| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is yqeW [H]
Identifier: 57238276
GI number: 57238276
Start: 564133
End: 565785
Strand: Direct
Name: yqeW [H]
Synonym: CJE0628
Alternate gene names: 57238276
Gene position: 564133-565785 (Clockwise)
Preceding gene: 57238277
Following gene: 57238270
Centisome position: 31.73
GC content: 29.04
Gene sequence:
>1653_bases GTGGCAATACTTCTTATTGGAATGACTAATTCAGGTATAGGTTTTAAAGCTTTTAGTGGTGGTTTGCTTGAAAAAATTTT AGCGAAGTCAACCGATACAAAGATAAAAAGTATACTTTTTGGTACTTTAAGTACTTTAATTATGCAATCTTCAACTTTAG TTTCTATTATTACGATTTCTTTTTTGAGTGCAGGGCTTATTTCTTTGGGTGCGGGCATAGGGATTATTTTTGGAGCAAAT TTAGGAAATACGGCAAGCTCTTGGCTGATTGTTGGTTTGACAAATATTAAAATTTCAATGCTAGCTATCCCACTTTTGAT TATTGGAGTATTATTTTTCTTTCAAAAAGATAGTGTTTTAAAAGGTTTGGGTAATATTTTTATTGGTATAGGATTTTTCT TTTTGGGTGTGGATTATATTAAAAGTGGTTTTGAAAATTTTAAACATATAATTGATCTTTCTCGTTTTGATTTTGCTGGT TTTAAAGGAGTTTTTGTTTTTTTAGGATTAGGTGCTTTGCTTACAGGAGTTATACAATCAAGCACAGCTACAATGGCTAT TATTGTCGCTGCTTTACTTGCAGGACAAATCAGTTTGGAAAATTCCTTAGCAGCAACTTTAGGTACTAGTGTTGGAGGAG TTGTAACGGCTGTTTTAGCTTCTTTAAGTACCAATATTGAAGGAAAGAAATTAGCGTTTGCAAGTTGTATTTTTAATTTT GGTATAGCTTTTTTAATAGTGCTTATTTTTCCTTATTTTATACATTTTCTTAATTTTTTATCCATTGTATTAAACATAGA AGATATAGCTTTGAAAGTAGCATTATTTCACACTTTGTTTAATTTAATTGGTGTTGTGCTTTTTTCATTCTTTACTCCTC AAATTGTTCTTTTTTTAAATAAGATAGTAAAAGCTCCTAAAGATAAGAATAAAGACAAGCCTTTATATCTTGATAGTAGT TTGGTTAAGTTTAGTGACACAGCCATCGAAGCTTTAAGGAAAGAAAGCGAGCATCTTTATAACAATACCTATGCAATTGT TGCTCATGCTATAGGTTTTAGTCGTAAAGATATACAAAGTGATAAAAGTTTTAAAGAAATTTTAGAAAATAAAAAGTGGT TTAGTAAAAATGTGGATTTGGACTATTTGTATCAAACTAGGATAAAGGTTCTTTTTGAAGCTATTATCGATTTTTCAACT AAAGCACAAGTTTATATTAACGATGAAACAAAGAATCATAAAATTTTTACCTTTAAGATGGCAGCTAAAAATTTAGCCGA AACAACTAAAAATTTAAAAATTATCCAAGCAAATATTAAGAAATATTCTAGTTCTTCTAATGAATTTTTGGCTTTAGAGT ACAATAAAATTAGATCGAATTTAGGAGAGCTTTTAAGAAGTATCGAAGAGCTTAGAGTTGTTGAAGATCGTGAAAAGCTT TATTTGATTATTAAAAATCTTCAAAAAGGAAAAGAAATTTTAAAAGAAATCGATACTTTAACCTTGAGCAATGTTGAACA TCTTATTTCAGTAAGAAAAATCACAACAGCTGAAGGAATTTCAATACTTAATGATACAACTTTTGCTGCTAAGATTGCTG AAGAACTTATAGATGCTGTTGAGGTGATGTTTTCTAAAGATATATCAAACTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCTTTAAAATATTTTAAATTTATTTCATGGAGTATTTTTACTTTAGTTCTGATTTTTATTTTAATTCGTTATGACGAGC TTGCCAATCTTTTAGCAGGA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTGTTTGTGCTAGTTTAGTTATTGTCTTGTATAGGCGTTAGAAATTCTTCATTGATTAAAATATCAACAACATCTTTAAA CATAGGCAAAGCACTTTGTG
Product: Na/Pi-cotransporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 550; Mature: 549
Protein sequence:
>550_residues MAILLIGMTNSGIGFKAFSGGLLEKILAKSTDTKIKSILFGTLSTLIMQSSTLVSIITISFLSAGLISLGAGIGIIFGAN LGNTASSWLIVGLTNIKISMLAIPLLIIGVLFFFQKDSVLKGLGNIFIGIGFFFLGVDYIKSGFENFKHIIDLSRFDFAG FKGVFVFLGLGALLTGVIQSSTATMAIIVAALLAGQISLENSLAATLGTSVGGVVTAVLASLSTNIEGKKLAFASCIFNF GIAFLIVLIFPYFIHFLNFLSIVLNIEDIALKVALFHTLFNLIGVVLFSFFTPQIVLFLNKIVKAPKDKNKDKPLYLDSS LVKFSDTAIEALRKESEHLYNNTYAIVAHAIGFSRKDIQSDKSFKEILENKKWFSKNVDLDYLYQTRIKVLFEAIIDFST KAQVYINDETKNHKIFTFKMAAKNLAETTKNLKIIQANIKKYSSSSNEFLALEYNKIRSNLGELLRSIEELRVVEDREKL YLIIKNLQKGKEILKEIDTLTLSNVEHLISVRKITTAEGISILNDTTFAAKIAEELIDAVEVMFSKDISN
Sequences:
>Translated_550_residues MAILLIGMTNSGIGFKAFSGGLLEKILAKSTDTKIKSILFGTLSTLIMQSSTLVSIITISFLSAGLISLGAGIGIIFGAN LGNTASSWLIVGLTNIKISMLAIPLLIIGVLFFFQKDSVLKGLGNIFIGIGFFFLGVDYIKSGFENFKHIIDLSRFDFAG FKGVFVFLGLGALLTGVIQSSTATMAIIVAALLAGQISLENSLAATLGTSVGGVVTAVLASLSTNIEGKKLAFASCIFNF GIAFLIVLIFPYFIHFLNFLSIVLNIEDIALKVALFHTLFNLIGVVLFSFFTPQIVLFLNKIVKAPKDKNKDKPLYLDSS LVKFSDTAIEALRKESEHLYNNTYAIVAHAIGFSRKDIQSDKSFKEILENKKWFSKNVDLDYLYQTRIKVLFEAIIDFST KAQVYINDETKNHKIFTFKMAAKNLAETTKNLKIIQANIKKYSSSSNEFLALEYNKIRSNLGELLRSIEELRVVEDREKL YLIIKNLQKGKEILKEIDTLTLSNVEHLISVRKITTAEGISILNDTTFAAKIAEELIDAVEVMFSKDISN >Mature_549_residues AILLIGMTNSGIGFKAFSGGLLEKILAKSTDTKIKSILFGTLSTLIMQSSTLVSIITISFLSAGLISLGAGIGIIFGANL GNTASSWLIVGLTNIKISMLAIPLLIIGVLFFFQKDSVLKGLGNIFIGIGFFFLGVDYIKSGFENFKHIIDLSRFDFAGF KGVFVFLGLGALLTGVIQSSTATMAIIVAALLAGQISLENSLAATLGTSVGGVVTAVLASLSTNIEGKKLAFASCIFNFG IAFLIVLIFPYFIHFLNFLSIVLNIEDIALKVALFHTLFNLIGVVLFSFFTPQIVLFLNKIVKAPKDKNKDKPLYLDSSL VKFSDTAIEALRKESEHLYNNTYAIVAHAIGFSRKDIQSDKSFKEILENKKWFSKNVDLDYLYQTRIKVLFEAIIDFSTK AQVYINDETKNHKIFTFKMAAKNLAETTKNLKIIQANIKKYSSSSNEFLALEYNKIRSNLGELLRSIEELRVVEDREKLY LIIKNLQKGKEILKEIDTLTLSNVEHLISVRKITTAEGISILNDTTFAAKIAEELIDAVEVMFSKDISN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To E.coli yjbB [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=341, Percent_Identity=25.5131964809384, Blast_Score=65, Evalue=1e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003841 - InterPro: IPR004633 [H]
Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 60562; Mature: 60431
Theoretical pI: Translated: 9.66; Mature: 9.66
