| Definition | Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002942 |
| Length | 3,397,754 |
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The map label for this gene is 52842203
Identifier: 52842203
GI number: 52842203
Start: 2226164
End: 2229016
Strand: Reverse
Name: 52842203
Synonym: lpg1986
Alternate gene names: NA
Gene position: 2229016-2226164 (Counterclockwise)
Preceding gene: 52842204
Following gene: 52842202
Centisome position: 65.6
GC content: 38.38
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TATTAGATAAGTTACTTCTATTTTTTACCAGCAATTGCAAATTATTTGATTAATTTATATTCATTTTGTGTTGTTTTTTT AATATTTCCTTAAGCTAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGTTCATTGGATGAATAATTCAGGTTATTTATCTTACAAAAGAGCTCCTTCATATCTAAATTGAAAAGAAGGAGTTCTTT TCACTATCGTATTTTTAATC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 950; Mature: 949
Protein sequence:
>950_residues MPKFSLHLSEVISMGKTTTPEINQLNKYVIDKKSIKLANDLWARSVPLKGTPAERYIVGTRKIPIDVAEKLQIRSLKGPI GIPEFDKNKPYKDYVVAPVYNLDDELVGLQIIQIDPDGNKATNPENSHFFCKRYLGQTNPLREGKAAVINKTDNVDVVFI AEGVETAASVASLDEVRNNYSVLASMGVSQLPATLAYVKTHYPPGSTVVLLKDHDDPVANPLANLEFEKACKALVFAGYK VIVKEPPNLNDDWNDVIVRGGVELLTRQFNLDNPVLIASDTPARNSKVTPHFKTLYADLLKNEKLAEEQVVYGLLDKLIG QLIDKLKKTQSSDDLHKTIKEIDEVARTTEGVRTLLPETKNIPYQLRGLRRALKELKFLEDRRRDSLREDEDIDFSTDPQ TNSNGDLFKAYSYVMRHCLKHLQTLNPSDVFDLKKHSEILGFYERRLNNIDNEIKRIPQLISEFGSDDEFVIKQLKNKLK SLKLERKLYAQEFHEMKQQLHLLRSAHPKGNTPYANYYKQFVEEANSIMMKGKTQTKAIREELTGVWANRKQELQEDYKK RIDAARQHFVSERKKAIPPMIEYLEALRVIVKERSKEIDGKKSQEKENTASASESRNYQERYLRAMEELSQSEGVDKLLQ DWLNNLENFKTVSPLIYYPPQEGATVEGVDLIDYDSDEEKTLDDLRKKIFDDEESLLESPINDREKGKAKLEGKAGDSNP QVMSGPSHLAEGLMQSVQPSSLKTSDLQLYLTIKDFSERLAVSLYKSFEVISPESGERQEFDGLALREKGLTIIERKTND GTGPGLFQRNFCQQKIVSKHDFVLKNMIAELKSQSHPEKFIDIDVPKPLNWYSENFTSEMQEHLVNAAKSMVVKALQNLT LEFNVNRPNAYSATDYRGLFFNRSLIPGGVSLRFSQASKGNEAVAHQRIDEISKARTAERESLILPMRGQ
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 108113; Mature: 107982
Theoretical pI: Translated: 6.92; Mature: 6.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPKFSLHLSEVISMGKTTTPEINQLNKYVIDKKSIKLANDLWARSVPLKGTPAERYIVGT CCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEC RKIPIDVAEKLQIRSLKGPIGIPEFDKNKPYKDYVVAPVYNLDDELVGLQIIQIDPDGNK CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEECEEEEEECCCCCC ATNPENSHFFCKRYLGQTNPLREGKAAVINKTDNVDVVFIAEGVETAASVASLDEVRNNY CCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH SVLASMGVSQLPATLAYVKTHYPPGSTVVLLKDHDDPVANPLANLEFEKACKALVFAGYK HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHCCE VIVKEPPNLNDDWNDVIVRGGVELLTRQFNLDNPVLIASDTPARNSKVTPHFKTLYADLL EEEECCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH KNEKLAEEQVVYGLLDKLIGQLIDKLKKTQSSDDLHKTIKEIDEVARTTEGVRTLLPETK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NIPYQLRGLRRALKELKFLEDRRRDSLREDEDIDFSTDPQTNSNGDLFKAYSYVMRHCLK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH HLQTLNPSDVFDLKKHSEILGFYERRLNNIDNEIKRIPQLISEFGSDDEFVIKQLKNKLK HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH SLKLERKLYAQEFHEMKQQLHLLRSAHPKGNTPYANYYKQFVEEANSIMMKGKTQTKAIR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH EELTGVWANRKQELQEDYKKRIDAARQHFVSERKKAIPPMIEYLEALRVIVKERSKEIDG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KKSQEKENTASASESRNYQERYLRAMEELSQSEGVDKLLQDWLNNLENFKTVSPLIYYPP CCHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECC QEGATVEGVDLIDYDSDEEKTLDDLRKKIFDDEESLLESPINDREKGKAKLEGKAGDSNP CCCCEECCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCC QVMSGPSHLAEGLMQSVQPSSLKTSDLQLYLTIKDFSERLAVSLYKSFEVISPESGERQE CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH FDGLALREKGLTIIERKTNDGTGPGLFQRNFCQQKIVSKHDFVLKNMIAELKSQSHPEKF HCCCHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE IDIDVPKPLNWYSENFTSEMQEHLVNAAKSMVVKALQNLTLEFNVNRPNAYSATDYRGLF EEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCE FNRSLIPGGVSLRFSQASKGNEAVAHQRIDEISKARTAERESLILPMRGQ EECCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCC >Mature Secondary Structure PKFSLHLSEVISMGKTTTPEINQLNKYVIDKKSIKLANDLWARSVPLKGTPAERYIVGT CCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEC RKIPIDVAEKLQIRSLKGPIGIPEFDKNKPYKDYVVAPVYNLDDELVGLQIIQIDPDGNK CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEECEEEEEECCCCCC ATNPENSHFFCKRYLGQTNPLREGKAAVINKTDNVDVVFIAEGVETAASVASLDEVRNNY CCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH SVLASMGVSQLPATLAYVKTHYPPGSTVVLLKDHDDPVANPLANLEFEKACKALVFAGYK HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHCCE VIVKEPPNLNDDWNDVIVRGGVELLTRQFNLDNPVLIASDTPARNSKVTPHFKTLYADLL EEEECCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH KNEKLAEEQVVYGLLDKLIGQLIDKLKKTQSSDDLHKTIKEIDEVARTTEGVRTLLPETK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NIPYQLRGLRRALKELKFLEDRRRDSLREDEDIDFSTDPQTNSNGDLFKAYSYVMRHCLK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH HLQTLNPSDVFDLKKHSEILGFYERRLNNIDNEIKRIPQLISEFGSDDEFVIKQLKNKLK HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH SLKLERKLYAQEFHEMKQQLHLLRSAHPKGNTPYANYYKQFVEEANSIMMKGKTQTKAIR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH EELTGVWANRKQELQEDYKKRIDAARQHFVSERKKAIPPMIEYLEALRVIVKERSKEIDG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC KKSQEKENTASASESRNYQERYLRAMEELSQSEGVDKLLQDWLNNLENFKTVSPLIYYPP CCHHHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECC QEGATVEGVDLIDYDSDEEKTLDDLRKKIFDDEESLLESPINDREKGKAKLEGKAGDSNP CCCCEECCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCC QVMSGPSHLAEGLMQSVQPSSLKTSDLQLYLTIKDFSERLAVSLYKSFEVISPESGERQE CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH FDGLALREKGLTIIERKTNDGTGPGLFQRNFCQQKIVSKHDFVLKNMIAELKSQSHPEKF HCCCHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE IDIDVPKPLNWYSENFTSEMQEHLVNAAKSMVVKALQNLTLEFNVNRPNAYSATDYRGLF EEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCE FNRSLIPGGVSLRFSQASKGNEAVAHQRIDEISKARTAERESLILPMRGQ EECCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA