| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is 57238505
Identifier: 57238505
GI number: 57238505
Start: 1557225
End: 1559591
Strand: Reverse
Name: 57238505
Synonym: CJE1655
Alternate gene names: NA
Gene position: 1559591-1557225 (Counterclockwise)
Preceding gene: 57238506
Following gene: 57238504
Centisome position: 87.72
GC content: 25.81
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TCGCTTTACCTAAATTAGATAAAGGTAGATGGGAGCTTAAGCTAAAGTTTTATGCAAATCAAGAAACAGTGGGTTTTTTT AGCTACGAATTAAATGCTCA
Downstream 100 bases:
>100_bases GTCAATTTGAGCCTTTTTTGGCATTAGAAGCGAGTGCAGGAAGCGGAAAAACCTTTGCCCTGAGTGTGCGTTTTGTAGCA CTTATTTTAAAAGGAGCTAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 788; Mature: 788
Protein sequence:
>788_residues MKLRIFSSSRQIREYYNQKKQQNALLDSAIHIGEFLDKVCLSNFHKASSYESLLLMQEACLKSKDLEKKLGISVEFFAFL KNNEYLFSFFKELSLEKKSIEDLKNNDYYATYNEHLEILDEVYKNYLALLEKNSFYDDLSLPKNYTLNKDFLDEYEAIVY DLQGFLSKFEENLLSEISQIKEVVLSFKTSKFNLEYLLKLDFLKIFDLKINTHYEINLSKQEILKEEIFKTKNSKMKLKS FELRALQCAFVMDEISHFVRKGLKPENIAVITPDESFCEFLRLFDKDNMLNFASGISIKESLFYQKFQALYESASSASFV YKNQEDYFEDTQMIFDYHNTLLHSLKLDFIEFKKYFDEKCDFEYFEKLLALFLENEKQELMYLIRKELYFIKDLLKNQSL TLKELIHLFFMQISQLSLSDVGGGKVTVMGLLESRGLCFDGVILVDFNEEFIPKRSVNELFLNNEVRKKAGLISYDRREN LQRFYYESLMKNALEVSICFVENEEKSKSRFLDELDFDFFYETHIHQKAYLNALKLDYEGIKPNLTPIKAPILKHNPFEF PLSFSRFNLLENQKRTYYYRYILNLAEPRVLSEESKAKNQGNFIHKMLEIYYKNYANNDFDIKVFANLLDKEYQKYNISE LDLEVFKLKFIQFAKNEKEHFSKGFYVVHTELELNNILKLGTDSIKLKGTIDRIDSSKEGNLIIDYKSGKVPSNSYQLAF YQALYDKNASVGFYDLNSMQILHQKAKSLDELRERLKDLVLMSKEEIEFENEQDEYCPYKLIYKKELK
Sequences:
>Translated_788_residues MKLRIFSSSRQIREYYNQKKQQNALLDSAIHIGEFLDKVCLSNFHKASSYESLLLMQEACLKSKDLEKKLGISVEFFAFL KNNEYLFSFFKELSLEKKSIEDLKNNDYYATYNEHLEILDEVYKNYLALLEKNSFYDDLSLPKNYTLNKDFLDEYEAIVY DLQGFLSKFEENLLSEISQIKEVVLSFKTSKFNLEYLLKLDFLKIFDLKINTHYEINLSKQEILKEEIFKTKNSKMKLKS FELRALQCAFVMDEISHFVRKGLKPENIAVITPDESFCEFLRLFDKDNMLNFASGISIKESLFYQKFQALYESASSASFV YKNQEDYFEDTQMIFDYHNTLLHSLKLDFIEFKKYFDEKCDFEYFEKLLALFLENEKQELMYLIRKELYFIKDLLKNQSL TLKELIHLFFMQISQLSLSDVGGGKVTVMGLLESRGLCFDGVILVDFNEEFIPKRSVNELFLNNEVRKKAGLISYDRREN LQRFYYESLMKNALEVSICFVENEEKSKSRFLDELDFDFFYETHIHQKAYLNALKLDYEGIKPNLTPIKAPILKHNPFEF PLSFSRFNLLENQKRTYYYRYILNLAEPRVLSEESKAKNQGNFIHKMLEIYYKNYANNDFDIKVFANLLDKEYQKYNISE LDLEVFKLKFIQFAKNEKEHFSKGFYVVHTELELNNILKLGTDSIKLKGTIDRIDSSKEGNLIIDYKSGKVPSNSYQLAF YQALYDKNASVGFYDLNSMQILHQKAKSLDELRERLKDLVLMSKEEIEFENEQDEYCPYKLIYKKELK >Mature_788_residues MKLRIFSSSRQIREYYNQKKQQNALLDSAIHIGEFLDKVCLSNFHKASSYESLLLMQEACLKSKDLEKKLGISVEFFAFL KNNEYLFSFFKELSLEKKSIEDLKNNDYYATYNEHLEILDEVYKNYLALLEKNSFYDDLSLPKNYTLNKDFLDEYEAIVY DLQGFLSKFEENLLSEISQIKEVVLSFKTSKFNLEYLLKLDFLKIFDLKINTHYEINLSKQEILKEEIFKTKNSKMKLKS FELRALQCAFVMDEISHFVRKGLKPENIAVITPDESFCEFLRLFDKDNMLNFASGISIKESLFYQKFQALYESASSASFV YKNQEDYFEDTQMIFDYHNTLLHSLKLDFIEFKKYFDEKCDFEYFEKLLALFLENEKQELMYLIRKELYFIKDLLKNQSL TLKELIHLFFMQISQLSLSDVGGGKVTVMGLLESRGLCFDGVILVDFNEEFIPKRSVNELFLNNEVRKKAGLISYDRREN LQRFYYESLMKNALEVSICFVENEEKSKSRFLDELDFDFFYETHIHQKAYLNALKLDYEGIKPNLTPIKAPILKHNPFEF PLSFSRFNLLENQKRTYYYRYILNLAEPRVLSEESKAKNQGNFIHKMLEIYYKNYANNDFDIKVFANLLDKEYQKYNISE LDLEVFKLKFIQFAKNEKEHFSKGFYVVHTELELNNILKLGTDSIKLKGTIDRIDSSKEGNLIIDYKSGKVPSNSYQLAF YQALYDKNASVGFYDLNSMQILHQKAKSLDELRERLKDLVLMSKEEIEFENEQDEYCPYKLIYKKELK
Specific function: Unknown
COG id: COG3893
COG function: function code L; Inactivated superfamily I helicase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 93623; Mature: 93623
Theoretical pI: Translated: 5.66; Mature: 5.66
