Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is 57237208

Identifier: 57237208

GI number: 57237208

Start: 197273

End: 199267

Strand: Direct

Name: 57237208

Synonym: CJE0197

Alternate gene names: NA

Gene position: 197273-199267 (Clockwise)

Preceding gene: 57237200

Following gene: 57237209

Centisome position: 11.1

GC content: 33.18

Gene sequence:

>1995_bases
ATGTACAAAAAACAAAATTTACCAGAACTTACCTTAAGGGGTTTGATTTTGGGAAGTATTTTAACTATTATTTTTACAGC
TTCAAATGTATATTTGGGGTTAAAAGTGGGACTTACTTTTTCATCATCAATTCCAGCTGTGGTCATCTCCATGGCGGTTT
TGAGTCTTTTTAAGACTTCAAATATTTTAGAAAATAATATGGTTCAAACTCAAGCTTCAGCAGCAGGAACTTTATCATCA
GTTATTTTTGTTATCCCAGGACTTTTTATGTGTGGGTATTGGAGTGAATTTCCACTTTGGCAAACTTTTATGATATGTCT
TTGTGGTGGCGGACTTGGAGTGCTTTTTACTATACCATTAAGAAGGACTATGGTGGTTGAAAGCAAGCTTGCTTATCCTG
AAGGTAGAGCTGCAGCTGAAATTTTAAAAGTAGCCAATAAAGATCAGAGTAGTAAAAAAGGAAAACAAGGCATTAAAGAA
ATAGCATTAGGCTCTTTTATAGCTGCTATTTTTAGTTTGTTAAGCAATGGTTTCAAGCTCGCTGCAAGTGAGAGTAATTT
TGCTTTTATTTGGAATAAAATGGCTTTTGGTTTTTCTATGGGATATTCTTTGGCACTTTTAGGGGCAGGTTATTTAGTTG
GTTTAGCAGGTGCTATAGCTCTTTTTGTAGGTATGTTTTTAGCTTGGGGTATTTTTACTCCCTATCTTTCAAATTTTGAA
TTCGATAGTGCAAAAAATGCCGTAGATTTAGCTTCTAGTGTATGGAGTTCTAAAGTAAGGCTTATAGGAACAGGAGCTAT
TGCTATAGCAGCGCTTTGGACTTTAATAGAACTTTTAAAACCCGTTATTGAAGGTATTAAAGAAATTGTTAAAAATGTTA
AAATTACTAATCAAGAAAAAAATGAAAGAACAAATATAGACCTTTCTTTAAAAAGTATTTTTATACTTTTTGTTTTAATG
GTTGTGGGTTTATTTATTACTTTTTATAGTTTTGTTGAAGATGCTAACTTAAGTATTTATTATCAAATGCTATTTTCATT
TGTTGGAACTTTAGTTTCTGTTTTAATAGGTTTTTTTGTTGCAGCAGCTTGCGGATATATGGCAGGACTTGTAGGATCTT
CTTCTAGTCCTATTTCTGGAATCGGACTTATTGGTGTTATTATTTCTTCTATTGTTTTTTTGGTTTTAGGTGTGGAACTT
TTTCAAGATCCTATGCTTTCTAAATTTGCAGTAGCATTAGCTATTTTTACTACTAGTGTTATTTTAGCTACAGCTGCTAT
TTCGAATGATAATTTACAAGATTTAAAGACAGGACATTTAGTCGGAGCTACTCCTTGGAAACAACAAGTTGCTTTACTTG
TAGGCTGTGTTTTTGGTGCTTTGGCTATAGTTCCTGTTTTAAATTTGCTTTATCAAGCCTATGGTTTTGTCGGAGCAATG
CCAAGAGAAGGTATGGATGCTTCATCAGCTTTAGCAGCACCGCAAGCAAATTTAATGAGCACTATCGCCCAAGGAATTTT
TCATCACAATATAGAGTGGGGTTATATGGCTCTTGGTGTATTTGTAGGAATTTTAATGATTATTATAGATAAAATTTTAA
AAGGAACACAGAAAATGTCTTTGCCGCCTTTAGCCGTTGGAATAGGTATTTACCTTCCCCCTGCTGTAAATATACCTTTA
GTTATAGGCGGAATTTTAAAATATATTGTAATGCAACACTTGACTAAAAAGTATGCAAAAAATTCTCATAAAGAAGAAAA
ACTTGCAAGTTGTGAGCAAAGAGGCACGCTTTTTGCTTCAGGGCTTATAGTGGGTGAAAGTATTTTTGGGGTAATTATCG
CAGGAATTACTGTATTTTCAGTAAGTATGGGTGGTAGTGAAAATCCTTTAGCTTTAAATTTAGCAAATTTTCATGATAGC
GAGCTTTTCGCACTTATCTTTTTTGTGGGAGTTGTATTATATTTCATTAAGCGTATTGTTAAAAAAGATGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGTTTTTTTGTATTATTTTATTTTGCTTTAGAGAAAATTATAAATTTAAACTTATAAGAATATTTTTTAAGTTGAAAGTA
AATTTTAAAACGGAGAAATG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTGGGGTTAAAACCCCATTTAATCCATTCTGATATAATTTTTCTTTTGCAATTATCATTCAAGGATTAAAATGGAAA
ATTTATATGCTTTAATACTT