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 1.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAILLIGMTNSGIGFKAFSGGLLEKILAKSTDTKIKSILFGTLSTLIMQSSTLVSIITIS CEEEEEEECCCCCCCHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH FLSAGLISLGAGIGIIFGANLGNTASSWLIVGLTNIKISMLAIPLLIIGVLFFFQKDSVL HHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH KGLGNIFIGIGFFFLGVDYIKSGFENFKHIIDLSRFDFAGFKGVFVFLGLGALLTGVIQS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC STATMAIIVAALLAGQISLENSLAATLGTSVGGVVTAVLASLSTNIEGKKLAFASCIFNF CHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH GIAFLIVLIFPYFIHFLNFLSIVLNIEDIALKVALFHTLFNLIGVVLFSFFTPQIVLFLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIVKAPKDKNKDKPLYLDSSLVKFSDTAIEALRKESEHLYNNTYAIVAHAIGFSRKDIQS HHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHCC DKSFKEILENKKWFSKNVDLDYLYQTRIKVLFEAIIDFSTKAQVYINDETKNHKIFTFKM CHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEEH AAKNLAETTKNLKIIQANIKKYSSSSNEFLALEYNKIRSNLGELLRSIEELRVVEDREKL HHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLIIKNLQKGKEILKEIDTLTLSNVEHLISVRKITTAEGISILNDTTFAAKIAEELIDAV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH EVMFSKDISN HHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure AILLIGMTNSGIGFKAFSGGLLEKILAKSTDTKIKSILFGTLSTLIMQSSTLVSIITIS EEEEEEECCCCCCCHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH FLSAGLISLGAGIGIIFGANLGNTASSWLIVGLTNIKISMLAIPLLIIGVLFFFQKDSVL HHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH KGLGNIFIGIGFFFLGVDYIKSGFENFKHIIDLSRFDFAGFKGVFVFLGLGALLTGVIQS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC STATMAIIVAALLAGQISLENSLAATLGTSVGGVVTAVLASLSTNIEGKKLAFASCIFNF CHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH GIAFLIVLIFPYFIHFLNFLSIVLNIEDIALKVALFHTLFNLIGVVLFSFFTPQIVLFLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KIVKAPKDKNKDKPLYLDSSLVKFSDTAIEALRKESEHLYNNTYAIVAHAIGFSRKDIQS HHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHCC DKSFKEILENKKWFSKNVDLDYLYQTRIKVLFEAIIDFSTKAQVYINDETKNHKIFTFKM CHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEEH AAKNLAETTKNLKIIQANIKKYSSSSNEFLALEYNKIRSNLGELLRSIEELRVVEDREKL HHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLIIKNLQKGKEILKEIDTLTLSNVEHLISVRKITTAEGISILNDTTFAAKIAEELIDAV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH EVMFSKDISN HHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8969508; 9023197; 9384377 [H]