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKLRIFSSSRQIREYYNQKKQQNALLDSAIHIGEFLDKVCLSNFHKASSYESLLLMQEAC CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH LKSKDLEKKLGISVEFFAFLKNNEYLFSFFKELSLEKKSIEDLKNNDYYATYNEHLEILD HCCCCHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHH EVYKNYLALLEKNSFYDDLSLPKNYTLNKDFLDEYEAIVYDLQGFLSKFEENLLSEISQI HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEVVLSFKTSKFNLEYLLKLDFLKIFDLKINTHYEINLSKQEILKEEIFKTKNSKMKLKS HHHHHHHCCCCCCHHHHHEEHHEEEEEEEECCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHH FELRALQCAFVMDEISHFVRKGLKPENIAVITPDESFCEFLRLFDKDNMLNFASGISIKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHH SLFYQKFQALYESASSASFVYKNQEDYFEDTQMIFDYHNTLLHSLKLDFIEFKKYFDEKC HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC DFEYFEKLLALFLENEKQELMYLIRKELYFIKDLLKNQSLTLKELIHLFFMQISQLSLSD CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC VGGGKVTVMGLLESRGLCFDGVILVDFNEEFIPKRSVNELFLNNEVRKKAGLISYDRREN CCCCEEEEEEEHHCCCCEECCEEEEECCHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHH LQRFYYESLMKNALEVSICFVENEEKSKSRFLDELDFDFFYETHIHQKAYLNALKLDYEG HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC IKPNLTPIKAPILKHNPFEFPLSFSRFNLLENQKRTYYYRYILNLAEPRVLSEESKAKNQ CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCC GNFIHKMLEIYYKNYANNDFDIKVFANLLDKEYQKYNISELDLEVFKLKFIQFAKNEKEH HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH FSKGFYVVHTELELNNILKLGTDSIKLKGTIDRIDSSKEGNLIIDYKSGKVPSNSYQLAF HCCCEEEEEEEECHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHH YQALYDKNASVGFYDLNSMQILHQKAKSLDELRERLKDLVLMSKEEIEFENEQDEYCPYK HHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCEE LIYKKELK EEEECCCC >Mature Secondary Structure MKLRIFSSSRQIREYYNQKKQQNALLDSAIHIGEFLDKVCLSNFHKASSYESLLLMQEAC CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH LKSKDLEKKLGISVEFFAFLKNNEYLFSFFKELSLEKKSIEDLKNNDYYATYNEHLEILD HCCCCHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHH EVYKNYLALLEKNSFYDDLSLPKNYTLNKDFLDEYEAIVYDLQGFLSKFEENLLSEISQI HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEVVLSFKTSKFNLEYLLKLDFLKIFDLKINTHYEINLSKQEILKEEIFKTKNSKMKLKS HHHHHHHCCCCCCHHHHHEEHHEEEEEEEECCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHH FELRALQCAFVMDEISHFVRKGLKPENIAVITPDESFCEFLRLFDKDNMLNFASGISIKE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHH SLFYQKFQALYESASSASFVYKNQEDYFEDTQMIFDYHNTLLHSLKLDFIEFKKYFDEKC HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC DFEYFEKLLALFLENEKQELMYLIRKELYFIKDLLKNQSLTLKELIHLFFMQISQLSLSD CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC VGGGKVTVMGLLESRGLCFDGVILVDFNEEFIPKRSVNELFLNNEVRKKAGLISYDRREN CCCCEEEEEEEHHCCCCEECCEEEEECCHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHH LQRFYYESLMKNALEVSICFVENEEKSKSRFLDELDFDFFYETHIHQKAYLNALKLDYEG HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC IKPNLTPIKAPILKHNPFEFPLSFSRFNLLENQKRTYYYRYILNLAEPRVLSEESKAKNQ CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCC GNFIHKMLEIYYKNYANNDFDIKVFANLLDKEYQKYNISELDLEVFKLKFIQFAKNEKEH HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH FSKGFYVVHTELELNNILKLGTDSIKLKGTIDRIDSSKEGNLIIDYKSGKVPSNSYQLAF HCCCEEEEEEEECHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHH YQALYDKNASVGFYDLNSMQILHQKAKSLDELRERLKDLVLMSKEEIEFENEQDEYCPYK HHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCCEE LIYKKELK EEEECCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9823893 [H]