Product: OPT family oligopeptide transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 664; Mature: 664

Protein sequence:

>664_residues
MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVVISMAVLSLFKTSNILENNMVQTQASAAGTLSS
VIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPLRRTMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSSKKGKQGIKE
IALGSFIAAIFSLLSNGFKLAASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE
FDSAKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEKNERTNIDLSLKSIFILFVLM
VVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFVAAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVEL
FQDPMLSKFAVALAIFTTSVILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVALLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM
PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMALGVFVGILMIIIDKILKGTQKMSLPPLAVGIGIYLPPAVNIPL
VIGGILKYIVMQHLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFASGLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLANFHDS
ELFALIFFVGVVLYFIKRIVKKDA

Sequences:

>Translated_664_residues
MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVVISMAVLSLFKTSNILENNMVQTQASAAGTLSS
VIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPLRRTMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSSKKGKQGIKE
IALGSFIAAIFSLLSNGFKLAASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE
FDSAKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEKNERTNIDLSLKSIFILFVLM
VVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFVAAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVEL
FQDPMLSKFAVALAIFTTSVILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVALLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM
PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMALGVFVGILMIIIDKILKGTQKMSLPPLAVGIGIYLPPAVNIPL
VIGGILKYIVMQHLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFASGLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLANFHDS
ELFALIFFVGVVLYFIKRIVKKDA
>Mature_664_residues
MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVVISMAVLSLFKTSNILENNMVQTQASAAGTLSS
VIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPLRRTMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSSKKGKQGIKE
IALGSFIAAIFSLLSNGFKLAASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE
FDSAKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEKNERTNIDLSLKSIFILFVLM
VVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFVAAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVEL
FQDPMLSKFAVALAIFTTSVILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVALLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM
PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMALGVFVGILMIIIDKILKGTQKMSLPPLAVGIGIYLPPAVNIPL
VIGGILKYIVMQHLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFASGLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLANFHDS
ELFALIFFVGVVLYFIKRIVKKDA

Specific function: Unknown

COG id: COG1297

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the oligopeptide OPT transporter family [H]

Homologues:

Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6321324, Length=450, Percent_Identity=22.8888888888889, Blast_Score=67, Evalue=1e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004814
- InterPro:   IPR004813 [H]

Pfam domain/function: PF03169 OPT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71213; Mature: 71213

Theoretical pI: Translated: 9.24; Mature: 9.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVVISMAVLSLFKTS
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NILENNMVQTQASAAGTLSSVIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECH
RRTMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSSKKGKQGIKEIALGSFIAAIFSLLSNGFKL
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
AASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE
EECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
FDSAKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEK
CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
NERTNIDLSLKSIFILFVLMVVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFV
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVELFQDPMLSKFAVALAIFTTSV
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVALLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM
HHHHHHCCCCCHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMALGVFVGILMIIIDKILKGTQKMS
CCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCC
LPPLAVGIGIYLPPAVNIPLVIGGILKYIVMQHLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFAS
CCCHHHHCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH
GLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLANFHDSELFALIFFVGVVLYFIKRIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKDA
HCCC
>Mature Secondary Structure
MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVVISMAVLSLFKTS
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
NILENNMVQTQASAAGTLSSVIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECH
RRTMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSSKKGKQGIKEIALGSFIAAIFSLLSNGFKL
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
AASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE
EECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
FDSAKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEK
CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
NERTNIDLSLKSIFILFVLMVVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFV
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVELFQDPMLSKFAVALAIFTTSV
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVALLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM
HHHHHHCCCCCHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMALGVFVGILMIIIDKILKGTQKMS
CCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCC
LPPLAVGIGIYLPPAVNIPLVIGGILKYIVMQHLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFAS
CCCHHHHCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH
GLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLANFHDSELFALIFFVGVVLYFIKRIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKDA
HCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]