Definition Dehalococcoides ethenogenes 195, complete genome.
Accession NC_002936
Length 1,469,720

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The map label for this gene is 57234330

Identifier: 57234330

GI number: 57234330

Start: 835073

End: 836395

Strand: Direct

Name: 57234330

Synonym: DET0909

Alternate gene names: NA

Gene position: 835073-836395 (Clockwise)

Preceding gene: 57234339

Following gene: 57234329

Centisome position: 56.82

GC content: 47.17

Gene sequence:

>1323_bases
ATGCTGGGGCTGACCCAGGATTATGTAACACCTTTTGCATTGGCACTAAAGGCATCCGTACCCCAGATAGGCATACTTTC
AGCACTACCCAACCTATCCATTGCTTTTTCACAGCTGTTTGCCCCGTTCCTGTCCGAGAAGGCCAAAAGCCGCAAAGCCT
TTGTGCTTAAGGCCGTATTGCTGCAAGCGGTATGTTTTATACCGGCGTTCATTCTGCCTGTTCTTTTCAGTGACTACGGG
GTGTGGTGGCTGATACTCTGGTACACTTTGGGGACTATGTTCGGCTCACTGGGTAATCCGGCCTGGTCAAGCCTGATGGC
AGACCTTGTCCCCGGCCCTATCCGCGGGCGTTTTTTCGGCTACCGCGGCATGATAGCCGGCATTATGACTCTGGCTTTTT
CACTTTTGAGCGGGCTGCTGCTCCAGATAAGCGCAAATACCCTCTTTTTGGGTTTTGGCCTTATATTTTTCGGTGCCAGC
TTAGCCCGTTTTATTTCAAGCTTCTTTTTAAACAAGATGGAAGACCCTCAGGCTAAAACCCCGGTCAAAGACAATGTCAG
CATGAAAGCCCTGTTAAAGGGTCTAAACACAACCCCCATGGGCAAATTCATATCTTACTCAGCCCTAATAAACTTCAGCA
CTTATATTGCCGCACCGTTTTTTGCGGTCTACATGCTGCGTGAGCTTGGCTTCGACTATCTGACATATATAATAGTAATA
TCCTCAGCCTCAATAGCCAATTTTGTGTTTATGAAGGTTTGGGGGCGGGTTTGTGATATCTGCGGCACGGTAAAGATACT
TAAGCTCTGCAGCATATTTGTACCGATAGTACCGCTTTTATGGATGTTTAGCCATAATACATATTACCTGATAGGTGTTC
AGGCACTTTCAGGCATTGTCTGGTCAGGTTTCCTGCTGTCAGGCACAAATTATATCTTTGAAAGTTCCAACCGCCGTAAC
CGGATGCGCGGTTTTGCCCTTTACACCGGGGGAAACAGTCTGGGTATTGCGCTGGGTTCACTTGTCGGCGGTTTATTGGT
TAGCATACTGCCCCAGATTAACGGCTACCATATGCTAAGCCTGTTTTTAGTATCTGTAATAGCCAGGGCAGCAGTAATAG
GTCTGCTGATAAACGGAATAAAAGAGCTTAAACCGGTAAATACCTCTATATATCAGTTGTTTATATCCGGGTGCAAACTG
GACGTACTGGCTCTTAGATTAAAAGCTGTGTTTCAGGCAATACCCCAGCTGCCGCGTCTTTTCCGCCAGCCTCTCCGCTC
CGGAATGGTAATCCGCATATTCCAGCTTATCATCCGTTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGCCATATTTCAATTAGGAAAACTGAGTAATTAAGATGAAAAATATCACTCGCCAGAGTTTAGATAACAGCATCAAAG
ACGGAGCGGCCTATTCAGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGAGCAAACAGTCCACTTTATTCCCCGTGCTAAATATATATAGCATCTTGCTTGCATTGCCGGTAAAACCCCTGCGGTTT
CACAAGTTGGATTTGCCTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Permease; Facilitator Superfamily Protein; Twin-Arginine Translocation Pathway Signal; Facilitator Family Transporter

Number of amino acids: Translated: 440; Mature: 440

Protein sequence:

>440_residues
MLGLTQDYVTPFALALKASVPQIGILSALPNLSIAFSQLFAPFLSEKAKSRKAFVLKAVLLQAVCFIPAFILPVLFSDYG
VWWLILWYTLGTMFGSLGNPAWSSLMADLVPGPIRGRFFGYRGMIAGIMTLAFSLLSGLLLQISANTLFLGFGLIFFGAS
LARFISSFFLNKMEDPQAKTPVKDNVSMKALLKGLNTTPMGKFISYSALINFSTYIAAPFFAVYMLRELGFDYLTYIIVI
SSASIANFVFMKVWGRVCDICGTVKILKLCSIFVPIVPLLWMFSHNTYYLIGVQALSGIVWSGFLLSGTNYIFESSNRRN
RMRGFALYTGGNSLGIALGSLVGGLLVSILPQINGYHMLSLFLVSVIARAAVIGLLINGIKELKPVNTSIYQLFISGCKL
DVLALRLKAVFQAIPQLPRLFRQPLRSGMVIRIFQLIIRF

Sequences:

>Translated_440_residues
MLGLTQDYVTPFALALKASVPQIGILSALPNLSIAFSQLFAPFLSEKAKSRKAFVLKAVLLQAVCFIPAFILPVLFSDYG
VWWLILWYTLGTMFGSLGNPAWSSLMADLVPGPIRGRFFGYRGMIAGIMTLAFSLLSGLLLQISANTLFLGFGLIFFGAS
LARFISSFFLNKMEDPQAKTPVKDNVSMKALLKGLNTTPMGKFISYSALINFSTYIAAPFFAVYMLRELGFDYLTYIIVI
SSASIANFVFMKVWGRVCDICGTVKILKLCSIFVPIVPLLWMFSHNTYYLIGVQALSGIVWSGFLLSGTNYIFESSNRRN
RMRGFALYTGGNSLGIALGSLVGGLLVSILPQINGYHMLSLFLVSVIARAAVIGLLINGIKELKPVNTSIYQLFISGCKL
DVLALRLKAVFQAIPQLPRLFRQPLRSGMVIRIFQLIIRF
>Mature_440_residues
MLGLTQDYVTPFALALKASVPQIGILSALPNLSIAFSQLFAPFLSEKAKSRKAFVLKAVLLQAVCFIPAFILPVLFSDYG
VWWLILWYTLGTMFGSLGNPAWSSLMADLVPGPIRGRFFGYRGMIAGIMTLAFSLLSGLLLQISANTLFLGFGLIFFGAS
LARFISSFFLNKMEDPQAKTPVKDNVSMKALLKGLNTTPMGKFISYSALINFSTYIAAPFFAVYMLRELGFDYLTYIIVI
SSASIANFVFMKVWGRVCDICGTVKILKLCSIFVPIVPLLWMFSHNTYYLIGVQALSGIVWSGFLLSGTNYIFESSNRRN
RMRGFALYTGGNSLGIALGSLVGGLLVSILPQINGYHMLSLFLVSVIARAAVIGLLINGIKELKPVNTSIYQLFISGCKL
DVLALRLKAVFQAIPQLPRLFRQPLRSGMVIRIFQLIIRF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48525; Mature: 48525

Theoretical pI: Translated: 10.51; Mature: 10.51

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHCCHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLGLTQDYVTPFALALKASVPQIGILSALPNLSIAFSQLFAPFLSEKAKSRKAFVLKAVL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQAVCFIPAFILPVLFSDYGVWWLILWYTLGTMFGSLGNPAWSSLMADLVPGPIRGRFFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
YRGMIAGIMTLAFSLLSGLLLQISANTLFLGFGLIFFGASLARFISSFFLNKMEDPQAKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
PVKDNVSMKALLKGLNTTPMGKFISYSALINFSTYIAAPFFAVYMLRELGFDYLTYIIVI
CCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
SSASIANFVFMKVWGRVCDICGTVKILKLCSIFVPIVPLLWMFSHNTYYLIGVQALSGIV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHH
WSGFLLSGTNYIFESSNRRNRMRGFALYTGGNSLGIALGSLVGGLLVSILPQINGYHMLS
HHHHHHCCCHHEECCCCCCCHHCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
LFLVSVIARAAVIGLLINGIKELKPVNTSIYQLFISGCKLDVLALRLKAVFQAIPQLPRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRQPLRSGMVIRIFQLIIRF
HHHHHHCCHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA