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The map label for this gene is sidH

Identifier: 52843025

GI number: 52843025

Start: 3194315

End: 3200992

Strand: Reverse

Name: sidH

Synonym: lpg2829

Alternate gene names: NA

Gene position: 3200992-3194315 (Counterclockwise)

Preceding gene: 52843026

Following gene: 52843022

Centisome position: 94.21

GC content: 36.64

Gene sequence:

>6678_bases
ATGAAAAGAACCATTGAAACCTACATCATCTATTTAAAAGAAGATTTAAAAATAGCTGATACTTGTAAAACAATAAAAGA
TGGTTTGTTAAAATCGATTACCGATAAAACCCATTTTTCTGAGGAATTGGCTACTTATTTTGAACGAGATAACCCCAATG
CCCCTTTTAAAGTTAACACGACTGATCCTACCCAAGTCGCTGTTCTGAAAAAATTGCTTAATGCTCTGGAAAATGCTGAA
AAGTCGTTTCGAGCTATTGAAAATATTGATATCAGTCGTGATAGGTACACTGCCATGATCGCTAAAGATGCAGTCATGGT
CAGTTATAAAGCGGTGCATGAAATTTATGCGGCTCTTCAACTAATCAATCACAGTAATTCGGACATACAAGATATAGTAG
GCCCACATATCCAAAAATTATTACCACAAATGGCTTTAGCCAGTAAGGCATTAGGAAATTTTGCTCCGGAGCATCCTGAG
GAGAGTGCCGGGGCAGTGCTTGCTGGTGTAGTCAATATGCTTCCAACTGAAAAGCCAACCGAGTCAGAAAGTTTGGGTAA
ACTCAGTAACCTTATTTTTGAATTGCCTCATTACTTCGAGGAGTTACAAAAATTAATCGCTACCGGGGCATCAGGGATTG
CCACCAAATCAATTACCAGTGCTGAAGACTATCAATCCGCAATGATAAAAAAGGCAAATGAAACAAAATATTATTTTGAA
CAACTCAGTTCCAAGAGTGGGCTATTAGCAATCCCAAGCTATCTTTCAATAGTCAAAAGATTAATTGCCCATAGTACTGA
TTTGGTTAATGCCGGTGCTCCTCTGACAAAACAAGCTTATTTGGATGCTGTCGCTAAGCTTGAAGACATTAAACATAATA
TTTTACCCCAATTGATTTCAGAGCTGGAAATGGTTGAAGAAAGCATGGGTTTAAAACCAGGTTTACTGACCGATCCCGCT
CTTGAACAAATGAATAAATACTATACGCAGCTGGCAGAGCAAGTTGATAATATTGCCAAGGCAGCTGGAGTTCTTGATAC
TGTTTCAGATTATTCTGATTCAATAGGGGGAAAAATCGTTCGTTTTCTTGCTGGAGATAGCAAAAAACTGGATGTGGGGC
CAAAATTAACGCCTGCACCTGATTTAGGTGTTTTGATGGACGATGTATTTATTCAGAAGAGAAGATCTAATCAGGAAAGC
CGACTTAATGAAGCCAGACTTAGCTCTGAAGACAAAAGTGTACTTGCCGCGGCCAATCGTTTCTTTGATAAAATCGGCTC
CTACAATAGCATTCACAAAGCATGGTCCAAGTGGAGTTTGGCAAACATTAGTCAGAGTGAAAAGGACGCTTTAATCAAGG
AGTACAAACAGTTTCAGCCACATTTTGCGGCATTATACCCAGATATTGACAAACTGGTTGTAGATGCTCTTACTCAGCCT
ACCGGAAGCAATATCGTTTCCAGACTATACAGTTCCGATTATAAGCAATTATGGAGTTCTGATCATTTTAAGCAGGTATT
ATCCTGTAAGGACTCTGTGCTATCCAGTATTCAGCAAAGCCTTGCTCAATCTGAGTTTAAAGCAAAGCTCATTGAAAAAA
CCATGAGTCACTCAGAAGAGACAGCTTATTCAATGAATAATAAAACAACTAATCTAACTACTCGGGTTCAACCGTTTGAA
CCACTAAAATTTACTTTGGAGGACGATAAACCGGTTGAGTATTACCATAAGAGGGTTATTGCAGCATCTAACCAAATTTT
AGAACTTGAAAGAGCACAGAAAGGAGTAGCGGAGTTTTTTAATTATATTCAGAAAAAGTATCCCCATGAAAACCCATCGT
TTGATTCTCTGGATGAATCGGATAAAGAATTTCTTCGCAAGGCTTATAAAACATTTCAACCACAATTATTGGCGTTGAAG
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GGTATCTCTTAAATCAGGTATTAATGACTATTTAAATGAGAAAATTAGTGATTTAAATCAGGATAAAACGACTTTGCTGG
ATAAGGAGGAAGAAGCTCGCGAAGAACAATATGCAAAAAATCCCTTGGTAGCGAAGGGGGCAGAACTTGAGAAACAAACG
CTCTTTGGGCAGATGAGTAAATTGAAGTTATCCAAGTCTGTTGATGATTTTTTCAATAAAAAATTTCAGACTTATCTTAA
GGACAATCTTTCTCCTGAGGTATGGAAACAGCTCTCATCGAATGGAGAAACGCTTGATTTTGACAAAATACCGTATCTCG
AGTTTCATAAAGACAGCCCTGAAGTTGCCATGTACAAGCAATTAATAAACTCCATGCATTATATGAAGAATGGCTTGGAA
AAGCTGGAGTCGTTAAATGACTATGGTGACCCCAATAACATTTATCACCGTACGCGATTTGTCATGACCACATTTAATGC
TCTGGTTATGAATATCTGTTTCAGTAAGTACTATGTTATGGAGGCAGGAAATAATCCAGGATTAAAGGCAATTGTCCAAG
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CCCAAGCAAAATATTATTACTGCATGGAAGAAACAACAAGCGGTTGTAGAATCTGGTTTGTCAAAAGGACCTAAGCCTAA
AACAGATCAGCAATTAATTAGTGAGCAATTGGGTAAAATTCAGGAAGCCATCGATAATTTTGATGGTGACCTGGAAGTTT
CAGATTCAGCCAGGGAAAAAATAAAAACTCAAATTGGCGAATTTGCCAAGGGGATCAGTGGCTTGTCTTTTGGCCCTGGT
TCTGTGAAAAAAATACTGGCTGCCTTGACCAAACTCGAAACCCAGCTTTCTAATCTGGATAAGGAAAGTCCTGAAGTAAC
ACTTGGTAAACTTAAGGACATTCATTCCGAATTGAATGCGCAATTCAGGGCGGCTGCAGAATATACCGAGTATCATTCAG
GTCAAAAGTTTGGCTCCTACTCCAATAACATAAGCACTATTGTCAGTAATTTTTGTAATGGTCTTGTTAGTAATCTGCCT
TTAAAACAAGAACCGGCACCAAAGGTTAAGGCACCAGAAAAACCTGTTACTCCTGTTATTACTGGTACAACTAACCCTCA
TGAGGTAGTTTTTGGCACAAAACATGAAGAATTTAATAGCGTTTATCAGCCCTATCTCTTGTTAAAGCGTATTACTGATG
AGTTTCGAGATCAAAATAATCCATATAAACCTTCTTTTGACGAATTAAAAGAGGAAGCGGTTAGTTATTATGACAAAATC
CAACCTCTTCTCGAGTCTGTTGATCCAAAATTTGATAAAAATTTCATAGCAAAACATAAAGAGTCATCAACACTACTGAA
AGCTATTGATGAAGTGATGTCAATGCGCCAACGCATTAATAATCCTGAAAGTAGTTTTGCTAAACTTAAGGATTTGCATT
TGGAAGGAGACTTTGAAAAAGAGGAAAACAAGGAAAAATTTCGACAGCTATACAAGGAAATTCAGCCGTACCTCCATAAA
ATCGATAGTACTTATGATCAAACGCAATTTTTAGAAGGTTTAAAGACAGCAAAGGATTTCAGTGGTGCTTTGCAAAGAAT
TATGAATGAGGAAAATGCTCTTCAACAAAGTACGTCACTGAAAGATACTTCTTATTTACAATTAATTGCAGAAAGCCTCT
ATCAAATTCCAGTCAAGCTCAATAAGTTAAAAGCGGAACCTGACACTCCAGAACCTTCCAAAGAGGAAATAGATGCGAAT
GTGAAAGCATTTGTTGAAGGATTAAATGGATTATCCTTTGGTCCAGGTTCAGTTAAAAAGATTCTGAGTACTGCCGCTAA
ACTGCAGATGCAGCTTTCTGATATTGGTAAAGAAGGACGAGAATTAACAATGGGGCGTTTAAAAGAAATTCAAGCAGAGT
TCGGCACCATTTTAATGGCGGCTGCTGATAATGCAGAATTTCATTTGGGCCTAAAGCCCGGTACGTATTCTCGTACTGTG
AGTGAGCGATTTGAAAAGTTCTATAGTTCTCTGATTGTCAATTTACCTTTGGAAAAAGATCAAACGGGTTTGGAGTTATT
AATTGATACAACAAGCACACAAAAACGTTTGGCAAGAGAAATGGAACGCCTTGAAAGTGTCAAGGAAGATACCAGTGCAA
TCGATACGAAAAAAAGTATATTTGGTACAGAGCATGAGCAATTCAGTACTTTATATCAACCATATGCCAGCTTAAGGCAT
ATTGCGAAGGATATAGAAGATGGGGTGCACATGAATCTGTACGAGAGGACATTAGAGGAATTAAAAGAAGAAGCTTCGAA
TGAATATAAAAAAATTCAACCTTATCTTGCTAAAATTAATCCTGAATTTACTGAGGATTACATTTCCAAAACAGATGGTG
