Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is cstA [H]

Identifier: 57237745

GI number: 57237745

Start: 930546

End: 932657

Strand: Reverse

Name: cstA [H]

Synonym: CJE0995

Alternate gene names: 57237745

Gene position: 932657-930546 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57237746

Following gene: 57237744

Centisome position: 52.46

GC content: 35.46

Gene sequence:

>2112_bases
ATGACTCAGTTAAGTACTAAAATTTTATGGTTGTTTGTTGCAACTTTAGGCGCTATTTGTTTTGGTTATTTAGCTTTACA
AAATGGCGAAAGTGTATCAGCGATTTATTTGGTGGTTGCTGCTGTATGTATTTATATGATAGGATATAGATTTTATGGGC
GTTTTGTAGCTTATAAGGTTTTAGAACTTGATAAAAATCGTGCAACACCAGCACTTGTAGAAAATGATGGGCGTGATTTT
GTGCCTACAAATAAAGCTGTATTATTTGGACATCATTTTGCTGCTATTGCAGGAGCAGGTCCATTAGTAGGACCTATCTT
GGCTGCTCAAATGGGATATTTGCCTTCCATGCTTTGGATTTTAGTAGGAGGAGTTTTAGCGGGTGCTGTGCATGATTTTG
TTGTTCTTTTTATATCTACTCGTAGAAAAGGTAGAAGTCTTGGCGAGATGATTAAGGATGAGATGGGTAAATTTACAGGT
GGAGTTGCTATGGTGGCGATTTTTGGCATTATGCTTATTATTATTGCCATTTTAGCTATGGTGGTTGTAAAAGCTTTAGC
AGAATCTCCATGGGGTTTATTTACTATCGCAATGACTATTCCTATAGCAATATTTATGGGCATTTATATGCGTTTTATCC
GTCCAGGTAGAGTAGGGGAGGCTTCTATAATAGGTTTTGTGCTTTTAATTTTGGCTATTCATTATGGTAGCGTTATAGCT
GCTGATCCTTATTGGGCTAAAATATTTACTTTAGAAGCTCCAATTTTGGCAATTGTTATGATGGCTTATGGTTTTATTGC
TTCTGTTTTACCTGTGTGGTTTTTACTTGCTCCAAGAGATTATCTTTCAACTTTTTTGAAAATCGGTGTTATTGTGGTAA
TGGCTGTAGCTATTGTTTTGGTTGCTCCTGATTTACAAATGCCAAAAGCAAATACTCAGTATTTTGATGGAACAGGTCCA
GTATTTGCAGGTGGAGTGTTTCCATTTTTATTTATTACCATTGCTTGTGGTGCGATCAGTGGTTTTCATGCTTTGATTTC
TAGTGGAACTACTCCTAAAATGCTTGAAAACGAAACTCATGCTTTGGCTGTTGGATATGGCTCTATGCTTGCTGAGAGTG
CTGTGGCGATTATGGCTTTAATTTGTGCTTGTATTTTACATCCAGGTCTTTATTTTGCTATAAATTCAAGCTCTGCTTTG
ATAGGAACAGATGTTGTAAATGTAGCACAAACTATTTCAAGTTGGGGATTTAGTATTACTCCTGAAGAAATTACTACTTT
AACCACAAATATAGGAGAGCATACTATACTTTCAAGAACAGGGGGAGCCCCGACTTTTGCTATAGGTGTAGCTTTGATCT
TACATGAACTTTTTGGCGGCGTGGATTTGATGGCTTTTTGGTATCATTTTGCTATATTGTTTGAAGCTTTATTTATTTTA
ACAGCGGTGGATGCTGGGACAAGGGCTTGTCGTTTTATGGTGCAAGATATATTGGGTAATGTTTATAAACCTTTAGGAGA
TATTCATAATTATCCAGCTGGACTTTTGGCTACGGCTTTAAGTGTTGCAGGTTGGGGATATTTTCTTTATCAAGGTGCCA
TTGATCCTAAGGGAGGAATTTATACGCTTTGGCCTCTTTTTGGCGTGAGTAATCAAATGCTTGCGGGTATGGCTTTGCTT
CTTGCTACAACTATACTTGTAAAAATGGGCAAGGCAAGATATACTTGGGTTACTTTAGTACCTGCGGTATTTGTCTTAGT
GGCAACTCTGTATGGAGGAATTCAAAAAATTATGCCTTATGAAGAAGGCAATAAAGTAGCAAATGCGGTAAGTCATGTAG
CCGCCGTTAGCATACAAAGTCAAAAAATTAAAGATTTAGAATTTAAATTAAATAATACTAAAGATGAAAAAGAAATTTCT
GTAATTAAAAAAGAAATTTCAATAGCCACTCAAAGTAAAGTTGGAAATTTGCTTAATGCAATTCTTTGTGTGTTCTTTAT
GATAGCTACCTTGCTTGTTATAATTTCTTGTATAGGAATTTGTTTAGGTAAAATTAAAATTCCTCTTAAAGAAACTAAGT
ATATTAAGATTGATGAATTTCAAAAAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATATTTTTTTAAAAATGTGAAAAAACTAAACATCTTTCTATACAATTTAATCTATAAATCTGCTATTCTTTGAAAATAT
TTTATTTTCTTAGGAGAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATTATTATGAAAAAGCTGAAAGGTTTTTTCATCCCTTGGTGGGACTTTCTAGTTATGATAAGTATTTAGAACACATGA
AACAAAAACATCCAGGAAAA

Product: carbon starvation protein A

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 703; Mature: 702

Protein sequence:

>703_residues
MTQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKVLELDKNRATPALVENDGRDF
VPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWILVGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFTG
GVAMVAIFGIMLIIIAILAMVVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA
ADPYWAKIFTLEAPILAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVLVAPDLQMPKANTQYFDGTGP
VFAGGVFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETHALAVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSAL
IGTDVVNVAQTISSWGFSITPEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL
TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGDIHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALL
LATTILVKMGKARYTWVTLVPAVFVLVATLYGGIQKIMPYEEGNKVANAVSHVAAVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEIS
VIKKEISIATQSKVGNLLNAILCVFFMIATLLVIISCIGICLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI

Sequences:

>Translated_703_residues
MTQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKVLELDKNRATPALVENDGRDF
VPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWILVGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFTG
GVAMVAIFGIMLIIIAILAMVVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA
ADPYWAKIFTLEAPILAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVLVAPDLQMPKANTQYFDGTGP
VFAGGVFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETHALAVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSAL
IGTDVVNVAQTISSWGFSITPEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL
TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGDIHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALL
LATTILVKMGKARYTWVTLVPAVFVLVATLYGGIQKIMPYEEGNKVANAVSHVAAVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEIS
VIKKEISIATQSKVGNLLNAILCVFFMIATLLVIISCIGICLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI
>Mature_702_residues
TQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKVLELDKNRATPALVENDGRDFV
PTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWILVGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFTGG
VAMVAIFGIMLIIIAILAMVVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIAA
DPYWAKIFTLEAPILAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVLVAPDLQMPKANTQYFDGTGPV
FAGGVFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETHALAVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSALI
GTDVVNVAQTISSWGFSITPEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFILT
AVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGDIHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALLL
ATTILVKMGKARYTWVTLVPAVFVLVATLYGGIQKIMPYEEGNKVANAVSHVAAVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEISV
IKKEISIATQSKVGNLLNAILCVFFMIATLLVIISCIGICLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI

Specific function: Peptide Utilization During Carbon Starvation. [C]

COG id: COG1966

COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CstA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=707, Percent_Identity=56.1527581329562, Blast_Score=761, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=722, Percent_Identity=51.6620498614958, Blast_Score=724, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003706 [H]

Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75777; Mature: 75646

Theoretical pI: Translated: 8.42; Mature: 8.42

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LELDKNRATPALVENDGRDFVPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWI
HHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFTGGVAMVAIFGIMLIIIAILAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
ADPYWAKIFTLEAPILAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVL
CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAPDLQMPKANTQYFDGTGPVFAGGVFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETH
HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCC
ALAVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSALIGTDVVNVAQTISSWGFSIT
EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL
HHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGDIHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGI
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCE
YTLWPLFGVSNQMLAGMALLLATTILVKMGKARYTWVTLVPAVFVLVATLYGGIQKIMPY
EEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
EEGNKVANAVSHVAAVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEISVIKKEISIATQSKVGNLLNA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILCVFFMIATLLVIISCIGICLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LELDKNRATPALVENDGRDFVPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWI
HHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFTGGVAMVAIFGIMLIIIAILAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
ADPYWAKIFTLEAPILAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVL
CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAPDLQMPKANTQYFDGTGPVFAGGVFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETH
HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCC
ALAVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSALIGTDVVNVAQTISSWGFSIT
EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL
HHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGDIHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGI
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCE
YTLWPLFGVSNQMLAGMALLLATTILVKMGKARYTWVTLVPAVFVLVATLYGGIQKIMPY
EEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
EEGNKVANAVSHVAAVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEISVIKKEISIATQSKVGNLLNA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILCVFFMIATLLVIISCIGICLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9923682 [H]