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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 52142400

GI number: 52142400

Start: 2957621

End: 2959465

Strand: Reverse

Name: yxdM [H]

Synonym: BCZK2842

Alternate gene names: 52142400

Gene position: 2959465-2957621 (Counterclockwise)

Preceding gene: 52142399

Following gene: 52142402

Centisome position: 55.83

GC content: 32.85

Gene sequence:

>1845_bases
ATGTTATTTAAACTTTCTATGTCAGGATTAAAAAGTAAATTGAAAGATTATATAGTTTTACTTGTTGGTCTTGTCATGTC
AATTTCAATTTTTTACATGTTTCAAACGTTAGCACTAAATAAATCATTTCTTGAATCAAGTGCAATGATTAATTCAATTG
GAGTGGTTTTCCAAACGGGTTCAGTGTTACTAGCAATTATTACATTTTTCTATATTTTGTATGCAAACTCATTCTTATTA
TCACTTCGTCAAAAAGAATTTGGGATGTATATGATGTTAGGAGCGAAAAAACATAAGATTACAGTGCTTATGTTTTTGGA
AACAATGATGATTGGAATAGCATCTTTAGCAATCGGAATCACGGTTGGTGTGGGTCTTGCCCAAGGAATTGGCAAGCTAT
TGATGAAACAACTTGATTTTACAGCAAGTGGCTATCAAGGATTTTATGTCCCATCCATAGCAATTACTTGTGTATTCTTC
TTTATATTATTTCTACTCTCAGCAATTATGAATAGCGTGAAACTAACGCGCATTTCGGTTTTACAGCTAGTACACGCAGA
CGCTTCAGCAGAACGTTCAATGATTAAAGGAAAGTGGACTGGTGTAATAGCAATTTCGGCTATAATTTTATTAGGAATTG
GCTACGCTTCTATGATTTATATGAATAAGTTAAAAGAACAAGGCCTGATGATTGCAATGCTAACAACTACAGTGGGAACG
TATTTGCTATTTGCTTCAGTTCTCCCGCTTATTATTAAAAAGTTAAAGGGAAATAAAAATCGTAATGAAAAAGGACTTAA
TGCTTTCACATTTTCACAGTTGAATTTCCGTGTTACTAGTTTAACGAAAGTATTAGCAACAGTTGCCATGTTAGTGGCAC
TTGGCGCAGGTGCGATTTCTGGTGGAATGGCTTTTAAAAATAATGTTATGAACTCTGTTGAGCAGTTTGAAATATATGAT
ACAGTGATTCATAATCCAACTCATGAAGAGAGGGAAATTTTAAGTGGTATTACATTTAAGGAGAAAAGTGAATATCGCTA
TAAAGTAGATGAAAAATTCGTTTACTACTTAAAAGAAGATTTAGAGAAAAAGCATCCACTGGTGTATGATGCTGATAGAA
AAAAGAGTTCAGATAAATTTCAACGTGTATCGGACGAACTTCGAGTAGGTGCCACTTCAAGAGATAGTCAAGAAGGGGAG
AATGAAAACGTAATTCCAGATACGTGGGATATGGCTTTAACATCTATACAACCAACGTATTTAAACTATATGGGTAAAGT
GATTAAAATTGTAGATCAAAAAATGTATGATGAAATACAGGGAACAGAAAAAAGAGTTCTGATTGGAAGAACAGACAATT
TTGTGGCATATAAAAAAGAATGGGAAAAAATTGACGAGTTACAACTAGATAAATATAAAATAAATGCTGATGATTTATTA
AGTAAGTACAATCTATATACACAATCTTATGCTGTTGCCAGCGGAACGGTATTTATGGGTTTCTTCCTAGGAATTGCATT
TCTAGCGATGATGGCAAGTTGTTTAATGTTTAAAATCCTTACTGGTGCTTCAAAAGATATTGTTCGTTATGAAATGCTTC
GTAAAATAGGTGTTCGCCGTGAATTACTAGCAAAGTCTATTTATAAAGAACTATTTTTGGTATTCCTGTTTCCAGCTGTG
GTAGGTATTGCACACGTACTAATGGGGATGAATATTTTTGGATTTATTTTAATGGATCCGTATTTCCGTATTTGGTTACC
AATTGTAATTTTTGTAGTTATTTATACGATTTACTACTTTATTACTGTCCAATTATATAAAGGAATTGTACTTCCGAAAG
AATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGAAATACGTCGCAGTGGTACGCGCGAATCATTCTATAAAGAGATTTTAGACGTACTGGCAACCTTAGGAACAAAAAAGG
TATAAGAAAGGGAGTTCAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGTAAAAGTGCCGAGTATATCCTACTCGGTGTTTTAACTATGCTTGGAATTTCTAACAAGCAATTAAGGCGGCTTGTAT
TTATTGAAAATATGTTTATT

Product: ABC transporter, permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 614; Mature: 614

Protein sequence:

>614_residues
MLFKLSMSGLKSKLKDYIVLLVGLVMSISIFYMFQTLALNKSFLESSAMINSIGVVFQTGSVLLAIITFFYILYANSFLL
SLRQKEFGMYMMLGAKKHKITVLMFLETMMIGIASLAIGITVGVGLAQGIGKLLMKQLDFTASGYQGFYVPSIAITCVFF
FILFLLSAIMNSVKLTRISVLQLVHADASAERSMIKGKWTGVIAISAIILLGIGYASMIYMNKLKEQGLMIAMLTTTVGT
YLLFASVLPLIIKKLKGNKNRNEKGLNAFTFSQLNFRVTSLTKVLATVAMLVALGAGAISGGMAFKNNVMNSVEQFEIYD
TVIHNPTHEEREILSGITFKEKSEYRYKVDEKFVYYLKEDLEKKHPLVYDADRKKSSDKFQRVSDELRVGATSRDSQEGE
NENVIPDTWDMALTSIQPTYLNYMGKVIKIVDQKMYDEIQGTEKRVLIGRTDNFVAYKKEWEKIDELQLDKYKINADDLL
SKYNLYTQSYAVASGTVFMGFFLGIAFLAMMASCLMFKILTGASKDIVRYEMLRKIGVRRELLAKSIYKELFLVFLFPAV
VGIAHVLMGMNIFGFILMDPYFRIWLPIVIFVVIYTIYYFITVQLYKGIVLPKE

Sequences:

>Translated_614_residues
MLFKLSMSGLKSKLKDYIVLLVGLVMSISIFYMFQTLALNKSFLESSAMINSIGVVFQTGSVLLAIITFFYILYANSFLL
SLRQKEFGMYMMLGAKKHKITVLMFLETMMIGIASLAIGITVGVGLAQGIGKLLMKQLDFTASGYQGFYVPSIAITCVFF
FILFLLSAIMNSVKLTRISVLQLVHADASAERSMIKGKWTGVIAISAIILLGIGYASMIYMNKLKEQGLMIAMLTTTVGT
YLLFASVLPLIIKKLKGNKNRNEKGLNAFTFSQLNFRVTSLTKVLATVAMLVALGAGAISGGMAFKNNVMNSVEQFEIYD
TVIHNPTHEEREILSGITFKEKSEYRYKVDEKFVYYLKEDLEKKHPLVYDADRKKSSDKFQRVSDELRVGATSRDSQEGE
NENVIPDTWDMALTSIQPTYLNYMGKVIKIVDQKMYDEIQGTEKRVLIGRTDNFVAYKKEWEKIDELQLDKYKINADDLL
SKYNLYTQSYAVASGTVFMGFFLGIAFLAMMASCLMFKILTGASKDIVRYEMLRKIGVRRELLAKSIYKELFLVFLFPAV
VGIAHVLMGMNIFGFILMDPYFRIWLPIVIFVVIYTIYYFITVQLYKGIVLPKE
>Mature_614_residues
MLFKLSMSGLKSKLKDYIVLLVGLVMSISIFYMFQTLALNKSFLESSAMINSIGVVFQTGSVLLAIITFFYILYANSFLL
SLRQKEFGMYMMLGAKKHKITVLMFLETMMIGIASLAIGITVGVGLAQGIGKLLMKQLDFTASGYQGFYVPSIAITCVFF
FILFLLSAIMNSVKLTRISVLQLVHADASAERSMIKGKWTGVIAISAIILLGIGYASMIYMNKLKEQGLMIAMLTTTVGT
YLLFASVLPLIIKKLKGNKNRNEKGLNAFTFSQLNFRVTSLTKVLATVAMLVALGAGAISGGMAFKNNVMNSVEQFEIYD
TVIHNPTHEEREILSGITFKEKSEYRYKVDEKFVYYLKEDLEKKHPLVYDADRKKSSDKFQRVSDELRVGATSRDSQEGE
NENVIPDTWDMALTSIQPTYLNYMGKVIKIVDQKMYDEIQGTEKRVLIGRTDNFVAYKKEWEKIDELQLDKYKINADDLL
SKYNLYTQSYAVASGTVFMGFFLGIAFLAMMASCLMFKILTGASKDIVRYEMLRKIGVRRELLAKSIYKELFLVFLFPAV
VGIAHVLMGMNIFGFILMDPYFRIWLPIVIFVVIYTIYYFITVQLYKGIVLPKE

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69431; Mature: 69431

Theoretical pI: Translated: 9.77; Mature: 9.77

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
5.2 %Met     (Translated Protein)
5.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
5.2 %Met     (Mature Protein)
5.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLFKLSMSGLKSKLKDYIVLLVGLVMSISIFYMFQTLALNKSFLESSAMINSIGVVFQTG
CEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVLLAIITFFYILYANSFLLSLRQKEFGMYMMLGAKKHKITVLMFLETMMIGIASLAIGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TVGVGLAQGIGKLLMKQLDFTASGYQGFYVPSIAITCVFFFILFLLSAIMNSVKLTRISV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQLVHADASAERSMIKGKWTGVIAISAIILLGIGYASMIYMNKLKEQGLMIAMLTTTVGT
HHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHH
YLLFASVLPLIIKKLKGNKNRNEKGLNAFTFSQLNFRVTSLTKVLATVAMLVALGAGAIS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
GGMAFKNNVMNSVEQFEIYDTVIHNPTHEEREILSGITFKEKSEYRYKVDEKFVYYLKED
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
LEKKHPLVYDADRKKSSDKFQRVSDELRVGATSRDSQEGENENVIPDTWDMALTSIQPTY
HHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHH
LNYMGKVIKIVDQKMYDEIQGTEKRVLIGRTDNFVAYKKEWEKIDELQLDKYKINADDLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCHHHHH
SKYNLYTQSYAVASGTVFMGFFLGIAFLAMMASCLMFKILTGASKDIVRYEMLRKIGVRR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ELLAKSIYKELFLVFLFPAVVGIAHVLMGMNIFGFILMDPYFRIWLPIVIFVVIYTIYYF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITVQLYKGIVLPKE
HHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLFKLSMSGLKSKLKDYIVLLVGLVMSISIFYMFQTLALNKSFLESSAMINSIGVVFQTG
CEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVLLAIITFFYILYANSFLLSLRQKEFGMYMMLGAKKHKITVLMFLETMMIGIASLAIGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TVGVGLAQGIGKLLMKQLDFTASGYQGFYVPSIAITCVFFFILFLLSAIMNSVKLTRISV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQLVHADASAERSMIKGKWTGVIAISAIILLGIGYASMIYMNKLKEQGLMIAMLTTTVGT
HHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHH
YLLFASVLPLIIKKLKGNKNRNEKGLNAFTFSQLNFRVTSLTKVLATVAMLVALGAGAIS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
GGMAFKNNVMNSVEQFEIYDTVIHNPTHEEREILSGITFKEKSEYRYKVDEKFVYYLKED
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
LEKKHPLVYDADRKKSSDKFQRVSDELRVGATSRDSQEGENENVIPDTWDMALTSIQPTY
HHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHH
LNYMGKVIKIVDQKMYDEIQGTEKRVLIGRTDNFVAYKKEWEKIDELQLDKYKINADDLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCHHHHH
SKYNLYTQSYAVASGTVFMGFFLGIAFLAMMASCLMFKILTGASKDIVRYEMLRKIGVRR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ELLAKSIYKELFLVFLFPAVVGIAHVLMGMNIFGFILMDPYFRIWLPIVIFVVIYTIYYF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITVQLYKGIVLPKE
HHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]