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The map label for this gene is 54293916

Identifier: 54293916

GI number: 54293916

Start: 1089375

End: 1092500

Strand: Reverse

Name: 54293916

Synonym: lpl0972

Alternate gene names: NA

Gene position: 1092500-1089375 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54293922

Following gene: 54293915

Centisome position: 32.65

GC content: 38.64

Gene sequence:

>3126_bases
ATGCCTGATTTTGAAACTACTGATGGCCAAACTCAAGTTATTATTCCACTCAGAGTTACTCCGCACACACACAAAGCGAT
GCCAACTATCACTGGAAGTATTTTCAGTCACGAAGCCGGTACAGTATTTTATGGTAATTATAATATGGAATATCTCCTTC
CTGCAGGAGACAGACTACGCTTAATAGCCAATCACAACAAGAAAACAGTACAGCTGATGCTATTCACTCATAACCCTGAA
CTGTTAAAAATTCTTCCGGGAGACAGACCATCTTCGCTAGTTGCTGATGTTATAAATCACATCAATCGCTATAAAGTTCA
AGCTGAAAGCTATAAAAAACCCCTAAGCCATGAGCAGGAAGAAAAAATTAACGTGGCTAATGCTTGCATCCGCTCCTTAA
ACCATCTATTGAAAAAAGAAAGACAATTAAAACCTCATGATCATGCTGGACAGGAGGAGTTAAGAAGAAAAATCATTTCC
ATTATTGAACATTGCCAGAACGACAATCGAATGATAGCCAATAATCCTGTGGTTTCAGAAGGAAGTTTTGGTTATATGTT
ATATGATGCGCACAAAACAGCACAGCATTATCGGTTTAACCGAGTTTTTTCTGTTTCTCGCCAGGATCAAATGGACTTTA
CCAAAGTGACTAAAACACAACTTGGAAAACCAATTACTCCTTGTTTTGTTTGGGATAGTGAAATCCATATTGGGCACAGT
AGCAGTGAGCTTGACGATGCGCTCAGGGTAATTTGTCAGCAATACCAACTCTGCCCTGCGCCAGCATTAAACGACATCCC
GGCCAATCGCTTTGCAAAACTGGAACGATTCATAAGTAAACTTTGGCATGACGGTCACGATTGGATTAATTATCTGGCAA
TCACAACAAAACCAAGTCATAAAACTGAAATACAAAAACGCTCTGATGGAGTATCTATTACCAAAATAACGCCTTACTAC
AAACTCAAAGGACTGCCTCAAAGAGGTTATAATAGTCTGGCTGCGATGGTAAATCATCTAGTGGAAAACTCAGCACAACA
GACAGAGGTAAACAGTATAAAAGAGGCGAAAAGATTACTAAGCCACTTACCTAATGGTAATTGGGTTATTGTGCCTCAAA
AAAATACTATTCTGTTAAGACTCGAAAATAAGCTGATTCATCTCAAATATTTTATTCATGATCAACTCTTTTATCCTTTG
CCAGATGGAGAGGATTTATATATTTTAAGCCAAATCAGCAAAAGACATCTTTACTTGCCTGAAAGAATCAGCCTCCGTTT
CAAAGCTTTTATTTCCCGTATACCTGATTTTTTTAAAGGTTTTTACAAAAGCATGAGCCAATTCATCATACATGACCTGC
ATGAAGAATTTTTTAATCATGTGCATGCAACTCATTCCCCTAAACAACATCTTTCAGAAAGAGATCAGCGTCCAAAATCT
AAAAAAATTAAAAGAACCTCTCTGCATGAAGCGCTCCAAAATCAGGGACTTCTCGCGAATGGTCAAACTCTTGAAGAGTT
CATTAGTGATCAGATCAATAACAGCCCCTATGTCATTGCAAGAGCAAACCATCCCCCTATTGTGCACACCTATGAAAATC
CTTTGCACAGAGCTTTGGGTGTAATACGCCATTTAGCCGGATTTTTTATAGACACTAGCGAACGTAACCCTATGATTGGA
ACTCTTGCCATGGCAGCTTATGTCTATGGAGCAGGAGCTGTACTCGCACCCAATGTTCTCGCTGACATTTTAAAAAAGCT
GCACTTAAGTGGCTTGATTTATGGAATTGAGCCTGTTCAAAAATTAGCTCACTTGATGAATCATGGCAAGACTTCAGAAG
CTATTTCTGCTTCTGTAACTCTCTGGCAAGGTATGGTAGTAAGCGGCAATTTGGATAAGTTCTTTGTCGATGCTGTCTCT
GTCCTGAAAGAAGACCCGGCAGAAATTGCTATTATTGTTTCTTTAGCGCTTAGCCTTGGTTATGGTTTAACAAAAGCGAT
TCCTTCACTGCAACATGAAATGGGTGACTTTCCTTATACCAACTATGCTGCTCTCGGAGGTAAAGGAGGTGCCGCTATCT
ATGATACCATTATGCACCCGGGTGATGACTGGTTCCTTGGGACTTGCAAGTGGTTTTGCAAGAATATTATAAATATTGGA
AAATTATTGGTTGCACCTTTTTTTGAAGGTTTTTACTATGGTTTTTTTGATGGATTTATAAATGGCTGGAAAAAAAGTGG
CAAATTGATAAAACAACTGGGTAAACAAACTTTAGCCGCAAGTGTTGATCTTATTTTAGCTATTTTAACCATCCCCTTAC
TTGAGGCTAGTTCGCTTTTAATACACGTCCCTTTTAGAGGAATTACCAATTTTTTCCGCAAATTACTGTCTGTATTAGGT
AACTTCCGTGCGATTGGGAAATTACTCATCGATATAGCAGAGCGTCCATCCACAAATAACTTCATATCTGAATTTACGCT
TTCCCCTCTTTATGGATTTACTTCCCCTTTTGGCCATTTCTCAGATAATCCAGTCACAAACATAGGCATTAATGGCATAA
GGCTGCTTTTTTTACCCCCCCTGCAGCTGATTAAAAATATTTTGATTCTCCCTCTGATAGACATACTTTCACTAACAGTA
AGAGTAAATTTATCTGTTATTAACCCTATTTCCCGACTTCTTGCCTATTCTACCGGTACTATTCTTTATCACTTCGGACA
GATTTGGGATCATTCAGCAGGAGTTTTGTTCTCAACAAGCGCGTATGGGGTGACTATATTATGTAATCACATAGACAGCA
AAGCGGGTGAATTAAAGCAATATTTGCTTTCCTTAATAGAAATAAATCGTGGAAAAGTATATCAATGGGCATTCCATGAT
GAGGATATACTGACACATAAAATAGTGCAGGATAATCAATACTATTTCGATGATCCCAGACGTTGCGAATTAATTCCTCA
CTCAGACAGTCACTGCTTGTTACGCAATTTATTATTGGGCGAAAGGAGCTCCACCAATAAAATCAAAGATAATCCGAAAT
CCCAACAACTGCATTTTCCAAGTCTGTTTCATGGTACCACACAAACACCAGACACAATGCCTCAAGAACATACACTGACT
ATCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAATGGGCTTTACTTTTCTTCAAAACCAACTTAAGCAATAAAAAATCACTAAATTAATGACAACATCCTTTTACCATAT
ATTAAACCAAATAAATCTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACACTTCCAAATCTAATTGCATTGATTTCATGGTTTTTATTTGCAAATTATGCTACTTGCTTCTAAGATGAAATACTAAT
ATTCAGCAAAAAACGGCTCC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Archaeal Membrane Protein

Number of amino acids: Translated: 1041; Mature: 1040

Protein sequence:

>1041_residues
MPDFETTDGQTQVIIPLRVTPHTHKAMPTITGSIFSHEAGTVFYGNYNMEYLLPAGDRLRLIANHNKKTVQLMLFTHNPE
LLKILPGDRPSSLVADVINHINRYKVQAESYKKPLSHEQEEKINVANACIRSLNHLLKKERQLKPHDHAGQEELRRKIIS
IIEHCQNDNRMIANNPVVSEGSFGYMLYDAHKTAQHYRFNRVFSVSRQDQMDFTKVTKTQLGKPITPCFVWDSEIHIGHS
SSELDDALRVICQQYQLCPAPALNDIPANRFAKLERFISKLWHDGHDWINYLAITTKPSHKTEIQKRSDGVSITKITPYY
KLKGLPQRGYNSLAAMVNHLVENSAQQTEVNSIKEAKRLLSHLPNGNWVIVPQKNTILLRLENKLIHLKYFIHDQLFYPL
PDGEDLYILSQISKRHLYLPERISLRFKAFISRIPDFFKGFYKSMSQFIIHDLHEEFFNHVHATHSPKQHLSERDQRPKS
KKIKRTSLHEALQNQGLLANGQTLEEFISDQINNSPYVIARANHPPIVHTYENPLHRALGVIRHLAGFFIDTSERNPMIG
TLAMAAYVYGAGAVLAPNVLADILKKLHLSGLIYGIEPVQKLAHLMNHGKTSEAISASVTLWQGMVVSGNLDKFFVDAVS
VLKEDPAEIAIIVSLALSLGYGLTKAIPSLQHEMGDFPYTNYAALGGKGGAAIYDTIMHPGDDWFLGTCKWFCKNIINIG
KLLVAPFFEGFYYGFFDGFINGWKKSGKLIKQLGKQTLAASVDLILAILTIPLLEASSLLIHVPFRGITNFFRKLLSVLG
NFRAIGKLLIDIAERPSTNNFISEFTLSPLYGFTSPFGHFSDNPVTNIGINGIRLLFLPPLQLIKNILILPLIDILSLTV
RVNLSVINPISRLLAYSTGTILYHFGQIWDHSAGVLFSTSAYGVTILCNHIDSKAGELKQYLLSLIEINRGKVYQWAFHD
EDILTHKIVQDNQYYFDDPRRCELIPHSDSHCLLRNLLLGERSSTNKIKDNPKSQQLHFPSLFHGTTQTPDTMPQEHTLT
I