AGTACTCATTACTCCATGCCATTGACAGGGTATTCGAAGAGCGTCATAAAATTAATAAACCATCCAGCCCTTTTGATAAA
TTAAGGGATTTATATTTGGATGGCGATTTCGAAAAAGAAGAGAATAAAGAACAATTTTTGCAGCTTTATGCGGAGCTTCA
ACCCCATCTTATCAAAATAAACTACCAATATGATCTCGCTTATTTTCTTAGGGAGTTGCAAACACCGGAAGATTTTAAAG
CCGCGACAGAAAGAATTATTAATGATGAAAGTAAACTTCAAGAATTGATTACCGGTTTGGATGATACAAAACGATTAAAG
GTAAAATTATGTGAAGAGCGTATAGGTTATTTTATTGATCTGCTAAAGAAACAGGAGCTGGAAGTTGGGCCAGAAAAAAT
ACAAGCCTTTAAAGAAAAAATATTTTTTAATTACATCCATGCTAATGTCAATAGTGCCCTTGATGCTAAAATTGGTTCTC
ATGCCGAACAGTTTCTACAATTCATTGAAAAGGATTTTCTCGATAAAAAAAATGAGATTTTAGAGAAAATTACTATTGAC
CAAGATATGGAAGAGGAAATTGCAAAAGCAATAGACAGAATAGCCCCTGACATTATCAATAATAAAATAGAGTCTTTTAA
AAAATTACTATTTGACAGTTATATTCAGAGCGATATTAAAAACTCTCTGCACAATGAATTGGGAATTTATACCAGTTTAT
TTATCGATAAAATAAGCCCGGAAATTCATTTGCATCAATCTGAAATATTGGGAAATGTTGCATTTGACAGCAAAATGGGG
GCTGAAATTGGCTCAAAAATTAATGCGATTACTCCCGGAATTTTGCTGAATAACAATCCATTGAAAGAGGCGTACGTTGA
TTTAAATAATACATTGAAGGAAATTAATACATTACTTGATGAGGAAAATAAAAAGACCAGGGATAATCCTTGTCGCAATG
AAAAAATAGCCAAATTGACTTCTCTAAAGGATCGCTTGAGTGATTTGGACAGTATTCCTAAAGAAAATACAGTGGAATTC
CTTAAGAAGATGCAAGAAGAAACAAGGTCTTCGCTGAAATCTCTGGAAAGCAATGACGCCTTAATCAATATTTATGATGT
ACTTAATTCTTTAAAAGAAACCATAGAGAACGGGAGTGACTTACCCGAAATCAAAAAAGATAAGTTACAAATGATTTCCG
ATGTTCAGAATATCCTCTCGAATTTTGATAAAAACCCAGCCGAGCGTTTAAATTTGGCAGTGCAAATATTAAATGACTCT
AACCCCGAAGTCTTGTCAAAAACTAAAGGAAACTTTCTTATTGGAGAAGCATTTAAAGGACAAGTTTTTACTAATTATAT
TAATACTAAAATCAGCGAGCAATTGAACAACGAACTCGGTCCTTATGGAAAGGTATTCTTGAAGCAAATCATGCCTGATT
TTATTGCCAAAAAATCTGAAATAATCAAAGAAATAGCCATTGATAATATGGAAACAGGGCTTGAAACCCAGTTTAAAATT
CATGCTCCTGCTATTTTTGAAAAGAATAAGGAGTTAAAAGCAGCTTACGAGCAATTAAACGTCCATCTAAAAGAAGTACA
GAGCCTGATTGAGGCAGAAGAAAAGAAACCTAAAGGTAATCCCTGCCGTGAAGAAAAAATAGCCGCATTAAGATCCCATC
AGTCTCAGTTAATGAATACCCAACGTATTCCGGATCATGAGACACTCAGGTTTTTGCAGGAGCAGAATAAAAGTGCGAAA
AGTTTTATGGGTAAATTAGAAAAATATGACACGATGATCAGTGTGTATGACTCACTGACAGAAATAAGAGAGCATGTTAG
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CCAGCAAAGAGCCTTCTATTCGTTTGGCAGAGGTCAAGGCTCACGGCCTAAGTGATCAATGTAAAAATGTATTACTTAAA
AATTCTGACAATTTTCTGGTGAGTTTCTTTAAAACGCTATTTTCCAAATTATTTAATATTAAAAACGAAAATGAAACTTT
GGTTTCATCATTCAAACAAAGGCTGCAAAATATCAAGGGTCCAGAGCCCGTCGCTACGCCTATGGAGACTCCAGAAAATG
AAGCACCTTTAGTGAATGCCAATATTACCAGATTCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGATTCAAAGTGAAGTAAATTTTGAGAGAAAAAACCACTATACTGGCATGAATCAACTATATTAATAATATAGATTGTT
CATTTGCTGGTTGATGTGGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCGAATTAGTTTTGATTTAATCAGACATAATCTTTCATTTCAGTCAAAACAACAATTAAATTTAACTAATTTCTTAGTA
AAGGATAGGGTGGCATTTCA

Product: SidH

Products: NA

Alternate protein names: SdhA GRIP Coiled-Coil Protein GCC

Number of amino acids: Translated: 2225; Mature: 2225

Protein sequence:

>2225_residues
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Sequences:

>Translated_2225_residues
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Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 252749; Mature: 252749

Theoretical pI: Translated: 5.54; Mature: 5.54

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKRTIETYIIYLKEDLKIADTCKTIKDGLLKSITDKTHFSEELATYFERDNPNAPFKVNT
CCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECC
TDPTQVAVLKKLLNALENAEKSFRAIENIDISRDRYTAMIAKDAVMVSYKAVHEIYAALQ
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LINHSNSDIQDIVGPHIQKLLPQMALASKALGNFAPEHPEESAGAVLAGVVNMLPTEKPT
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ESESLGKLSNLIFELPHYFEELQKLIATGASGIATKSITSAEDYQSAMIKKANETKYYFE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
QLSSKSGLLAIPSYLSIVKRLIAHSTDLVNAGAPLTKQAYLDAVAKLEDIKHNILPQLIS
HHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELEMVEESMGLKPGLLTDPALEQMNKYYTQLAEQVDNIAKAAGVLDTVSDYSDSIGGKIV
HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RFLAGDSKKLDVGPKLTPAPDLGVLMDDVFIQKRRSNQESRLNEARLSSEDKSVLAAANR
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
FFDKIGSYNSIHKAWSKWSLANISQSEKDALIKEYKQFQPHFAALYPDIDKLVVDALTQP
HHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCC
TGSNIVSRLYSSDYKQLWSSDHFKQVLSCKDSVLSSIQQSLAQSEFKAKLIEKTMSHSEE
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
TAYSMNNKTTNLTTRVQPFEPLKFTLEDDKPVEYYHKRVIAASNQILELERAQKGVAEFF
HHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NYIQKKYPHENPSFDSLDESDKEFLRKAYKTFQPQLLALKHDDINTRLVSSLTSSKPTDP
HHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCC
PLRLTDLVSLKSGINDYLNEKISDLNQDKTTLLDKEEEAREEQYAKNPLVAKGAELEKQT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCEEECCCCC
EVAMYKQLINSMHYMKNGLEKLESLNDYGDPNNIYHRTRFVMTTFNALVMNICFSKYYVM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
EAGNNPGLKAIVQEGLDLLKPLEGMPLIGDYLKTTEKQEPPKQNIITAWKKQQAVVESGL
ECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKGPKPKTDQQLISEQLGKIQEAIDNFDGDLEVSDSAREKIKTQIGEFAKGISGLSFGPG
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
SVKKILAALTKLETQLSNLDKESPEVTLGKLKDIHSELNAQFRAAAEYTEYHSGQKFGSY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
SNNISTIVSNFCNGLVSNLPLKQEPAPKVKAPEKPVTPVITGTTNPHEVVFGTKHEEFNS
CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEEECCCHHHHHH
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>Mature Secondary Structure
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