| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is 57237592
Identifier: 57237592
GI number: 57237592
Start: 529595
End: 532237
Strand: Direct
Name: 57237592
Synonym: CJE0590
Alternate gene names: NA
Gene position: 529595-532237 (Clockwise)
Preceding gene: 57237591
Following gene: 57237593
Centisome position: 29.79
GC content: 25.5
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TAGCTTATTTAGATGATAAAAAATGGCTTTTAGCCATGGATGATCTGCTTTTCTTTTGCGAAAAGAGAATTAAAGATAGT GATTATTATGAAGGTTAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AATGAACTGCCTCCTTCTTTCTAATAATGGCATAGCACTAAATTTACCTCCATCTTTAGGAGGCTCGGTTGCAAATTATA ATTATATGTTAAAGCTAGAC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 880; Mature: 879
Protein sequence:
>880_residues MGTSLNELKTGREKLEIINQVLARINSISEAIDNTRLDEVVGLKQACESLKNECLKFKNDIVDKNDDILSKYDDINKKYS NISEKYNNVNAKFDYIKEAYEDFSLNKQEIQNIKDFLENNTEEFENLKKDIQKYEEIKFNLDNYINEIKQNKDFVKEYFD LNTKIKDEILSELNHALEIVDSLHLNVDELKEIKPELISIKKEVKDLANEAKLVVSKASEIIKNKINTIFFENQRLNQEM IDSVKKLEEIKFDIGVKYKEIASAYELLLESKQNIEDLREVIALYKEFENDITSYSQIIKDFKSKIENLERDLKSQSESI YSSLNDKQNEILKKLNEVKNEALVKFDELTAKCEGYKIHFEQSYDRFNQRALIANEDLGRLAEVAKKELGNDKLIYETEL KVLAEETIKQMEEMLKGLSDERNEVTEVFETQKKEFTTLVDTSKVMIDNLNHIFNANYQAKKNEFSIIFNEKLHSLNENK QDFLNELVSAKENGLNKINETKEQSLNEIIQTKEQGLNELETKKGECIDEIDNQARIYDISGVKANVEYLLSLLNDKDDG KDDGIKDEIANIEQGIKDKEQELEEIKKQIEEALNNNDELKQKNEELKEIKNQIDEALSQEPPADTSELEERKEELENQI AELEQEIAGELINKKEEIEKELEEANQNLEDKNNELEQNEKDKKLITQKVLDITIKTLEALIDTKVSLNGDEEINGNKTF ANPILVKVDPTNDNHLTNKIYVDTTLNTKANLNGDNIFNGTNTFNQALTSPTNPTNDNHLTRKWYVDYGGGIKNLGTTGS INLDLRQAQHFILTANAGTSIGIANFGGVGKSGTITINNCQNVVAFNAPFKFRIAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT
Sequences:
>Translated_880_residues MGTSLNELKTGREKLEIINQVLARINSISEAIDNTRLDEVVGLKQACESLKNECLKFKNDIVDKNDDILSKYDDINKKYS NISEKYNNVNAKFDYIKEAYEDFSLNKQEIQNIKDFLENNTEEFENLKKDIQKYEEIKFNLDNYINEIKQNKDFVKEYFD LNTKIKDEILSELNHALEIVDSLHLNVDELKEIKPELISIKKEVKDLANEAKLVVSKASEIIKNKINTIFFENQRLNQEM IDSVKKLEEIKFDIGVKYKEIASAYELLLESKQNIEDLREVIALYKEFENDITSYSQIIKDFKSKIENLERDLKSQSESI YSSLNDKQNEILKKLNEVKNEALVKFDELTAKCEGYKIHFEQSYDRFNQRALIANEDLGRLAEVAKKELGNDKLIYETEL KVLAEETIKQMEEMLKGLSDERNEVTEVFETQKKEFTTLVDTSKVMIDNLNHIFNANYQAKKNEFSIIFNEKLHSLNENK QDFLNELVSAKENGLNKINETKEQSLNEIIQTKEQGLNELETKKGECIDEIDNQARIYDISGVKANVEYLLSLLNDKDDG KDDGIKDEIANIEQGIKDKEQELEEIKKQIEEALNNNDELKQKNEELKEIKNQIDEALSQEPPADTSELEERKEELENQI AELEQEIAGELINKKEEIEKELEEANQNLEDKNNELEQNEKDKKLITQKVLDITIKTLEALIDTKVSLNGDEEINGNKTF ANPILVKVDPTNDNHLTNKIYVDTTLNTKANLNGDNIFNGTNTFNQALTSPTNPTNDNHLTRKWYVDYGGGIKNLGTTGS INLDLRQAQHFILTANAGTSIGIANFGGVGKSGTITINNCQNVVAFNAPFKFRIAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT >Mature_879_residues GTSLNELKTGREKLEIINQVLARINSISEAIDNTRLDEVVGLKQACESLKNECLKFKNDIVDKNDDILSKYDDINKKYSN ISEKYNNVNAKFDYIKEAYEDFSLNKQEIQNIKDFLENNTEEFENLKKDIQKYEEIKFNLDNYINEIKQNKDFVKEYFDL NTKIKDEILSELNHALEIVDSLHLNVDELKEIKPELISIKKEVKDLANEAKLVVSKASEIIKNKINTIFFENQRLNQEMI DSVKKLEEIKFDIGVKYKEIASAYELLLESKQNIEDLREVIALYKEFENDITSYSQIIKDFKSKIENLERDLKSQSESIY SSLNDKQNEILKKLNEVKNEALVKFDELTAKCEGYKIHFEQSYDRFNQRALIANEDLGRLAEVAKKELGNDKLIYETELK VLAEETIKQMEEMLKGLSDERNEVTEVFETQKKEFTTLVDTSKVMIDNLNHIFNANYQAKKNEFSIIFNEKLHSLNENKQ DFLNELVSAKENGLNKINETKEQSLNEIIQTKEQGLNELETKKGECIDEIDNQARIYDISGVKANVEYLLSLLNDKDDGK DDGIKDEIANIEQGIKDKEQELEEIKKQIEEALNNNDELKQKNEELKEIKNQIDEALSQEPPADTSELEERKEELENQIA ELEQEIAGELINKKEEIEKELEEANQNLEDKNNELEQNEKDKKLITQKVLDITIKTLEALIDTKVSLNGDEEINGNKTFA NPILVKVDPTNDNHLTNKIYVDTTLNTKANLNGDNIFNGTNTFNQALTSPTNPTNDNHLTRKWYVDYGGGIKNLGTTGSI NLDLRQAQHFILTANAGTSIGIANFGGVGKSGTITINNCQNVVAFNAPFKFRIAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 101020; Mature: 100889
Theoretical pI: Translated: 4.47; Mature: 4.47