Sequences:

>Translated_1041_residues
MPDFETTDGQTQVIIPLRVTPHTHKAMPTITGSIFSHEAGTVFYGNYNMEYLLPAGDRLRLIANHNKKTVQLMLFTHNPE
LLKILPGDRPSSLVADVINHINRYKVQAESYKKPLSHEQEEKINVANACIRSLNHLLKKERQLKPHDHAGQEELRRKIIS
IIEHCQNDNRMIANNPVVSEGSFGYMLYDAHKTAQHYRFNRVFSVSRQDQMDFTKVTKTQLGKPITPCFVWDSEIHIGHS
SSELDDALRVICQQYQLCPAPALNDIPANRFAKLERFISKLWHDGHDWINYLAITTKPSHKTEIQKRSDGVSITKITPYY
KLKGLPQRGYNSLAAMVNHLVENSAQQTEVNSIKEAKRLLSHLPNGNWVIVPQKNTILLRLENKLIHLKYFIHDQLFYPL
PDGEDLYILSQISKRHLYLPERISLRFKAFISRIPDFFKGFYKSMSQFIIHDLHEEFFNHVHATHSPKQHLSERDQRPKS
KKIKRTSLHEALQNQGLLANGQTLEEFISDQINNSPYVIARANHPPIVHTYENPLHRALGVIRHLAGFFIDTSERNPMIG
TLAMAAYVYGAGAVLAPNVLADILKKLHLSGLIYGIEPVQKLAHLMNHGKTSEAISASVTLWQGMVVSGNLDKFFVDAVS
VLKEDPAEIAIIVSLALSLGYGLTKAIPSLQHEMGDFPYTNYAALGGKGGAAIYDTIMHPGDDWFLGTCKWFCKNIINIG
KLLVAPFFEGFYYGFFDGFINGWKKSGKLIKQLGKQTLAASVDLILAILTIPLLEASSLLIHVPFRGITNFFRKLLSVLG
NFRAIGKLLIDIAERPSTNNFISEFTLSPLYGFTSPFGHFSDNPVTNIGINGIRLLFLPPLQLIKNILILPLIDILSLTV
RVNLSVINPISRLLAYSTGTILYHFGQIWDHSAGVLFSTSAYGVTILCNHIDSKAGELKQYLLSLIEINRGKVYQWAFHD
EDILTHKIVQDNQYYFDDPRRCELIPHSDSHCLLRNLLLGERSSTNKIKDNPKSQQLHFPSLFHGTTQTPDTMPQEHTLT
I
>Mature_1040_residues
PDFETTDGQTQVIIPLRVTPHTHKAMPTITGSIFSHEAGTVFYGNYNMEYLLPAGDRLRLIANHNKKTVQLMLFTHNPEL
LKILPGDRPSSLVADVINHINRYKVQAESYKKPLSHEQEEKINVANACIRSLNHLLKKERQLKPHDHAGQEELRRKIISI
IEHCQNDNRMIANNPVVSEGSFGYMLYDAHKTAQHYRFNRVFSVSRQDQMDFTKVTKTQLGKPITPCFVWDSEIHIGHSS
SELDDALRVICQQYQLCPAPALNDIPANRFAKLERFISKLWHDGHDWINYLAITTKPSHKTEIQKRSDGVSITKITPYYK
LKGLPQRGYNSLAAMVNHLVENSAQQTEVNSIKEAKRLLSHLPNGNWVIVPQKNTILLRLENKLIHLKYFIHDQLFYPLP
DGEDLYILSQISKRHLYLPERISLRFKAFISRIPDFFKGFYKSMSQFIIHDLHEEFFNHVHATHSPKQHLSERDQRPKSK
KIKRTSLHEALQNQGLLANGQTLEEFISDQINNSPYVIARANHPPIVHTYENPLHRALGVIRHLAGFFIDTSERNPMIGT
LAMAAYVYGAGAVLAPNVLADILKKLHLSGLIYGIEPVQKLAHLMNHGKTSEAISASVTLWQGMVVSGNLDKFFVDAVSV
LKEDPAEIAIIVSLALSLGYGLTKAIPSLQHEMGDFPYTNYAALGGKGGAAIYDTIMHPGDDWFLGTCKWFCKNIINIGK
LLVAPFFEGFYYGFFDGFINGWKKSGKLIKQLGKQTLAASVDLILAILTIPLLEASSLLIHVPFRGITNFFRKLLSVLGN
FRAIGKLLIDIAERPSTNNFISEFTLSPLYGFTSPFGHFSDNPVTNIGINGIRLLFLPPLQLIKNILILPLIDILSLTVR
VNLSVINPISRLLAYSTGTILYHFGQIWDHSAGVLFSTSAYGVTILCNHIDSKAGELKQYLLSLIEINRGKVYQWAFHDE
DILTHKIVQDNQYYFDDPRRCELIPHSDSHCLLRNLLLGERSSTNKIKDNPKSQQLHFPSLFHGTTQTPDTMPQEHTLTI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 117848; Mature: 117717

Theoretical pI: Translated: 9.08; Mature: 9.08

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPDFETTDGQTQVIIPLRVTPHTHKAMPTITGSIFSHEAGTVFYGNYNMEYLLPAGDRLR
CCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCEEE
LIANHNKKTVQLMLFTHNPELLKILPGDRPSSLVADVINHINRYKVQAESYKKPLSHEQE
EEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHCCCCCCCHH
EKINVANACIRSLNHLLKKERQLKPHDHAGQEELRRKIISIIEHCQNDNRMIANNPVVSE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEECC
GSFGYMLYDAHKTAQHYRFNRVFSVSRQDQMDFTKVTKTQLGKPITPCFVWDSEIHIGHS
CCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCEEEECCC
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CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCC
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HHHHHHHCCCEEEEEECCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
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ERISLRFKAFISRIPDFFKGFYKSMSQFIIHDLHEEFFNHVHATHSPKQHLSERDQRPKS
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCHH
KKIKRTSLHEALQNQGLLANGQTLEEFISDQINNSPYVIARANHPPIVHTYENPLHRALG
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
IHVPFRGITNFFRKLLSVLGNFRAIGKLLIDIAERPSTNNFISEFTLSPLYGFTSPFGHF
EEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCHHHCCCCCCCCC
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CCCCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCCH
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HHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECC
EDILTHKIVQDNQYYFDDPRRCELIPHSDSHCLLRNLLLGERSSTNKIKDNPKSQQLHFP
CHHHHHHHHCCCCEECCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
SLFHGTTQTPDTMPQEHTLTI
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
PDFETTDGQTQVIIPLRVTPHTHKAMPTITGSIFSHEAGTVFYGNYNMEYLLPAGDRLR
CCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCEEE
LIANHNKKTVQLMLFTHNPELLKILPGDRPSSLVADVINHINRYKVQAESYKKPLSHEQE
EEECCCCEEEEEEEEECCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHCCCCCCCHH
EKINVANACIRSLNHLLKKERQLKPHDHAGQEELRRKIISIIEHCQNDNRMIANNPVVSE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEECC
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CCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCEEEECCC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
IHVPFRGITNFFRKLLSVLGNFRAIGKLLIDIAERPSTNNFISEFTLSPLYGFTSPFGHF
EEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCHHHCCCCCCCCC
SDNPVTNIGINGIRLLFLPPLQLIKNILILPLIDILSLTVRVNLSVINPISRLLAYSTGT
CCCCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCCH
ILYHFGQIWDHSAGVLFSTSAYGVTILCNHIDSKAGELKQYLLSLIEINRGKVYQWAFHD
HHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECC
EDILTHKIVQDNQYYFDDPRRCELIPHSDSHCLLRNLLLGERSSTNKIKDNPKSQQLHFP
CHHHHHHHHCCCCEECCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
SLFHGTTQTPDTMPQEHTLTI
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA