTGCAGSTKDKSVEKKVV EECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH SEGTAIRDEKESSVARSVGVTFNLQSGNVKDDKVKLSGVDLGKIEDSVLSASSCETTVKD HCCCCCCCHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCC NKPVICVGKESTFQLASSLDLVNTVEDSSRNTRGLSETCSLMLDFDRNGNPVYEEATSKL CCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHC VPSFYPDNVIYHTKEKHCGVDLPQSEDQLYSCITNVHSQYDVTENSVSVYPRDLVPDDIK CCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCHHHH QAKQNEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQYDVTENSVSVCQSDLVPDDIKQAKQSEDTKQGAF HHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEE IATGSTTAAAHSQYDVTENSVSVYQSDLVSDNIKQAKQNEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQ EEECCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHCCC YDMTENSVSVCQSDLVPDGVKQSKQHEDTKQGAFIVTGSVSAKLDIVDVVSLGEKRDIDE CCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHCCEEEEECCCCCEEEHHHHHHCCCCCCHHH KVVKSSGCTTADSVSNPVGMDKVQYCVPDLEMRVKMDLVEDHHNMASMEKCYPDREVVEQ HHHHCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH LSNVTTCLVSTPVIEHRVHSVESVAELQVKIGPLDEGKCKDSVVRSSSFTSDTCLKDTGA HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCC TMTVEEYGNKPSTGLCASRGDDSVSSMIGIGSYFIDKMICDIDTTVQLNNTFSTLEKRKN EEEHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHH CFIDNIKKNNEKIFSNLVNIMDLIKETVGIQFFDTKSTDDISRYVMEQSSGVYDDVMSQM HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH LIQDEKYLFKVFKHIIPVFAKIFFNNDPISSMEWKLVDELFSMRRAVLQDNVYFQRIFYC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH IVCACEKTAGTIKKIQSLSKQCDEIREKIKKCNLRQGKKKSALSKFTDHFSEKKEDLLCL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDKIEKELNLTKQVYTNLIAEKEALLTGDVAYIRYFVSRIVFDSWKFDDKAKQVVKNIKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LAPYVLCDVLYEEEKKYLGLVKCIVCEYTVFYKDIDNFLPIVQQYHDRRQSRSAAAQKFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DQEIDGVLPMDTLEGVGDLVAMELGQNSKCNAH HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNEIILYTAVSLFFICVYYVLLVVRFVCYVLSVMKYKSKELDISDNYTKSRVTYCSQSEY CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHEECCCCCC EKYEMDTLSGKDGIEFLKSVYHNDSDDIGHVLKSKSTVSSTKMDQVTHQVPGVQTIEHDS HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCC AIEGHQVMDKENAGVGVHYSHTETTIKTSLSFKSDVMVDTKDKSVEKKVVPENTIRINEK CCCCHHHHCCCCCCCCEEECCCCHHHEEECCCCCCEEEECCCCCHHHHCCCCCCEEECCC KRDVFVSASIQTDIKSNQVKLSSSVLEKPDEKSDVTDTACTGSTKDKSVEEKVVPEGDTI CCEEEEEEEEECCCCCCCEEEHHHHHCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCHHHHCCCCCCEE RINEKKRDVFVSASAQTGDMKSDQVKLSGSRLEKLDERKDVTDTGCAGSTKDKSVEKKVV EECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH SEGTAIRDEKESSVARSVGVTFNLQSGNVKDDKVKLSGVDLGKIEDSVLSASSCETTVKD HCCCCCCCHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCC NKPVICVGKESTFQLASSLDLVNTVEDSSRNTRGLSETCSLMLDFDRNGNPVYEEATSKL CCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHC VPSFYPDNVIYHTKEKHCGVDLPQSEDQLYSCITNVHSQYDVTENSVSVYPRDLVPDDIK CCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCHHHH QAKQNEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQYDVTENSVSVCQSDLVPDDIKQAKQSEDTKQGAF HHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEE IATGSTTAAAHSQYDVTENSVSVYQSDLVSDNIKQAKQNEDTKQGAFIATGSTTAAAHSQ EEECCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHCCC YDMTENSVSVCQSDLVPDGVKQSKQHEDTKQGAFIVTGSVSAKLDIVDVVSLGEKRDIDE CCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHCCEEEEECCCCCEEEHHHHHHCCCCCCHHH KVVKSSGCTTADSVSNPVGMDKVQYCVPDLEMRVKMDLVEDHHNMASMEKCYPDREVVEQ HHHHCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH LSNVTTCLVSTPVIEHRVHSVESVAELQVKIGPLDEGKCKDSVVRSSSFTSDTCLKDTGA HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCC TMTVEEYGNKPSTGLCASRGDDSVSSMIGIGSYFIDKMICDIDTTVQLNNTFSTLEKRKN EEEHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHH CFIDNIKKNNEKIFSNLVNIMDLIKETVGIQFFDTKSTDDISRYVMEQSSGVYDDVMSQM HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH LIQDEKYLFKVFKHIIPVFAKIFFNNDPISSMEWKLVDELFSMRRAVLQDNVYFQRIFYC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH IVCACEKTAGTIKKIQSLSKQCDEIREKIKKCNLRQGKKKSALSKFTDHFSEKKEDLLCL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDKIEKELNLTKQVYTNLIAEKEALLTGDVAYIRYFVSRIVFDSWKFDDKAKQVVKNIKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LAPYVLCDVLYEEEKKYLGLVKCIVCEYTVFYKDIDNFLPIVQQYHDRRQSRSAAAQKFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DQEIDGVLPMDTLEGVGDLVAMELGQNSKCNAH HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA