Definition Bacillus licheniformis ATCC 14580, complete genome.
Accession NC_006322
Length 4,222,645

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The map label for this gene is yqbO [H]

Identifier: 52785323

GI number: 52785323

Start: 1524888

End: 1530188

Strand: Direct

Name: yqbO [H]

Synonym: BLi01559

Alternate gene names: 52785323

Gene position: 1524888-1530188 (Clockwise)

Preceding gene: 52785322

Following gene: 52785324

Centisome position: 36.11

GC content: 46.73

Gene sequence:

>5301_bases
TTGGCGACTGAATCAGTCGGATCTATACGCGTTAGTTTAGGTCTAGACAACATTGACTTCTCTCGCGGCCTCCAGGACGT
TAACAGAAAATTAAAGGTACTAAACTCGGAATTCAAAGCAGCAATGGCTGGCGCTGGCCGATTCGATAACAGCCTGGATT
CATTGCGTAATAAGACCGACATATTAAATCGGACTTTACAAACGCAAAAGGCAAAACTTAACGAGTTGAAGCGGCAATAT
GAAGAGAGCGTAAGGACGACGGGAAGGTATTCGGCACAATCCGAAAAGCTCCTCGCCCAGTATAATCGAACTGTTGCAGC
GGTTCGGAAAACTGAGGATCAGTTAGACCTTCTTAACCGTAAAATGAGAGAGCAGAGCAACGGCTTCAGTCAATTAGGCG
CTAAAATTAGCGCAAGCATTAAGACGATCGATACGAAGTTGCGCGTATTGGATTCGTCATTTGAGGCCGCATCAGCCGGC
GTAAGGGATTTCGGTTCTACTACCGAGCAACTACGACAAAAATCGGAACATCTTACGCAATCGATCTCGTTACAAGAGCA
GCGACTTAAAAACATCCGCCGACTGTATCTCGAAGCTAAACGCGCAAAAGGCGAAGATGCTCAGGCGACTCAAGAATTAC
GCGTTCAAATGAATCAAGCGACGGCACAACTTCGAACAACTCAAGCCGAACTGGCCGCAACGAACCGACAGATCCAATCG
AACACGGGCCGTTGGAACGAGCTCGGCAACCGGATGGGTGAAGTCGGGGACCGGATGCGGGACGTTGGGGGTCGAATGCA
ATCTGCGGGATCTGAAATCGCGATGTCATTCGGCGTAGCGACAGCGGCTTTAGGCGGAGGTCTTGCGGTTTCAACGAAAA
AAGCGATGGACTTCGAGCAGCAGATGTCGAGCGTGAAGGCGGTCATGAATCCGGCAGAAGCCAACCAATACAGCGCTGCC
CTTACGGAATTAGCCATTAAACTCGGTGCTGATACGAAATACAGTGCGCTTGAGGCTGCGCAAGGTATGGAAGAACTCGT
AAAGGCCGGTGTATCTACGAAGGACATACTGAATGGCGCACTTAAGGGCGCGCTATCGCTTGCGACAGCGGGAGAATTAG
AGCTTGCGGATGCGGCGGAAATTGCGTCGACTGCACTGAATGCGTTTAAAGACGATAACATTAGCGTTGCACAGGCAGCA
GATATTCTCGCAGGGGCCGCAAACTCTTCTGCAACAACGGTTGGAGAGATGCGGTATGGTCTTCAAATGACATCCGCAGT
AGCAGCCGGTATGGGACTGTCTTTTAAAGACACGGCTACTACACTAGCCCTCTTCGCACAGAATGGACTTAAAGGATCAG
ATGCAGGTACTTCGATGAAAACGATGTTAAGTCGTTTAGTACCTATGACAAAAGCTCAGTACGAGACAATGCACGATCTT
GGTCTAGTCACCCTTGATACTTCCGAAGCTTTTAAACGTATGGCTGATAAAGGCTTCAAACCAGCGAGTAAAAATATCGG
CGATATATACGAGGCACTTAACAAGTATGTTGAAAAGACGACAGGAGCGAAGCAAGGGACCGAAAAGTTCGAGAAGGCCT
TTGACAAAGCCACTCGGAGTCTTGGAATCATGGACAATAAATTTTTCGATGCTAACGGAAATATTCGGAGTATGACAGAA
ATATCTGGAGAGCTTTCTAAGGCGCTTGACGGTTTGTCCGCAAAAGATAAACAAGAAGCCCTTTACAATATTTTCGGTAG
TGACGCTATTCGAGGCGCGTTGATTCTTGGTAAGGAAGGAAGTAAAGGCTTCGATAAAATGGCGGCTGCAATGGATAAAA
TTAAGGCCGATAATGTTGCTGCTGAAAAAATGAATAACCTTAAGGGTAAAATCGAAGAGCTTTCCGGTGCCGTAGAAACT
GCACAAATTTCATTTGGTAATGCGCTAACCCCAGCTATCTCTGCACTCGTTTCTGTGCTTCAGAGCGCGACGGACTGGTT
TAATGGTCTATCTAAAGGAATGCAATCGTTCGTAGCTATTTCTTTAGCGGTTACAACTGTAATTATGGGCATTGTTGCAG
CGTTAGGTTTTTTAATGCTAGGTGTCGGCCAAATGATATCTGGACTCGGGACTGTAAGCGGTCTTTTAAAAGGTTTGATA
AAAAGTGAAAAGTTCATAAAGGTTATAGGTGTTGCATTCGGAGCACTTACGAGTCCGATCGGCCTTACGGTTCTTGGCAT
AACCGCGGTAGGAGCAGCTCTTGTAATCGCGTACAAAAAGTCTGAGAAATTCCGTAATTTTGTAAACGGCGCTTTTGAAT
CAGTCAGAAACGTGACGGTTACGGCATTCAGCAGTATTTCGGCAGTGGTAGGCGACACATTTAATTTTATACAAAAAGCT
TCGGTAGCCGGGTGGGAGAGATTTTCTGACGGCGTCTCCGTTATTGTTCCGGCAGTACGAAAGCGATTTGCTAACGTGGT
TAATTCAATAGGTGAATTCGTTTCAAACATCGGATCGTCGATCGCAGATAGATTCGGTTCCGGACTAGCGGATAGAACCG
GCTCCGCAGTAGATTTATTCATTCAGAATTTAAGGGCTGCGTTTTCGAGCGTGGGCGGAATCATATCGATTTTAGCGCCA
ACCGTGACTGCGTTAGGGCTGGCGATGGCCGGAGTTTCCGGATCTATTGGTTTTGTCATCACCTCTCTTGTTAGTCTAGC
CGGTTTTTTATTCCGACTATATCAAACAAACGAAGAGTTTAGAGCGTCTGTACAGAACGCCTGGTCACAGATTATGTCGG
TGATCGGTAACGTTGTAGTTGCGATTCAGCCAATCATAAATCAATTTATCGGGTATTTTTCGGATATTGCAGCAGAGCTT
GCACCTGAATTCGCGAAAACGGGCGAAGTCATAATGTCCAGCATTAGTTCGTTAGGACCAACGTTTACTGAGCTCGGAAA
TGCTTTTGGGGAATTGTGGACAACGTTAGGTCAATCATTCTCTGAAATTGCGGTTCAGATAGCGCCGGTAATCCAGGAAT
TAGGCGTGACTTTCGCGGCGTTTCTACCGCAAGTTGTAACTTTGGTTGGACAGTTGATTCAGACATGGGCATCTTTCCAA
GTCCAATTCGCACAACTTATTATGCAAGTCGCATCGGTACTATTGCCAATGTTAGCTCAAGCATTTACATCTTTGCTTCC
GCTGATTTTACAAATCGTATCGTCTGTACTTCCAATAGTGCTACAGTTGATTCAGTCCCTTGTTCCAGTAGTAACCACTA
TTGCGACTACCTTGTTACCAATTTTGCTACAGGCGTTTCAGTCAATTTTCCCGCCAGTACTGGCGATAATTCAGTCTGTA
GTGCCTATCGTCGCTAATCTGTTAACATCAGTTGCTCAAATCTTGAGTCAGTTGGCTGTAACCTTGCTACCACTCATTCT
GCAAGTTGTTCAGGCTGTTTTCCCTGTTGTAACAAGCATCATTCAGATTGCCATGCAGGTAGCCGTAACGGTTTTACAGT
TAGTGGCAACTATAATTCGTACTGTTCTTATCCCAGCGATCCAATTCGTGCTGAAAATTGTGCAAGTCGTGTTCCCTGTA
GTTGTTAGTGTAATCCAAAACGCACTCAATATCGTGATCAACGTAGTTAAGTTTTTCACTGCGCTACTAAAAGGCAATTG
GAGTGCGGTCTGGAATGCGATACTTGGGATTCTGAAAAGTATTTGGAACATAATCACCGCAGTAATCCGAGGAGCTGTAA
ATGTAGTCCTCACACTCTTTTCTGGATTGGTCAATGGGGCAGTTAGCGCCTGGAATTTCTTGAAGGACAGAACAGTAGGT
TTGTTCAAATCAATCGGGAAATTTGCGGCCGACACGTTCCACAACATGATCGAGGGAGCAAAGGCGCTACCAGGTGAAAT
TGGTGACGGAATAAAAAATATGGCCGGCAGAGCTCTATCCGGAGTTAAATCTCTAGGAAATACGATGATCGGCGGACTTG
AAGGAATTATCAATGGCTTGACGCAAAAAGGGATTAACAAGCTACTCGATACATTCGGGGTGGATAAAAAACTCCGGATC
CCTAAACTCGAAATTCCGAGGTTCGCTAAAGGTACGCCAGCAGGTGGGCACAAAGGCGGTCTTGCTATCTTAGGAGATGG
AGGCGGTCCGGAGTTATTCCGTACACCTTCCGGTTTCACAGGTTTAAGCCCTGGAACCGACACGCTCTTTAATCTGCCAA
AGGGGACGCAAGTCTTGCCGCATAAAGAAACACGCGAGGTACTATCTTCTGGAATCCCCGCATTCAGGAAAGGTACGAAG
AACAAAAGTTTCTTCGATTCTGCTATCGATGTTGGAAAATCCGCTGTTGATGCGGGTAAAGCTGCCGTAAACAGTGTTAA
GGATTTCGCTTTTGATGCGTGGGAATACGTAAGCAATCCGTCAAAACTTATCGCTAAAACGATAGAAAGTCTCGGACTGA
AGTTGCCGGATATTTCCGGAGCTTTCGGGACAATTGCGAAAGGTGCCTTCGGTAAAGTCAAAGATTCCGCCGTCAGCTTT
ATGAAAAAGAAACTCGCTGACTTTGGTGGAGCTTTCGGAAGTGGCGATAAAGCGTCCGGAAACGTTAAGCAATGGATTCG
GGCGGCGATGGCTAAAACGAATTCGCCAGCTTCTTGGTTCGCTCCACTCGTTACAATTGCGATGAAAGAGTCCGGAGGCC
GTACGGGTCCGTCTACAATTAATCGTTGGGACTCGAACTGGAGACGTGGTACACCGTCAATGGGACTTATGCAAACGATC
AAACCAACGTTTGATGCGTATAAGCTTCCGGGCATGGGCGATATCATGAATCCGGTGCACAACGCGGTTGCGGCTATACG
TTATATCAAATCTCGCTATGGAAGCCCGTTTAATACTCCAGGCATCAGATCGATGGAGAAAGGCGGTCCGTACAAAGGAT
ATAAAATCGGCGATATTGTGACGCAAAAGCAGCTCGCCTGGATTGCGGAAGAAGGTCCAGAAGCGATTATTCCGTTGCAA
AACCATAGGCAGCGGGCGCAGCAATTATGGACGGCGGCAGGAAGAGAAATCGGTATGGATCCGTCTGGTGGAAGTAACGA
AGAAGAACTCGCGTTGTTGCGTGGACAGAACGCGCTACTCAGACAGACGAACACATTGCTAACGGGGATTCTACGCAAAG
ATCCGAGTGTAGTTGTCGATACGGCAGCACTAACGGACAGTGTAGAAAAAGGTCAGGCACAAAACATCGGATTCAATAAG
CTGCTGTGGGGTGATCGGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTAGTGATGGTGGTAGCTCTCACGGAAGCGGAAAAACACAACAAAAACTCGGCTATATCGATCAGATACCGGGTTTTT
AGAAGGGAGGTATCGGAGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGGCGTATCTTACGATTATAAAAAACGGTGAAACCATTGATCACCGTAAATACGGCTTAAAGCTTTTGAGTTTTCGCAA
GGAATCGCTAACACACCGAA

Product: YqbO

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1766; Mature: 1765

Protein sequence:

>1766_residues
MATESVGSIRVSLGLDNIDFSRGLQDVNRKLKVLNSEFKAAMAGAGRFDNSLDSLRNKTDILNRTLQTQKAKLNELKRQY
EESVRTTGRYSAQSEKLLAQYNRTVAAVRKTEDQLDLLNRKMREQSNGFSQLGAKISASIKTIDTKLRVLDSSFEAASAG
VRDFGSTTEQLRQKSEHLTQSISLQEQRLKNIRRLYLEAKRAKGEDAQATQELRVQMNQATAQLRTTQAELAATNRQIQS
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LLWGDR

Sequences:

>Translated_1766_residues
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EESVRTTGRYSAQSEKLLAQYNRTVAAVRKTEDQLDLLNRKMREQSNGFSQLGAKISASIKTIDTKLRVLDSSFEAASAG
VRDFGSTTEQLRQKSEHLTQSISLQEQRLKNIRRLYLEAKRAKGEDAQATQELRVQMNQATAQLRTTQAELAATNRQIQS
NTGRWNELGNRMGEVGDRMRDVGGRMQSAGSEIAMSFGVATAALGGGLAVSTKKAMDFEQQMSSVKAVMNPAEANQYSAA
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TVTALGLAMAGVSGSIGFVITSLVSLAGFLFRLYQTNEEFRASVQNAWSQIMSVIGNVVVAIQPIINQFIGYFSDIAAEL
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VPIVANLLTSVAQILSQLAVTLLPLILQVVQAVFPVVTSIIQIAMQVAVTVLQLVATIIRTVLIPAIQFVLKIVQVVFPV
VVSVIQNALNIVINVVKFFTALLKGNWSAVWNAILGILKSIWNIITAVIRGAVNVVLTLFSGLVNGAVSAWNFLKDRTVG
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LLWGDR
>Mature_1765_residues
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KSFFDSAIDVGKSAVDAGKAAVNSVKDFAFDAWEYVSNPSKLIAKTIESLGLKLPDISGAFGTIAKGAFGKVKDSAVSFM
KKKLADFGGAFGSGDKASGNVKQWIRAAMAKTNSPASWFAPLVTIAMKESGGRTGPSTINRWDSNWRRGTPSMGLMQTIK
PTFDAYKLPGMGDIMNPVHNAVAAIRYIKSRYGSPFNTPGIRSMEKGGPYKGYKIGDIVTQKQLAWIAEEGPEAIIPLQN
HRQRAQQLWTAAGREIGMDPSGGSNEEELALLRGQNALLRQTNTLLTGILRKDPSVVVDTAALTDSVEKGQAQNIGFNKL
LWGDR

Specific function: Unknown

COG id: COG3953

COG function: function code R; SLT domain proteins

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis xkdO [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR008258
- InterPro:   IPR010090 [H]

Pfam domain/function: PF10145 PhageMin_Tail; PF01464 SLT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 187971; Mature: 187839

Theoretical pI: Translated: 10.20; Mature: 10.20

Prosite motif: PS00678 WD_REPEATS_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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CCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
ILNRTLQTQKAKLNELKRQYEESVRTTGRYSAQSEKLLAQYNRTVAAVRKTEDQLDLLNR
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SISLQEQRLKNIRRLYLEAKRAKGEDAQATQELRVQMNQATAQLRTTQAELAATNRQIQS
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NTGRWNELGNRMGEVGDRMRDVGGRMQSAGSEIAMSFGVATAALGGGLAVSTKKAMDFEQ
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHHHH
QMSSVKAVMNPAEANQYSAALTELAIKLGADTKYSALEAAQGMEELVKAGVSTKDILNGA
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KSEKFIKVIGVAFGALTSPIGLTVLGITAVGAALVIAYKKSEKFRNFVNGAFESVRNVTV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TAFSSISAVVGDTFNFIQKASVAGWERFSDGVSVIVPAVRKRFANVVNSIGEFVSNIGSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
TSLVSLAGFLFRLYQTNEEFRASVQNAWSQIMSVIGNVVVAIQPIINQFIGYFSDIAAEL
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQLIQSLVPVVTTIATTLLPILLQAFQSIFPPVLAIIQSVVPIVANLLTSVAQILSQLAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLLPLILQVVQAVFPVVTSIIQIAMQVAVTVLQLVATIIRTVLIPAIQFVLKIVQVVFPV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVSVIQNALNIVINVVKFFTALLKGNWSAVWNAILGILKSIWNIITAVIRGAVNVVLTLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GVKSLGNTMIGGLEGIINGLTQKGINKLLDTFGVDKKLRIPKLEIPRFAKGTPAGGHKGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
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EEEEECCCCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHCCCC
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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
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HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
APLVTIAMKESGGRTGPSTINRWDSNWRRGTPSMGLMQTIKPTFDAYKLPGMGDIMNPVH
HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
NAVAAIRYIKSRYGSPFNTPGIRSMEKGGPYKGYKIGDIVTQKQLAWIAEEGPEAIIPLQ
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
NHRQRAQQLWTAAGREIGMDPSGGSNEEELALLRGQNALLRQTNTLLTGILRKDPSVVVD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
TAALTDSVEKGQAQNIGFNKLLWGDR
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
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CCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
ILNRTLQTQKAKLNELKRQYEESVRTTGRYSAQSEKLLAQYNRTVAAVRKTEDQLDLLNR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KMREQSNGFSQLGAKISASIKTIDTKLRVLDSSFEAASAGVRDFGSTTEQLRQKSEHLTQ
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
SISLQEQRLKNIRRLYLEAKRAKGEDAQATQELRVQMNQATAQLRTTQAELAATNRQIQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NTGRWNELGNRMGEVGDRMRDVGGRMQSAGSEIAMSFGVATAALGGGLAVSTKKAMDFEQ
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHHHH
QMSSVKAVMNPAEANQYSAALTELAIKLGADTKYSALEAAQGMEELVKAGVSTKDILNGA
HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LKGALSLATAGELELADAAEIASTALNAFKDDNISVAQAADILAGAANSSATTVGEMRYG
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
LQMTSAVAAGMGLSFKDTATTLALFAQNGLKGSDAGTSMKTMLSRLVPMTKAQYETMHDL
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GLVTLDTSEAFKRMADKGFKPASKNIGDIYEALNKYVEKTTGAKQGTEKFEKAFDKATRS
CEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LGIMDNKFFDANGNIRSMTEISGELSKALDGLSAKDKQEALYNIFGSDAIRGALILGKEG
HCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCEEEECCCC
SKGFDKMAAAMDKIKADNVAAEKMNNLKGKIEELSGAVETAQISFGNALTPAISALVSVL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
QSATDWFNGLSKGMQSFVAISLAVTTVIMGIVAALGFLMLGVGQMISGLGTVSGLLKGLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSEKFIKVIGVAFGALTSPIGLTVLGITAVGAALVIAYKKSEKFRNFVNGAFESVRNVTV
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