| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is cstA [H]
Identifier: 57237745
GI number: 57237745
Start: 930546
End: 932657
Strand: Reverse
Name: cstA [H]
Synonym: CJE0995
Alternate gene names: 57237745
Gene position: 932657-930546 (Counterclockwise)
Preceding gene: 57237746
Following gene: 57237744
Centisome position: 52.46
GC content: 35.46
Gene sequence:
>2112_bases ATGACTCAGTTAAGTACTAAAATTTTATGGTTGTTTGTTGCAACTTTAGGCGCTATTTGTTTTGGTTATTTAGCTTTACA AAATGGCGAAAGTGTATCAGCGATTTATTTGGTGGTTGCTGCTGTATGTATTTATATGATAGGATATAGATTTTATGGGC GTTTTGTAGCTTATAAGGTTTTAGAACTTGATAAAAATCGTGCAACACCAGCACTTGTAGAAAATGATGGGCGTGATTTT GTGCCTACAAATAAAGCTGTATTATTTGGACATCATTTTGCTGCTATTGCAGGAGCAGGTCCATTAGTAGGACCTATCTT GGCTGCTCAAATGGGATATTTGCCTTCCATGCTTTGGATTTTAGTAGGAGGAGTTTTAGCGGGTGCTGTGCATGATTTTG TTGTTCTTTTTATATCTACTCGTAGAAAAGGTAGAAGTCTTGGCGAGATGATTAAGGATGAGATGGGTAAATTTACAGGT GGAGTTGCTATGGTGGCGATTTTTGGCATTATGCTTATTATTATTGCCATTTTAGCTATGGTGGTTGTAAAAGCTTTAGC AGAATCTCCATGGGGTTTATTTACTATCGCAATGACTATTCCTATAGCAATATTTATGGGCATTTATATGCGTTTTATCC GTCCAGGTAGAGTAGGGGAGGCTTCTATAATAGGTTTTGTGCTTTTAATTTTGGCTATTCATTATGGTAGCGTTATAGCT GCTGATCCTTATTGGGCTAAAATATTTACTTTAGAAGCTCCAATTTTGGCAATTGTTATGATGGCTTATGGTTTTATTGC TTCTGTTTTACCTGTGTGGTTTTTACTTGCTCCAAGAGATTATCTTTCAACTTTTTTGAAAATCGGTGTTATTGTGGTAA TGGCTGTAGCTATTGTTTTGGTTGCTCCTGATTTACAAATGCCAAAAGCAAATACTCAGTATTTTGATGGAACAGGTCCA GTATTTGCAGGTGGAGTGTTTCCATTTTTATTTATTACCATTGCTTGTGGTGCGATCAGTGGTTTTCATGCTTTGATTTC TAGTGGAACTACTCCTAAAATGCTTGAAAACGAAACTCATGCTTTGGCTGTTGGATATGGCTCTATGCTTGCTGAGAGTG CTGTGGCGATTATGGCTTTAATTTGTGCTTGTATTTTACATCCAGGTCTTTATTTTGCTATAAATTCAAGCTCTGCTTTG ATAGGAACAGATGTTGTAAATGTAGCACAAACTATTTCAAGTTGGGGATTTAGTATTACTCCTGAAGAAATTACTACTTT AACCACAAATATAGGAGAGCATACTATACTTTCAAGAACAGGGGGAGCCCCGACTTTTGCTATAGGTGTAGCTTTGATCT TACATGAACTTTTTGGCGGCGTGGATTTGATGGCTTTTTGGTATCATTTTGCTATATTGTTTGAAGCTTTATTTATTTTA ACAGCGGTGGATGCTGGGACAAGGGCTTGTCGTTTTATGGTGCAAGATATATTGGGTAATGTTTATAAACCTTTAGGAGA TATTCATAATTATCCAGCTGGACTTTTGGCTACGGCTTTAAGTGTTGCAGGTTGGGGATATTTTCTTTATCAAGGTGCCA TTGATCCTAAGGGAGGAATTTATACGCTTTGGCCTCTTTTTGGCGTGAGTAATCAAATGCTTGCGGGTATGGCTTTGCTT CTTGCTACAACTATACTTGTAAAAATGGGCAAGGCAAGATATACTTGGGTTACTTTAGTACCTGCGGTATTTGTCTTAGT GGCAACTCTGTATGGAGGAATTCAAAAAATTATGCCTTATGAAGAAGGCAATAAAGTAGCAAATGCGGTAAGTCATGTAG CCGCCGTTAGCATACAAAGTCAAAAAATTAAAGATTTAGAATTTAAATTAAATAATACTAAAGATGAAAAAGAAATTTCT GTAATTAAAAAAGAAATTTCAATAGCCACTCAAAGTAAAGTTGGAAATTTGCTTAATGCAATTCTTTGTGTGTTCTTTAT GATAGCTACCTTGCTTGTTATAATTTCTTGTATAGGAATTTGTTTAGGTAAAATTAAAATTCCTCTTAAAGAAACTAAGT ATATTAAGATTGATGAATTTCAAAAAATTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATATTTTTTTAAAAATGTGAAAAAACTAAACATCTTTCTATACAATTTAATCTATAAATCTGCTATTCTTTGAAAATAT TTTATTTTCTTAGGAGAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATATTATTATGAAAAAGCTGAAAGGTTTTTTCATCCCTTGGTGGGACTTTCTAGTTATGATAAGTATTTAGAACACATGA AACAAAAACATCCAGGAAAA
Product: carbon starvation protein A
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 703; Mature: 702
Protein sequence:
>703_residues MTQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKVLELDKNRATPALVENDGRDF VPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWILVGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFTG GVAMVAIFGIMLIIIAILAMVVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA ADPYWAKIFTLEAPILAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVLVAPDLQMPKANTQYFDGTGP VFAGGVFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETHALAVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSAL IGTDVVNVAQTISSWGFSITPEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGDIHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALL LATTILVKMGKARYTWVTLVPAVFVLVATLYGGIQKIMPYEEGNKVANAVSHVAAVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEIS VIKKEISIATQSKVGNLLNAILCVFFMIATLLVIISCIGICLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI
Sequences:
>Translated_703_residues MTQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKVLELDKNRATPALVENDGRDF VPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWILVGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFTG GVAMVAIFGIMLIIIAILAMVVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA ADPYWAKIFTLEAPILAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVLVAPDLQMPKANTQYFDGTGP VFAGGVFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETHALAVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSAL IGTDVVNVAQTISSWGFSITPEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGDIHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALL LATTILVKMGKARYTWVTLVPAVFVLVATLYGGIQKIMPYEEGNKVANAVSHVAAVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEIS VIKKEISIATQSKVGNLLNAILCVFFMIATLLVIISCIGICLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI >Mature_702_residues TQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKVLELDKNRATPALVENDGRDFV PTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWILVGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFTGG VAMVAIFGIMLIIIAILAMVVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIAA DPYWAKIFTLEAPILAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVLVAPDLQMPKANTQYFDGTGPV FAGGVFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETHALAVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSALI GTDVVNVAQTISSWGFSITPEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFILT AVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGDIHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALLL ATTILVKMGKARYTWVTLVPAVFVLVATLYGGIQKIMPYEEGNKVANAVSHVAAVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEISV IKKEISIATQSKVGNLLNAILCVFFMIATLLVIISCIGICLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI
Specific function: Peptide Utilization During Carbon Starvation. [C]
COG id: COG1966
COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the CstA family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=707, Percent_Identity=56.1527581329562, Blast_Score=761, Evalue=0.0, Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=722, Percent_Identity=51.6620498614958, Blast_Score=724, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003706 [H]
Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75777; Mature: 75646
Theoretical pI: Translated: 8.42; Mature: 8.42
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 3.7 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 3.6 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LELDKNRATPALVENDGRDFVPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWI HHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFTGGVAMVAIFGIMLIIIAILAM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE ADPYWAKIFTLEAPILAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVL CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAPDLQMPKANTQYFDGTGPVFAGGVFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETH HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCC ALAVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSALIGTDVVNVAQTISSWGFSIT EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC PEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL HHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGDIHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGI HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCE YTLWPLFGVSNQMLAGMALLLATTILVKMGKARYTWVTLVPAVFVLVATLYGGIQKIMPY EEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EEGNKVANAVSHVAAVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEISVIKKEISIATQSKVGNLLNA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILCVFFMIATLLVIISCIGICLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHCCC >Mature Secondary Structure TQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LELDKNRATPALVENDGRDFVPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWI HHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFTGGVAMVAIFGIMLIIIAILAM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE ADPYWAKIFTLEAPILAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVL CCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAPDLQMPKANTQYFDGTGPVFAGGVFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETH HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCC ALAVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSALIGTDVVNVAQTISSWGFSIT EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC PEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL HHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGDIHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGI HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCE YTLWPLFGVSNQMLAGMALLLATTILVKMGKARYTWVTLVPAVFVLVATLYGGIQKIMPY EEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EEGNKVANAVSHVAAVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEISVIKKEISIATQSKVGNLLNA CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILCVFFMIATLLVIISCIGICLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9923682 [H]