Definition Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome.
Accession NC_006360
Length 892,758

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The map label for this gene is 54020017

Identifier: 54020017

GI number: 54020017

Start: 79134

End: 83834

Strand: Direct

Name: 54020017

Synonym: mhp067

Alternate gene names: NA

Gene position: 79134-83834 (Clockwise)

Preceding gene: 54020016

Following gene: 54020018

Centisome position: 8.86

GC content: 26.06

Gene sequence:

>4701_bases
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TATTTCGGATTTTTTACTTGAACAAGAACAATTAATAATTAAAAATTTATATCAAAAATCAAAAAATTATAAAGAAGAAA
AGTCAATAAATATTCTTTATTTAGGGATAGGATTTTTAAAATGATACGAAAATACTGAGGAAAACACTCCTATTTATAGT
CCTATTTTTTTATTTCCTGTCCAAATTAACCGCTTGATTTTTCAAGCAAAAGAAACAATTTCGCTAGAATTTCTCGATAA
TGCCTTTCTAAGTATAAATTTTACGCTTCTAAAAAAACTGCAAATCTTAGGACTAGATACTAAACTTTCTAAATTCAGAA
TCGATAATTCGCTTTCGATTAAGGAAAATTACAATAATTTTAAAAAGTTATTCAGTGAAGGTAATAACTTATCTAACTGA
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AAAAATTATTAAAAATAATTTTTATACAGAAATAAATGGAAATTTTTTTGGTTCAGATTCTTTAATTAAAACTACTGACG
AAACCAAAAAAATCAAAACCGCTGATGAATTCAATAACATCAACCCACGCGATTATTTTCATATTTTAGAAGCAGATTCA
ACTCAAGAAGCAGCAATTCAGGCGGCGATAAAAGGGGAAAATTTTATTTTAGATGGACCTCCAGGAACCGGAAAGTCACA
GACAATTACTAATATAATCAACGAATTTTTGGCAAGAGGGAAAACAGTTTTATTTGTTGCTGAAAAACTAGCGGCACTAA
ATGTTGTTTATTCAAACCTTAAAAAAATTGGATTATCAGATTCGGTAATTGCGATTCATAATGAAAATATAAATAAAAAA
GAAATAATCAACGAGCTTTTAAATACTTTAGAAAAAGGATCAAATTCAATTTTAATTAATAAGGTTGAAAGCAACCTAAT
CGAAAATAATTACTCTGAATTACAGCGAAAATTGAATGATTATGGTGATAAATTAACAAAAATTCGTCCACAGTTATCAA
AAAGTTTATATCAATTAATAGCTGAATATCAGAATCTTGCCGATTTTTCTAGTTTTGATTTTTATTTATCTGAGGAAAAA
ATTAGGAAAATTAACTATGAAACTCTACAGAAAATTCAATGAGCTCTTAATAATTTGTTTCAAAAATTAAAAAATATTAA
TTTTAATTTAAAAAAACATCCTTGATATGGTTTTAAATCGGCACAAGTTGATGAATTTGAAAAAGAAAAATTTAGAACTT
GGTTATTAGAATTAATTAAATTAAGCAAGCTAATTTTTGAAAATATTAAAGAATTTAAGTTTTTTTTAATGCATTCTGAT
CAACATCTTAGCAATATTATAAATTTATCAGAACTTCTAGAATCCTTATATAAATTAACAAAAATCGATTTAGTAGGCTT
GCAAGAAATTGAAGATTTATCATTTGAGATAGAAAAATATAGTCAAATTAAGGAAACTAAGGCAGAAATTATTAGCCTTG
AAGATAATCTAAAAGTTTATTTTAAAAGAATTCCGCTAAATATTCCGCTTTTGGAGTTTAAAGAGGTTATTGAAACTCAC
CAAAATTCCAGGATAAAATTTTTGGACTTTAAGTATAAAAAAATTAAAAAAACCTTATCTACTTATCTTAAAGATGGTTA
TGAGCCTGAAATTTTCCTTAAAACTCACTCATTAATTCATTTATTAATTCAAAAAAAATTATTGTTATCAAAATTAGTTG
AGAGTCTCAAATTTAAATTAAGTCTGAATTCAGAAGAAGAAATTGAAAATAATCTTTGACAGCTGAAATTTTATGTAAAA
TTAAAATTTTTAAATAATTCAACAAAAATTAAGGTTCAAAACAAAGAATTTGTTGACTTTTTCTTTGATTCAAAATACAC
AAAAGAACTTTTAACAGAAAAATTATTTTCCCCAGTTATTAAATTTATGCAGATATGAAAGGAATTTAGTTCATATTTTG
ATTCTAAACAGTTTGATTTTTTGTTTCTTGAAAAGAAAAAATTCGAGGAAAACTTACATCAAAAGTTTGTAAAAATCGAC
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AATAGAAAAGAACATTCAACAAGATTTTTATAAAATTTTTACTAAAAAATTTTATAAATTATTAATTGATCAAATAGTTC
ATTTGGAATTTGAGGCTTTTGATTGACAAACTTTGCATTTAAACCAAATGCAGTTTGAACAAGCCCAGAAAAATTTAGAC
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AATTAGAATTTTAAAACAAGAAGCAAATAAATCTCGTCGCTTAATGCCTTTTCATGAACTTTTTGTCCGAATACCTAATC
TGTTAAAAAAATTAAAACCTTGCCTTATGATGTCGCCACTTTCAGTTAGTTCATATTTTAAAAATAGTGATATTGTGTTT
GATCTTGTAATTTTTGATGAAGCCTCGCAACTAAAACCAGAAAGTGCAATCGGCGCAATTATCCGTGGAAAACAGTATAT
AATTGCGGGTGATAAAGAGCAAATGCCCCCTACAAGTTTTTTTGATAGTCTTTCTGAATATGGAGAAAATGACGAAGATC
TAGCAGAATTTAACGTTTCTGATTATCTTTCAATTCTTGATGTAAGCCAAACTTTTTTAAAATCTTATAGATTAAAATGG
CATTATCGGTCAAAATTTGAAGAGCTAATTCAACCTTCAAACATTGAAATTTATAATAATGATTTAATGACTTTTCCGGC
AATCGAAAGGCCACAAGAATTTCAAGGAATTAAATTTTTTAAAGTTGAAAAGGCAGTTTATAAAAATCGTAGAAATGAAA
AGGAAGCCGAAAAAGTACTTGAAGTCCTTGCAGAAATTTTTCAAAAATATCAAAATAAGTTTACAATTGGAGTCGTTACA
ACAAATCTTGAACAGGAAAAATTAATTGCTGGGAAAATTGATAGGTTTAAGGCAGAAAATCCGCGGTATTTTCAAGGTAT
ATCAGAAGGTATTTTTGTTAAAAATATTGAATCAGTTCAAGGTGATGAACGAGATATTATCATTTTTTCACTGAATTTTG
GGCCTAATCCAGAGGGAAAAATTTCTGCTAATTTCGGAGCAATCAATCAAAAAAATGGTTATCGCCGTTTGAATGTCGCT
TTTACTCGCGCTAAATATTCAACAGTTGTTGTTTCTTCAATTGAACCAGAACAAATCGATCTAACAAAAACAAAAGCCAG
GGGTGCTGTTTTTCTAAGGAAATATTTAGAAATTGCCAAATATGGCGCTCAATTTAGTACTCAAACTACAAAAACCACAT
CAAATGAAGTAACTTTTGAATCTATTGTTTATAATGAACTAAAAAAATTAGGTTATAAATTATTAAAAAATGTGGGTTAT
TCTAATTATAAAATTGATTTAGTTATTTTAAATCCTGAAAATGAAGATCAGTTTCTGCTAGGCATTGAATGCGATGGTTC
AATTTTTGCAAAACTAAAAAATGCGAGGGATCGTGATATTTTAAGGAAAAAAGTTCTTGAATCGCGTGGTTGGAAAATTT
TTAGAATTTGGTCAATTGATTGATTTCAAAATCCCAAATTACAAATAAAAAAAATTAAAGAACAATTAAAACTAATAGGA
ACTAAAAAAGCTGAAAAAAGCCAGGATGTGTTAGTAAAACAAAAGAAAACTAATGAAAATTTGATTTTAATAGCTGAAAA
ACCAAAAAACAATTTCAGATCAGCATTTCAAATAAGATTTAAATTGGATTTTCAAACTTTAATTAAATTATATGATAAAA
TTAAGGATAAATTTAGTTTATTAATCTATATTTTTGAAAAAGTGCAAATTTTACACAAAAATGAATTTTATAAAATTATT
GCCTGATTAGATGGTAAGACAAGAACAAGTATTCTAACTAAACAAGATGCACTTAAAATAGCTAATAATCTGATAAAAAA
AGGTATAATTTTCGAATCACAATCACATTATTTATTAAAAAATGTTGTAAATTATAATTTTTTCTTTCAACCAAAAAGGC
CAATAAAGGAAATTCACTATTTCGAGATTAAAGATTTGATTATAAAAATAGTTCAACACACAAATTCGATAACTAAAGCC
GATTTATATAACTTAATTTTAGAAGTCACTCATTTCACAAGCCTACAAAACAAAACTCGCGACTATCTTGATAGATGTCT
TGAAAAATTAATAAGTGAAAAATTAATTTTTATTGATAGATATAGCAATTTAACTTTATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATACTTTTTTATCATAGAACTTATTTAGTGTTTTTTTCTAAAAAAACATTTATAATATTCATACATATTTTGAAAAAAGT
ATTTTTTTTAAGGAAATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCCTAATTGTTTTGTTCATTTTTCTATTACTAGGTTGATAACTTTTTATGCTAAAAAAAAGTTGTTTTTATATCATTTGT
GGTATAATTTATGTAATTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1566; Mature: 1566

Protein sequence:

>1566_residues
MEVDSVYENLKNWQNKLLDISKKNRLINFNLFQPTKSVPLKLGILLPDFNQFLDNIIENKTTLFFRSLDQQKKASKKNSH
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PIFLFPVQINRLIFQAKETISLEFLDNAFLSINFTLLKKLQILGLDTKLSKFRIDNSLSIKENYNNFKKLFSEGNNLSNW
EMIETIQLSAFDYSKIEIYTDLVENQEKIIKNNFYTEINGNFFGSDSLIKTTDETKKIKTADEFNNINPRDYFHILEADS
TQEAAIQAAIKGENFILDGPPGTGKSQTITNIINEFLARGKTVLFVAEKLAALNVVYSNLKKIGLSDSVIAIHNENINKK
EIINELLNTLEKGSNSILINKVESNLIENNYSELQRKLNDYGDKLTKIRPQLSKSLYQLIAEYQNLADFSSFDFYLSEEK
IRKINYETLQKIQWALNNLFQKLKNINFNLKKHPWYGFKSAQVDEFEKEKFRTWLLELIKLSKLIFENIKEFKFFLMHSD
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QNSRIKFLDFKYKKIKKTLSTYLKDGYEPEIFLKTHSLIHLLIQKKLLLSKLVESLKFKLSLNSEEEIENNLWQLKFYVK
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AWLDGKTRTSILTKQDALKIANNLIKKGIIFESQSHYLLKNVVNYNFFFQPKRPIKEIHYFEIKDLIIKIVQHTNSITKA
DLYNLILEVTHFTSLQNKTRDYLDRCLEKLISEKLIFIDRYSNLTL

Sequences:

>Translated_1566_residues
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EMIETIQLSAFDYSKIEIYTDLVENQEKIIKNNFYTEINGNFFGSDSLIKTTDETKKIKTADEFNNINPRDYFHILEADS
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>Mature_1566_residues
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DLYNLILEVTHFTSLQNKTRDYLDRCLEKLISEKLIFIDRYSNLTL

Specific function: Unknown

COG id: COG1112

COG function: function code L; Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the DNA2/NAM7 helicase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 182275; Mature: 182275

Theoretical pI: Translated: 9.64; Mature: 9.64

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
0.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
0.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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TLFFRSLDQQKKASKKNSHKLSDFLPLTLEQLQINTKISKIPPKVIISDFLLEQEQLIIK
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EEECCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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STKIKVQNKEFVDFFFDSKYTKELLTEKLFSPVIKFMQIKEFSSYFDSKQFDFLFLEKKK
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIDQIVHLEFEAFDQTLHLNQMQFEQAQKNLDQLTRKKVDSILLEKIPQIDSFSDKNSEI
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NRRNEKEAEKVLEVLAEIFQKYQNKFTIGVVTTNLEQEKLIAGKIDRFKAENPRYFQGIS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCC
EGIFVKNIESVQGDERDIIIFSLNFGPNPEGKISANFGAINQKNGYRRLNVAFTRAKYST
CCEEEECHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEEEECEEEE
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EEEECCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
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VQHTNSITKADLYNLILEVTHFTSLQNKTRDYLDRCLEKLISEKLIFIDRYSNLTL
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCH
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HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHEEE
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EEECCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
ETIQLSAFDYSKIEIYTDLVENQEKIIKNNFYTEINGNFFGSDSLIKTTDETKKIKTADE
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEECCCCCEECCCHHHHCCCHHH
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CCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEE
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EEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHH
SNLIENNYSELQRKLNDYGDKLTKIRPQLSKSLYQLIAEYQNLADFSSFDFYLSEEKIRK
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECHHHHHH
INYETLQKIQALNNLFQKLKNINFNLKKHPYGFKSAQVDEFEKEKFRTWLLELIKLSKLI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FENIKEFKFFLMHSDQHLSNIINLSELLESLYKLTKIDLVGLQEIEDLSFEIEKYSQIKE
HHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TKAEIISLEDNLKVYFKRIPLNIPLLEFKEVIETHQNSRIKFLDFKYKKIKKTLSTYLKD
HHHHHEECCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHC
GYEPEIFLKTHSLIHLLIQKKLLLSKLVESLKFKLSLNSEEEIENNLQLKFYVKLKFLNN
CCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHCCCCEEEEEEEEEEECC
STKIKVQNKEFVDFFFDSKYTKELLTEKLFSPVIKFMQIKEFSSYFDSKQFDFLFLEKKK
CEEEEECCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHH
FEENLHQKFVKIDQIYEISRINTDINALIQLEIDDFVKKAIEKNIQQDFYKIFTKKFYKL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIDQIVHLEFEAFDQTLHLNQMQFEQAQKNLDQLTRKKVDSILLEKIPQIDSFSDKNSEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCE
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EEEHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEECCCCHHHHCCCCCEEEEEEEECCH
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HHCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHH
SQTFLKSYRLKWHYRSKFEELIQPSNIEIYNNDLMTFPAIERPQEFQGIKFFKVEKAVYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEECCCCCCCCHHCCCEEEEHHHHHHH
NRRNEKEAEKVLEVLAEIFQKYQNKFTIGVVTTNLEQEKLIAGKIDRFKAENPRYFQGIS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCC
EGIFVKNIESVQGDERDIIIFSLNFGPNPEGKISANFGAINQKNGYRRLNVAFTRAKYST
CCEEEECHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEEEECEEEE
VVVSSIEPEQIDLTKTKARGAVFLRKYLEIAKYGAQFSTQTTKTTSNEVTFESIVYNELK
EEEECCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
KLGYKLLKNVGYSNYKIDLVILNPENEDQFLLGIECDGSIFAKLKNARDRDILRKKVLES
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
RGWKIFRIWSIDFQNPKLQIKKIKEQLKLIGTKKAEKSQDVLVKQKKTNENLILIAEKPK
CCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCC
NNFRSAFQIRFKLDFQTLIKLYDKIKDKFSLLIYIFEKVQILHKNEFYKIIALDGKTRTS
CCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VQHTNSITKADLYNLILEVTHFTSLQNKTRDYLDRCLEKLISEKLIFIDRYSNLTL
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8948633 [H]