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 1.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 0.5 %Met (Mature Protein) 1.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGTSLNELKTGREKLEIINQVLARINSISEAIDNTRLDEVVGLKQACESLKNECLKFKND CCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVDKNDDILSKYDDINKKYSNISEKYNNVNAKFDYIKEAYEDFSLNKQEIQNIKDFLENN HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCC TEEFENLKKDIQKYEEIKFNLDNYINEIKQNKDFVKEYFDLNTKIKDEILSELNHALEIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH DSLHLNVDELKEIKPELISIKKEVKDLANEAKLVVSKASEIIKNKINTIFFENQRLNQEM HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHH IDSVKKLEEIKFDIGVKYKEIASAYELLLESKQNIEDLREVIALYKEFENDITSYSQIIK HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DFKSKIENLERDLKSQSESIYSSLNDKQNEILKKLNEVKNEALVKFDELTAKCEGYKIHF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE EQSYDRFNQRALIANEDLGRLAEVAKKELGNDKLIYETELKVLAEETIKQMEEMLKGLSD HHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC ERNEVTEVFETQKKEFTTLVDTSKVMIDNLNHIFNANYQAKKNEFSIIFNEKLHSLNENK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHCCCCH QDFLNELVSAKENGLNKINETKEQSLNEIIQTKEQGLNELETKKGECIDEIDNQARIYDI HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCHHHHHCCCCEEEEC SGVKANVEYLLSLLNDKDDGKDDGIKDEIANIEQGIKDKEQELEEIKKQIEEALNNNDEL CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH KQKNEELKEIKNQIDEALSQEPPADTSELEERKEELENQIAELEQEIAGELINKKEEIEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH ELEEANQNLEDKNNELEQNEKDKKLITQKVLDITIKTLEALIDTKVSLNGDEEINGNKTF HHHHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEE ANPILVKVDPTNDNHLTNKIYVDTTLNTKANLNGDNIFNGTNTFNQALTSPTNPTNDNHL CCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCC TRKWYVDYGGGIKNLGTTGSINLDLRQAQHFILTANAGTSIGIANFGGVGKSGTITINNC EEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCC QNVVAFNAPFKFRIAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT CCEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEC >Mature Secondary Structure GTSLNELKTGREKLEIINQVLARINSISEAIDNTRLDEVVGLKQACESLKNECLKFKND CCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVDKNDDILSKYDDINKKYSNISEKYNNVNAKFDYIKEAYEDFSLNKQEIQNIKDFLENN HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCC TEEFENLKKDIQKYEEIKFNLDNYINEIKQNKDFVKEYFDLNTKIKDEILSELNHALEIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH DSLHLNVDELKEIKPELISIKKEVKDLANEAKLVVSKASEIIKNKINTIFFENQRLNQEM HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHH IDSVKKLEEIKFDIGVKYKEIASAYELLLESKQNIEDLREVIALYKEFENDITSYSQIIK HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DFKSKIENLERDLKSQSESIYSSLNDKQNEILKKLNEVKNEALVKFDELTAKCEGYKIHF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE EQSYDRFNQRALIANEDLGRLAEVAKKELGNDKLIYETELKVLAEETIKQMEEMLKGLSD HHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC ERNEVTEVFETQKKEFTTLVDTSKVMIDNLNHIFNANYQAKKNEFSIIFNEKLHSLNENK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHCCCCH QDFLNELVSAKENGLNKINETKEQSLNEIIQTKEQGLNELETKKGECIDEIDNQARIYDI HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCHHHHHCCCCEEEEC SGVKANVEYLLSLLNDKDDGKDDGIKDEIANIEQGIKDKEQELEEIKKQIEEALNNNDEL CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH KQKNEELKEIKNQIDEALSQEPPADTSELEERKEELENQIAELEQEIAGELINKKEEIEK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH ELEEANQNLEDKNNELEQNEKDKKLITQKVLDITIKTLEALIDTKVSLNGDEEINGNKTF HHHHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEE ANPILVKVDPTNDNHLTNKIYVDTTLNTKANLNGDNIFNGTNTFNQALTSPTNPTNDNHL CCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCC TRKWYVDYGGGIKNLGTTGSINLDLRQAQHFILTANAGTSIGIANFGGVGKSGTITINNC EEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCC QNVVAFNAPFKFRIAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT CCEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA